Doublet Group distance statistics: 50550

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 9, 14, 16, 5, 5, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.002, 0.005, 0.008, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.005 std_dev=0.003
C5	A	0, 0.002, 0.006, 0.010, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.006 std_dev=0.004
N1	A	0, 0.001, 0.008, 0.016, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.008 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.003, 0.011, 0.018, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.003, 0.011, 0.020, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.004, 0.013, 0.021, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.013 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.002, 0.011, 0.019, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.011 std_dev=0.009
O2	A	0, 0.007, 0.027, 0.046, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.027 std_dev=0.020
O4	A	0, 0.012, 0.049, 0.086, 0.161 max_d=0.161 avg_d=0.049 std_dev=0.037
C2'	A	0, 0.039, 0.109, 0.179, 0.274 max_d=0.274 avg_d=0.109 std_dev=0.070
O4'	A	0, 0.026, 0.096, 0.167, 0.305 max_d=0.305 avg_d=0.096 std_dev=0.070
C4'	A	0, 0.043, 0.170, 0.297, 0.615 max_d=0.615 avg_d=0.170 std_dev=0.127
C4	B	0, 0.243, 0.378, 0.514, 0.702 max_d=0.702 avg_d=0.378 std_dev=0.135
N3	B	0, 0.203, 0.339, 0.475, 0.714 max_d=0.714 avg_d=0.339 std_dev=0.136
N4	B	0, 0.229, 0.384, 0.539, 0.889 max_d=0.889 avg_d=0.384 std_dev=0.155
N1	B	0, 0.242, 0.400, 0.559, 0.895 max_d=0.895 avg_d=0.400 std_dev=0.158
C2	B	0, 0.199, 0.369, 0.538, 0.826 max_d=0.826 avg_d=0.369 std_dev=0.169
C6	B	0, 0.302, 0.484, 0.665, 0.915 max_d=0.915 avg_d=0.484 std_dev=0.182
C1'	B	0, 0.253, 0.443, 0.633, 1.051 max_d=1.051 avg_d=0.443 std_dev=0.190
C5	B	0, 0.293, 0.490, 0.688, 1.159 max_d=1.159 avg_d=0.490 std_dev=0.198
O4'	B	0, 0.261, 0.474, 0.687, 1.214 max_d=1.214 avg_d=0.474 std_dev=0.213
C2'	B	0, 0.262, 0.501, 0.740, 1.211 max_d=1.211 avg_d=0.501 std_dev=0.239
C5'	A	0, 0.079, 0.330, 0.582, 1.232 max_d=1.232 avg_d=0.330 std_dev=0.252
C4'	B	0, 0.294, 0.549, 0.804, 1.364 max_d=1.364 avg_d=0.549 std_dev=0.255
O2	B	0, 0.160, 0.435, 0.710, 1.371 max_d=1.371 avg_d=0.435 std_dev=0.275
C5'	B	0, 0.309, 0.589, 0.869, 1.474 max_d=1.474 avg_d=0.589 std_dev=0.280
C3'	B	0, 0.287, 0.571, 0.855, 1.410 max_d=1.410 avg_d=0.571 std_dev=0.284
O2'	A	0, -0.055, 0.237, 0.529, 1.649 max_d=1.649 avg_d=0.237 std_dev=0.292
O5'	B	0, 0.242, 0.547, 0.853, 1.435 max_d=1.435 avg_d=0.547 std_dev=0.305
C3'	A	0, -0.156, 0.152, 0.459, 1.714 max_d=1.714 avg_d=0.152 std_dev=0.307
O2'	B	0, 0.244, 0.572, 0.900, 1.814 max_d=1.814 avg_d=0.572 std_dev=0.328
P	B	0, 0.247, 0.604, 0.962, 1.932 max_d=1.932 avg_d=0.604 std_dev=0.357
O3'	B	0, 0.307, 0.674, 1.041, 1.948 max_d=1.948 avg_d=0.674 std_dev=0.367
O5'	A	0, 0.019, 0.396, 0.773, 2.064 max_d=2.064 avg_d=0.396 std_dev=0.377
OP1	B	0, 0.298, 0.694, 1.089, 2.080 max_d=2.080 avg_d=0.694 std_dev=0.396
OP2	A	0, 0.123, 0.526, 0.930, 1.791 max_d=1.791 avg_d=0.526 std_dev=0.404
OP2	B	0, 0.193, 0.601, 1.010, 2.365 max_d=2.365 avg_d=0.601 std_dev=0.409
P	A	0, 0.031, 0.538, 1.045, 2.660 max_d=2.660 avg_d=0.538 std_dev=0.507
O3'	A	0, -0.362, 0.234, 0.830, 3.284 max_d=3.284 avg_d=0.234 std_dev=0.596
OP1	A	0, -0.027, 0.672, 1.370, 3.994 max_d=3.994 avg_d=0.672 std_dev=0.698

