Doublet Group distance statistics: 50524

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.002, 0.006, 0.010, 0.010 max_d=0.010 avg_d=0.006 std_dev=0.004
C4	A	0, 0.002, 0.008, 0.014, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.008 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.001, 0.011, 0.021, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.011 std_dev=0.010
C8	A	0, 0.003, 0.019, 0.035, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.019 std_dev=0.016
N9	A	0, 0.006, 0.022, 0.039, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.022 std_dev=0.017
N1	A	0, 0.000, 0.018, 0.035, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.018 std_dev=0.017
N3	A	0, 0.003, 0.020, 0.038, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.020 std_dev=0.018
C1'	A	0, 0.003, 0.022, 0.041, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.022 std_dev=0.019
N6	A	0, 0.004, 0.026, 0.047, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.026 std_dev=0.021
N7	A	0, -0.004, 0.019, 0.043, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.019 std_dev=0.024
C2	A	0, -0.002, 0.022, 0.047, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.022 std_dev=0.024
O4'	A	0, 0.012, 0.036, 0.061, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.036 std_dev=0.024
C2'	A	0, 0.012, 0.062, 0.112, 0.137 max_d=0.137 avg_d=0.062 std_dev=0.050
O2'	A	0, 0.039, 0.117, 0.194, 0.217 max_d=0.217 avg_d=0.117 std_dev=0.078
C3'	A	0, 0.050, 0.140, 0.231, 0.233 max_d=0.233 avg_d=0.140 std_dev=0.090
O3'	A	0, 0.077, 0.189, 0.301, 0.284 max_d=0.284 avg_d=0.189 std_dev=0.112
C4'	A	0, 0.003, 0.135, 0.268, 0.356 max_d=0.356 avg_d=0.135 std_dev=0.133
C5'	A	0, 0.002, 0.290, 0.578, 0.769 max_d=0.769 avg_d=0.290 std_dev=0.288
C5'	B	0, 0.125, 0.424, 0.724, 0.829 max_d=0.829 avg_d=0.424 std_dev=0.299
O5'	B	0, 0.081, 0.386, 0.691, 0.846 max_d=0.846 avg_d=0.386 std_dev=0.305
C4'	B	0, 0.155, 0.487, 0.819, 0.906 max_d=0.906 avg_d=0.487 std_dev=0.332
N2	B	0, 0.240, 0.574, 0.908, 0.820 max_d=0.820 avg_d=0.574 std_dev=0.334
O4'	B	0, 0.174, 0.519, 0.864, 0.928 max_d=0.928 avg_d=0.519 std_dev=0.345
N3	B	0, 0.223, 0.568, 0.914, 0.915 max_d=0.915 avg_d=0.568 std_dev=0.345
C1'	B	0, 0.181, 0.530, 0.879, 0.956 max_d=0.956 avg_d=0.530 std_dev=0.349
C2	B	0, 0.238, 0.589, 0.939, 0.913 max_d=0.913 avg_d=0.589 std_dev=0.351
P	B	0, 0.008, 0.371, 0.734, 0.963 max_d=0.963 avg_d=0.371 std_dev=0.363
N9	B	0, 0.192, 0.556, 0.920, 1.001 max_d=1.001 avg_d=0.556 std_dev=0.364
C4	B	0, 0.211, 0.575, 0.940, 0.997 max_d=0.997 avg_d=0.575 std_dev=0.365
C3'	B	0, 0.130, 0.500, 0.871, 1.020 max_d=1.020 avg_d=0.500 std_dev=0.371
N1	B	0, 0.245, 0.632, 1.019, 1.043 max_d=1.043 avg_d=0.632 std_dev=0.387
O3'	B	0, 0.140, 0.531, 0.922, 1.045 max_d=1.045 avg_d=0.531 std_dev=0.391
C2'	B	0, 0.165, 0.558, 0.951, 1.082 max_d=1.082 avg_d=0.558 std_dev=0.393
C8	B	0, 0.187, 0.584, 0.982, 1.108 max_d=1.108 avg_d=0.584 std_dev=0.398
C5	B	0, 0.213, 0.614, 1.016, 1.118 max_d=1.118 avg_d=0.614 std_dev=0.402
O2'	B	0, 0.197, 0.599, 1.001, 1.088 max_d=1.088 avg_d=0.599 std_dev=0.402
