Doublet Group distance statistics: 50553

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 2, 3, 3, 1, 2, 1, 4, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.004, 0.006, 0.008, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.006 std_dev=0.002
C5	A	0, 0.004, 0.008, 0.012, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.008 std_dev=0.004
C2	A	0, 0.008, 0.013, 0.018, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.013 std_dev=0.005
C1'	A	0, 0.007, 0.012, 0.018, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.012 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.002, 0.008, 0.014, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.008 std_dev=0.006
C4	A	0, 0.005, 0.010, 0.016, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.010 std_dev=0.006
C6	A	0, 0.004, 0.010, 0.016, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.010 std_dev=0.006
O2	A	0, 0.020, 0.030, 0.041, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.030 std_dev=0.010
O4	A	0, 0.011, 0.055, 0.098, 0.177 max_d=0.177 avg_d=0.055 std_dev=0.043
O4'	A	0, -0.022, 0.125, 0.273, 0.436 max_d=0.436 avg_d=0.125 std_dev=0.148
C2'	A	0, -0.041, 0.154, 0.348, 0.580 max_d=0.580 avg_d=0.154 std_dev=0.194
N3	B	0, 0.216, 0.427, 0.637, 0.900 max_d=0.900 avg_d=0.427 std_dev=0.210
N4	B	0, 0.228, 0.443, 0.658, 0.933 max_d=0.933 avg_d=0.443 std_dev=0.215
C4	B	0, 0.223, 0.441, 0.658, 0.930 max_d=0.930 avg_d=0.441 std_dev=0.218
C2	B	0, 0.258, 0.502, 0.747, 0.936 max_d=0.936 avg_d=0.502 std_dev=0.244
C5	B	0, 0.318, 0.574, 0.829, 0.977 max_d=0.977 avg_d=0.574 std_dev=0.255
N1	B	0, 0.306, 0.583, 0.861, 0.992 max_d=0.992 avg_d=0.583 std_dev=0.277
O2	B	0, 0.299, 0.579, 0.858, 0.949 max_d=0.949 avg_d=0.579 std_dev=0.280
OP2	A	0, 0.144, 0.427, 0.710, 1.170 max_d=1.170 avg_d=0.427 std_dev=0.283
C6	B	0, 0.332, 0.625, 0.917, 1.099 max_d=1.099 avg_d=0.625 std_dev=0.292
P	A	0, 0.091, 0.404, 0.717, 1.172 max_d=1.172 avg_d=0.404 std_dev=0.313
C3'	A	0, -0.068, 0.255, 0.577, 0.993 max_d=0.993 avg_d=0.255 std_dev=0.322
O2'	A	0, -0.077, 0.262, 0.601, 1.008 max_d=1.008 avg_d=0.262 std_dev=0.339
C4'	A	0, -0.084, 0.259, 0.601, 1.099 max_d=1.099 avg_d=0.259 std_dev=0.342
C1'	B	0, 0.344, 0.700, 1.056, 1.203 max_d=1.203 avg_d=0.700 std_dev=0.356
O5'	A	0, 0.014, 0.377, 0.741, 1.232 max_d=1.232 avg_d=0.377 std_dev=0.364
C2'	B	0, 0.330, 0.704, 1.077, 1.341 max_d=1.341 avg_d=0.704 std_dev=0.373
O4'	B	0, 0.396, 0.802, 1.209, 1.395 max_d=1.395 avg_d=0.802 std_dev=0.407
C3'	B	0, 0.317, 0.744, 1.170, 1.486 max_d=1.486 avg_d=0.744 std_dev=0.426
O2'	B	0, 0.383, 0.830, 1.278, 1.623 max_d=1.623 avg_d=0.830 std_dev=0.448
C4'	B	0, 0.388, 0.849, 1.309, 1.607 max_d=1.607 avg_d=0.849 std_dev=0.460
C5'	B	0, 0.421, 0.911, 1.401, 1.726 max_d=1.726 avg_d=0.911 std_dev=0.490
O5'	B	0, 0.386, 0.877, 1.368, 1.707 max_d=1.707 avg_d=0.877 std_dev=0.491
OP1	A	0, 0.047, 0.543, 1.040, 1.895 max_d=1.895 avg_d=0.543 std_dev=0.497
O3'	B	0, 0.320, 0.829, 1.338, 1.793 max_d=1.793 avg_d=0.829 std_dev=0.509
O3'	A	0, -0.114, 0.398, 0.911, 1.565 max_d=1.565 avg_d=0.398 std_dev=0.512
P	B	0, 0.414, 0.991, 1.568, 2.056 max_d=2.056 avg_d=0.991 std_dev=0.577
OP2	B	0, 0.375, 1.001, 1.626, 2.146 max_d=2.146 avg_d=1.001 std_dev=0.626
C5'	A	0, -0.188, 0.452, 1.092, 1.986 max_d=1.986 avg_d=0.452 std_dev=0.640
OP1	B	0, 0.419, 1.129, 1.839, 2.432 max_d=2.432 avg_d=1.129 std_dev=0.710

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.30	0.31	0.11	0.25
