Doublet Group distance statistics: 50528

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.003, 0.015, 0.027, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.015 std_dev=0.012
C6	A	0, 0.005, 0.018, 0.031, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.018 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.006, 0.023, 0.040, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.023 std_dev=0.017
N3	A	0, 0.007, 0.024, 0.042, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.024 std_dev=0.017
N1	A	0, 0.006, 0.023, 0.041, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.023 std_dev=0.018
C5	A	0, 0.005, 0.023, 0.041, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.023 std_dev=0.018
N9	A	0, 0.011, 0.039, 0.067, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.039 std_dev=0.028
C4	A	0, 0.008, 0.038, 0.067, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.038 std_dev=0.029
N7	A	0, 0.008, 0.050, 0.092, 0.102 max_d=0.102 avg_d=0.050 std_dev=0.042
N6	A	0, 0.021, 0.073, 0.124, 0.111 max_d=0.111 avg_d=0.073 std_dev=0.052
C8	A	0, 0.012, 0.067, 0.123, 0.136 max_d=0.136 avg_d=0.067 std_dev=0.056
O4'	A	0, 0.027, 0.286, 0.546, 0.628 max_d=0.628 avg_d=0.286 std_dev=0.260
O2'	B	0, 0.116, 0.418, 0.720, 0.703 max_d=0.703 avg_d=0.418 std_dev=0.302
C2'	A	0, -0.055, 0.289, 0.634, 0.773 max_d=0.773 avg_d=0.289 std_dev=0.344
C4'	A	0, 0.087, 0.470, 0.853, 0.938 max_d=0.938 avg_d=0.470 std_dev=0.383
O2'	A	0, -0.001, 0.386, 0.773, 0.915 max_d=0.915 avg_d=0.386 std_dev=0.387
C3'	A	0, 0.041, 0.510, 0.979, 1.132 max_d=1.132 avg_d=0.510 std_dev=0.469
C2'	B	0, 0.229, 0.783, 1.337, 1.191 max_d=1.191 avg_d=0.783 std_dev=0.554
O5'	A	0, 0.202, 0.804, 1.406, 1.449 max_d=1.449 avg_d=0.804 std_dev=0.602
C5'	A	0, 0.142, 0.819, 1.496, 1.659 max_d=1.659 avg_d=0.819 std_dev=0.677
O3'	A	0, 0.049, 0.730, 1.410, 1.638 max_d=1.638 avg_d=0.730 std_dev=0.680
OP2	A	0, 0.276, 0.957, 1.638, 1.528 max_d=1.528 avg_d=0.957 std_dev=0.681
P	A	0, 0.250, 0.985, 1.721, 1.767 max_d=1.767 avg_d=0.985 std_dev=0.736
OP1	A	0, 0.356, 1.316, 2.276, 2.264 max_d=2.264 avg_d=1.316 std_dev=0.960
C1'	B	0, 0.380, 1.472, 2.565, 2.615 max_d=2.615 avg_d=1.472 std_dev=1.093
C3'	B	0, 0.452, 1.713, 2.974, 3.000 max_d=3.000 avg_d=1.713 std_dev=1.261
O4'	B	0, 0.613, 2.130, 3.647, 3.419 max_d=3.419 avg_d=2.130 std_dev=1.517
C8	B	0, 0.544, 2.110, 3.676, 3.748 max_d=3.748 avg_d=2.110 std_dev=1.566
C4'	B	0, 0.681, 2.348, 4.016, 3.707 max_d=3.707 avg_d=2.348 std_dev=1.667
N9	B	0, 0.633, 2.308, 3.983, 3.924 max_d=3.924 avg_d=2.308 std_dev=1.675
N7	B	0, 0.879, 3.122, 5.364, 5.168 max_d=5.168 avg_d=3.122 std_dev=2.243
O3'	B	0, 0.964, 3.336, 5.707, 5.305 max_d=5.305 avg_d=3.336 std_dev=2.371
C5'	B	0, 1.044, 3.594, 6.144, 5.650 max_d=5.650 avg_d=3.594 std_dev=2.550
OP2	B	0, 1.128, 3.863, 6.598, 5.953 max_d=5.953 avg_d=3.863 std_dev=2.735
C4	B	0, 1.114, 3.863, 6.612, 6.170 max_d=6.170 avg_d=3.863 std_dev=2.749
O5'	B	0, 1.155, 3.948, 6.740, 6.022 max_d=6.022 avg_d=3.948 std_dev=2.793
