Doublet Group distance statistics: 50527

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.002, 0.010, 0.018, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.010 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.001, 0.009, 0.016, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.009 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.001, 0.011, 0.022, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.011 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.001, 0.012, 0.023, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.012 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.001, 0.014, 0.027, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.014 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.001, 0.015, 0.029, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.015 std_dev=0.014
N3	A	0, 0.001, 0.015, 0.029, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.015 std_dev=0.014
N7	A	0, 0.002, 0.017, 0.032, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.017 std_dev=0.015
N9	A	0, 0.003, 0.022, 0.041, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.022 std_dev=0.019
C8	A	0, 0.000, 0.027, 0.054, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.027 std_dev=0.027
N6	A	0, 0.002, 0.037, 0.072, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.037 std_dev=0.035
O2'	A	0, 0.035, 0.295, 0.554, 0.678 max_d=0.678 avg_d=0.295 std_dev=0.259
C2'	A	0, 0.044, 0.330, 0.616, 0.766 max_d=0.766 avg_d=0.330 std_dev=0.286
O4'	A	0, 0.068, 0.378, 0.688, 0.817 max_d=0.817 avg_d=0.378 std_dev=0.310
O4'	B	0, 0.101, 0.427, 0.753, 0.917 max_d=0.917 avg_d=0.427 std_dev=0.326
C1'	B	0, 0.157, 0.500, 0.843, 0.962 max_d=0.962 avg_d=0.500 std_dev=0.343
O2'	B	0, 0.227, 0.577, 0.926, 0.930 max_d=0.930 avg_d=0.577 std_dev=0.349
C4'	B	0, 0.150, 0.515, 0.879, 0.960 max_d=0.960 avg_d=0.515 std_dev=0.365
C2'	B	0, 0.251, 0.649, 1.047, 1.078 max_d=1.078 avg_d=0.649 std_dev=0.398
C5'	B	0, 0.238, 0.646, 1.054, 1.021 max_d=1.021 avg_d=0.646 std_dev=0.408
N9	B	0, 0.251, 0.675, 1.100, 1.173 max_d=1.173 avg_d=0.675 std_dev=0.424
N3	B	0, 0.316, 0.749, 1.182, 1.028 max_d=1.028 avg_d=0.749 std_dev=0.433
C3'	B	0, 0.274, 0.724, 1.175, 1.167 max_d=1.167 avg_d=0.724 std_dev=0.450
C4	B	0, 0.318, 0.777, 1.236, 1.190 max_d=1.190 avg_d=0.777 std_dev=0.459
O5'	B	0, 0.285, 0.770, 1.254, 1.269 max_d=1.269 avg_d=0.770 std_dev=0.484
C4'	A	0, 0.109, 0.595, 1.081, 1.312 max_d=1.312 avg_d=0.595 std_dev=0.486
C3'	A	0, 0.092, 0.589, 1.086, 1.341 max_d=1.341 avg_d=0.589 std_dev=0.497
C8	B	0, 0.300, 0.814, 1.328, 1.390 max_d=1.390 avg_d=0.814 std_dev=0.514
C2	B	0, 0.368, 0.884, 1.399, 1.286 max_d=1.286 avg_d=0.884 std_dev=0.515
O3'	B	0, 0.303, 0.831, 1.358, 1.314 max_d=1.314 avg_d=0.831 std_dev=0.527
N2	B	0, 0.355, 0.908, 1.462, 1.446 max_d=1.446 avg_d=0.908 std_dev=0.553
C5	B	0, 0.389, 0.950, 1.512, 1.419 max_d=1.419 avg_d=0.950 std_dev=0.561
P	B	0, 0.341, 0.936, 1.531, 1.471 max_d=1.471 avg_d=0.936 std_dev=0.595
N7	B	0, 0.383, 0.982, 1.580, 1.551 max_d=1.551 avg_d=0.982 std_dev=0.598
