Doublet Group distance statistics: 50537

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.000, 0.005, 0.010, 0.010 max_d=0.010 avg_d=0.005 std_dev=0.005
C4	A	0, 0.000, 0.007, 0.014, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.007 std_dev=0.007
C8	A	0, 0.000, 0.008, 0.016, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.008 std_dev=0.008
N9	A	0, 0.000, 0.009, 0.017, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.009 std_dev=0.009
N7	A	0, 0.000, 0.011, 0.022, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.011 std_dev=0.011
C6	A	0, 0.000, 0.012, 0.024, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.012 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.000, 0.017, 0.034, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.017 std_dev=0.017
C2	A	0, 0.000, 0.017, 0.034, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.017 std_dev=0.017
N3	A	0, 0.000, 0.018, 0.037, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.018 std_dev=0.018
N6	A	0, 0.000, 0.021, 0.041, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.021 std_dev=0.021
C1'	A	0, 0.000, 0.029, 0.057, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.029 std_dev=0.029
O4'	A	0, 0.000, 0.135, 0.270, 0.270 max_d=0.270 avg_d=0.135 std_dev=0.135
C2'	A	0, 0.000, 0.140, 0.280, 0.280 max_d=0.280 avg_d=0.140 std_dev=0.140
O2'	B	0, 0.000, 0.187, 0.373, 0.373 max_d=0.373 avg_d=0.187 std_dev=0.187
O2'	A	0, 0.000, 0.235, 0.470, 0.470 max_d=0.470 avg_d=0.235 std_dev=0.235
C3'	A	0, 0.000, 0.331, 0.662, 0.662 max_d=0.662 avg_d=0.331 std_dev=0.331
C4'	A	0, 0.000, 0.332, 0.665, 0.665 max_d=0.665 avg_d=0.332 std_dev=0.332
C5'	A	0, 0.000, 0.580, 1.161, 1.161 max_d=1.161 avg_d=0.580 std_dev=0.580
O3'	A	0, 0.000, 0.588, 1.175, 1.175 max_d=1.175 avg_d=0.588 std_dev=0.588
O4'	B	0, 0.000, 0.687, 1.373, 1.373 max_d=1.373 avg_d=0.687 std_dev=0.687
C1'	B	0, 0.000, 0.797, 1.594, 1.594 max_d=1.594 avg_d=0.797 std_dev=0.797
C2'	B	0, 0.000, 0.803, 1.607, 1.607 max_d=1.607 avg_d=0.803 std_dev=0.803
C4'	B	0, 0.000, 0.918, 1.836, 1.836 max_d=1.836 avg_d=0.918 std_dev=0.918
O5'	A	0, 0.000, 1.090, 2.180, 2.180 max_d=2.180 avg_d=1.090 std_dev=1.090
OP2	A	0, 0.000, 1.150, 2.301, 2.301 max_d=2.301 avg_d=1.150 std_dev=1.150
N9	B	0, 0.000, 1.298, 2.596, 2.596 max_d=2.596 avg_d=1.298 std_dev=1.298
C5'	B	0, 0.000, 1.317, 2.634, 2.634 max_d=2.634 avg_d=1.317 std_dev=1.317
C3'	B	0, 0.000, 1.426, 2.853, 2.853 max_d=2.853 avg_d=1.426 std_dev=1.426
P	B	0, 0.000, 1.428, 2.856, 2.856 max_d=2.856 avg_d=1.428 std_dev=1.428
P	A	0, 0.000, 1.487, 2.975, 2.975 max_d=2.975 avg_d=1.487 std_dev=1.487
OP1	B	0, 0.000, 1.553, 3.106, 3.106 max_d=3.106 avg_d=1.553 std_dev=1.553
C4	B	0, 0.000, 1.618, 3.237, 3.237 max_d=3.237 avg_d=1.618 std_dev=1.618
O5'	B	0, 0.000, 1.828, 3.657, 3.657 max_d=3.657 avg_d=1.828 std_dev=1.828
C5	B	0, 0.000, 2.039, 4.078, 4.078 max_d=4.078 avg_d=2.039 std_dev=2.039
O3'	B	0, 0.000, 2.072, 4.144, 4.144 max_d=4.144 avg_d=2.072 std_dev=2.072
C8	B	0, 0.000, 2.094, 4.188, 4.188 max_d=4.188 avg_d=2.094 std_dev=2.094
