Doublet Group distance statistics: 50534

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.000, 0.001, 0.002, 0.002 max_d=0.002 avg_d=0.001 std_dev=0.001
C6	A	0, 0.000, 0.002, 0.004, 0.004 max_d=0.004 avg_d=0.002 std_dev=0.002
C1'	A	0, 0.000, 0.002, 0.005, 0.005 max_d=0.005 avg_d=0.002 std_dev=0.002
N3	A	0, 0.000, 0.004, 0.008, 0.008 max_d=0.008 avg_d=0.004 std_dev=0.004
N1	A	0, 0.000, 0.004, 0.008, 0.008 max_d=0.008 avg_d=0.004 std_dev=0.004
C4	A	0, 0.000, 0.005, 0.011, 0.011 max_d=0.011 avg_d=0.005 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.000, 0.007, 0.015, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.007 std_dev=0.007
N9	A	0, 0.000, 0.012, 0.024, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.012 std_dev=0.012
C8	A	0, 0.000, 0.012, 0.025, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.012 std_dev=0.012
N6	A	0, 0.000, 0.014, 0.029, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.014 std_dev=0.014
N7	A	0, 0.000, 0.018, 0.036, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.018 std_dev=0.018
O2'	B	0, 0.000, 0.446, 0.892, 0.892 max_d=0.892 avg_d=0.446 std_dev=0.446
C2'	B	0, 0.000, 0.481, 0.963, 0.963 max_d=0.963 avg_d=0.481 std_dev=0.481
O4'	B	0, 0.000, 0.514, 1.028, 1.028 max_d=1.028 avg_d=0.514 std_dev=0.514
C1'	B	0, 0.000, 0.591, 1.183, 1.183 max_d=1.183 avg_d=0.591 std_dev=0.591
O4'	A	0, 0.000, 1.288, 2.575, 2.575 max_d=2.575 avg_d=1.288 std_dev=1.288
C2'	A	0, 0.000, 1.344, 2.689, 2.689 max_d=2.689 avg_d=1.344 std_dev=1.344
C3'	B	0, 0.000, 1.518, 3.037, 3.037 max_d=3.037 avg_d=1.518 std_dev=1.518
C4'	B	0, 0.000, 1.703, 3.405, 3.405 max_d=3.405 avg_d=1.703 std_dev=1.703
C4'	A	0, 0.000, 1.771, 3.542, 3.542 max_d=3.542 avg_d=1.771 std_dev=1.771
N9	B	0, 0.000, 1.830, 3.661, 3.661 max_d=3.661 avg_d=1.830 std_dev=1.830
C3'	A	0, 0.000, 1.848, 3.696, 3.696 max_d=3.696 avg_d=1.848 std_dev=1.848
O2'	A	0, 0.000, 1.949, 3.898, 3.898 max_d=3.898 avg_d=1.949 std_dev=1.949
O3'	A	0, 0.000, 1.972, 3.943, 3.943 max_d=3.943 avg_d=1.972 std_dev=1.972
O3'	B	0, 0.000, 2.096, 4.192, 4.192 max_d=4.192 avg_d=2.096 std_dev=2.096
C8	B	0, 0.000, 2.603, 5.207, 5.207 max_d=5.207 avg_d=2.603 std_dev=2.603
C5'	B	0, 0.000, 2.651, 5.303, 5.303 max_d=5.303 avg_d=2.651 std_dev=2.651
C4	B	0, 0.000, 2.980, 5.959, 5.959 max_d=5.959 avg_d=2.980 std_dev=2.980
C5'	A	0, 0.000, 3.236, 6.471, 6.471 max_d=6.471 avg_d=3.236 std_dev=3.236
