Doublet Group distance statistics: 50539

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.000, 0.017, 0.034, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.017 std_dev=0.017
N1	A	0, 0.000, 0.020, 0.040, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.020 std_dev=0.020
C6	A	0, 0.000, 0.022, 0.044, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.022 std_dev=0.022
C4	A	0, 0.000, 0.025, 0.050, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.025 std_dev=0.025
C2	A	0, 0.000, 0.029, 0.059, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.029 std_dev=0.029
N3	A	0, 0.000, 0.035, 0.071, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.035 std_dev=0.035
C1'	A	0, 0.000, 0.044, 0.089, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.044 std_dev=0.044
O2'	A	0, 0.000, 0.044, 0.089, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.044 std_dev=0.044
N9	A	0, 0.000, 0.052, 0.104, 0.104 max_d=0.104 avg_d=0.052 std_dev=0.052
N7	A	0, 0.000, 0.054, 0.109, 0.109 max_d=0.109 avg_d=0.054 std_dev=0.054
C8	A	0, 0.000, 0.079, 0.159, 0.159 max_d=0.159 avg_d=0.079 std_dev=0.079
N6	A	0, 0.000, 0.080, 0.160, 0.160 max_d=0.160 avg_d=0.080 std_dev=0.080
O4'	A	0, 0.000, 0.214, 0.428, 0.428 max_d=0.428 avg_d=0.214 std_dev=0.214
C2'	A	0, 0.000, 0.228, 0.457, 0.457 max_d=0.457 avg_d=0.228 std_dev=0.228
P	A	0, 0.000, 0.297, 0.595, 0.595 max_d=0.595 avg_d=0.297 std_dev=0.297
C2'	B	0, 0.000, 0.395, 0.790, 0.790 max_d=0.790 avg_d=0.395 std_dev=0.395
O5'	A	0, 0.000, 0.411, 0.822, 0.822 max_d=0.822 avg_d=0.411 std_dev=0.411
O2'	B	0, 0.000, 0.431, 0.862, 0.862 max_d=0.862 avg_d=0.431 std_dev=0.431
C4'	A	0, 0.000, 0.486, 0.971, 0.971 max_d=0.971 avg_d=0.486 std_dev=0.486
C3'	A	0, 0.000, 0.527, 1.054, 1.054 max_d=1.054 avg_d=0.527 std_dev=0.527
C5'	A	0, 0.000, 0.588, 1.177, 1.177 max_d=1.177 avg_d=0.588 std_dev=0.588
O3'	A	0, 0.000, 0.743, 1.486, 1.486 max_d=1.486 avg_d=0.743 std_dev=0.743
C3'	B	0, 0.000, 0.761, 1.522, 1.522 max_d=1.522 avg_d=0.761 std_dev=0.761
C1'	B	0, 0.000, 1.303, 2.607, 2.607 max_d=2.607 avg_d=1.303 std_dev=1.303
OP1	A	0, 0.000, 1.416, 2.832, 2.832 max_d=2.832 avg_d=1.416 std_dev=1.416
C4'	B	0, 0.000, 1.487, 2.975, 2.975 max_d=2.975 avg_d=1.487 std_dev=1.487
OP2	A	0, 0.000, 1.494, 2.988, 2.988 max_d=2.988 avg_d=1.494 std_dev=1.494
O3'	B	0, 0.000, 1.646, 3.292, 3.292 max_d=3.292 avg_d=1.646 std_dev=1.646
O4'	B	0, 0.000, 1.674, 3.347, 3.347 max_d=3.347 avg_d=1.674 std_dev=1.674
C5'	B	0, 0.000, 1.981, 3.962, 3.962 max_d=3.962 avg_d=1.981 std_dev=1.981
N9	B	0, 0.000, 2.062, 4.124, 4.124 max_d=4.124 avg_d=2.062 std_dev=2.062
C8	B	0, 0.000, 2.154, 4.308, 4.308 max_d=4.308 avg_d=2.154 std_dev=2.154
O5'	B	0, 0.000, 2.666, 5.331, 5.331 max_d=5.331 avg_d=2.666 std_dev=2.666
OP2	B	0, 0.000, 3.119, 6.237, 6.237 max_d=6.237 avg_d=3.119 std_dev=3.119
C4	B	0, 0.000, 3.125, 6.249, 6.249 max_d=6.249 avg_d=3.125 std_dev=3.125
N7	B	0, 0.000, 3.133, 6.266, 6.266 max_d=6.266 avg_d=3.133 std_dev=3.133