OP1	A	0, 0.000, 2.128, 4.256, 4.256 max_d=4.256 avg_d=2.128 std_dev=2.128
OP2	B	0, 0.000, 2.178, 4.355, 4.355 max_d=4.355 avg_d=2.178 std_dev=2.178
N3	B	0, 0.000, 2.186, 4.373, 4.373 max_d=4.373 avg_d=2.186 std_dev=2.186
C6	B	0, 0.000, 2.383, 4.766, 4.766 max_d=4.766 avg_d=2.383 std_dev=2.383
N7	B	0, 0.000, 2.517, 5.034, 5.034 max_d=5.034 avg_d=2.517 std_dev=2.517
N1	B	0, 0.000, 2.565, 5.130, 5.130 max_d=5.130 avg_d=2.565 std_dev=2.565
C2	B	0, 0.000, 2.694, 5.388, 5.388 max_d=5.388 avg_d=2.694 std_dev=2.694
O6	B	0, 0.000, 2.878, 5.757, 5.757 max_d=5.757 avg_d=2.878 std_dev=2.878
N2	B	0, 0.000, 3.622, 7.244, 7.244 max_d=7.244 avg_d=3.622 std_dev=3.622

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.03	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.00	0.15	0.20	0.09	0.12
C2	0.03	0.00	0.06	0.15	0.01	0.17	0.01	0.33	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.09	0.27	0.03	0.67	1.04	0.55	0.80
C2'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.03	0.03	0.05	0.07	0.03	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.09	0.12	0.01	0.08
C3'	0.02	0.15	0.01	0.00	0.14	0.01	0.14	0.00	0.15	0.09	0.15	0.15	0.14	0.11	0.10	0.03	0.00	0.00	0.05	0.08	0.04	0.07
C4	0.02	0.01	0.02	0.14	0.00	0.11	0.00	0.21	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.08	0.17	0.01	0.53	0.78	0.38	0.56
C4'	0.01	0.17	0.00	0.01	0.11	0.00	0.09	0.00	0.11	0.00	0.15	0.17	0.10	0.03	0.04	0.08	0.03	0.00	0.02	0.05	0.02	0.02
C5	0.02	0.01	0.01	0.14	0.00	0.09	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.09	0.17	0.01	0.54	0.90	0.42	0.60
C5'	0.01	0.33	0.01	0.00	0.21	0.00	0.19	0.00	0.24	0.05	0.30	0.30	0.23	0.11	0.10	0.07	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00
C6	0.03	0.00	0.03	0.15	0.01	0.11	0.01	0.24	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.22	0.01	0.63	1.09	0.53	0.75
C8	0.01	0.01	0.03	0.09	0.00	0.00	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.06	0.06	0.05	0.31	0.51	0.23	0.30
N1	0.03	0.00	0.05	0.15	0.01	0.15	0.01	0.30	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.10	0.26	0.01	0.68	1.15	0.58	0.84
N3	0.03	0.00	0.07	0.15	0.00	0.17	0.00	0.30	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.22	0.04	0.60	0.85	0.44	0.66
N6	0.03	0.01	0.03	0.14	0.02	0.10	0.01	0.23	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.12	0.22	0.02	0.63	1.14	0.55	0.76
N7	0.01	0.01	0.01	0.11	0.01	0.03	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.11	0.04	0.42	0.73	0.33	0.45
N9	0.01	0.01	0.01	0.10	0.00	0.04	0.01	0.10	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.06	0.07	0.01	0.35	0.51	0.24	0.34
O2'	0.00	0.09	0.00	0.03	0.08	0.08	0.09	0.07	0.10	0.06	0.10	0.08	0.12	0.08	0.06	0.00	0.05	0.09	0.06	0.02	0.05	0.06
O3'	0.03	0.27	0.02	0.00	0.17	0.03	0.17	0.00	0.22	0.06	0.26	0.22	0.22	0.11	0.07	0.05	0.00	0.03	0.09	0.09	0.13	0.03
O4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.04	0.02	0.04	0.01	0.09	0.03	0.00	0.13	0.11	0.08	0.06
