Doublet Group distance statistics: 50522

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.004, 0.009, 0.014, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.009 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.004, 0.009, 0.015, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.009 std_dev=0.006
C1'	A	0, 0.006, 0.013, 0.020, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.013 std_dev=0.007
N3	A	0, 0.006, 0.016, 0.027, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.016 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.005, 0.016, 0.027, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.016 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.006, 0.018, 0.029, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.018 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.008, 0.022, 0.036, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.022 std_dev=0.014
N9	A	0, 0.009, 0.023, 0.038, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.023 std_dev=0.015
N6	A	0, 0.012, 0.031, 0.051, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.031 std_dev=0.019
N7	A	0, 0.010, 0.035, 0.059, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.035 std_dev=0.024
C8	A	0, 0.013, 0.041, 0.070, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.041 std_dev=0.028
O2'	B	0, 0.237, 0.554, 0.871, 0.981 max_d=0.981 avg_d=0.554 std_dev=0.317
C2'	B	0, 0.329, 0.715, 1.100, 1.134 max_d=1.134 avg_d=0.715 std_dev=0.386
OP2	B	0, 0.942, 1.914, 2.885, 2.578 max_d=2.578 avg_d=1.914 std_dev=0.971
O4'	A	0, 0.356, 1.502, 2.648, 2.479 max_d=2.479 avg_d=1.502 std_dev=1.146
C2'	A	0, 0.383, 1.566, 2.749, 2.552 max_d=2.552 avg_d=1.566 std_dev=1.183
C3'	B	0, 0.870, 2.145, 3.420, 3.488 max_d=3.488 avg_d=2.145 std_dev=1.275
C1'	B	0, 0.904, 2.281, 3.658, 3.614 max_d=3.614 avg_d=2.281 std_dev=1.377
P	B	0, 1.135, 2.556, 3.977, 3.815 max_d=3.815 avg_d=2.556 std_dev=1.421
C4'	A	0, 0.480, 1.980, 3.480, 3.282 max_d=3.282 avg_d=1.980 std_dev=1.500
C3'	A	0, 0.488, 2.139, 3.791, 3.513 max_d=3.513 avg_d=2.139 std_dev=1.652
O5'	B	0, 1.146, 2.875, 4.605, 4.443 max_d=4.443 avg_d=2.875 std_dev=1.729
OP1	B	0, 1.190, 2.927, 4.664, 4.643 max_d=4.643 avg_d=2.927 std_dev=1.737
O2'	A	0, 0.582, 2.355, 4.128, 3.834 max_d=3.834 avg_d=2.355 std_dev=1.773
O4'	B	0, 1.333, 3.112, 4.892, 4.612 max_d=4.612 avg_d=3.112 std_dev=1.780
C4'	B	0, 1.348, 3.185, 5.021, 4.840 max_d=4.840 avg_d=3.185 std_dev=1.836
O3'	A	0, 0.468, 2.317, 4.166, 3.869 max_d=3.869 avg_d=2.317 std_dev=1.849
C8	B	0, 1.073, 2.933, 4.793, 4.913 max_d=4.913 avg_d=2.933 std_dev=1.860
N9	B	0, 1.059, 2.923, 4.787, 4.752 max_d=4.752 avg_d=2.923 std_dev=1.864
O3'	B	0, 0.899, 2.889, 4.879, 4.861 max_d=4.861 avg_d=2.889 std_dev=1.990
C5'	B	0, 1.646, 3.688, 5.731, 5.765 max_d=5.765 avg_d=3.688 std_dev=2.043
N7	B	0, 1.376, 4.180, 6.985, 6.962 max_d=6.962 avg_d=4.180 std_dev=2.805
C4	B	0, 1.321, 4.168, 7.015, 6.757 max_d=6.757 avg_d=4.168 std_dev=2.847
C5'	A	0, 0.911, 3.790, 6.670, 6.206 max_d=6.206 avg_d=3.790 std_dev=2.879