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.14	0.01	0.00	0.11	0.27	0.12	0.14
C2	0.01	0.00	0.05	0.06	0.00	0.02	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.20	0.09	0.00	0.01	0.16	0.49	0.14	0.22
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.02	0.01	0.04	0.10	0.04	0.01	0.03	0.09	0.00	0.01	0.02	0.01	0.22	0.32	0.16	0.24
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.16	0.00	0.20	0.01	0.18	0.09	0.11	0.05	0.01	0.00	0.18	0.01	0.04	0.09	0.08	0.05
C4	0.00	0.00	0.02	0.16	0.00	0.06	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.16	0.05	0.00	0.02	0.13	0.44	0.18	0.13
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.06	0.00	0.08	0.00	0.07	0.03	0.04	0.03	0.15	0.01	0.07	0.00	0.01	0.08	0.12	0.02
C5	0.01	0.00	0.04	0.20	0.00	0.08	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.01	0.09	0.09	0.00	0.03	0.16	0.34	0.17	0.10
C5'	0.05	0.08	0.10	0.01	0.07	0.00	0.09	0.00	0.08	0.06	0.07	0.11	0.05	0.10	0.08	0.01	0.01	0.13	0.16	0.01
C6	0.01	0.00	0.04	0.18	0.00	0.07	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.06	0.07	0.00	0.03	0.14	0.31	0.11	0.10
N1	0.00	0.00	0.01	0.09	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.09	0.05	0.00	0.01	0.12	0.37	0.11	0.16
N3	0.01	0.00	0.03	0.11	0.00	0.04	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.20	0.04	0.00	0.02	0.14	0.51	0.16	0.20
O2	0.02	0.00	0.09	0.05	0.01	0.03	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00	0.27	0.18	0.01	0.01	0.22	0.54	0.17	0.28
O2'	0.01	0.20	0.00	0.01	0.16	0.15	0.09	0.05	0.06	0.09	0.20	0.27	0.00	0.03	0.17	0.10	0.16	0.29	0.13	0.20
O3'	0.14	0.09	0.01	0.00	0.05	0.01	0.09	0.10	0.07	0.05	0.04	0.18	0.03	0.00	0.07	0.11	0.12	0.29	0.16	0.17
O4	0.01	0.00	0.02	0.18	0.00	0.07	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.17	0.07	0.00	0.03	0.13	0.44	0.22	0.11
O4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.10	0.11	0.03	0.00	0.04	0.11	0.13	0.05
O5'	0.11	0.16	0.22	0.04	0.13	0.01	0.16	0.01	0.14	0.12	0.14	0.22	0.16	0.12	0.13	0.04	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.27	0.49	0.32	0.09	0.44	0.08	0.34	0.13	0.31	0.37	0.51	0.54	0.29	0.29	0.44	0.11	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.12	0.14	0.16	0.08	0.18	0.12	0.17	0.16	0.11	0.11	0.16	0.17	0.13	0.16	0.22	0.13	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.14	0.22	0.24	0.05	0.13	0.02	0.10	0.01	0.10	0.16	0.20	0.28	0.20	0.17	0.11	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.12	0.10	0.16	0.14	0.11	0.13	0.10	0.12	0.10	0.10	0.09	0.14	0.12	0.24	0.17	0.11	0.11	0.13	0.13	0.12
C2	0.12	0.09	0.15	0.12	0.12	0.11	0.11	0.10	0.09	0.09	0.10	0.15	0.12	0.22	0.14	0.11	0.09	0.11	0.11	0.10
C2'	0.17	0.13	0.22	0.21	0.12	0.18	0.12	0.17	0.12	0.14	0.12	0.15	0.15	0.31	0.25	0.16	0.15	0.17	0.15	0.15
C3'	0.14	0.11	0.22	0.20	0.18	0.16	0.16	0.14	0.13	0.12	0.14	0.23	0.13	0.32	0.26	0.13	0.11	0.13	0.09	0.10
C4	0.13	0.13	0.14	0.11	0.09	0.11	0.10	0.10	0.09	0.11	0.10	0.13	0.18	0.20	0.11	0.12	0.09	0.09	0.10	0.09
C4'	0.13	0.10	0.18	0.15	0.12	0.13	0.11	0.12	0.10	0.10	0.10	0.16	0.12	0.27	0.20	0.12	0.10	0.12	0.11	0.10
C5	0.13	0.13	0.14	0.11	0.09	0.11	0.09	0.10	0.09	0.11	0.10	0.12	0.17	0.21	0.11	0.12	0.09	0.10	0.10	0.09
C5'	0.20	0.14	0.23	0.19	0.09	0.19	0.09	0.16	0.10	0.14	0.10	0.14	0.20	0.35	0.22	0.18	0.12	0.13	0.10	0.11