O5'	0.15	0.67	0.09	0.05	0.53	0.02	0.54	0.00	0.63	0.31	0.68	0.60	0.63	0.42	0.35	0.06	0.09	0.13	0.00	0.03	0.01	0.01
OP1	0.20	1.04	0.12	0.08	0.78	0.05	0.90	0.02	1.09	0.51	1.15	0.85	1.14	0.73	0.51	0.02	0.09	0.11	0.03	0.00	0.01	0.01
OP2	0.09	0.55	0.01	0.04	0.38	0.02	0.42	0.02	0.53	0.23	0.58	0.44	0.55	0.33	0.24	0.05	0.13	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.12	0.80	0.08	0.07	0.56	0.02	0.60	0.00	0.75	0.30	0.84	0.66	0.76	0.45	0.34	0.06	0.03	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.23	1.34	0.22	0.17	0.51	0.23	0.06	0.06	0.32	0.69	0.93	1.85	1.20	0.65	0.05	0.08	0.33	0.23	0.33	0.05	0.49	0.10	0.18
C2	0.03	0.44	0.18	0.50	0.03	0.36	0.36	0.13	0.24	0.81	0.13	0.76	0.43	0.78	0.29	0.05	0.97	0.10	0.26	0.41	0.24	0.26	0.26
C2'	0.26	1.26	0.22	0.09	0.58	0.17	0.21	0.10	0.45	0.49	0.95	1.65	1.14	0.41	0.16	0.03	0.13	0.27	0.39	0.24	0.54	0.11	0.30
C3'	0.42	1.32	0.31	0.09	0.67	0.21	0.24	0.21	0.44	0.46	0.95	1.67	1.26	0.42	0.26	0.23	0.17	0.43	0.03	0.19	0.17	0.15	0.01
C4	0.10	0.87	0.23	0.42	0.21	0.39	0.22	0.15	0.03	0.82	0.48	1.32	0.81	0.80	0.15	0.06	0.76	0.09	0.45	0.27	0.45	0.15	0.31
C4'	0.46	1.67	0.34	0.09	0.78	0.22	0.25	0.24	0.51	0.55	1.19	2.18	1.55	0.55	0.28	0.34	0.26	0.44	0.12	0.19	0.11	0.48	0.16
C5	0.03	0.71	0.23	0.54	0.08	0.45	0.34	0.27	0.18	0.87	0.32	1.16	0.65	0.89	0.24	0.04	0.95	0.03	0.54	0.42	0.51	0.20	0.36
C5'	0.51	1.69	0.37	0.11	0.73	0.24	0.08	0.27	0.31	0.67	1.08	2.26	1.61	0.77	0.25	0.50	0.40	0.45	0.35	0.08	0.13	0.76	0.36
C6	0.06	0.43	0.20	0.62	0.09	0.46	0.46	0.31	0.34	0.88	0.09	0.82	0.41	0.90	0.33	0.02	1.14	0.06	0.50	0.55	0.44	0.27	0.36
C8	0.13	1.06	0.25	0.42	0.28	0.40	0.18	0.20	0.03	0.83	0.63	1.59	0.94	0.84	0.11	0.06	0.72	0.15	0.57	0.25	0.62	0.07	0.34
N1	0.10	0.28	0.18	0.62	0.16	0.42	0.48	0.26	0.38	0.84	0.02	0.60	0.27	0.85	0.37	0.02	1.17	0.13	0.37	0.55	0.32	0.30	0.32
N3	0.10	0.77	0.21	0.37	0.19	0.33	0.21	0.04	0.04	0.79	0.42	1.15	0.74	0.75	0.15	0.07	0.71	0.05	0.27	0.24	0.29	0.17	0.24
N6	0.11	0.31	0.19	0.68	0.18	0.48	0.54	0.37	0.44	0.89	0.03	0.69	0.28	0.94	0.38	0.00	1.24	0.10	0.54	0.65	0.47	0.30	0.38
N7	0.06	0.85	0.24	0.52	0.14	0.45	0.31	0.29	0.12	0.88	0.43	1.35	0.76	0.90	0.20	0.04	0.90	0.08	0.60	0.39	0.60	0.15	0.37
N9	0.17	1.11	0.24	0.34	0.35	0.35	0.11	0.10	0.11	0.79	0.70	1.62	1.01	0.77	0.06	0.07	0.60	0.17	0.47	0.15	0.54	0.05	0.29
O2'	0.37	1.55	0.26	0.02	0.82	0.11	0.53	0.14	0.81	0.22	1.29	1.93	1.36	0.09	0.36	0.05	0.06	0.34	0.41	0.63	0.70	0.21	0.37
O3'	0.74	1.51	0.56	0.16	1.04	0.31	0.69	0.15	0.83	0.08	1.23	1.73	1.47	0.12	0.69	0.47	0.08	0.74	0.01	0.61	0.01	0.01	0.00
O4'	0.27	1.50	0.22	0.11	0.56	0.20	0.03	0.18	0.30	0.77	1.01	2.09	1.34	0.77	0.06	0.18	0.34	0.26	0.06	0.02	0.30	0.37	0.02
O5'	0.61	1.70	0.48	0.27	0.69	0.40	0.02	0.15	0.17	0.69	1.02	2.42	1.61	0.89	0.26	0.67	0.63	0.55	0.26	0.31	0.18	0.93	0.41
OP1	0.73	1.53	0.66	0.52	0.59	0.62	0.21	0.01	0.12	0.68	0.77	2.31	1.49	1.01	0.26	0.98	1.04	0.66	0.19	0.72	0.25	1.02	0.43
OP2	0.44	1.49	0.28	0.01	0.45	0.16	0.30	0.39	0.16	0.78	0.76	2.30	1.35	1.10	0.08	0.65	0.44	0.35	0.67	0.73	0.52	1.25	0.69
P	0.66	1.56	0.57	0.38	0.60	0.49	0.19	0.09	0.07	0.70	0.81	2.31	1.51	1.01	0.24	0.87	0.85	0.58	0.31	0.63	0.25	0.97	0.44

