Doublet Group distance statistics: 50544

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N1	A	0, 0.000, 0.009, 0.019, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.009 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.000, 0.014, 0.029, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.014 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.000, 0.015, 0.030, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.015 std_dev=0.015
N6	A	0, 0.000, 0.021, 0.042, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.021 std_dev=0.021
C6	A	0, 0.000, 0.021, 0.043, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.021 std_dev=0.021
C4	A	0, 0.000, 0.022, 0.045, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.022 std_dev=0.022
C5	A	0, 0.000, 0.024, 0.047, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.024 std_dev=0.024
N3	A	0, 0.000, 0.024, 0.047, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.024 std_dev=0.024
N9	A	0, 0.000, 0.028, 0.056, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.028 std_dev=0.028
C8	A	0, 0.000, 0.030, 0.061, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.030 std_dev=0.030
N7	A	0, 0.000, 0.031, 0.062, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.031 std_dev=0.031
O3'	B	0, 0.000, 0.203, 0.406, 0.406 max_d=0.406 avg_d=0.203 std_dev=0.203
C3'	B	0, 0.000, 0.228, 0.455, 0.455 max_d=0.455 avg_d=0.228 std_dev=0.228
C2'	B	0, 0.000, 0.324, 0.647, 0.647 max_d=0.647 avg_d=0.324 std_dev=0.324
O2'	B	0, 0.000, 0.374, 0.748, 0.748 max_d=0.748 avg_d=0.374 std_dev=0.374
O5'	B	0, 0.000, 0.394, 0.789, 0.789 max_d=0.789 avg_d=0.394 std_dev=0.394
C4'	B	0, 0.000, 0.442, 0.884, 0.884 max_d=0.884 avg_d=0.442 std_dev=0.442
OP1	B	0, 0.000, 0.468, 0.935, 0.935 max_d=0.935 avg_d=0.468 std_dev=0.468
OP2	A	0, 0.000, 0.504, 1.008, 1.008 max_d=1.008 avg_d=0.504 std_dev=0.504
P	B	0, 0.000, 0.532, 1.064, 1.064 max_d=1.064 avg_d=0.532 std_dev=0.532
C1'	B	0, 0.000, 0.547, 1.094, 1.094 max_d=1.094 avg_d=0.547 std_dev=0.547
O4'	B	0, 0.000, 0.589, 1.178, 1.178 max_d=1.178 avg_d=0.589 std_dev=0.589
N9	B	0, 0.000, 0.614, 1.228, 1.228 max_d=1.228 avg_d=0.614 std_dev=0.614
C5'	B	0, 0.000, 0.628, 1.256, 1.256 max_d=1.256 avg_d=0.628 std_dev=0.628
C8	B	0, 0.000, 0.680, 1.361, 1.361 max_d=1.361 avg_d=0.680 std_dev=0.680
N7	B	0, 0.000, 0.716, 1.432, 1.432 max_d=1.432 avg_d=0.716 std_dev=0.716
C5	B	0, 0.000, 0.783, 1.565, 1.565 max_d=1.565 avg_d=0.783 std_dev=0.783
OP2	B	0, 0.000, 0.800, 1.600, 1.600 max_d=1.600 avg_d=0.800 std_dev=0.800
C4	B	0, 0.000, 0.809, 1.618, 1.618 max_d=1.618 avg_d=0.809 std_dev=0.809
O6	B	0, 0.000, 0.996, 1.993, 1.993 max_d=1.993 avg_d=0.996 std_dev=0.996
C6	B	0, 0.000, 0.997, 1.993, 1.993 max_d=1.993 avg_d=0.997 std_dev=0.997
O4'	A	0, 0.000, 1.064, 2.128, 2.128 max_d=2.128 avg_d=1.064 std_dev=1.064
N3	B	0, 0.000, 1.100, 2.200, 2.200 max_d=2.200 avg_d=1.100 std_dev=1.100
C2'	A	0, 0.000, 1.104, 2.208, 2.208 max_d=2.208 avg_d=1.104 std_dev=1.104
N1	B	0, 0.000, 1.304, 2.607, 2.607 max_d=2.607 avg_d=1.304 std_dev=1.304