N3	B	0, 1.377, 4.579, 7.780, 7.326 max_d=7.326 avg_d=4.579 std_dev=3.201
C5	B	0, 1.523, 5.000, 8.476, 8.203 max_d=8.203 avg_d=5.000 std_dev=3.477
O5'	A	0, 1.092, 4.596, 8.100, 7.558 max_d=7.558 avg_d=4.596 std_dev=3.504
C2	B	0, 1.648, 5.955, 10.261, 9.588 max_d=9.588 avg_d=5.955 std_dev=4.306
C6	B	0, 1.835, 6.540, 11.245, 10.699 max_d=10.699 avg_d=6.540 std_dev=4.705
N2	B	0, 1.736, 6.551, 11.367, 10.593 max_d=10.593 avg_d=6.551 std_dev=4.815
P	A	0, 1.574, 6.426, 11.278, 10.457 max_d=10.457 avg_d=6.426 std_dev=4.852
N1	B	0, 1.868, 6.911, 11.955, 11.211 max_d=11.211 avg_d=6.911 std_dev=5.043
OP1	A	0, 1.739, 6.924, 12.109, 11.346 max_d=11.346 avg_d=6.924 std_dev=5.185
OP2	A	0, 1.754, 6.952, 12.151, 11.197 max_d=11.197 avg_d=6.952 std_dev=5.198
O6	B	0, 2.067, 7.544, 13.020, 12.386 max_d=12.386 avg_d=7.544 std_dev=5.476

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.30	0.00	0.14	0.23	0.18	0.02
C2	0.01	0.00	0.10	0.20	0.00	0.61	0.00	1.21	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.14	0.50	1.55	1.79	1.07	1.58
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.04	0.01	0.01	0.21	0.04	0.06	0.07	0.10	0.03	0.04	0.01	0.00	0.02	0.02	0.19	0.19	0.15	0.18
C3'	0.01	0.20	0.00	0.00	0.06	0.00	0.25	0.02	0.17	0.49	0.03	0.23	0.27	0.47	0.22	0.01	0.00	0.01	0.02	0.06	0.12	0.05
C4	0.00	0.00	0.04	0.06	0.00	0.23	0.00	0.49	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.13	0.08	0.26	0.75	0.87	0.15	0.60
C4'	0.01	0.61	0.01	0.00	0.23	0.00	0.03	0.01	0.16	0.46	0.42	0.60	0.05	0.34	0.09	0.26	0.02	0.00	0.01	0.09	0.11	0.05
C5	0.01	0.00	0.01	0.25	0.00	0.03	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.27	0.05	0.11	0.46	0.59	0.46	0.25
C5'	0.07	1.21	0.21	0.02	0.49	0.01	0.15	0.00	0.41	0.66	0.88	1.14	0.21	0.48	0.05	0.05	0.19	0.02	0.01	0.12	0.05	0.02
C6	0.01	0.00	0.04	0.17	0.00	0.16	0.00	0.41	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.23	0.06	0.22	0.78	0.97	0.20	0.63
C8	0.01	0.00	0.06	0.49	0.00	0.46	0.00	0.66	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.37	0.09	0.28	0.42	0.37	1.32	0.74
N1	0.01	0.00	0.07	0.03	0.00	0.42	0.00	0.88	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.12	0.05	0.39	1.27	1.53	0.63	1.24
N3	0.01	0.00	0.10	0.23	0.00	0.60	0.00	1.14	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.09	0.19	0.51	1.40	1.53	0.93	1.36
N6	0.01	0.00	0.03	0.27	0.00	0.05	0.00	0.21	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.30	0.13	0.14	0.59	0.78	0.47	0.40
N7	0.01	0.00	0.04	0.47	0.00	0.34	0.00	0.48	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.38	0.14	0.16	0.20	0.20	1.25	0.54
N9	0.00	0.00	0.01	0.22	0.00	0.09	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.19	0.09	0.01	0.17	0.27	0.47	0.06
O2'	0.01	0.07	0.00	0.01	0.13	0.26	0.27	0.05	0.23	0.37	0.12	0.09	0.30	0.38	0.19	0.00	0.02	0.19	0.17	0.21	0.05	0.14
O3'	0.30	0.14	0.02	0.00	0.08	0.02	0.05	0.19	0.06	0.09	0.05	0.19	0.13	0.14	0.09	0.02	0.00	0.21	0.15	0.21	0.08	0.10
O4'	0.00	0.50	0.02	0.01	0.26	0.00	0.11	0.02	0.22	0.28	0.39	0.51	0.14	0.16	0.01	0.19	0.21	0.00	0.10	0.24	0.19	0.02