C5	B	0, 1.262, 4.356, 7.450, 6.896 max_d=6.896 avg_d=4.356 std_dev=3.094
N3	B	0, 1.407, 4.849, 8.291, 7.644 max_d=7.644 avg_d=4.849 std_dev=3.442
P	B	0, 1.477, 5.047, 8.618, 7.695 max_d=7.695 avg_d=5.047 std_dev=3.570
C6	B	0, 1.771, 6.070, 10.370, 9.412 max_d=9.412 avg_d=6.070 std_dev=4.300
C2	B	0, 1.895, 6.499, 11.104, 10.101 max_d=10.101 avg_d=6.499 std_dev=4.605
OP1	B	0, 1.933, 6.620, 11.308, 10.223 max_d=10.223 avg_d=6.620 std_dev=4.687
O6	B	0, 1.968, 6.737, 11.506, 10.386 max_d=10.386 avg_d=6.737 std_dev=4.769
N1	B	0, 2.075, 7.105, 12.135, 10.966 max_d=10.966 avg_d=7.105 std_dev=5.030
N2	B	0, 2.252, 7.720, 13.188, 11.973 max_d=11.973 avg_d=7.720 std_dev=5.468

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.05	0.04	0.06	0.06
C2	0.04	0.00	0.18	0.14	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.22	0.20	0.03	0.09	0.11	0.21	0.14
C2'	0.00	0.18	0.00	0.00	0.08	0.00	0.01	0.01	0.04	0.11	0.12	0.19	0.02	0.09	0.02	0.00	0.01	0.00	0.07	0.05	0.09	0.06
C3'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.06	0.00	0.07	0.01	0.07	0.17	0.10	0.15	0.11	0.15	0.05	0.01	0.00	0.01	0.13	0.09	0.13	0.11
C4	0.02	0.01	0.08	0.06	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.10	0.08	0.02	0.08	0.10	0.18	0.13
C4'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.05	0.10	0.03	0.05	0.09	0.10	0.04	0.03	0.01	0.00	0.00	0.04	0.00	0.00
C5	0.01	0.01	0.01	0.07	0.00	0.06	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.08	0.01	0.13	0.18	0.26	0.20
C5'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.06	0.00	0.12	0.00	0.12	0.13	0.09	0.03	0.16	0.15	0.06	0.03	0.01	0.01	0.01	0.07	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.04	0.07	0.00	0.05	0.01	0.12	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.07	0.08	0.02	0.15	0.21	0.31	0.23
C8	0.01	0.01	0.11	0.17	0.00	0.10	0.01	0.13	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.00	0.08	0.18	0.02	0.12	0.15	0.19	0.16
N1	0.03	0.00	0.12	0.10	0.01	0.03	0.01	0.09	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.15	0.14	0.02	0.13	0.17	0.28	0.20
N3	0.04	0.00	0.19	0.15	0.00	0.05	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.22	0.20	0.04	0.07	0.07	0.16	0.10
N6	0.01	0.01	0.02	0.11	0.01	0.09	0.01	0.16	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.03	0.11	0.03	0.20	0.29	0.38	0.29
N7	0.01	0.01	0.09	0.15	0.01	0.10	0.00	0.15	0.02	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.01	0.06	0.17	0.01	0.16	0.22	0.28	0.22
N9	0.00	0.01	0.02	0.05	0.00	0.04	0.01	0.06	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.01	0.06	0.07	0.13	0.09
O2'	0.01	0.22	0.00	0.01	0.10	0.03	0.03	0.03	0.07	0.08	0.15	0.22	0.03	0.06	0.01	0.00	0.02	0.03	0.05	0.04	0.07	0.05
O3'	0.01	0.20	0.01	0.00	0.08	0.01	0.08	0.01	0.08	0.18	0.14	0.20	0.11	0.17	0.05	0.02	0.00	0.01	0.18	0.16	0.18	0.16
O4'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.04	0.03	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.13	0.11	0.11	0.11