C6	B	0, 0.230, 0.651, 1.071, 1.170 max_d=1.170 avg_d=0.651 std_dev=0.420
P	A	0, 0.086, 0.509, 0.932, 1.082 max_d=1.082 avg_d=0.509 std_dev=0.423
N7	B	0, 0.196, 0.624, 1.051, 1.198 max_d=1.198 avg_d=0.624 std_dev=0.427
OP2	B	0, -0.023, 0.412, 0.847, 1.144 max_d=1.144 avg_d=0.412 std_dev=0.435
OP1	B	0, -0.012, 0.446, 0.905, 1.213 max_d=1.213 avg_d=0.446 std_dev=0.458
O6	B	0, 0.227, 0.698, 1.168, 1.325 max_d=1.325 avg_d=0.698 std_dev=0.470
OP1	A	0, 0.175, 0.686, 1.196, 1.212 max_d=1.212 avg_d=0.686 std_dev=0.510
O5'	A	0, 0.197, 0.905, 1.613, 1.635 max_d=1.635 avg_d=0.905 std_dev=0.708
OP2	A	0, 0.049, 0.832, 1.614, 1.940 max_d=1.940 avg_d=0.832 std_dev=0.783

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.04	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.15	0.30	0.57	0.15
C2	0.05	0.00	0.07	0.08	0.02	0.06	0.02	0.09	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.08	0.08	0.05	0.27	0.29	0.71	0.21
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.03	0.06	0.07	0.03	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.19	0.31	0.38	0.14
C3'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.06	0.00	0.09	0.01	0.09	0.09	0.09	0.07	0.11	0.11	0.05	0.02	0.00	0.01	0.26	0.38	0.20	0.15
C4	0.02	0.02	0.03	0.06	0.00	0.04	0.00	0.10	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.06	0.02	0.30	0.30	0.69	0.21
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.06	0.08	0.06	0.06	0.08	0.09	0.04	0.03	0.02	0.00	0.01	0.29	0.29	0.04
C5	0.01	0.02	0.03	0.09	0.00	0.07	0.00	0.15	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.09	0.00	0.38	0.31	0.72	0.25
C5'	0.01	0.09	0.01	0.01	0.10	0.01	0.15	0.00	0.15	0.17	0.12	0.08	0.18	0.19	0.09	0.04	0.01	0.01	0.00	0.37	0.25	0.01
C6	0.02	0.00	0.03	0.09	0.01	0.06	0.00	0.15	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.09	0.01	0.39	0.31	0.72	0.26
C8	0.01	0.03	0.03	0.09	0.01	0.08	0.00	0.17	0.00	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.09	0.01	0.38	0.32	0.72	0.24
N1	0.04	0.00	0.06	0.09	0.02	0.06	0.02	0.12	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.06	0.09	0.04	0.33	0.30	0.72	0.24
N3	0.05	0.01	0.07	0.07	0.01	0.06	0.00	0.08	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.07	0.07	0.04	0.23	0.28	0.68	0.19
N6	0.01	0.01	0.03	0.11	0.01	0.08	0.01	0.18	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.10	0.01	0.44	0.32	0.70	0.29
N7	0.01	0.02	0.03	0.11	0.00	0.09	0.00	0.19	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.11	0.01	0.42	0.32	0.73	0.27
N9	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.04	0.00	0.09	0.01	0.00	0.03	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.01	0.28	0.31	0.67	0.20
O2'	0.01	0.08	0.00	0.02	0.02	0.03	0.01	0.04	0.03	0.02	0.06	0.07	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.03	0.03	0.24	0.36	0.07
O3'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.06	0.02	0.09	0.01	0.09	0.09	0.09	0.07	0.10	0.11	0.05	0.00	0.00	0.02	0.20	0.35	0.12	0.10
O4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.04	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00	0.09	0.30	0.54	0.13