C2	B	0, 0.000, 1.370, 2.740, 2.740 max_d=2.740 avg_d=1.370 std_dev=1.370
O3'	A	0, 0.000, 1.392, 2.784, 2.784 max_d=2.784 avg_d=1.392 std_dev=1.392
C3'	A	0, 0.000, 1.406, 2.811, 2.811 max_d=2.811 avg_d=1.406 std_dev=1.406
C4'	A	0, 0.000, 1.497, 2.994, 2.994 max_d=2.994 avg_d=1.497 std_dev=1.497
O2'	A	0, 0.000, 1.619, 3.237, 3.237 max_d=3.237 avg_d=1.619 std_dev=1.619
N2	B	0, 0.000, 1.758, 3.515, 3.515 max_d=3.515 avg_d=1.758 std_dev=1.758
P	A	0, 0.000, 1.794, 3.588, 3.588 max_d=3.588 avg_d=1.794 std_dev=1.794
O5'	A	0, 0.000, 2.445, 4.889, 4.889 max_d=4.889 avg_d=2.445 std_dev=2.445
C5'	A	0, 0.000, 2.498, 4.997, 4.997 max_d=4.997 avg_d=2.498 std_dev=2.498
OP1	A	0, 0.000, 2.547, 5.094, 5.094 max_d=5.094 avg_d=2.547 std_dev=2.547

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.04	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.15	0.00	0.35	0.14	0.22	0.02
C2	0.00	0.00	0.29	0.31	0.02	0.37	0.02	0.69	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.14	0.32	0.20	1.25	0.91	0.02	0.79
C2'	0.00	0.29	0.00	0.01	0.13	0.01	0.04	0.11	0.10	0.19	0.21	0.28	0.05	0.11	0.01	0.00	0.02	0.01	0.51	0.49	0.46	0.42
C3'	0.00	0.31	0.01	0.00	0.03	0.00	0.14	0.01	0.05	0.45	0.16	0.32	0.14	0.39	0.16	0.02	0.02	0.02	0.26	0.46	0.50	0.34
C4	0.01	0.02	0.13	0.03	0.00	0.12	0.01	0.25	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.15	0.11	0.09	0.80	0.49	0.13	0.42
C4'	0.00	0.37	0.01	0.00	0.12	0.00	0.02	0.00	0.07	0.27	0.24	0.38	0.00	0.21	0.06	0.22	0.01	0.00	0.00	0.08	0.25	0.17
C5	0.02	0.02	0.04	0.14	0.01	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.20	0.05	0.02	0.66	0.42	0.16	0.37
C5'	0.04	0.69	0.11	0.01	0.25	0.00	0.05	0.00	0.19	0.32	0.48	0.66	0.08	0.25	0.03	0.09	0.14	0.01	0.00	0.26	0.16	0.00
C6	0.02	0.01	0.10	0.05	0.02	0.07	0.00	0.19	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.21	0.01	0.06	0.83	0.58	0.12	0.52
C8	0.00	0.03	0.19	0.45	0.00	0.27	0.00	0.32	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.20	0.27	0.09	0.22	0.08	0.23	0.04
N1	0.01	0.01	0.21	0.16	0.01	0.24	0.02	0.48	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.18	0.18	0.13	1.09	0.81	0.05	0.72
N3	0.01	0.00	0.28	0.32	0.00	0.38	0.01	0.66	0.03	0.01	0.02	0.00	0.03	0.00	0.01	0.10	0.33	0.21	1.18	0.78	0.05	0.67
N6	0.02	0.01	0.05	0.14	0.02	0.00	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.24	0.07	0.03	0.75	0.53	0.13	0.49
N7	0.01	0.03	0.11	0.39	0.01	0.21	0.00	0.25	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.23	0.25	0.06	0.35	0.18	0.21	0.16
N9	0.00	0.02	0.01	0.16	0.00	0.06	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.14	0.02	0.00	0.47	0.24	0.19	0.16
O2'	0.01	0.14	0.00	0.02	0.15	0.22	0.20	0.09	0.21	0.20	0.18	0.10	0.24	0.23	0.14	0.00	0.02	0.15	0.19	0.14	0.26	0.09
O3'	0.15	0.32	0.02	0.02	0.11	0.01	0.05	0.14	0.01	0.27	0.18	0.33	0.07	0.25	0.02	0.02	0.00	0.08	0.13	0.18	0.42	0.04
O4'	0.00	0.20	0.01	0.02	0.09	0.00	0.02	0.01	0.06	0.09	0.13	0.21	0.03	0.06	0.00	0.15	0.08	0.00	0.17	0.04	0.61	0.25