O5'	0.05	0.09	0.07	0.13	0.08	0.00	0.13	0.01	0.15	0.12	0.13	0.07	0.20	0.16	0.06	0.05	0.18	0.13	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.04	0.11	0.05	0.09	0.10	0.04	0.18	0.07	0.21	0.15	0.17	0.07	0.29	0.22	0.07	0.04	0.16	0.11	0.01	0.00	0.02	0.00
OP2	0.06	0.21	0.09	0.13	0.18	0.00	0.26	0.02	0.31	0.19	0.28	0.16	0.38	0.28	0.13	0.07	0.18	0.11	0.01	0.02	0.00	0.01
P	0.06	0.14	0.06	0.11	0.13	0.00	0.20	0.01	0.23	0.16	0.20	0.10	0.29	0.22	0.09	0.05	0.16	0.11	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.43	1.99	0.11	0.54	1.21	0.70	1.23	1.00	1.62	0.54	1.98	2.40	1.59	0.83	0.72	0.04	1.00	0.28	1.07	1.65	1.62	0.96	1.22
C2	0.26	1.14	0.09	0.38	0.73	0.46	0.69	0.59	0.87	0.30	1.07	1.32	0.99	0.45	0.43	0.09	0.71	0.12	0.64	0.85	0.80	0.55	0.67
C2'	0.44	2.03	0.27	0.64	1.17	0.92	1.18	1.26	1.61	0.49	2.01	2.50	1.59	0.74	0.67	0.22	0.99	0.54	1.38	1.64	1.96	1.25	1.56
C3'	0.38	2.02	0.23	0.62	1.15	0.90	1.18	1.24	1.63	0.46	2.03	2.48	1.55	0.74	0.63	0.18	0.97	0.49	1.39	1.68	2.01	1.27	1.59
C4	0.31	1.47	0.05	0.45	0.90	0.53	0.89	0.73	1.15	0.38	1.42	1.75	1.21	0.59	0.54	0.10	0.85	0.16	0.81	1.15	1.13	0.71	0.89
C4'	0.43	2.15	0.16	0.55	1.29	0.74	1.35	1.09	1.80	0.59	2.19	2.58	1.68	0.91	0.76	0.06	0.99	0.31	1.20	1.87	1.87	1.11	1.40
C5	0.26	1.16	0.11	0.39	0.72	0.40	0.71	0.55	0.92	0.31	1.12	1.39	0.96	0.47	0.43	0.16	0.74	0.11	0.66	0.92	0.91	0.59	0.72
C5'	0.39	2.07	0.08	0.53	1.25	0.68	1.32	1.01	1.77	0.58	2.13	2.48	1.61	0.90	0.74	0.07	0.99	0.20	1.14	1.85	1.80	1.05	1.33
C6	0.20	0.84	0.16	0.32	0.52	0.27	0.51	0.37	0.66	0.23	0.80	0.99	0.70	0.34	0.32	0.20	0.60	0.08	0.49	0.66	0.62	0.44	0.52
C8	0.32	1.50	0.06	0.46	0.91	0.51	0.93	0.73	1.22	0.41	1.49	1.81	1.21	0.63	0.54	0.13	0.87	0.16	0.85	1.24	1.24	0.76	0.94
N1	0.19	0.79	0.16	0.30	0.50	0.28	0.48	0.36	0.61	0.22	0.75	0.92	0.68	0.32	0.31	0.19	0.55	0.06	0.46	0.60	0.55	0.42	0.47
N3	0.33	1.53	0.05	0.47	0.96	0.59	0.93	0.79	1.18	0.39	1.45	1.81	1.29	0.61	0.56	0.05	0.88	0.17	0.83	1.17	1.13	0.72	0.90
N6	0.16	0.59	0.20	0.28	0.37	0.15	0.37	0.20	0.47	0.18	0.58	0.71	0.50	0.25	0.24	0.23	0.50	0.09	0.35	0.47	0.43	0.34	0.36
N7	0.27	1.22	0.11	0.40	0.75	0.40	0.76	0.58	0.99	0.34	1.20	1.47	0.99	0.51	0.45	0.17	0.77	0.12	0.70	1.00	0.99	0.63	0.77
N9	0.35	1.68	0.04	0.49	1.02	0.59	1.03	0.84	1.34	0.45	1.65	2.02	1.35	0.69	0.60	0.08	0.93	0.19	0.92	1.36	1.35	0.82	1.03
O2'	0.60	2.33	0.43	0.70	1.38	1.01	1.40	1.39	1.87	0.66	2.32	2.84	1.83	0.93	0.85	0.34	1.02	0.65	1.48	1.91	2.17	1.37	1.70
O3'	0.45	2.11	0.35	0.69	1.18	1.03	1.22	1.40	1.71	0.51	2.14	2.61	1.61	0.77	0.66	0.29	0.98	0.65	1.58	1.77	2.26	1.47	1.82
O4'	0.47	2.07	0.10	0.50	1.29	0.61	1.34	0.93	1.75	0.63	2.10	2.46	1.65	0.94	0.79	0.05	1.01	0.18	1.00	1.80	1.62	0.91	1.16
O5'	0.31	1.81	0.02	0.55	1.08	0.67	1.14	0.96	1.53	0.47	1.86	2.19	1.41	0.76	0.62	0.15	0.99	0.22	1.10	1.60	1.67	1.01	1.26
OP1	0.31	1.85	0.02	0.54	1.11	0.66	1.19	0.95	1.61	0.51	1.93	2.22	1.42	0.82	0.64	0.17	0.98	0.20	1.10	1.71	1.72	1.02	1.28
OP2	0.18	1.45	0.22	0.61	0.83	0.65	0.88	0.87	1.22	0.32	1.49	1.76	1.10	0.57	0.43	0.35	1.03	0.16	1.03	1.28	1.51	0.93	1.15
P	0.27	1.70	0.10	0.57	1.01	0.64	1.08	0.90	1.46	0.44	1.75	2.04	1.31	0.73	0.57	0.24	1.02	0.13	1.04	1.53	1.61	0.96	1.20