N1	B	0, 0.431, 1.032, 1.633, 1.504 max_d=1.504 avg_d=1.032 std_dev=0.601
OP1	B	0, 0.344, 0.978, 1.612, 1.571 max_d=1.571 avg_d=0.978 std_dev=0.634
C6	B	0, 0.454, 1.089, 1.724, 1.556 max_d=1.556 avg_d=1.089 std_dev=0.635
OP2	B	0, 0.430, 1.079, 1.728, 1.593 max_d=1.593 avg_d=1.079 std_dev=0.649
O3'	A	0, 0.097, 0.771, 1.445, 1.833 max_d=1.833 avg_d=0.771 std_dev=0.674
O6	B	0, 0.521, 1.260, 1.999, 1.848 max_d=1.848 avg_d=1.260 std_dev=0.739
C5'	A	0, 0.187, 0.990, 1.792, 2.172 max_d=2.172 avg_d=0.990 std_dev=0.802
O5'	A	0, 0.231, 1.158, 2.084, 2.381 max_d=2.381 avg_d=1.158 std_dev=0.926
OP2	A	0, 0.474, 1.495, 2.516, 2.817 max_d=2.817 avg_d=1.495 std_dev=1.021
P	A	0, 0.364, 1.391, 2.418, 2.830 max_d=2.830 avg_d=1.391 std_dev=1.027
OP1	A	0, 0.504, 1.914, 3.324, 3.453 max_d=3.453 avg_d=1.914 std_dev=1.410

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.03	0.03	0.01	0.15	0.04	0.55	0.17
C2	0.02	0.00	0.18	0.19	0.00	0.05	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.15	0.26	0.08	0.24	0.23	0.61	0.21
C2'	0.00	0.18	0.00	0.01	0.12	0.03	0.09	0.03	0.12	0.05	0.16	0.17	0.11	0.04	0.04	0.00	0.04	0.02	0.08	0.06	0.44	0.13
C3'	0.00	0.19	0.01	0.00	0.13	0.00	0.12	0.01	0.16	0.03	0.19	0.17	0.16	0.07	0.05	0.03	0.01	0.01	0.06	0.12	0.32	0.10
C4	0.01	0.00	0.12	0.13	0.00	0.05	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.09	0.16	0.03	0.24	0.23	0.60	0.22
C4'	0.01	0.05	0.03	0.00	0.05	0.00	0.06	0.00	0.06	0.06	0.06	0.05	0.08	0.07	0.04	0.05	0.04	0.00	0.03	0.20	0.38	0.10
C5	0.01	0.01	0.09	0.12	0.00	0.06	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.08	0.14	0.01	0.25	0.37	0.60	0.27
C5'	0.04	0.09	0.03	0.01	0.09	0.00	0.10	0.00	0.10	0.12	0.09	0.08	0.12	0.13	0.08	0.05	0.06	0.02	0.01	0.32	0.18	0.01
C6	0.01	0.00	0.12	0.16	0.00	0.06	0.01	0.10	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.19	0.03	0.25	0.42	0.60	0.27
C8	0.02	0.01	0.05	0.03	0.01	0.06	0.01	0.12	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.05	0.02	0.07	0.24	0.31	0.58	0.28
N1	0.01	0.00	0.16	0.19	0.00	0.06	0.01	0.09	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.14	0.24	0.05	0.25	0.34	0.61	0.24
N3	0.02	0.00	0.17	0.17	0.00	0.05	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.14	0.23	0.08	0.23	0.16	0.60	0.19
N6	0.02	0.01	0.11	0.16	0.01	0.08	0.01	0.12	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.10	0.18	0.03	0.25	0.53	0.59	0.31
N7	0.02	0.01	0.04	0.07	0.00	0.07	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.05	0.05	0.05	0.25	0.44	0.59	0.31
N9	0.01	0.00	0.04	0.05	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.06	0.01	0.22	0.17	0.58	0.22
O2'	0.03	0.15	0.00	0.03	0.09	0.05	0.08	0.05	0.11	0.05	0.14	0.14	0.10	0.05	0.05	0.00	0.08	0.04	0.07	0.18	0.42	0.09
O3'	0.03	0.26	0.04	0.01	0.16	0.04	0.14	0.06	0.19	0.02	0.24	0.23	0.18	0.05	0.06	0.08	0.00	0.03	0.15	0.23	0.23	0.09
O4'	0.01	0.08	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.02	0.03	0.07	0.05	0.08	0.03	0.05	0.01	0.04	0.03	0.00	0.13	0.07	0.57	0.18
