Doublet Group distance statistics: 50551

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 1, 4, 7, 7, 13, 5, 2, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.007, 0.011, 0.015, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.011 std_dev=0.004
N3	A	0, 0.002, 0.007, 0.012, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.007 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.010, 0.016, 0.022, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.016 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.005, 0.012, 0.019, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.012 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.006, 0.014, 0.021, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.014 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.007, 0.016, 0.024, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.016 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.004, 0.013, 0.022, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.013 std_dev=0.009
O2	A	0, 0.006, 0.029, 0.053, 0.126 max_d=0.126 avg_d=0.029 std_dev=0.023
O4	A	0, 0.030, 0.078, 0.126, 0.195 max_d=0.195 avg_d=0.078 std_dev=0.048
O4'	A	0, 0.047, 0.118, 0.188, 0.294 max_d=0.294 avg_d=0.118 std_dev=0.070
C2'	A	0, 0.080, 0.151, 0.221, 0.284 max_d=0.284 avg_d=0.151 std_dev=0.071
C4'	A	0, 0.105, 0.207, 0.309, 0.434 max_d=0.434 avg_d=0.207 std_dev=0.102
C3'	A	0, 0.092, 0.202, 0.312, 0.429 max_d=0.429 avg_d=0.202 std_dev=0.110
O2'	A	0, 0.124, 0.236, 0.349, 0.634 max_d=0.634 avg_d=0.236 std_dev=0.113
N4	B	0, 0.258, 0.398, 0.539, 0.698 max_d=0.698 avg_d=0.398 std_dev=0.141
N3	B	0, 0.209, 0.364, 0.520, 0.671 max_d=0.671 avg_d=0.364 std_dev=0.156
C4	B	0, 0.235, 0.392, 0.548, 0.711 max_d=0.711 avg_d=0.392 std_dev=0.156
O3'	A	0, 0.124, 0.285, 0.445, 0.605 max_d=0.605 avg_d=0.285 std_dev=0.160
C5'	A	0, 0.192, 0.355, 0.517, 0.725 max_d=0.725 avg_d=0.355 std_dev=0.162
O5'	A	0, 0.182, 0.348, 0.513, 0.833 max_d=0.833 avg_d=0.348 std_dev=0.165
C2	B	0, 0.225, 0.410, 0.595, 0.789 max_d=0.789 avg_d=0.410 std_dev=0.185
C5	B	0, 0.276, 0.462, 0.648, 0.836 max_d=0.836 avg_d=0.462 std_dev=0.186
O2	B	0, 0.228, 0.424, 0.621, 0.951 max_d=0.951 avg_d=0.424 std_dev=0.197
N1	B	0, 0.278, 0.483, 0.687, 0.898 max_d=0.898 avg_d=0.483 std_dev=0.205
C6	B	0, 0.300, 0.506, 0.712, 0.884 max_d=0.884 avg_d=0.506 std_dev=0.206
C1'	B	0, 0.341, 0.567, 0.792, 1.106 max_d=1.106 avg_d=0.567 std_dev=0.226
O4'	B	0, 0.429, 0.655, 0.881, 1.090 max_d=1.090 avg_d=0.655 std_dev=0.226
P	A	0, 0.206, 0.441, 0.676, 1.401 max_d=1.401 avg_d=0.441 std_dev=0.235
C2'	B	0, 0.359, 0.616, 0.874, 1.409 max_d=1.409 avg_d=0.616 std_dev=0.258
O5'	B	0, 0.529, 0.791, 1.054, 1.445 max_d=1.445 avg_d=0.791 std_dev=0.262
C4'	B	0, 0.481, 0.756, 1.030, 1.423 max_d=1.423 avg_d=0.756 std_dev=0.274
O2'	B	0, 0.445, 0.729, 1.013, 1.644 max_d=1.644 avg_d=0.729 std_dev=0.284
C3'	B	0, 0.449, 0.734, 1.020, 1.522 max_d=1.522 avg_d=0.734 std_dev=0.285
OP2	B	0, 0.504, 0.792, 1.079, 1.644 max_d=1.644 avg_d=0.792 std_dev=0.287
OP1	A	0, 0.217, 0.513, 0.809, 1.765 max_d=1.765 avg_d=0.513 std_dev=0.296
P	B	0, 0.518, 0.822, 1.127, 1.730 max_d=1.730 avg_d=0.822 std_dev=0.304
OP2	A	0, 0.178, 0.484, 0.790, 1.781 max_d=1.781 avg_d=0.484 std_dev=0.306
C5'	B	0, 0.520, 0.827, 1.133, 1.606 max_d=1.606 avg_d=0.827 std_dev=0.306
O3'	B	0, 0.476, 0.844, 1.213, 1.931 max_d=1.931 avg_d=0.844 std_dev=0.369
OP1	B	0, 0.428, 0.839, 1.251, 2.215 max_d=2.215 avg_d=0.839 std_dev=0.412

