Doublet Group distance statistics: 50525

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.004, 0.018, 0.031, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.018 std_dev=0.014
C2	A	0, 0.007, 0.022, 0.036, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.022 std_dev=0.015
N1	A	0, 0.007, 0.030, 0.053, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.030 std_dev=0.023
N3	A	0, 0.010, 0.034, 0.058, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.034 std_dev=0.024
C1'	A	0, 0.011, 0.036, 0.061, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.036 std_dev=0.025
C5	A	0, 0.005, 0.031, 0.056, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.031 std_dev=0.025
C4	A	0, 0.010, 0.045, 0.081, 0.090 max_d=0.090 avg_d=0.045 std_dev=0.036
N9	A	0, 0.013, 0.055, 0.096, 0.109 max_d=0.109 avg_d=0.055 std_dev=0.041
N7	A	0, 0.008, 0.061, 0.113, 0.130 max_d=0.130 avg_d=0.061 std_dev=0.052
N6	A	0, 0.012, 0.066, 0.119, 0.130 max_d=0.130 avg_d=0.066 std_dev=0.053
C8	A	0, 0.013, 0.081, 0.149, 0.174 max_d=0.174 avg_d=0.081 std_dev=0.068
C2'	B	0, 0.348, 0.871, 1.394, 1.375 max_d=1.375 avg_d=0.871 std_dev=0.523
O4'	B	0, 0.327, 0.975, 1.623, 1.659 max_d=1.659 avg_d=0.975 std_dev=0.648
O2'	B	0, 0.479, 1.144, 1.809, 1.608 max_d=1.608 avg_d=1.144 std_dev=0.665
C2'	A	0, 0.517, 1.236, 1.954, 1.731 max_d=1.731 avg_d=1.236 std_dev=0.719
O4'	A	0, 0.528, 1.259, 1.990, 1.750 max_d=1.750 avg_d=1.259 std_dev=0.731
C1'	B	0, 0.283, 1.116, 1.950, 1.979 max_d=1.979 avg_d=1.116 std_dev=0.833
C3'	B	0, 0.410, 1.291, 2.172, 2.188 max_d=2.188 avg_d=1.291 std_dev=0.881
O3'	B	0, 0.445, 1.344, 2.243, 2.193 max_d=2.193 avg_d=1.344 std_dev=0.899
O2'	A	0, 0.708, 1.701, 2.695, 2.495 max_d=2.495 avg_d=1.701 std_dev=0.994
C3'	A	0, 0.608, 1.737, 2.867, 2.764 max_d=2.764 avg_d=1.737 std_dev=1.130
C4'	A	0, 0.767, 1.919, 3.071, 2.823 max_d=2.823 avg_d=1.919 std_dev=1.152
C4'	B	0, 0.347, 1.669, 2.990, 3.024 max_d=3.024 avg_d=1.669 std_dev=1.322
O5'	A	0, 1.120, 2.653, 4.186, 3.627 max_d=3.627 avg_d=2.653 std_dev=1.533
C5'	A	0, 1.190, 2.825, 4.460, 3.882 max_d=3.882 avg_d=2.825 std_dev=1.635
O3'	A	0, 0.240, 2.052, 3.864, 3.943 max_d=3.943 avg_d=2.052 std_dev=1.812
P	A	0, 1.462, 3.462, 5.462, 4.711 max_d=4.711 avg_d=3.462 std_dev=2.000
N9	B	0, 0.442, 2.469, 4.497, 4.520 max_d=4.520 avg_d=2.469 std_dev=2.028
OP1	A	0, 1.487, 3.518, 5.549, 4.737 max_d=4.737 avg_d=3.518 std_dev=2.031
OP2	A	0, 1.527, 3.619, 5.711, 4.982 max_d=4.982 avg_d=3.619 std_dev=2.092
C5'	B	0, 0.641, 3.147, 5.652, 5.695 max_d=5.695 avg_d=3.147 std_dev=2.505
O5'	B	0, 0.997, 3.517, 6.038, 6.064 max_d=6.064 avg_d=3.517 std_dev=2.521
C4	B	0, 0.715, 3.554, 6.394, 6.353 max_d=6.353 avg_d=3.554 std_dev=2.839
C8	B	0, 0.533, 3.439, 6.345, 6.399 max_d=6.399 avg_d=3.439 std_dev=2.906
N3	B	0, 0.879, 3.979, 7.078, 7.037 max_d=7.037 avg_d=3.979 std_dev=3.100
P	B	0, 1.143, 4.625, 8.108, 8.163 max_d=8.163 avg_d=4.625 std_dev=3.483
OP2	B	0, 1.276, 4.946, 8.615, 8.636 max_d=8.636 avg_d=4.946 std_dev=3.670