O5'	0.14	1.55	0.19	0.02	0.75	0.01	0.46	0.01	0.78	0.42	1.27	1.40	0.59	0.20	0.17	0.17	0.15	0.10	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.23	1.79	0.19	0.06	0.87	0.09	0.59	0.12	0.97	0.37	1.53	1.53	0.78	0.20	0.27	0.21	0.21	0.24	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.18	1.07	0.15	0.12	0.15	0.11	0.46	0.05	0.20	1.32	0.63	0.93	0.47	1.25	0.47	0.05	0.08	0.19	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.02	1.58	0.18	0.05	0.60	0.05	0.25	0.02	0.63	0.74	1.24	1.36	0.40	0.54	0.06	0.14	0.10	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.43	1.97	0.15	0.95	1.21	0.63	1.22	1.04	1.59	0.54	1.92	2.36	1.60	0.82	0.72	0.10	1.21	0.23	0.80	1.61	1.46	0.51	0.83
C2	0.34	0.27	0.22	0.43	0.20	0.31	0.20	0.43	0.18	0.26	0.16	0.40	0.32	0.28	0.22	0.15	0.34	0.46	0.27	0.23	1.04	0.32	0.43
C2'	0.51	2.45	0.09	0.85	1.47	0.65	1.45	1.16	1.90	0.59	2.36	2.99	1.99	0.93	0.85	0.19	1.00	0.21	0.95	1.91	1.69	0.56	1.00
C3'	0.22	2.12	0.56	1.55	0.97	1.45	0.99	1.99	1.56	0.07	2.08	2.76	1.53	0.41	0.26	0.32	1.69	0.73	1.81	1.60	2.45	1.31	1.82
C4	0.35	0.95	0.18	0.68	0.56	0.33	0.46	0.66	0.61	0.20	0.83	1.20	0.83	0.25	0.35	0.10	0.77	0.35	0.46	0.56	1.22	0.40	0.59
C4'	0.86	1.39	1.27	2.30	0.31	2.13	0.40	2.55	0.96	0.57	1.42	1.96	0.80	0.14	0.39	1.02	2.59	1.36	2.33	1.06	2.85	1.85	2.28
C5	0.31	0.54	0.20	0.55	0.30	0.29	0.20	0.52	0.25	0.19	0.40	0.73	0.50	0.16	0.23	0.13	0.56	0.38	0.36	0.19	1.11	0.35	0.50
C5'	2.05	0.30	2.42	3.48	0.88	3.31	0.80	3.72	0.21	1.79	0.32	0.93	0.36	1.34	1.59	2.08	3.68	2.56	3.50	0.13	4.00	3.06	3.47
C6	0.30	0.14	0.22	0.38	0.21	0.34	0.32	0.40	0.35	0.33	0.25	0.15	0.16	0.39	0.24	0.18	0.27	0.45	0.28	0.44	0.97	0.29	0.39
C8	0.33	1.20	0.17	0.75	0.70	0.42	0.65	0.77	0.87	0.26	1.12	1.50	0.99	0.39	0.41	0.09	0.91	0.30	0.57	0.86	1.29	0.44	0.66
N1	0.30	0.26	0.23	0.31	0.30	0.41	0.46	0.38	0.52	0.40	0.43	0.18	0.19	0.50	0.28	0.19	0.16	0.49	0.28	0.63	0.92	0.27	0.36
N3	0.37	0.90	0.20	0.66	0.55	0.31	0.43	0.63	0.55	0.20	0.75	1.11	0.82	0.23	0.36	0.12	0.72	0.38	0.43	0.48	1.21	0.40	0.57
N6	0.29	0.40	0.24	0.31	0.38	0.42	0.55	0.39	0.66	0.44	0.59	0.34	0.27	0.58	0.32	0.22	0.17	0.47	0.30	0.78	0.89	0.25	0.35
N7	0.31	0.74	0.19	0.61	0.41	0.32	0.32	0.60	0.43	0.17	0.63	0.97	0.64	0.17	0.27	0.13	0.68	0.35	0.43	0.39	1.17	0.38	0.56
N9	0.36	1.40	0.17	0.81	0.84	0.46	0.79	0.84	1.04	0.32	1.32	1.72	1.16	0.49	0.50	0.08	0.99	0.28	0.62	1.03	1.34	0.46	0.70
O2'	1.25	3.38	0.69	0.22	2.34	0.16	2.36	0.55	2.85	1.42	3.31	3.89	2.86	1.81	1.67	0.73	0.41	0.84	0.33	2.86	1.08	0.37	0.32
O3'	0.25	2.78	0.15	1.16	1.53	1.14	1.62	1.66	2.27	0.50	2.81	3.45	2.09	1.00	0.74	0.10	1.37	0.41	1.50	2.36	2.06	0.89	1.45
O4'	0.52	1.27	0.97	1.90	0.43	1.59	0.50	1.94	0.94	0.26	1.29	1.70	0.81	0.11	0.15	0.80	2.25	0.89	1.69	1.01	2.25	1.35	1.67
O5'	2.59	0.38	2.94	4.00	1.43	3.78	1.27	4.02	0.69	2.18	0.28	0.24	1.00	1.73	2.09	2.65	4.46	3.05	3.78	0.54	4.18	3.39	3.70
OP1	3.68	1.45	3.73	4.80	2.49	4.82	2.27	4.92	1.66	3.17	1.28	0.90	2.12	2.70	3.14	3.38	5.46	4.23	4.77	1.46	4.96	4.46	4.65