O5'	B	0, 0.000, 3.546, 7.092, 7.092 max_d=7.092 avg_d=3.546 std_dev=3.546
O5'	A	0, 0.000, 3.565, 7.130, 7.130 max_d=7.130 avg_d=3.565 std_dev=3.565
N3	B	0, 0.000, 3.581, 7.162, 7.162 max_d=7.162 avg_d=3.581 std_dev=3.581
N7	B	0, 0.000, 3.753, 7.507, 7.507 max_d=7.507 avg_d=3.753 std_dev=3.753
C5	B	0, 0.000, 3.896, 7.792, 7.792 max_d=7.792 avg_d=3.896 std_dev=3.896
OP2	B	0, 0.000, 4.269, 8.538, 8.538 max_d=8.538 avg_d=4.269 std_dev=4.269
P	B	0, 0.000, 4.391, 8.781, 8.781 max_d=8.781 avg_d=4.391 std_dev=4.391
C2	B	0, 0.000, 4.819, 9.638, 9.638 max_d=9.638 avg_d=4.819 std_dev=4.819
OP1	B	0, 0.000, 4.822, 9.644, 9.644 max_d=9.644 avg_d=4.822 std_dev=4.822
OP2	A	0, 0.000, 5.025, 10.050, 10.050 max_d=10.050 avg_d=5.025 std_dev=5.025
P	A	0, 0.000, 5.046, 10.092, 10.092 max_d=10.092 avg_d=5.046 std_dev=5.046
C6	B	0, 0.000, 5.165, 10.329, 10.329 max_d=10.329 avg_d=5.165 std_dev=5.165
N1	B	0, 0.000, 5.459, 10.917, 10.917 max_d=10.917 avg_d=5.459 std_dev=5.459
N2	B	0, 0.000, 5.765, 11.530, 11.530 max_d=11.530 avg_d=5.765 std_dev=5.765
OP1	A	0, 0.000, 5.982, 11.963, 11.963 max_d=11.963 avg_d=5.982 std_dev=5.982
O6	B	0, 0.000, 6.155, 12.310, 12.310 max_d=12.310 avg_d=6.155 std_dev=6.155

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.20	0.00	0.02	0.17	0.17	0.05
C2	0.00	0.00	0.25	0.39	0.00	0.57	0.00	1.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.12	0.32	0.35	1.08	1.79	1.70	1.46
C2'	0.00	0.25	0.00	0.01	0.12	0.01	0.04	0.14	0.09	0.13	0.18	0.26	0.05	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.12	0.16	0.03	0.02
C3'	0.00	0.39	0.01	0.00	0.07	0.00	0.13	0.00	0.01	0.48	0.21	0.40	0.13	0.41	0.16	0.02	0.01	0.01	0.38	0.12	0.34	0.30
C4	0.00	0.00	0.12	0.07	0.00	0.23	0.00	0.48	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.16	0.14	0.19	0.42	0.78	0.75	0.57
C4'	0.01	0.57	0.01	0.00	0.23	0.00	0.05	0.00	0.19	0.37	0.42	0.56	0.09	0.25	0.05	0.23	0.00	0.00	0.01	0.07	0.06	0.00
C5	0.00	0.00	0.04	0.13	0.00	0.05	0.00	0.21	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.21	0.03	0.08	0.12	0.45	0.42	0.24
C5'	0.05	1.10	0.14	0.00	0.48	0.00	0.21	0.00	0.46	0.49	0.85	1.02	0.29	0.31	0.02	0.08	0.17	0.00	0.00	0.11	0.09	0.00
C6	0.00	0.00	0.09	0.01	0.00	0.19	0.00	0.46	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.22	0.03	0.16	0.40	0.87	0.83	0.61