O5'	0.15	0.24	0.08	0.06	0.24	0.03	0.25	0.01	0.25	0.24	0.25	0.23	0.25	0.25	0.22	0.07	0.15	0.13	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.04	0.23	0.06	0.12	0.23	0.20	0.37	0.32	0.42	0.31	0.34	0.16	0.53	0.44	0.17	0.18	0.23	0.07	0.02	0.00	0.05	0.01
OP2	0.55	0.61	0.44	0.32	0.60	0.38	0.60	0.18	0.60	0.58	0.61	0.60	0.59	0.59	0.58	0.42	0.23	0.57	0.01	0.05	0.00	0.00
P	0.17	0.21	0.13	0.10	0.22	0.10	0.27	0.01	0.27	0.28	0.24	0.19	0.31	0.31	0.22	0.09	0.09	0.18	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.06	0.25	0.19	0.06	0.13	0.10	0.12	0.21	0.16	0.04	0.23	0.33	0.21	0.06	0.07	0.25	0.11	0.12	0.16	0.15	0.23	0.22	0.23
C2	0.06	0.12	0.11	0.14	0.06	0.21	0.05	0.31	0.04	0.11	0.08	0.18	0.12	0.10	0.05	0.21	0.12	0.18	0.22	0.05	0.26	0.27	0.27
C2'	0.29	0.34	0.42	0.33	0.29	0.25	0.27	0.25	0.28	0.26	0.32	0.40	0.33	0.25	0.29	0.42	0.39	0.22	0.35	0.26	0.41	0.39	0.41
C3'	0.32	0.38	0.51	0.42	0.31	0.29	0.27	0.27	0.29	0.25	0.34	0.45	0.37	0.23	0.30	0.54	0.52	0.23	0.36	0.27	0.44	0.38	0.42
C4	0.03	0.16	0.11	0.07	0.06	0.19	0.04	0.30	0.06	0.08	0.12	0.23	0.14	0.06	0.03	0.21	0.03	0.17	0.22	0.05	0.27	0.27	0.28
C4'	0.15	0.34	0.35	0.23	0.21	0.09	0.19	0.15	0.24	0.08	0.31	0.43	0.29	0.12	0.14	0.40	0.33	0.06	0.17	0.24	0.25	0.19	0.23
C5	0.03	0.15	0.07	0.13	0.04	0.23	0.03	0.36	0.04	0.11	0.10	0.22	0.12	0.09	0.03	0.20	0.10	0.19	0.26	0.03	0.31	0.30	0.30
C5'	0.16	0.34	0.37	0.24	0.21	0.07	0.20	0.12	0.26	0.10	0.32	0.43	0.29	0.14	0.15	0.45	0.36	0.03	0.13	0.26	0.23	0.15	0.19
C6	0.05	0.13	0.08	0.19	0.05	0.27	0.06	0.40	0.04	0.13	0.08	0.20	0.11	0.12	0.05	0.19	0.18	0.19	0.27	0.05	0.32	0.30	0.31
C8	0.00	0.19	0.11	0.06	0.06	0.20	0.04	0.34	0.08	0.08	0.15	0.27	0.14	0.06	0.02	0.20	0.05	0.18	0.25	0.07	0.31	0.29	0.30
N1	0.07	0.12	0.10	0.21	0.06	0.28	0.07	0.40	0.06	0.14	0.08	0.18	0.12	0.13	0.07	0.20	0.21	0.19	0.26	0.07	0.30	0.30	0.30
N3	0.04	0.15	0.12	0.07	0.06	0.16	0.04	0.26	0.05	0.08	0.11	0.21	0.13	0.06	0.03	0.22	0.04	0.16	0.20	0.04	0.25	0.26	0.26
N6	0.06	0.13	0.09	0.23	0.06	0.28	0.06	0.43	0.05	0.13	0.08	0.20	0.12	0.13	0.06	0.18	0.24	0.17	0.28	0.06	0.33	0.30	0.31
N7	0.01	0.17	0.08	0.11	0.05	0.23	0.03	0.37	0.05	0.10	0.13	0.25	0.13	0.08	0.02	0.20	0.09	0.18	0.26	0.04	0.32	0.30	0.31
N9	0.02	0.20	0.13	0.02	0.08	0.17	0.06	0.28	0.10	0.06	0.16	0.27	0.16	0.05	0.03	0.21	0.02	0.16	0.21	0.09	0.27	0.26	0.27
O2'	0.29	0.35	0.42	0.36	0.30	0.27	0.28	0.27	0.29	0.27	0.33	0.41	0.34	0.26	0.29	0.37	0.41	0.24	0.35	0.27	0.40	0.38	0.40
O3'	0.47	0.52	0.68	0.61	0.46	0.45	0.42	0.40	0.43	0.40	0.48	0.59	0.52	0.38	0.45	0.68	0.72	0.36	0.48	0.40	0.54	0.48	0.52
O4'	0.10	0.31	0.21	0.07	0.19	0.14	0.19	0.26	0.24	0.12	0.30	0.39	0.25	0.16	0.13	0.27	0.12	0.17	0.14	0.25	0.18	0.16	0.17
O5'	0.28	0.41	0.46	0.32	0.32	0.14	0.30	0.03	0.34	0.22	0.39	0.48	0.38	0.25	0.27	0.55	0.43	0.11	0.15	0.34	0.25	0.16	0.21
OP1	0.17	0.39	0.34	0.30	0.16	0.37	0.15	0.51	0.27	0.09	0.38	0.53	0.28	0.08	0.09	0.43	0.43	0.29	0.47	0.29	0.63	0.48	0.55
OP2	0.58	0.34	0.57	0.62	0.51	0.70	0.54	0.80	0.47	0.66	0.37	0.25	0.41	0.63	0.59	0.57	0.64	0.70	0.84	0.49	0.92	0.90	0.91