OP2	3.46	1.13	3.57	4.76	2.31	4.92	2.26	5.27	1.66	3.27	1.14	0.48	1.74	2.83	3.04	2.91	4.96	4.16	5.17	1.57	5.36	4.80	5.08
P	3.55	1.27	3.72	4.85	2.37	4.79	2.22	4.95	1.62	3.14	1.18	0.68	1.91	2.69	3.04	3.26	5.38	4.09	4.77	1.47	5.03	4.44	4.68

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.29	0.00	0.14	0.00	0.61	0.46	0.23
C2	0.01	0.00	0.30	0.32	0.00	0.11	0.00	0.15	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.22	0.20	0.09	0.29	0.01	0.68	0.39	0.21
C2'	0.01	0.30	0.00	0.01	0.15	0.02	0.06	0.21	0.12	0.14	0.22	0.36	0.30	0.08	0.01	0.00	0.02	0.02	0.32	0.09	0.84	0.37	0.39
C3'	0.02	0.32	0.01	0.00	0.26	0.00	0.29	0.03	0.33	0.22	0.34	0.33	0.28	0.27	0.18	0.02	0.00	0.01	0.31	0.35	0.40	0.24	0.18
C4	0.00	0.00	0.15	0.26	0.00	0.09	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.21	0.11	0.05	0.30	0.00	0.70	0.39	0.21
C4'	0.00	0.11	0.02	0.00	0.09	0.00	0.11	0.00	0.12	0.11	0.12	0.12	0.10	0.11	0.07	0.23	0.02	0.00	0.01	0.13	0.27	0.32	0.09
C5	0.00	0.00	0.06	0.29	0.00	0.11	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.28	0.05	0.03	0.37	0.00	0.74	0.34	0.20
C5'	0.06	0.15	0.21	0.03	0.10	0.00	0.11	0.00	0.15	0.09	0.16	0.17	0.12	0.11	0.04	0.05	0.19	0.01	0.01	0.16	0.26	0.32	0.01
C6	0.00	0.01	0.12	0.33	0.00	0.12	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.29	0.08	0.05	0.38	0.00	0.73	0.32	0.20
C8	0.00	0.00	0.14	0.22	0.00	0.11	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.27	0.12	0.06	0.37	0.01	0.77	0.35	0.21
N1	0.01	0.00	0.22	0.34	0.00	0.12	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.26	0.14	0.08	0.34	0.01	0.71	0.36	0.20
N2	0.02	0.00	0.36	0.33	0.01	0.12	0.01	0.17	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.22	0.26	0.11	0.26	0.01	0.66	0.40	0.21
N3	0.01	0.00	0.30	0.28	0.00	0.10	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.18	0.21	0.09	0.25	0.01	0.67	0.41	0.21
N7	0.00	0.00	0.08	0.27	0.00	0.11	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.31	0.10	0.03	0.41	0.01	0.77	0.29	0.20
N9	0.00	0.00	0.01	0.18	0.00	0.07	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.18	0.12	0.01	0.27	0.00	0.70	0.41	0.22
O2'	0.02	0.22	0.00	0.02	0.21	0.23	0.28	0.05	0.29	0.27	0.26	0.22	0.18	0.31	0.18	0.00	0.03	0.17	0.25	0.32	0.72	0.35	0.27
O3'	0.29	0.20	0.02	0.00	0.11	0.02	0.05	0.19	0.08	0.12	0.14	0.26	0.21	0.10	0.12	0.03	0.00	0.22	0.26	0.09	0.35	0.20	0.21
O4'	0.00	0.09	0.02	0.01	0.05	0.00	0.03	0.01	0.05	0.06	0.08	0.11	0.09	0.03	0.01	0.17	0.22	0.00	0.08	0.04	0.40	0.53	0.22
O5'	0.14	0.29	0.32	0.31	0.30	0.01	0.37	0.01	0.38	0.37	0.34	0.26	0.25	0.41	0.27	0.25	0.26	0.08	0.00	0.41	0.02	0.02	0.01
O6	0.00	0.01	0.09	0.35	0.00	0.13	0.00	0.16	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.32	0.09	0.04	0.41	0.00	0.73	0.28	0.20
OP1	0.61	0.68	0.84	0.40	0.70	0.27	0.74	0.26	0.73	0.77	0.71	0.66	0.67	0.77	0.70	0.72	0.35	0.40	0.02	0.73	0.00	0.01	0.00
OP2	0.46	0.39	0.37	0.24	0.39	0.32	0.34	0.32	0.32	0.35	0.36	0.40	0.41	0.29	0.41	0.35	0.20	0.53	0.02	0.28	0.01	0.00	0.00
P	0.23	0.21	0.39	0.18	0.21	0.09	0.20	0.01	0.20	0.21	0.20	0.21	0.21	0.20	0.22	0.27	0.21	0.22	0.01	0.20	0.00	0.00	0.00