C6	0.12	0.11	0.14	0.11	0.10	0.11	0.09	0.10	0.09	0.10	0.09	0.13	0.15	0.22	0.12	0.11	0.08	0.10	0.10	0.09
N1	0.12	0.10	0.15	0.12	0.11	0.11	0.10	0.10	0.09	0.09	0.09	0.14	0.12	0.22	0.14	0.11	0.09	0.10	0.11	0.09
N3	0.12	0.11	0.14	0.11	0.11	0.11	0.10	0.10	0.09	0.10	0.09	0.15	0.16	0.21	0.12	0.11	0.08	0.10	0.10	0.09
O2	0.11	0.10	0.15	0.14	0.14	0.12	0.12	0.12	0.11	0.10	0.12	0.16	0.11	0.22	0.16	0.11	0.11	0.13	0.13	0.12
O2'	0.39	0.31	0.45	0.45	0.24	0.42	0.27	0.41	0.31	0.34	0.25	0.19	0.34	0.54	0.48	0.38	0.39	0.41	0.39	0.39
O3'	0.24	0.18	0.38	0.38	0.13	0.30	0.14	0.29	0.17	0.19	0.14	0.14	0.22	0.47	0.47	0.22	0.27	0.32	0.27	0.27
O4	0.14	0.16	0.15	0.11	0.10	0.12	0.10	0.11	0.10	0.13	0.13	0.13	0.20	0.20	0.11	0.13	0.10	0.11	0.12	0.10
O4'	0.11	0.09	0.15	0.13	0.10	0.11	0.10	0.11	0.09	0.09	0.09	0.14	0.11	0.23	0.15	0.11	0.10	0.11	0.12	0.10
O5'	0.29	0.23	0.33	0.28	0.13	0.28	0.13	0.25	0.16	0.22	0.16	0.17	0.31	0.46	0.31	0.27	0.19	0.19	0.14	0.16
OP1	0.78	0.71	0.79	0.74	0.50	0.76	0.51	0.73	0.61	0.70	0.60	0.38	0.80	0.92	0.75	0.77	0.65	0.63	0.55	0.62
OP2	0.23	0.19	0.23	0.19	0.21	0.21	0.23	0.19	0.20	0.19	0.17	0.27	0.26	0.33	0.19	0.23	0.19	0.18	0.19	0.18
P	0.40	0.33	0.43	0.36	0.15	0.38	0.16	0.34	0.23	0.32	0.23	0.12	0.43	0.56	0.39	0.38	0.27	0.24	0.17	0.23

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.04	0.05	0.03
C2	0.01	0.00	0.03	0.05	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.05	0.01	0.06	0.07	0.09	0.07
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.01	0.03	0.02	0.05	0.00	0.02	0.01	0.02	0.06	0.05	0.03
C3'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.02	0.05	0.04	0.07	0.03	0.00	0.01	0.03	0.06	0.04	0.03
C4	0.01	0.00	0.02	0.03	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.03	0.02	0.07	0.09	0.12	0.10
C4'	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.07	0.02	0.00	0.01	0.05	0.02	0.02
C5	0.01	0.00	0.02	0.03	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.04	0.02	0.07	0.09	0.12	0.10
C5'	0.01	0.03	0.02	0.01	0.05	0.00	0.05	0.00	0.05	0.03	0.04	0.05	0.03	0.08	0.03	0.01	0.01	0.05	0.02	0.02
C6	0.01	0.00	0.03	0.03	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.04	0.02	0.07	0.07	0.09	0.08
N1	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.05	0.06	0.08	0.06
N3	0.01	0.00	0.03	0.05	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.05	0.01	0.07	0.08	0.11	0.09
N4	0.01	0.00	0.02	0.04	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.04	0.02	0.07	0.10	0.13	0.11
O2	0.01	0.00	0.05	0.07	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.05	0.08	0.02	0.05	0.07	0.09	0.06
O2'	0.01	0.03	0.00	0.03	0.03	0.07	0.02	0.08	0.02	0.01	0.04	0.03	0.05	0.00	0.05	0.04	0.05	0.10	0.04	0.06
O3'	0.01	0.05	0.02	0.00	0.03	0.02	0.04	0.03	0.04	0.02	0.05	0.04	0.08	0.05	0.00	0.02	0.04	0.09	0.05	0.05
O4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.02	0.00	0.04	0.05	0.05	0.04
O5'	0.03	0.06	0.02	0.03	0.07	0.01	0.07	0.01	0.07	0.05	0.07	0.07	0.05	0.05	0.04	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.04	0.07	0.06	0.06	0.09	0.05	0.09	0.05	0.07	0.06	0.08	0.10	0.07	0.10	0.09	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.05	0.09	0.05	0.04	0.12	0.02	0.12	0.02	0.09	0.08	0.11	0.13	0.09	0.04	0.05	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.03	0.07	0.03	0.03	0.10	0.02	0.10	0.02	0.08	0.06	0.09	0.11	0.06	0.06	0.05	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00