N3	B	0, 0.000, 3.489, 6.979, 6.979 max_d=6.979 avg_d=3.489 std_dev=3.489
P	B	0, 0.000, 3.585, 7.169, 7.169 max_d=7.169 avg_d=3.585 std_dev=3.585
C5	B	0, 0.000, 3.814, 7.629, 7.629 max_d=7.629 avg_d=3.814 std_dev=3.814
OP1	B	0, 0.000, 4.254, 8.507, 8.507 max_d=8.507 avg_d=4.254 std_dev=4.254
C2	B	0, 0.000, 4.676, 9.353, 9.353 max_d=9.353 avg_d=4.676 std_dev=4.676
C6	B	0, 0.000, 5.087, 10.173, 10.173 max_d=10.173 avg_d=5.087 std_dev=5.087
N2	B	0, 0.000, 5.214, 10.428, 10.428 max_d=10.428 avg_d=5.214 std_dev=5.214
N1	B	0, 0.000, 5.454, 10.907, 10.907 max_d=10.907 avg_d=5.454 std_dev=5.454
O6	B	0, 0.000, 5.884, 11.768, 11.768 max_d=11.768 avg_d=5.884 std_dev=5.884

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.02	0.03	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.04	0.05	0.06	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.36	0.13	0.09
C2	0.05	0.00	0.17	0.22	0.02	0.09	0.01	0.10	0.01	0.04	0.01	0.00	0.02	0.02	0.04	0.01	0.19	0.02	0.14	0.40	0.53	0.01
C2'	0.00	0.17	0.00	0.00	0.11	0.01	0.12	0.01	0.14	0.03	0.16	0.16	0.15	0.07	0.04	0.00	0.03	0.01	0.11	0.19	0.02	0.15
C3'	0.02	0.22	0.00	0.00	0.18	0.01	0.22	0.01	0.25	0.12	0.24	0.19	0.28	0.18	0.11	0.01	0.01	0.01	0.11	0.02	0.11	0.09
C4	0.03	0.02	0.11	0.18	0.00	0.08	0.01	0.07	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.15	0.01	0.12	0.44	0.48	0.02
C4'	0.00	0.09	0.01	0.01	0.08	0.00	0.10	0.01	0.11	0.07	0.10	0.08	0.15	0.09	0.05	0.08	0.05	0.00	0.00	0.05	0.10	0.01
C5	0.03	0.01	0.12	0.22	0.01	0.10	0.00	0.11	0.01	0.03	0.01	0.00	0.03	0.02	0.03	0.01	0.21	0.02	0.18	0.49	0.65	0.02
C5'	0.01	0.10	0.01	0.01	0.07	0.01	0.11	0.00	0.12	0.06	0.11	0.08	0.16	0.09	0.04	0.07	0.08	0.01	0.01	0.07	0.22	0.01
C6	0.04	0.01	0.14	0.25	0.01	0.11	0.01	0.12	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.04	0.04	0.01	0.24	0.02	0.20	0.48	0.73	0.05
C8	0.01	0.04	0.03	0.12	0.02	0.07	0.03	0.06	0.04	0.00	0.04	0.02	0.07	0.01	0.01	0.00	0.13	0.02	0.14	0.55	0.52	0.03
N1	0.04	0.01	0.16	0.24	0.02	0.10	0.01	0.11	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.03	0.04	0.01	0.22	0.02	0.17	0.44	0.66	0.03
N3	0.05	0.00	0.16	0.19	0.00	0.08	0.00	0.08	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.15	0.02	0.10	0.38	0.42	0.02
N6	0.06	0.02	0.15	0.28	0.02	0.15	0.03	0.16	0.00	0.07	0.02	0.01	0.00	0.07	0.06	0.02	0.29	0.04	0.27	0.47	0.88	0.11
N7	0.02	0.02	0.07	0.18	0.01	0.09	0.02	0.09	0.04	0.01	0.03	0.01	0.07	0.00	0.02	0.01	0.19	0.01	0.19	0.56	0.69	0.01
N9	0.00	0.04	0.04	0.11	0.02	0.05	0.03	0.04	0.04	0.01	0.04	0.02	0.06	0.02	0.00	0.01	0.09	0.00	0.08	0.45	0.37	0.05
O2'	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.08	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.07	0.07	0.04	0.07	0.03	0.06
O3'	0.01	0.19	0.03	0.01	0.15	0.05	0.21	0.08	0.24	0.13	0.22	0.15	0.29	0.19	0.09	0.07	0.00	0.03	0.04	0.30	0.15	0.01
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.04	0.01	0.00	0.07	0.03	0.00	0.05	0.34	0.08	0.04