P	0.21	0.20	0.36	0.29	0.12	0.29	0.07	0.39	0.07	0.16	0.15	0.30	0.19	0.12	0.16	0.45	0.40	0.26	0.40	0.06	0.51	0.43	0.46

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.03	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.07	0.01	0.08	0.09	0.08
C2	0.03	0.00	0.06	0.12	0.00	0.05	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.09	0.15	0.02	0.07	0.01	0.07	0.16	0.09
C2'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.03	0.03	0.01	0.02	0.02	0.03	0.04	0.07	0.07	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.09	0.02	0.11	0.18	0.09
C3'	0.01	0.12	0.01	0.00	0.09	0.00	0.08	0.02	0.10	0.05	0.12	0.13	0.11	0.06	0.05	0.01	0.01	0.01	0.16	0.10	0.18	0.22	0.17
C4	0.01	0.00	0.03	0.09	0.00	0.05	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.10	0.01	0.09	0.00	0.09	0.15	0.10
C4'	0.01	0.05	0.03	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.06	0.05	0.06	0.05	0.04	0.06	0.03	0.06	0.03	0.00	0.02	0.08	0.05	0.04	0.02
C5	0.01	0.01	0.01	0.08	0.00	0.06	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.09	0.02	0.11	0.01	0.12	0.18	0.13
C5'	0.02	0.06	0.02	0.02	0.05	0.01	0.08	0.00	0.09	0.07	0.08	0.05	0.04	0.08	0.04	0.06	0.02	0.02	0.00	0.11	0.08	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.02	0.10	0.00	0.06	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.05	0.12	0.02	0.12	0.00	0.12	0.20	0.14
C8	0.02	0.01	0.03	0.05	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.05	0.04	0.13	0.01	0.13	0.17	0.14
N1	0.02	0.00	0.04	0.12	0.00	0.06	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.14	0.01	0.09	0.01	0.09	0.18	0.11
N2	0.03	0.00	0.07	0.13	0.00	0.05	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.11	0.17	0.03	0.06	0.01	0.05	0.15	0.07
N3	0.03	0.00	0.07	0.11	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.14	0.03	0.06	0.00	0.06	0.14	0.08
N7	0.02	0.01	0.02	0.06	0.00	0.06	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.06	0.04	0.14	0.02	0.14	0.20	0.15
N9	0.01	0.00	0.01	0.05	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.06	0.01	0.09	0.01	0.09	0.13	0.10
O2'	0.01	0.09	0.01	0.01	0.04	0.06	0.03	0.06	0.05	0.02	0.08	0.11	0.07	0.02	0.01	0.00	0.05	0.03	0.04	0.05	0.05	0.10	0.04
O3'	0.03	0.15	0.03	0.01	0.10	0.03	0.09	0.02	0.12	0.05	0.14	0.17	0.14	0.06	0.06	0.05	0.00	0.03	0.20	0.11	0.27	0.28	0.23
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.04	0.01	0.03	0.03	0.04	0.01	0.03	0.03	0.00	0.12	0.03	0.15	0.12	0.15
O5'	0.07	0.07	0.09	0.16	0.09	0.02	0.11	0.00	0.12	0.13	0.09	0.06	0.06	0.14	0.09	0.04	0.20	0.12	0.00	0.13	0.01	0.02	0.01
O6	0.01	0.01	0.02	0.10	0.00	0.08	0.01	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.05	0.11	0.03	0.13	0.00	0.14	0.21	0.15
OP1	0.08	0.07	0.11	0.18	0.09	0.05	0.12	0.08	0.12	0.13	0.09	0.05	0.06	0.14	0.09	0.05	0.27	0.15	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00
OP2	0.09	0.16	0.18	0.22	0.15	0.04	0.18	0.02	0.20	0.17	0.18	0.15	0.14	0.20	0.13	0.10	0.28	0.12	0.02	0.21	0.01	0.00	0.00
P	0.08	0.09	0.09	0.17	0.10	0.02	0.13	0.01	0.14	0.14	0.11	0.07	0.08	0.15	0.10	0.04	0.23	0.15	0.01	0.15	0.00	0.00	0.00