C5	B	0, 0.878, 4.661, 8.444, 8.424 max_d=8.424 avg_d=4.661 std_dev=3.783
N7	B	0, 0.802, 4.628, 8.453, 8.478 max_d=8.478 avg_d=4.628 std_dev=3.826
C2	B	0, 1.140, 5.353, 9.566, 9.511 max_d=9.511 avg_d=5.353 std_dev=4.213
OP1	B	0, 1.041, 5.686, 10.331, 10.436 max_d=10.436 avg_d=5.686 std_dev=4.645
C6	B	0, 1.161, 5.981, 10.801, 10.742 max_d=10.742 avg_d=5.981 std_dev=4.820
N1	B	0, 1.250, 6.162, 11.075, 10.993 max_d=10.993 avg_d=6.162 std_dev=4.912
N2	B	0, 1.365, 6.281, 11.196, 11.144 max_d=11.144 avg_d=6.281 std_dev=4.916
O6	B	0, 1.364, 7.118, 12.872, 12.810 max_d=12.810 avg_d=7.118 std_dev=5.754

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.33	0.00	0.23	0.38	0.10	0.22
C2	0.02	0.00	0.15	0.13	0.00	0.19	0.00	0.25	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.33	0.29	0.25	0.18	0.30	0.18	0.13
C2'	0.00	0.15	0.00	0.00	0.10	0.01	0.09	0.20	0.12	0.06	0.14	0.13	0.12	0.06	0.03	0.01	0.10	0.00	0.41	0.62	0.22	0.41
C3'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.23	0.01	0.39	0.01	0.37	0.48	0.26	0.08	0.46	0.51	0.27	0.01	0.01	0.02	0.08	0.47	0.32	0.22
C4	0.01	0.00	0.10	0.23	0.00	0.08	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.23	0.08	0.14	0.11	0.27	0.16	0.10
C4'	0.01	0.19	0.01	0.01	0.08	0.00	0.10	0.00	0.10	0.24	0.13	0.18	0.11	0.20	0.08	0.27	0.04	0.01	0.00	0.23	0.22	0.08
C5	0.01	0.00	0.09	0.39	0.00	0.10	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.24	0.21	0.08	0.06	0.26	0.22	0.10
C5'	0.09	0.25	0.20	0.01	0.10	0.00	0.05	0.00	0.09	0.20	0.19	0.24	0.08	0.16	0.03	0.06	0.25	0.02	0.00	0.06	0.17	0.01
C6	0.01	0.00	0.12	0.37	0.00	0.10	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.27	0.17	0.13	0.05	0.26	0.25	0.09
C8	0.01	0.01	0.06	0.48	0.00	0.24	0.00	0.20	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.25	0.40	0.12	0.20	0.28	0.18	0.18
N1	0.02	0.00	0.14	0.26	0.00	0.13	0.00	0.19	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.30	0.08	0.21	0.11	0.25	0.22	0.06
N3	0.02	0.00	0.13	0.08	0.00	0.18	0.00	0.24	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.30	0.37	0.25	0.21	0.33	0.15	0.17
N6	0.01	0.00	0.12	0.46	0.00	0.11	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.26	0.33	0.10	0.09	0.30	0.31	0.17
N7	0.01	0.00	0.06	0.51	0.00	0.20	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.25	0.46	0.06	0.19	0.32	0.25	0.21
N9	0.01	0.01	0.03	0.27	0.00	0.08	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.16	0.03	0.02	0.13	0.28	0.12	0.13
O2'	0.02	0.33	0.01	0.01	0.23	0.27	0.24	0.06	0.27	0.25	0.30	0.30	0.26	0.25	0.16	0.00	0.21	0.21	0.30	0.61	0.19	0.36
O3'	0.33	0.29	0.10	0.01	0.08	0.04	0.21	0.25	0.17	0.40	0.08	0.37	0.33	0.46	0.03	0.21	0.00	0.24	0.43	0.77	1.13	0.78
O4'	0.00	0.25	0.00	0.02	0.14	0.01	0.08	0.02	0.13	0.12	0.21	0.25	0.10	0.06	0.02	0.21	0.24	0.00	0.11	0.20	0.04	0.09