O5'	0.15	0.27	0.19	0.26	0.30	0.01	0.38	0.00	0.39	0.38	0.33	0.23	0.44	0.42	0.28	0.03	0.20	0.09	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.30	0.29	0.31	0.38	0.30	0.29	0.31	0.37	0.31	0.32	0.30	0.28	0.32	0.32	0.31	0.24	0.35	0.30	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.57	0.71	0.38	0.20	0.69	0.29	0.72	0.25	0.72	0.72	0.72	0.68	0.70	0.73	0.67	0.36	0.12	0.54	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.15	0.21	0.14	0.15	0.21	0.04	0.25	0.01	0.26	0.24	0.24	0.19	0.29	0.27	0.20	0.07	0.10	0.13	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.15	0.17	0.12	0.12	0.18	0.13	0.18	0.13	0.18	0.18	0.18	0.16	0.17	0.18	0.18	0.11	0.11	0.17	0.07	0.18	0.10	0.12	0.06
C2	0.16	0.21	0.13	0.11	0.20	0.12	0.19	0.15	0.19	0.15	0.21	0.20	0.21	0.16	0.18	0.12	0.10	0.16	0.11	0.18	0.16	0.06	0.08
C2'	0.13	0.17	0.10	0.09	0.18	0.09	0.18	0.10	0.19	0.17	0.18	0.16	0.16	0.18	0.17	0.09	0.08	0.14	0.03	0.18	0.14	0.13	0.09
C3'	0.14	0.20	0.10	0.09	0.19	0.09	0.21	0.10	0.22	0.18	0.22	0.19	0.19	0.20	0.18	0.08	0.08	0.13	0.03	0.22	0.13	0.13	0.08
C4	0.14	0.17	0.12	0.13	0.17	0.13	0.17	0.15	0.17	0.15	0.18	0.15	0.16	0.16	0.17	0.12	0.12	0.16	0.09	0.17	0.11	0.08	0.02
C4'	0.13	0.18	0.11	0.12	0.18	0.13	0.18	0.14	0.19	0.17	0.19	0.17	0.17	0.18	0.17	0.11	0.13	0.15	0.07	0.19	0.09	0.10	0.04
C5	0.12	0.13	0.12	0.15	0.12	0.15	0.12	0.17	0.14	0.10	0.14	0.12	0.12	0.11	0.12	0.15	0.16	0.15	0.12	0.14	0.14	0.06	0.05
C5'	0.16	0.24	0.12	0.12	0.22	0.12	0.22	0.14	0.24	0.19	0.25	0.24	0.22	0.21	0.20	0.11	0.12	0.16	0.06	0.25	0.09	0.10	0.04
C6	0.11	0.11	0.12	0.16	0.10	0.17	0.10	0.19	0.12	0.07	0.13	0.11	0.10	0.08	0.09	0.15	0.17	0.14	0.15	0.12	0.18	0.06	0.09
C8	0.13	0.13	0.12	0.14	0.14	0.15	0.14	0.16	0.15	0.13	0.15	0.12	0.13	0.14	0.14	0.15	0.15	0.16	0.09	0.16	0.10	0.09	0.02
N1	0.12	0.16	0.11	0.14	0.13	0.16	0.12	0.19	0.14	0.09	0.16	0.16	0.15	0.10	0.12	0.13	0.15	0.14	0.16	0.14	0.19	0.07	0.12
N3	0.18	0.21	0.15	0.13	0.21	0.13	0.20	0.13	0.21	0.19	0.21	0.20	0.21	0.19	0.21	0.13	0.11	0.19	0.08	0.20	0.12	0.08	0.02
N6	0.12	0.06	0.16	0.20	0.04	0.20	0.05	0.21	0.08	0.06	0.08	0.05	0.04	0.05	0.06	0.20	0.22	0.15	0.18	0.10	0.21	0.06	0.12
N7	0.12	0.11	0.13	0.16	0.11	0.16	0.12	0.17	0.13	0.10	0.13	0.09	0.10	0.11	0.12	0.16	0.17	0.15	0.11	0.14	0.12	0.07	0.03
N9	0.14	0.16	0.12	0.13	0.17	0.13	0.17	0.14	0.17	0.16	0.17	0.14	0.16	0.17	0.17	0.12	0.12	0.17	0.08	0.17	0.09	0.10	0.02
O2'	0.14	0.17	0.12	0.12	0.18	0.12	0.19	0.13	0.19	0.19	0.19	0.16	0.17	0.20	0.18	0.11	0.11	0.15	0.05	0.19	0.12	0.13	0.07
O3'	0.13	0.19	0.10	0.08	0.19	0.08	0.20	0.09	0.21	0.18	0.21	0.18	0.18	0.20	0.18	0.08	0.07	0.12	0.03	0.21	0.14	0.14	0.10
O4'	0.15	0.16	0.13	0.13	0.17	0.14	0.18	0.14	0.18	0.17	0.17	0.14	0.16	0.18	0.18	0.13	0.13	0.17	0.07	0.18	0.10	0.12	0.07
O5'	0.35	0.43	0.32	0.27	0.40	0.27	0.40	0.21	0.42	0.35	0.43	0.43	0.41	0.37	0.37	0.35	0.25	0.33	0.13	0.42	0.18	0.09	0.02
OP1	0.39	0.30	0.41	0.43	0.34	0.43	0.32	0.43	0.30	0.35	0.29	0.29	0.33	0.32	0.37	0.43	0.43	0.42	0.35	0.28	0.21	0.31	0.28
OP2	0.59	0.52	0.68	0.70	0.50	0.67	0.43	0.64	0.41	0.44	0.46	0.56	0.54	0.40	0.50	0.78	0.78	0.56	0.59	0.37	0.64	0.41	0.52