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01	0.00	0.08	0.07	0.15	0.09
C2	0.02	0.00	0.05	0.05	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.05	0.01	0.02	0.14	0.16	0.28	0.18
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.04	0.01	0.03	0.02	0.03	0.02	0.05	0.07	0.00	0.02	0.06	0.01	0.06	0.10	0.14	0.08
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.06	0.00	0.08	0.02	0.08	0.04	0.05	0.06	0.02	0.00	0.07	0.02	0.06	0.13	0.11	0.08
C4	0.01	0.01	0.04	0.06	0.00	0.06	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.07	0.00	0.03	0.20	0.26	0.38	0.27
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.06	0.00	0.08	0.01	0.08	0.04	0.04	0.04	0.05	0.01	0.06	0.00	0.02	0.05	0.05	0.02
C5	0.01	0.01	0.03	0.08	0.01	0.08	0.00	0.15	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.09	0.01	0.03	0.21	0.27	0.37	0.28
C5'	0.02	0.07	0.02	0.02	0.13	0.01	0.15	0.00	0.14	0.08	0.09	0.05	0.05	0.03	0.14	0.02	0.01	0.05	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.03	0.08	0.01	0.08	0.00	0.14	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.08	0.01	0.02	0.18	0.21	0.29	0.22
N1	0.00	0.01	0.02	0.04	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.04	0.01	0.01	0.13	0.14	0.24	0.16
N3	0.01	0.00	0.05	0.05	0.00	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.06	0.01	0.02	0.17	0.21	0.34	0.23
O2	0.03	0.01	0.07	0.06	0.01	0.04	0.01	0.05	0.02	0.02	0.01	0.00	0.10	0.08	0.01	0.03	0.12	0.12	0.25	0.15
O2'	0.02	0.07	0.00	0.02	0.06	0.05	0.03	0.05	0.03	0.03	0.08	0.10	0.00	0.04	0.07	0.04	0.06	0.10	0.11	0.06
O3'	0.01	0.05	0.02	0.00	0.07	0.01	0.09	0.03	0.08	0.04	0.06	0.08	0.04	0.00	0.09	0.01	0.06	0.18	0.14	0.11
O4	0.01	0.01	0.06	0.07	0.00	0.06	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.09	0.00	0.03	0.20	0.29	0.41	0.30
O4'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.00	0.03	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.04	0.01	0.03	0.00	0.06	0.05	0.11	0.08
O5'	0.08	0.14	0.06	0.06	0.20	0.02	0.21	0.01	0.18	0.13	0.17	0.12	0.06	0.06	0.20	0.06	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.07	0.16	0.10	0.13	0.26	0.05	0.27	0.05	0.21	0.14	0.21	0.12	0.10	0.18	0.29	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.15	0.28	0.14	0.11	0.38	0.05	0.37	0.02	0.29	0.24	0.34	0.25	0.11	0.14	0.41	0.11	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.18	0.08	0.08	0.27	0.02	0.28	0.01	0.22	0.16	0.23	0.15	0.06	0.11	0.30	0.08	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.08	0.07	0.14	0.16	0.05	0.09	0.05	0.07	0.05	0.06	0.06	0.07	0.10	0.13	0.22	0.07	0.10	0.13	0.16	0.09
C2	0.08	0.08	0.14	0.16	0.05	0.09	0.05	0.08	0.05	0.07	0.06	0.07	0.11	0.13	0.22	0.07	0.10	0.13	0.15	0.09
C2'	0.11	0.10	0.17	0.18	0.07	0.11	0.07	0.09	0.07	0.09	0.08	0.08	0.13	0.16	0.23	0.09	0.11	0.12	0.15	0.08
C3'	0.09	0.09	0.14	0.16	0.08	0.09	0.07	0.06	0.07	0.08	0.08	0.10	0.11	0.14	0.20	0.08	0.09	0.08	0.14	0.06
C4	0.09	0.09	0.14	0.17	0.07	0.10	0.07	0.09	0.07	0.08	0.08	0.08	0.11	0.12	0.21	0.07	0.13	0.15	0.16	0.11
C4'	0.07	0.07	0.13	0.15	0.06	0.07	0.06	0.05	0.05	0.06	0.05	0.08	0.10	0.12	0.21	0.06	0.09	0.11	0.15	0.08
C5	0.09	0.09	0.14	0.17	0.08	0.10	0.08	0.10	0.08	0.08	0.08	0.09	0.11	0.12	0.22	0.07	0.14	0.16	0.18	0.12
C5'	0.07	0.08	0.08	0.10	0.11	0.06	0.12	0.08	0.10	0.08	0.08	0.13	0.09	0.09	0.15	0.10	0.12	0.14	0.19	0.15
C6	0.08	0.08	0.13	0.17	0.06	0.09	0.06	0.09	0.06	0.07	0.07	0.08	0.10	0.12	0.22	0.07	0.13	0.15	0.17	0.11