C8	0.00	0.00	0.13	0.48	0.01	0.37	0.00	0.49	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.20	0.22	0.19	0.63	0.50	0.54	0.65
N1	0.00	0.00	0.18	0.21	0.00	0.42	0.01	0.85	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.18	0.19	0.28	0.83	1.50	1.44	1.18
N3	0.00	0.00	0.26	0.40	0.00	0.56	0.00	1.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.09	0.34	0.35	0.97	1.51	1.42	1.24
N6	0.00	0.00	0.05	0.13	0.00	0.09	0.00	0.29	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.25	0.06	0.10	0.20	0.63	0.57	0.38
N7	0.00	0.01	0.08	0.41	0.01	0.25	0.01	0.31	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.24	0.21	0.10	0.46	0.29	0.37	0.47
N9	0.00	0.00	0.00	0.16	0.00	0.05	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.15	0.03	0.00	0.06	0.16	0.14	0.00
O2'	0.01	0.12	0.00	0.02	0.16	0.23	0.21	0.08	0.22	0.20	0.18	0.09	0.25	0.24	0.15	0.00	0.01	0.16	0.25	0.02	0.04	0.15
O3'	0.20	0.32	0.00	0.01	0.14	0.00	0.03	0.17	0.03	0.22	0.19	0.34	0.06	0.21	0.03	0.01	0.00	0.14	0.49	0.47	0.55	0.50
O4'	0.00	0.35	0.01	0.01	0.19	0.00	0.08	0.00	0.16	0.19	0.28	0.35	0.10	0.10	0.00	0.16	0.14	0.00	0.16	0.18	0.29	0.14
O5'	0.02	1.08	0.12	0.38	0.42	0.01	0.12	0.00	0.40	0.63	0.83	0.97	0.20	0.46	0.06	0.25	0.49	0.16	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.17	1.79	0.16	0.12	0.78	0.07	0.45	0.11	0.87	0.50	1.50	1.51	0.63	0.29	0.16	0.02	0.47	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.17	1.70	0.03	0.34	0.75	0.06	0.42	0.09	0.83	0.54	1.44	1.42	0.57	0.37	0.14	0.04	0.55	0.29	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.05	1.46	0.02	0.30	0.57	0.00	0.24	0.00	0.61	0.65	1.18	1.24	0.38	0.47	0.00	0.15	0.50	0.14	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.22	2.18	0.16	0.01	0.92	0.01	0.55	0.31	1.03	0.48	1.83	2.95	1.74	0.31	0.24	0.04	0.10	0.15	0.28	0.79	0.52	1.01	0.77
C2	0.20	1.72	0.23	0.15	1.00	0.11	0.80	0.11	1.11	0.08	1.53	1.95	1.50	0.18	0.40	0.02	0.16	0.15	0.42	0.96	0.36	0.16	0.11
C2'	0.68	2.37	0.64	0.53	1.18	0.53	0.69	0.15	1.06	0.20	1.88	3.16	2.04	0.16	0.58	0.58	0.74	0.63	0.14	0.71	0.08	0.70	0.40
C3'	0.95	2.43	0.94	0.89	1.33	0.89	0.80	0.51	1.12	0.01	1.92	3.19	2.17	0.02	0.79	0.85	1.13	0.93	0.43	0.75	0.28	0.39	0.07
C4	0.23	2.33	0.20	0.04	1.18	0.02	0.99	0.14	1.50	0.09	2.14	2.85	1.85	0.22	0.46	0.02	0.04	0.12	0.10	1.35	0.04	0.44	0.25
C4'	0.96	2.45	0.94	0.87	1.38	0.90	0.89	0.57	1.22	0.04	1.99	3.16	2.19	0.07	0.83	0.80	1.03	0.96	0.46	0.88	0.26	0.32	0.04