P	0.26	0.24	0.27	0.26	0.25	0.25	0.23	0.23	0.23	0.22	0.24	0.24	0.25	0.22	0.24	0.31	0.27	0.26	0.16	0.22	0.15	0.06	0.06

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.07	0.03
C2	0.02	0.00	0.05	0.04	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.10	0.05	0.01	0.05	0.01	0.07	0.15	0.07
C2'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.03	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.04	0.05	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.03	0.05	0.07	0.04
C3'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.05	0.05	0.05	0.05	0.04	0.05	0.03	0.02	0.00	0.01	0.06	0.05	0.07	0.07	0.06
C4	0.01	0.01	0.03	0.03	0.00	0.02	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.06	0.03	0.00	0.05	0.00	0.07	0.14	0.07
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.04	0.03	0.03	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.05	0.05	0.01
C5	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.02	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.05	0.04	0.01	0.07	0.01	0.11	0.17	0.10
C5'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.04	0.01	0.06	0.00	0.06	0.07	0.05	0.02	0.03	0.08	0.04	0.03	0.01	0.00	0.00	0.07	0.07	0.03	0.01
C6	0.01	0.00	0.03	0.05	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.07	0.05	0.01	0.08	0.00	0.13	0.18	0.11
C8	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.04	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.02	0.07	0.01	0.09	0.15	0.09
N1	0.02	0.00	0.04	0.05	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.09	0.05	0.00	0.07	0.01	0.11	0.17	0.10
N2	0.02	0.00	0.05	0.05	0.01	0.04	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.07	0.01	0.04	0.02	0.06	0.14	0.06
N3	0.02	0.00	0.04	0.04	0.01	0.03	0.02	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.09	0.05	0.01	0.04	0.00	0.05	0.13	0.06
N7	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.03	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.05	0.02	0.09	0.02	0.12	0.18	0.11
N9	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.00	0.05	0.01	0.06	0.12	0.06
O2'	0.01	0.10	0.00	0.02	0.06	0.02	0.05	0.03	0.07	0.01	0.09	0.12	0.09	0.03	0.03	0.00	0.02	0.02	0.04	0.06	0.07	0.07	0.04
O3'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.05	0.05	0.05	0.07	0.05	0.05	0.02	0.02	0.00	0.01	0.09	0.05	0.11	0.09	0.09
O4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.06	0.02	0.08	0.06	0.06
O5'	0.02	0.05	0.03	0.06	0.05	0.01	0.07	0.00	0.08	0.07	0.07	0.04	0.04	0.09	0.05	0.04	0.09	0.06	0.00	0.09	0.00	0.01	0.01
O6	0.00	0.01	0.03	0.05	0.00	0.03	0.01	0.07	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.06	0.05	0.02	0.09	0.00	0.15	0.19	0.12
OP1	0.03	0.07	0.05	0.07	0.07	0.05	0.11	0.07	0.13	0.09	0.11	0.06	0.05	0.12	0.06	0.07	0.11	0.08	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00
OP2	0.07	0.15	0.07	0.07	0.14	0.05	0.17	0.03	0.18	0.15	0.17	0.14	0.13	0.18	0.12	0.07	0.09	0.06	0.01	0.19	0.00	0.00	0.01
P	0.03	0.07	0.04	0.06	0.07	0.01	0.10	0.01	0.11	0.09	0.10	0.06	0.06	0.11	0.06	0.04	0.09	0.06	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00