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.08	0.00	0.02	0.04	0.00	0.03	0.00	0.04	0.02	0.07	0.09	0.09	0.00	0.01	0.02	0.15	0.00	0.12	0.03	0.17	0.72	0.40
C2	0.08	0.00	0.59	0.58	0.01	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.45	0.45	0.26	0.05	0.01	0.64	0.55	0.65
C2'	0.00	0.59	0.00	0.00	0.29	0.02	0.11	0.08	0.22	0.30	0.44	0.71	0.58	0.17	0.01	0.00	0.00	0.00	0.16	0.14	0.06	0.72	0.28
C3'	0.02	0.58	0.00	0.00	0.40	0.01	0.38	0.01	0.47	0.12	0.56	0.63	0.52	0.23	0.22	0.01	0.01	0.01	0.31	0.44	0.47	0.32	0.08
C4	0.04	0.01	0.29	0.40	0.00	0.09	0.00	0.10	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.08	0.23	0.13	0.28	0.01	0.34	0.52	0.41
C4'	0.00	0.04	0.02	0.01	0.09	0.00	0.17	0.00	0.16	0.25	0.10	0.00	0.02	0.25	0.12	0.23	0.03	0.00	0.00	0.19	0.14	0.53	0.20
C5	0.03	0.00	0.11	0.38	0.00	0.17	0.00	0.24	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.16	0.23	0.03	0.52	0.00	0.18	0.23	0.14
C5'	0.00	0.00	0.08	0.01	0.10	0.00	0.24	0.00	0.21	0.38	0.10	0.08	0.02	0.38	0.16	0.12	0.15	0.01	0.00	0.27	0.27	0.36	0.00
C6	0.04	0.01	0.22	0.47	0.01	0.16	0.01	0.21	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.34	0.08	0.46	0.00	0.29	0.16	0.20
C8	0.02	0.01	0.30	0.12	0.00	0.25	0.00	0.38	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.53	0.02	0.22	0.76	0.00	0.17	0.18	0.17
N1	0.07	0.00	0.44	0.56	0.02	0.10	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.22	0.44	0.18	0.25	0.01	0.51	0.35	0.45
N2	0.09	0.00	0.71	0.63	0.01	0.00	0.00	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.65	0.53	0.33	0.11	0.01	0.79	0.62	0.79
N3	0.09	0.00	0.58	0.52	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.46	0.37	0.26	0.02	0.01	0.58	0.66	0.67
N7	0.00	0.00	0.17	0.23	0.00	0.25	0.00	0.38	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.47	0.10	0.14	0.79	0.00	0.13	0.01	0.21
N9	0.01	0.03	0.01	0.22	0.01	0.12	0.01	0.16	0.02	0.00	0.03	0.03	0.02	0.00	0.00	0.15	0.04	0.01	0.38	0.01	0.14	0.54	0.26
O2'	0.02	0.45	0.00	0.01	0.08	0.23	0.16	0.12	0.05	0.53	0.22	0.65	0.46	0.47	0.15	0.00	0.02	0.19	0.26	0.17	0.20	0.69	0.18
O3'	0.15	0.45	0.00	0.01	0.23	0.03	0.23	0.15	0.34	0.02	0.44	0.53	0.37	0.10	0.04	0.02	0.00	0.07	0.33	0.33	0.75	0.16	0.23
O4'	0.00	0.26	0.00	0.01	0.13	0.00	0.03	0.01	0.08	0.22	0.18	0.33	0.26	0.14	0.01	0.19	0.07	0.00	0.07	0.04	0.29	0.80	0.52
O5'	0.12	0.05	0.16	0.31	0.28	0.00	0.52	0.00	0.46	0.76	0.25	0.11	0.02	0.79	0.38	0.26	0.33	0.07	0.00	0.57	0.02	0.00	0.00
O6	0.03	0.01	0.14	0.44	0.01	0.19	0.00	0.27	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.17	0.33	0.04	0.57	0.00	0.19	0.03	0.04
OP1	0.17	0.64	0.06	0.47	0.34	0.14	0.18	0.27	0.29	0.17	0.51	0.79	0.58	0.13	0.14	0.20	0.75	0.29	0.02	0.19	0.00	0.00	0.00
OP2	0.72	0.55	0.72	0.32	0.52	0.53	0.23	0.36	0.16	0.18	0.35	0.62	0.66	0.01	0.54	0.69	0.16	0.80	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00
P	0.40	0.65	0.28	0.08	0.41	0.20	0.14	0.00	0.20	0.17	0.45	0.79	0.67	0.21	0.26	0.18	0.23	0.52	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00