O5'	0.01	0.14	0.11	0.11	0.12	0.00	0.18	0.01	0.20	0.14	0.17	0.10	0.27	0.19	0.08	0.04	0.04	0.05	0.00	0.00	0.02	0.00
OP1	0.36	0.40	0.19	0.02	0.44	0.05	0.49	0.07	0.48	0.55	0.44	0.38	0.47	0.56	0.45	0.07	0.30	0.34	0.00	0.00	0.01	0.01
OP2	0.13	0.53	0.02	0.11	0.48	0.10	0.65	0.22	0.73	0.52	0.66	0.42	0.88	0.69	0.37	0.03	0.15	0.08	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.09	0.01	0.15	0.09	0.02	0.01	0.02	0.01	0.05	0.03	0.03	0.02	0.11	0.01	0.05	0.06	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.37	2.42	0.08	0.53	1.50	0.58	1.62	0.74	2.08	0.78	2.45	2.85	1.90	1.19	0.87	0.29	0.94	0.03	0.74	2.14	1.18	0.46	0.74
C2	0.83	2.05	0.09	0.50	1.71	0.32	1.76	0.54	1.98	1.16	2.11	2.06	1.86	1.45	1.27	0.13	1.15	0.60	0.28	1.99	0.75	0.07	0.27
C2'	0.32	1.97	0.19	0.59	1.22	0.49	1.32	0.63	1.69	0.63	1.99	2.33	1.56	0.96	0.71	0.36	1.02	0.09	0.54	1.74	0.88	0.28	0.47
C3'	0.33	2.12	0.14	0.56	1.29	0.50	1.42	0.66	1.85	0.67	2.18	2.53	1.64	1.04	0.75	0.30	0.98	0.08	0.61	1.93	1.03	0.35	0.57
C4	0.63	2.65	0.02	0.54	1.85	0.53	1.98	0.75	2.42	1.09	2.73	2.85	2.19	1.53	1.19	0.22	1.10	0.27	0.67	2.47	1.24	0.35	0.69
C4'	0.35	2.38	0.03	0.45	1.45	0.52	1.61	0.69	2.11	0.77	2.48	2.86	1.82	1.19	0.84	0.22	0.83	0.02	0.73	2.21	1.19	0.47	0.74
C5	0.68	2.87	0.07	0.53	2.04	0.54	2.27	0.82	2.80	1.26	3.08	3.03	2.32	1.79	1.33	0.19	1.13	0.31	0.75	2.92	1.53	0.38	0.83
C5'	0.36	2.57	0.02	0.47	1.56	0.56	1.77	0.75	2.34	0.84	2.73	3.07	1.93	1.32	0.90	0.23	0.87	0.01	0.81	2.50	1.37	0.52	0.85
C6	0.79	2.69	0.13	0.48	2.07	0.44	2.33	0.75	2.79	1.40	2.94	2.73	2.23	1.91	1.43	0.13	1.12	0.46	0.62	2.91	1.48	0.27	0.72
C8	0.51	2.97	0.01	0.57	1.91	0.65	2.15	0.90	2.78	1.07	3.17	3.35	2.29	1.62	1.15	0.26	1.09	0.10	0.91	2.93	1.65	0.54	0.99
N1	0.85	2.28	0.14	0.47	1.90	0.33	2.07	0.63	2.35	1.36	2.45	2.27	1.99	1.74	1.40	0.09	1.13	0.61	0.37	2.41	1.07	0.10	0.43
N3	0.67	2.19	0.02	0.52	1.65	0.42	1.69	0.59	1.98	1.00	2.20	2.29	1.94	1.32	1.13	0.21	1.09	0.39	0.43	1.98	0.84	0.19	0.40
N6	0.81	2.75	0.18	0.43	2.13	0.41	2.49	0.74	3.01	1.51	3.11	2.80	2.25	2.09	1.49	0.09	1.07	0.48	0.61	3.23	1.69	0.26	0.80
N7	0.60	3.05	0.04	0.55	2.05	0.62	2.34	0.90	2.99	1.22	3.33	3.32	2.37	1.81	1.28	0.22	1.12	0.19	0.90	3.17	1.76	0.51	1.01
N9	0.50	2.74	0.02	0.55	1.77	0.60	1.93	0.81	2.44	0.98	2.82	3.11	2.17	1.45	1.08	0.26	1.05	0.12	0.79	2.52	1.36	0.46	0.82
O2'	0.32	1.55	0.12	0.41	1.00	0.29	1.05	0.38	1.32	0.54	1.54	1.82	1.27	0.79	0.61	0.26	0.74	0.17	0.30	1.34	0.50	0.11	0.21
O3'	0.38	1.86	0.07	0.43	1.17	0.32	1.27	0.46	1.63	0.65	1.90	2.21	1.47	0.95	0.72	0.19	0.81	0.19	0.40	1.69	0.73	0.18	0.33
O4'	0.36	2.62	0.01	0.46	1.59	0.58	1.76	0.77	2.31	0.84	2.71	3.14	2.00	1.30	0.92	0.24	0.85	0.02	0.83	2.41	1.34	0.55	0.88
O5'	0.37	2.67	0.07	0.56	1.62	0.62	1.83	0.85	2.45	0.85	2.85	3.16	2.00	1.35	0.92	0.27	1.00	0.00	0.89	2.62	1.55	0.56	0.94
OP1	0.91	3.42	0.44	0.06	2.33	0.14	2.68	0.35	3.40	1.59	3.77	3.86	2.65	2.19	1.58	0.14	0.58	0.53	0.38	3.69	1.14	0.00	0.47
OP2	0.13	2.63	0.29	0.86	1.47	0.98	1.71	1.29	2.42	0.60	2.86	3.17	1.90	1.16	0.71	0.45	1.33	0.31	1.37	2.64	2.24	1.09	1.51