O5'	0.23	0.18	0.41	0.08	0.11	0.00	0.06	0.00	0.05	0.20	0.11	0.21	0.09	0.19	0.13	0.30	0.43	0.11	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.38	0.30	0.62	0.47	0.27	0.23	0.26	0.06	0.26	0.28	0.25	0.33	0.30	0.32	0.28	0.61	0.77	0.20	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.10	0.18	0.22	0.32	0.16	0.22	0.22	0.17	0.25	0.18	0.22	0.15	0.31	0.25	0.12	0.19	1.13	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.22	0.13	0.41	0.22	0.10	0.08	0.10	0.01	0.09	0.18	0.06	0.17	0.17	0.21	0.13	0.36	0.78	0.09	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.13	3.27	0.25	0.74	1.78	0.94	1.97	1.47	2.84	0.49	3.48	3.83	2.38	1.16	0.76	0.50	0.65	0.32	1.32	2.98	2.21	1.31	1.76
C2	0.06	1.46	0.12	0.23	1.10	0.32	1.33	0.20	1.63	0.62	1.67	1.41	1.14	1.04	0.58	0.54	0.20	0.12	0.35	1.71	0.27	0.48	0.22
C2'	0.07	2.95	0.32	0.74	1.46	0.91	1.57	1.46	2.41	0.21	3.08	3.61	2.12	0.75	0.49	0.54	0.57	0.44	1.45	2.54	2.33	1.56	1.93
C3'	0.26	3.34	0.19	0.53	1.76	0.71	1.86	1.30	2.74	0.38	3.47	4.09	2.46	1.00	0.76	0.43	0.42	0.19	1.26	2.88	2.26	1.47	1.82
C4	0.09	2.58	0.17	0.52	1.67	0.70	2.04	0.84	2.72	0.82	2.95	2.68	1.91	1.49	0.84	0.57	0.51	0.23	0.59	2.90	1.05	0.18	0.69
C4'	0.54	3.77	0.40	0.69	2.13	0.83	2.31	1.45	3.28	0.72	4.00	4.50	2.80	1.42	1.07	0.56	0.70	0.26	1.32	3.49	2.50	1.53	1.95
C5	0.13	2.35	0.08	0.39	1.71	0.57	2.28	0.54	2.95	1.19	2.92	2.30	1.71	1.92	0.98	0.56	0.48	0.14	0.38	3.30	0.62	0.45	0.30
C5'	0.71	3.88	0.61	0.84	2.30	0.92	2.59	1.43	3.63	1.00	4.25	4.54	2.89	1.76	1.26	0.81	0.93	0.40	1.22	3.96	2.43	1.33	1.81
C6	0.12	1.70	0.06	0.19	1.46	0.33	2.08	0.12	2.51	1.32	2.27	1.50	1.24	1.98	0.95	0.52	0.31	0.06	0.57	2.87	0.33	1.09	0.56
C8	0.16	3.02	0.17	0.61	1.92	0.82	2.45	1.03	3.37	1.06	3.61	3.22	2.16	1.87	1.01	0.57	0.68	0.23	0.73	3.79	1.40	0.32	0.91
N1	0.05	1.21	0.07	0.09	1.12	0.17	1.59	0.18	1.83	1.07	1.62	1.01	0.90	1.55	0.75	0.52	0.16	0.05	0.70	2.04	0.49	1.17	0.73
N3	0.06	2.19	0.21	0.47	1.38	0.63	1.55	0.76	2.05	0.48	2.33	2.31	1.70	1.00	0.62	0.56	0.39	0.26	0.59	2.09	0.92	0.27	0.66
N6	0.15	1.44	0.13	0.07	1.39	0.21	2.14	0.15	2.54	1.57	2.12	1.13	1.02	2.24	1.01	0.48	0.26	0.08	0.83	3.03	0.62	1.59	0.95
N7	0.17	2.67	0.09	0.48	1.87	0.67	2.51	0.72	3.33	1.28	3.35	2.69	1.91	2.11	1.07	0.56	0.59	0.16	0.45	3.84	0.88	0.32	0.45
N9	0.12	3.04	0.21	0.65	1.82	0.85	2.18	1.16	3.03	0.78	3.44	3.33	2.20	1.51	0.87	0.56	0.64	0.28	0.91	3.27	1.60	0.63	1.16
O2'	0.28	2.81	0.38	0.72	1.36	0.86	1.33	1.44	2.07	0.38	2.78	3.50	2.08	0.56	0.51	0.45	0.51	0.50	1.56	2.10	2.49	1.81	2.11
O3'	0.85	3.80	0.57	0.23	2.22	0.11	2.20	0.66	3.00	0.79	3.78	4.64	2.99	1.31	1.26	0.42	0.51	0.48	0.70	3.03	1.70	1.08	1.32
O4'	0.48	3.76	0.34	0.75	2.17	0.92	2.42	1.51	3.40	0.82	4.07	4.37	2.78	1.56	1.10	0.51	0.77	0.27	1.29	3.61	2.39	1.36	1.83
O5'	0.61	3.73	0.48	0.69	2.28	0.79	2.67	1.18	3.69	1.12	4.20	4.27	2.75	1.92	1.27	0.72	0.81	0.28	0.90	4.10	1.98	0.84	1.37
OP1	0.67	3.82	0.44	0.62	2.46	0.72	2.97	1.08	4.04	1.42	4.41	4.28	2.83	2.31	1.45	0.61	0.81	0.26	0.73	4.61	1.87	0.58	1.18
OP2	0.54	3.50	0.53	0.73	2.04	0.83	2.38	1.23	3.38	0.88	3.91	4.08	2.54	1.62	1.07	0.80	0.79	0.35	1.05	3.77	2.13	1.07	1.55