O5'	0.35	1.25	0.51	0.26	0.80	0.00	0.66	0.00	0.83	0.22	1.09	1.18	0.75	0.35	0.47	0.19	0.13	0.17	0.00	0.00	0.00	0.00
OP1	0.14	0.91	0.49	0.46	0.49	0.08	0.42	0.26	0.58	0.08	0.81	0.78	0.53	0.18	0.24	0.14	0.18	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00
OP2	0.22	0.02	0.46	0.50	0.13	0.25	0.16	0.16	0.12	0.23	0.05	0.05	0.13	0.21	0.19	0.26	0.42	0.61	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.02	0.79	0.42	0.34	0.42	0.17	0.37	0.00	0.52	0.04	0.72	0.67	0.49	0.16	0.16	0.09	0.04	0.25	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.11	0.07	0.06	0.13	0.05	0.21	0.09	0.29	0.05	0.20	0.03	0.13	0.04	0.17	0.12	0.00	0.10	0.19	0.26	0.07	0.10	0.36	0.26
C2	0.15	0.36	0.09	0.09	0.21	0.13	0.13	0.34	0.19	0.06	0.30	0.44	0.33	0.02	0.11	0.17	0.13	0.04	0.22	0.14	0.17	0.36	0.28
C2'	0.49	0.43	0.30	0.27	0.51	0.40	0.56	0.44	0.55	0.60	0.48	0.36	0.44	0.61	0.54	0.19	0.09	0.54	0.42	0.58	0.18	0.60	0.43
C3'	0.99	0.94	0.88	0.81	1.00	0.84	1.03	0.82	1.02	1.05	0.97	0.87	0.95	1.06	1.02	0.81	0.66	0.96	0.81	1.03	0.54	0.97	0.78
C4	0.02	0.22	0.00	0.12	0.08	0.17	0.02	0.31	0.08	0.13	0.17	0.30	0.19	0.09	0.01	0.07	0.14	0.08	0.26	0.04	0.13	0.35	0.27
C4'	1.09	0.80	1.09	1.11	0.97	1.12	1.00	1.09	0.93	1.10	0.84	0.68	0.87	1.07	1.06	1.06	1.06	1.10	1.08	0.94	0.87	1.18	1.03
C5	0.08	0.29	0.03	0.10	0.15	0.12	0.09	0.26	0.14	0.07	0.24	0.36	0.25	0.03	0.05	0.09	0.14	0.01	0.23	0.11	0.12	0.31	0.24
C5'	1.81	1.39	1.81	1.79	1.65	1.76	1.66	1.69	1.56	1.80	1.44	1.20	1.51	1.75	1.77	1.73	1.69	1.77	1.67	1.56	1.44	1.81	1.62
C6	0.17	0.38	0.09	0.06	0.24	0.05	0.18	0.22	0.24	0.01	0.34	0.46	0.35	0.04	0.14	0.15	0.13	0.11	0.18	0.20	0.12	0.27	0.21
C8	0.02	0.17	0.03	0.12	0.04	0.16	0.01	0.26	0.04	0.13	0.13	0.24	0.13	0.10	0.04	0.02	0.13	0.09	0.25	0.02	0.10	0.32	0.24
N1	0.20	0.41	0.11	0.06	0.27	0.06	0.19	0.27	0.26	0.01	0.36	0.49	0.38	0.05	0.17	0.17	0.14	0.13	0.18	0.21	0.15	0.30	0.24
N3	0.03	0.24	0.02	0.13	0.10	0.20	0.02	0.35	0.08	0.14	0.18	0.32	0.21	0.10	0.01	0.11	0.13	0.09	0.26	0.04	0.15	0.38	0.29
N6	0.20	0.42	0.10	0.04	0.28	0.01	0.22	0.17	0.29	0.06	0.38	0.50	0.38	0.09	0.18	0.15	0.13	0.15	0.14	0.25	0.09	0.21	0.16
N7	0.04	0.25	0.01	0.10	0.11	0.12	0.06	0.24	0.12	0.08	0.20	0.32	0.21	0.05	0.03	0.06	0.14	0.02	0.23	0.09	0.09	0.29	0.22
N9	0.05	0.14	0.04	0.13	0.01	0.19	0.04	0.29	0.01	0.16	0.10	0.21	0.11	0.13	0.07	0.02	0.13	0.13	0.26	0.01	0.11	0.35	0.26
O2'	0.02	0.07	0.29	0.30	0.01	0.08	0.07	0.03	0.06	0.12	0.01	0.14	0.07	0.14	0.04	0.42	0.51	0.09	0.00	0.09	0.19	0.19	0.05
O3'	0.98	0.98	0.88	0.81	1.01	0.83	1.03	0.79	1.03	1.02	1.01	0.94	0.99	1.04	1.01	0.84	0.67	0.93	0.81	1.04	0.54	0.95	0.77
O4'	0.56	0.19	0.62	0.74	0.39	0.78	0.43	0.82	0.35	0.60	0.24	0.07	0.26	0.54	0.52	0.58	0.77	0.65	0.78	0.36	0.64	0.83	0.75
O5'	1.91	1.27	1.73	1.83	1.70	1.96	1.77	2.01	1.62	2.04	1.38	0.97	1.42	1.96	1.90	1.52	1.66	2.04	1.94	1.64	1.79	2.15	1.97
OP1	1.94	1.50	1.69	1.73	1.93	1.79	2.01	1.85	1.87	2.17	1.63	1.15	1.66	2.16	2.06	1.40	1.53	1.95	1.81	1.89	1.72	2.15	1.89
OP2	0.42	0.13	0.23	0.30	0.38	0.42	0.48	0.51	0.41	0.62	0.25	0.06	0.18	0.62	0.49	0.07	0.17	0.51	0.40	0.46	0.32	0.68	0.48