C5	0.26	2.54	0.24	0.04	1.43	0.07	1.45	0.07	2.05	0.29	2.59	2.92	1.95	0.73	0.67	0.06	0.05	0.08	0.30	2.02	0.18	0.07	0.04
C5'	1.63	2.90	1.65	1.64	1.97	1.65	1.48	1.36	1.74	0.72	2.45	3.51	2.72	0.72	1.48	1.47	1.77	1.66	1.21	1.39	1.09	0.51	0.78
C6	0.24	2.34	0.26	0.08	1.50	0.06	1.65	0.07	2.20	0.55	2.52	2.48	1.82	1.05	0.77	0.10	0.07	0.05	0.55	2.22	0.47	0.29	0.37
C8	0.27	2.65	0.21	0.02	1.36	0.10	1.27	0.23	1.91	0.07	2.61	3.28	2.02	0.46	0.57	0.03	0.06	0.10	0.02	1.86	0.18	0.43	0.32
N1	0.21	1.91	0.26	0.14	1.32	0.03	1.36	0.18	1.71	0.43	1.96	1.98	1.59	0.83	0.67	0.09	0.04	0.08	0.66	1.66	0.59	0.29	0.45
N3	0.20	1.91	0.19	0.09	0.93	0.07	0.62	0.08	1.00	0.33	1.60	2.36	1.61	0.12	0.29	0.01	0.16	0.16	0.11	0.79	0.01	0.55	0.28
N6	0.25	2.33	0.28	0.08	1.61	0.09	1.99	0.12	2.62	0.88	2.74	2.38	1.77	1.50	0.91	0.14	0.15	0.02	0.70	2.82	0.65	0.62	0.61
N7	0.28	2.72	0.24	0.01	1.50	0.11	1.56	0.14	2.25	0.34	2.83	3.19	2.05	0.81	0.71	0.06	0.10	0.08	0.22	2.29	0.06	0.11	0.04
N9	0.24	2.42	0.18	0.00	1.15	0.05	0.92	0.25	1.47	0.19	2.20	3.09	1.89	0.10	0.42	0.01	0.03	0.12	0.08	1.31	0.27	0.66	0.48
O2'	0.50	2.23	0.42	0.24	0.96	0.25	0.43	0.22	0.82	0.46	1.72	3.11	1.86	0.45	0.36	0.47	0.49	0.41	0.26	0.44	0.60	1.20	0.90
O3'	0.83	2.29	0.82	0.78	1.15	0.79	0.60	0.40	0.91	0.19	1.76	3.10	2.02	0.23	0.63	0.78	1.06	0.82	0.30	0.52	0.09	0.61	0.26
O4'	0.53	2.32	0.47	0.33	1.16	0.36	0.77	0.07	1.20	0.20	1.96	3.02	1.94	0.07	0.52	0.31	0.41	0.49	0.04	0.94	0.21	0.65	0.44
O5'	1.60	2.83	1.68	1.73	1.97	1.74	1.55	1.62	1.81	0.82	2.45	3.37	2.63	0.85	1.50	1.42	1.82	1.66	1.56	1.51	1.51	0.90	1.20
OP1	2.76	3.47	2.95	3.11	2.85	3.08	2.37	2.94	2.49	1.85	3.05	3.90	3.42	1.76	2.53	2.69	3.25	2.83	2.79	2.14	2.92	2.20	2.52
OP2	2.37	3.36	2.56	2.66	2.74	2.63	2.44	2.74	2.65	1.83	3.11	3.71	3.21	1.89	2.36	2.18	2.62	2.43	2.82	2.42	2.85	2.31	2.60
P	2.16	3.15	2.31	2.42	2.45	2.41	2.05	2.38	2.26	1.43	2.80	3.59	3.01	1.43	2.05	2.00	2.47	2.23	2.33	1.97	2.38	1.76	2.06

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.04	0.05	0.03	0.01	0.00	0.02	0.11	0.01	0.24	0.01	0.43	0.15	0.13
C2	0.04	0.00	0.45	0.33	0.03	0.18	0.01	0.30	0.01	0.03	0.00	0.00	0.01	0.02	0.04	0.43	0.26	0.39	0.36	0.02	0.07	0.68	0.16
C2'	0.00	0.45	0.00	0.01	0.22	0.01	0.08	0.10	0.17	0.24	0.34	0.56	0.44	0.14	0.00	0.00	0.02	0.00	0.30	0.11	0.64	0.22	0.39
C3'	0.01	0.33	0.01	0.00	0.25	0.00	0.28	0.01	0.32	0.16	0.35	0.34	0.28	0.23	0.17	0.03	0.01	0.00	0.02	0.33	0.56	0.03	0.18