P	0.57	3.62	0.46	0.65	2.23	0.75	2.66	1.10	3.68	1.14	4.12	4.12	2.65	1.96	1.24	0.72	0.79	0.25	0.82	4.15	1.88	0.71	1.27

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.00	0.01	0.31	0.00	0.21	0.01	0.33	0.11	0.18
C2	0.02	0.00	0.38	0.13	0.00	0.32	0.00	0.42	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.37	0.29	0.45	0.34	0.01	0.34	0.14	0.24
C2'	0.00	0.38	0.00	0.00	0.21	0.01	0.12	0.17	0.19	0.17	0.31	0.44	0.37	0.07	0.03	0.00	0.02	0.02	0.39	0.15	0.64	0.51	0.49
C3'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.19	0.00	0.28	0.01	0.28	0.31	0.21	0.07	0.10	0.34	0.19	0.02	0.01	0.02	0.06	0.32	0.38	0.08	0.16
C4	0.01	0.00	0.21	0.19	0.00	0.10	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.18	0.23	0.30	0.00	0.29	0.24	0.25
C4'	0.01	0.32	0.01	0.00	0.10	0.00	0.03	0.00	0.06	0.30	0.21	0.44	0.31	0.22	0.07	0.27	0.02	0.00	0.01	0.02	0.17	0.16	0.05
C5	0.00	0.00	0.12	0.28	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.18	0.06	0.10	0.40	0.00	0.38	0.48	0.43
C5'	0.06	0.42	0.17	0.01	0.15	0.00	0.04	0.00	0.11	0.35	0.30	0.57	0.39	0.27	0.06	0.09	0.19	0.01	0.00	0.05	0.14	0.22	0.01
C6	0.01	0.00	0.19	0.28	0.00	0.06	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.10	0.08	0.20	0.39	0.00	0.38	0.49	0.41
C8	0.01	0.00	0.17	0.31	0.00	0.30	0.00	0.35	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.52	0.06	0.24	0.56	0.01	0.48	0.56	0.59
N1	0.01	0.00	0.31	0.21	0.00	0.21	0.00	0.30	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.19	0.18	0.35	0.33	0.00	0.31	0.31	0.27
N2	0.02	0.00	0.44	0.07	0.00	0.44	0.00	0.57	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.55	0.38	0.54	0.39	0.01	0.43	0.11	0.30
N3	0.02	0.00	0.37	0.10	0.00	0.31	0.00	0.39	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.37	0.32	0.44	0.32	0.00	0.36	0.11	0.24
N7	0.00	0.00	0.07	0.34	0.00	0.22	0.00	0.27	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.45	0.08	0.12	0.57	0.01	0.55	0.70	0.66
N9	0.00	0.00	0.03	0.19	0.00	0.07	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.19	0.13	0.01	0.31	0.01	0.29	0.24	0.28
O2'	0.01	0.37	0.00	0.02	0.07	0.27	0.18	0.09	0.10	0.52	0.19	0.55	0.37	0.45	0.19	0.00	0.02	0.17	0.30	0.17	0.62	0.59	0.47
O3'	0.31	0.29	0.02	0.01	0.18	0.02	0.06	0.19	0.08	0.06	0.18	0.38	0.32	0.08	0.13	0.02	0.00	0.21	0.19	0.04	0.25	0.20	0.15
O4'	0.00	0.45	0.02	0.02	0.23	0.00	0.10	0.01	0.20	0.24	0.35	0.54	0.44	0.12	0.01	0.17	0.21	0.00	0.15	0.15	0.18	0.11	0.09
O5'	0.21	0.34	0.39	0.06	0.30	0.01	0.40	0.00	0.39	0.56	0.33	0.39	0.32	0.57	0.31	0.30	0.19	0.15	0.00	0.45	0.01	0.01	0.00
O6	0.01	0.01	0.15	0.32	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.17	0.04	0.15	0.45	0.00	0.47	0.63	0.52
OP1	0.33	0.34	0.64	0.38	0.29	0.17	0.38	0.14	0.38	0.48	0.31	0.43	0.36	0.55	0.29	0.62	0.25	0.18	0.01	0.47	0.00	0.01	0.00
OP2	0.11	0.14	0.51	0.08	0.24	0.16	0.48	0.22	0.49	0.56	0.31	0.11	0.11	0.70	0.24	0.59	0.20	0.11	0.01	0.63	0.01	0.00	0.00
P	0.18	0.24	0.49	0.16	0.25	0.05	0.43	0.01	0.41	0.59	0.27	0.30	0.24	0.66	0.28	0.47	0.15	0.09	0.00	0.52	0.00	0.00	0.00