P	1.40	0.92	1.14	1.22	1.32	1.37	1.43	1.47	1.31	1.65	1.07	0.61	1.04	1.62	1.49	0.88	1.02	1.52	1.39	1.35	1.30	1.71	1.49

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.03	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.11	0.01	0.11	0.11	0.04
C2	0.02	0.00	0.13	0.14	0.01	0.05	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.11	0.18	0.02	0.09	0.01	0.02	0.12	0.02
C2'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.07	0.01	0.04	0.01	0.06	0.04	0.10	0.16	0.13	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.05	0.01	0.17	0.06
C3'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.08	0.01	0.05	0.01	0.08	0.04	0.12	0.16	0.13	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.07	0.02	0.20	0.12
C4	0.01	0.01	0.07	0.08	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.05	0.09	0.01	0.14	0.00	0.04	0.10	0.05
C4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.07	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.12	0.13	0.02
C5	0.01	0.00	0.04	0.05	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.07	0.00	0.18	0.00	0.05	0.07	0.07
C5'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.05	0.03	0.01	0.00	0.02	0.03	0.00	0.00	0.01	0.19	0.10	0.01
C6	0.01	0.00	0.06	0.08	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.11	0.01	0.16	0.00	0.01	0.06	0.06
C8	0.00	0.00	0.04	0.04	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.04	0.02	0.25	0.00	0.14	0.05	0.11
N1	0.02	0.00	0.10	0.12	0.00	0.04	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.09	0.16	0.01	0.12	0.01	0.01	0.09	0.04
N2	0.03	0.00	0.16	0.16	0.01	0.07	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.14	0.22	0.02	0.06	0.02	0.04	0.13	0.00
N3	0.02	0.00	0.13	0.13	0.00	0.05	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.10	0.16	0.01	0.08	0.01	0.01	0.13	0.01
N7	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.24	0.00	0.10	0.02	0.11
N9	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.17	0.01	0.10	0.09	0.06
O2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.05	0.01	0.03	0.02	0.05	0.03	0.09	0.14	0.10	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.04	0.02	0.17	0.07
O3'	0.01	0.18	0.01	0.01	0.09	0.01	0.07	0.03	0.11	0.04	0.16	0.22	0.16	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.24	0.09	0.12	0.24	0.21
O4'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.14	0.00	0.18	0.09	0.07
O5'	0.11	0.09	0.02	0.11	0.14	0.01	0.18	0.00	0.16	0.25	0.12	0.06	0.08	0.24	0.17	0.05	0.24	0.14	0.00	0.17	0.00	0.01	0.00
O6	0.01	0.01	0.05	0.07	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.09	0.00	0.17	0.00	0.01	0.04	0.07
OP1	0.11	0.02	0.01	0.02	0.04	0.12	0.05	0.19	0.01	0.14	0.01	0.04	0.01	0.10	0.10	0.02	0.12	0.18	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.11	0.12	0.17	0.20	0.10	0.13	0.07	0.10	0.06	0.05	0.09	0.13	0.13	0.02	0.09	0.17	0.24	0.09	0.01	0.04	0.00	0.00	0.00
P	0.04	0.02	0.06	0.12	0.05	0.02	0.07	0.01	0.06	0.11	0.04	0.00	0.01	0.11	0.06	0.07	0.21	0.07	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00