N1	0.07	0.07	0.13	0.16	0.05	0.09	0.05	0.07	0.05	0.06	0.06	0.07	0.10	0.12	0.22	0.06	0.11	0.13	0.16	0.09
N3	0.08	0.08	0.13	0.16	0.05	0.09	0.05	0.08	0.05	0.07	0.06	0.07	0.11	0.12	0.21	0.07	0.11	0.13	0.15	0.09
O2	0.08	0.08	0.15	0.17	0.06	0.10	0.06	0.08	0.06	0.07	0.06	0.08	0.11	0.14	0.23	0.08	0.10	0.13	0.14	0.09
O2'	0.15	0.14	0.21	0.22	0.10	0.16	0.09	0.14	0.11	0.13	0.11	0.10	0.17	0.21	0.27	0.14	0.15	0.16	0.18	0.13
O3'	0.12	0.12	0.18	0.18	0.10	0.12	0.09	0.08	0.09	0.10	0.10	0.12	0.15	0.18	0.23	0.10	0.09	0.08	0.13	0.05
O4	0.11	0.11	0.14	0.17	0.09	0.11	0.08	0.10	0.09	0.10	0.11	0.09	0.13	0.13	0.20	0.09	0.14	0.15	0.17	0.12
O4'	0.07	0.07	0.12	0.15	0.05	0.08	0.05	0.06	0.05	0.06	0.06	0.07	0.10	0.12	0.21	0.06	0.10	0.14	0.17	0.10
O5'	0.15	0.15	0.11	0.11	0.18	0.14	0.19	0.17	0.18	0.16	0.15	0.19	0.14	0.12	0.13	0.18	0.20	0.20	0.24	0.22
OP1	0.24	0.23	0.17	0.17	0.28	0.23	0.30	0.29	0.29	0.25	0.24	0.29	0.20	0.17	0.15	0.28	0.31	0.32	0.35	0.35
OP2	0.38	0.36	0.31	0.31	0.39	0.37	0.41	0.42	0.41	0.39	0.36	0.39	0.34	0.32	0.27	0.42	0.43	0.43	0.45	0.46
P	0.24	0.24	0.17	0.17	0.27	0.23	0.29	0.28	0.28	0.25	0.24	0.28	0.22	0.18	0.14	0.28	0.30	0.30	0.34	0.33

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.04	0.06	0.07	0.03
C2	0.01	0.00	0.05	0.07	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.05	0.07	0.01	0.08	0.08	0.12	0.06
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.05	0.04	0.09	0.00	0.01	0.01	0.04	0.07	0.10	0.05
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.06	0.00	0.06	0.02	0.05	0.04	0.07	0.07	0.09	0.02	0.01	0.01	0.05	0.08	0.09	0.06
C4	0.01	0.01	0.03	0.06	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.07	0.02	0.11	0.12	0.16	0.10
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.04	0.02	0.03	0.04	0.04	0.05	0.02	0.00	0.01	0.06	0.04	0.02
C5	0.01	0.01	0.03	0.06	0.00	0.04	0.00	0.07	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.06	0.02	0.11	0.11	0.16	0.10
C5'	0.01	0.04	0.01	0.02	0.07	0.00	0.07	0.00	0.06	0.04	0.05	0.07	0.04	0.05	0.03	0.01	0.01	0.07	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.04	0.05	0.01	0.04	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.06	0.02	0.09	0.09	0.12	0.07
N1	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.02	0.01	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.08	0.07	0.10	0.05
N3	0.01	0.01	0.05	0.07	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.09	0.01	0.10	0.10	0.14	0.08
N4	0.02	0.02	0.04	0.07	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.09	0.03	0.11	0.13	0.17	0.11
O2	0.02	0.01	0.09	0.09	0.02	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.08	0.10	0.02	0.08	0.08	0.10	0.05
O2'	0.02	0.05	0.00	0.02	0.02	0.05	0.03	0.05	0.03	0.02	0.04	0.03	0.08	0.00	0.03	0.04	0.03	0.07	0.07	0.04
O3'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.07	0.02	0.06	0.03	0.06	0.03	0.09	0.09	0.10	0.03	0.00	0.01	0.08	0.11	0.11	0.08
O4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.04	0.01	0.00	0.06	0.07	0.07	0.06
O5'	0.04	0.08	0.04	0.05	0.11	0.01	0.11	0.01	0.09	0.08	0.10	0.11	0.08	0.03	0.08	0.06	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.06	0.08	0.07	0.08	0.12	0.06	0.11	0.07	0.09	0.07	0.10	0.13	0.08	0.07	0.11	0.07	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.07	0.12	0.10	0.09	0.16	0.04	0.16	0.02	0.12	0.10	0.14	0.17	0.10	0.07	0.11	0.07	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.03	0.06	0.05	0.06	0.10	0.02	0.10	0.01	0.07	0.05	0.08	0.11	0.05	0.04	0.08	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00