P	0.47	2.92	0.03	0.47	1.82	0.56	2.09	0.80	2.78	1.02	3.18	3.40	2.19	1.58	1.08	0.20	0.94	0.09	0.85	3.01	1.62	0.50	0.94

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.03	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.05	0.06	0.05	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.12	0.02	0.18	0.11	0.04
C2	0.05	0.00	0.20	0.23	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.27	0.14	0.35	0.05	0.32	0.14	0.26
C2'	0.00	0.20	0.00	0.01	0.11	0.01	0.07	0.01	0.11	0.08	0.16	0.23	0.19	0.03	0.02	0.00	0.00	0.01	0.04	0.11	0.19	0.21	0.01
C3'	0.01	0.23	0.01	0.00	0.15	0.01	0.14	0.01	0.19	0.02	0.22	0.25	0.20	0.05	0.07	0.02	0.01	0.02	0.00	0.19	0.23	0.30	0.01
C4	0.03	0.01	0.11	0.15	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.16	0.08	0.27	0.01	0.24	0.01	0.13
C4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.07	0.01	0.01	0.00	0.03	0.19	0.21	0.01
C5	0.03	0.00	0.07	0.14	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.16	0.05	0.29	0.01	0.23	0.01	0.11
C5'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.00	0.03	0.02	0.03	0.01	0.08	0.03	0.00	0.00	0.03	0.24	0.28	0.01
C6	0.03	0.02	0.11	0.19	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.23	0.08	0.33	0.02	0.26	0.07	0.16
C8	0.01	0.02	0.08	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.07	0.01	0.05	0.17	0.01	0.15	0.18	0.04
N1	0.05	0.01	0.16	0.22	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.26	0.12	0.37	0.04	0.31	0.14	0.24
N2	0.06	0.00	0.23	0.25	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.30	0.17	0.37	0.06	0.35	0.19	0.31
N3	0.05	0.00	0.19	0.20	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.21	0.13	0.31	0.04	0.30	0.09	0.22
N7	0.02	0.01	0.03	0.05	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.06	0.07	0.01	0.23	0.00	0.16	0.12	0.00
N9	0.01	0.01	0.02	0.07	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.06	0.01	0.20	0.00	0.19	0.09	0.05
O2'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.07	0.03	0.08	0.01	0.07	0.01	0.04	0.02	0.06	0.02	0.00	0.01	0.05	0.09	0.00	0.07	0.24	0.07
O3'	0.01	0.27	0.00	0.01	0.16	0.01	0.16	0.03	0.23	0.01	0.26	0.30	0.21	0.07	0.06	0.01	0.00	0.00	0.08	0.23	0.21	0.36	0.03
O4'	0.00	0.14	0.01	0.02	0.08	0.01	0.05	0.00	0.08	0.05	0.12	0.17	0.13	0.01	0.01	0.05	0.00	0.00	0.13	0.06	0.16	0.10	0.04
O5'	0.12	0.35	0.04	0.00	0.27	0.00	0.29	0.00	0.33	0.17	0.37	0.37	0.31	0.23	0.20	0.09	0.08	0.13	0.00	0.34	0.01	0.00	0.00
O6	0.02	0.05	0.11	0.19	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.01	0.04	0.06	0.04	0.00	0.00	0.00	0.23	0.06	0.34	0.00	0.26	0.08	0.16
OP1	0.18	0.32	0.19	0.23	0.24	0.19	0.23	0.24	0.26	0.15	0.31	0.35	0.30	0.16	0.19	0.07	0.21	0.16	0.01	0.26	0.00	0.03	0.01
OP2	0.11	0.14	0.21	0.30	0.01	0.21	0.01	0.28	0.07	0.18	0.14	0.19	0.09	0.12	0.09	0.24	0.36	0.10	0.00	0.08	0.03	0.00	0.02
P	0.04	0.26	0.01	0.01	0.13	0.01	0.11	0.01	0.16	0.04	0.24	0.31	0.22	0.00	0.05	0.07	0.03	0.04	0.00	0.16	0.01	0.02	0.00