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.05	0.07	0.05	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.14	0.03	0.15	0.07	0.08
C2	0.05	0.00	0.09	0.08	0.02	0.05	0.02	0.05	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.16	0.10	0.04	0.33	0.01	0.30	0.28	0.30
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.06	0.12	0.08	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.18	0.01	0.23	0.04	0.15
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.06	0.01	0.09	0.01	0.08	0.12	0.07	0.11	0.07	0.12	0.06	0.01	0.00	0.01	0.23	0.10	0.29	0.04	0.19
C4	0.02	0.02	0.03	0.06	0.00	0.02	0.01	0.07	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.07	0.06	0.01	0.34	0.02	0.30	0.25	0.30
C4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.00	0.05	0.01	0.04	0.08	0.02	0.09	0.05	0.09	0.03	0.03	0.03	0.00	0.01	0.05	0.11	0.19	0.02
C5	0.01	0.02	0.01	0.09	0.01	0.05	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.00	0.05	0.11	0.01	0.43	0.01	0.40	0.38	0.41
C5'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.07	0.01	0.13	0.00	0.12	0.15	0.08	0.05	0.03	0.17	0.07	0.04	0.02	0.01	0.01	0.14	0.14	0.26	0.01
C6	0.03	0.01	0.02	0.08	0.01	0.04	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.11	0.02	0.45	0.00	0.43	0.44	0.45
C8	0.01	0.03	0.04	0.12	0.01	0.08	0.00	0.15	0.01	0.00	0.02	0.04	0.02	0.00	0.01	0.02	0.13	0.02	0.42	0.01	0.36	0.26	0.36
N1	0.05	0.00	0.06	0.07	0.02	0.02	0.01	0.08	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.13	0.09	0.04	0.41	0.01	0.38	0.39	0.39
N2	0.07	0.01	0.12	0.11	0.03	0.09	0.02	0.05	0.01	0.04	0.00	0.00	0.02	0.03	0.04	0.21	0.15	0.06	0.29	0.01	0.28	0.26	0.27
N3	0.05	0.01	0.08	0.07	0.01	0.05	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.15	0.09	0.04	0.29	0.01	0.26	0.21	0.25
N7	0.01	0.02	0.03	0.12	0.01	0.09	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.00	0.01	0.00	0.15	0.02	0.47	0.01	0.44	0.42	0.46
N9	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.03	0.00	0.07	0.01	0.01	0.02	0.04	0.02	0.01	0.00	0.02	0.06	0.01	0.32	0.02	0.27	0.16	0.25
O2'	0.00	0.16	0.00	0.01	0.07	0.03	0.05	0.04	0.09	0.02	0.13	0.21	0.15	0.00	0.02	0.00	0.04	0.04	0.05	0.08	0.09	0.08	0.04
O3'	0.02	0.10	0.01	0.00	0.06	0.03	0.11	0.02	0.11	0.13	0.09	0.15	0.09	0.15	0.06	0.04	0.00	0.02	0.16	0.14	0.27	0.05	0.16
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.06	0.04	0.02	0.01	0.04	0.02	0.00	0.04	0.02	0.08	0.22	0.05
O5'	0.14	0.33	0.18	0.23	0.34	0.01	0.43	0.01	0.45	0.42	0.41	0.29	0.29	0.47	0.32	0.05	0.16	0.04	0.00	0.49	0.01	0.01	0.01
O6	0.03	0.01	0.01	0.10	0.02	0.05	0.01	0.14	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.08	0.14	0.02	0.49	0.00	0.49	0.52	0.51
OP1	0.15	0.30	0.23	0.29	0.30	0.11	0.40	0.14	0.43	0.36	0.38	0.28	0.26	0.44	0.27	0.09	0.27	0.08	0.01	0.49	0.00	0.00	0.00
OP2	0.07	0.28	0.04	0.04	0.25	0.19	0.38	0.26	0.44	0.26	0.39	0.26	0.21	0.42	0.16	0.08	0.05	0.22	0.01	0.52	0.00	0.00	0.00
P	0.08	0.30	0.15	0.19	0.30	0.02	0.41	0.01	0.45	0.36	0.39	0.27	0.25	0.46	0.25	0.04	0.16	0.05	0.01	0.51	0.00	0.00	0.00