C4	0.01	0.03	0.22	0.25	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.01	0.03	0.03	0.01	0.01	0.01	0.09	0.16	0.21	0.28	0.00	0.02	0.58	0.15
C4'	0.01	0.18	0.01	0.00	0.04	0.00	0.09	0.00	0.03	0.30	0.08	0.26	0.19	0.26	0.09	0.20	0.00	0.00	0.00	0.09	0.48	0.19	0.08
C5	0.01	0.01	0.08	0.28	0.00	0.09	0.00	0.10	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.20	0.07	0.18	0.00	0.27	0.73	0.33
C5'	0.01	0.30	0.10	0.01	0.08	0.00	0.10	0.00	0.01	0.42	0.17	0.43	0.29	0.37	0.10	0.08	0.09	0.00	0.01	0.10	0.34	0.25	0.01
C6	0.02	0.01	0.17	0.32	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.26	0.15	0.21	0.00	0.38	0.82	0.38
C8	0.01	0.03	0.24	0.16	0.01	0.30	0.01	0.42	0.02	0.00	0.03	0.04	0.02	0.00	0.01	0.47	0.07	0.27	0.02	0.02	0.12	0.50	0.29
N1	0.04	0.00	0.34	0.35	0.03	0.08	0.02	0.17	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.02	0.04	0.24	0.29	0.28	0.30	0.01	0.27	0.79	0.29
N2	0.05	0.00	0.56	0.34	0.03	0.26	0.01	0.43	0.01	0.04	0.01	0.00	0.02	0.02	0.04	0.62	0.28	0.47	0.42	0.02	0.01	0.66	0.10
N3	0.03	0.01	0.44	0.28	0.01	0.19	0.00	0.29	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.01	0.03	0.43	0.20	0.40	0.37	0.02	0.07	0.56	0.07
N7	0.01	0.02	0.14	0.23	0.01	0.26	0.01	0.37	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.40	0.15	0.16	0.03	0.01	0.35	0.71	0.43
N9	0.00	0.04	0.00	0.17	0.01	0.09	0.01	0.10	0.02	0.01	0.04	0.04	0.03	0.01	0.00	0.13	0.06	0.00	0.20	0.01	0.10	0.43	0.10
O2'	0.02	0.43	0.00	0.03	0.09	0.20	0.12	0.08	0.01	0.47	0.24	0.62	0.43	0.40	0.13	0.00	0.05	0.18	0.16	0.12	0.69	0.39	0.41
O3'	0.11	0.26	0.02	0.01	0.16	0.00	0.20	0.09	0.26	0.07	0.29	0.28	0.20	0.15	0.06	0.05	0.00	0.07	0.32	0.28	0.40	0.10	0.00
O4'	0.01	0.39	0.00	0.00	0.21	0.00	0.07	0.00	0.15	0.27	0.28	0.47	0.40	0.16	0.00	0.18	0.07	0.00	0.18	0.09	0.41	0.25	0.06
O5'	0.24	0.36	0.30	0.02	0.28	0.00	0.18	0.01	0.21	0.02	0.30	0.42	0.37	0.03	0.20	0.16	0.32	0.18	0.00	0.15	0.01	0.00	0.00
O6	0.01	0.02	0.11	0.33	0.00	0.09	0.00	0.10	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.12	0.28	0.09	0.15	0.00	0.53	0.88	0.48
OP1	0.43	0.07	0.64	0.56	0.02	0.48	0.27	0.34	0.38	0.12	0.27	0.01	0.07	0.35	0.10	0.69	0.40	0.41	0.01	0.53	0.00	0.00	0.00
OP2	0.15	0.68	0.22	0.03	0.58	0.19	0.73	0.25	0.82	0.50	0.79	0.66	0.56	0.71	0.43	0.39	0.10	0.25	0.00	0.88	0.00	0.00	0.00
P	0.13	0.16	0.39	0.18	0.15	0.08	0.33	0.01	0.38	0.29	0.29	0.10	0.07	0.43	0.10	0.41	0.00	0.06	0.00	0.48	0.00	0.00	0.00