C2	0.01	0.00	0.07	0.04	0.01	0.07	0.01	0.25	0.00	0.00	0.00	0.00	0.13	0.03	0.01	0.03	0.32	0.26	0.19	0.25
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.02	0.02	0.06	0.03	0.08	0.01	0.05	0.13	0.00	0.02	0.02	0.01	0.13	0.14	0.16	0.08
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.15	0.00	0.22	0.01	0.21	0.09	0.08	0.06	0.02	0.00	0.16	0.02	0.03	0.09	0.28	0.08
C4	0.01	0.01	0.02	0.15	0.00	0.19	0.01	0.44	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.15	0.00	0.03	0.30	0.24	0.28	0.26
C4'	0.01	0.07	0.02	0.00	0.19	0.00	0.24	0.00	0.22	0.11	0.12	0.02	0.06	0.01	0.20	0.00	0.01	0.18	0.21	0.01
C5	0.01	0.01	0.06	0.22	0.01	0.24	0.00	0.48	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.24	0.01	0.03	0.29	0.24	0.27	0.26
C5'	0.07	0.25	0.03	0.01	0.44	0.00	0.48	0.00	0.42	0.26	0.35	0.16	0.06	0.05	0.47	0.02	0.01	0.33	0.29	0.01
C6	0.01	0.00	0.08	0.21	0.01	0.22	0.00	0.42	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.22	0.01	0.03	0.30	0.24	0.20	0.25
N1	0.00	0.00	0.01	0.09	0.01	0.11	0.01	0.26	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.08	0.01	0.01	0.32	0.26	0.16	0.24
N3	0.01	0.00	0.05	0.08	0.00	0.12	0.00	0.35	0.01	0.00	0.00	0.01	0.11	0.06	0.00	0.03	0.32	0.24	0.24	0.25
O2	0.01	0.00	0.13	0.06	0.01	0.02	0.01	0.16	0.01	0.01	0.01	0.00	0.21	0.13	0.01	0.05	0.32	0.28	0.17	0.25
O2'	0.02	0.13	0.00	0.02	0.05	0.06	0.03	0.06	0.05	0.03	0.11	0.21	0.00	0.03	0.06	0.06	0.04	0.12	0.19	0.05
O3'	0.01	0.03	0.02	0.00	0.15	0.01	0.24	0.05	0.22	0.08	0.06	0.13	0.03	0.00	0.16	0.01	0.26	0.20	0.44	0.28
O4	0.01	0.01	0.02	0.16	0.00	0.20	0.01	0.47	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.16	0.00	0.03	0.29	0.25	0.31	0.27
O4'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.03	0.00	0.03	0.02	0.03	0.01	0.03	0.05	0.06	0.01	0.03	0.00	0.35	0.42	0.15	0.33
O5'	0.30	0.32	0.13	0.03	0.30	0.01	0.29	0.01	0.30	0.32	0.32	0.32	0.04	0.26	0.29	0.35	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.31	0.26	0.14	0.09	0.24	0.18	0.24	0.33	0.24	0.26	0.24	0.28	0.12	0.20	0.25	0.42	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.11	0.19	0.16	0.28	0.28	0.21	0.27	0.29	0.20	0.16	0.24	0.17	0.19	0.44	0.31	0.15	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.25	0.25	0.08	0.08	0.26	0.01	0.26	0.01	0.25	0.24	0.25	0.25	0.05	0.28	0.27	0.33	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.24	0.20	0.27	0.26	0.11	0.23	0.12	0.20	0.16	0.20	0.14	0.09	0.24	0.32	0.30	0.21	0.18	0.17	0.16	0.16
C2	0.23	0.19	0.26	0.25	0.11	0.22	0.13	0.20	0.17	0.20	0.14	0.10	0.23	0.30	0.28	0.21	0.18	0.18	0.17	0.16
C2'	0.14	0.12	0.17	0.16	0.08	0.13	0.08	0.11	0.08	0.11	0.09	0.10	0.16	0.20	0.20	0.12	0.10	0.09	0.10	0.09
C3'	0.20	0.20	0.22	0.21	0.15	0.19	0.13	0.18	0.15	0.18	0.19	0.14	0.24	0.25	0.24	0.19	0.17	0.15	0.14	0.14
C4	0.19	0.19	0.20	0.20	0.11	0.17	0.11	0.15	0.13	0.17	0.16	0.09	0.22	0.23	0.23	0.16	0.13	0.13	0.13	0.12
C4'	0.27	0.26	0.30	0.29	0.21	0.26	0.21	0.25	0.23	0.25	0.24	0.19	0.28	0.33	0.32	0.25	0.24	0.23	0.24	0.23
C5	0.19	0.19	0.21	0.20	0.12	0.16	0.10	0.14	0.13	0.17	0.17	0.09	0.24	0.24	0.24	0.16	0.13	0.13	0.12	0.11
C5'	0.49	0.49	0.51	0.50	0.47	0.48	0.47	0.49	0.48	0.48	0.48	0.46	0.49	0.52	0.52	0.47	0.49	0.48	0.49	0.48
C6	0.20	0.20	0.23	0.22	0.11	0.18	0.10	0.16	0.13	0.18	0.16	0.09	0.24	0.27	0.25	0.18	0.14	0.13	0.12	0.12
N1	0.22	0.19	0.25	0.24	0.11	0.21	0.11	0.18	0.15	0.19	0.15	0.09	0.24	0.29	0.27	0.20	0.16	0.15	0.15	0.14
N3	0.21	0.19	0.23	0.22	0.11	0.19	0.12	0.18	0.16	0.18	0.14	0.10	0.22	0.26	0.25	0.19	0.16	0.16	0.16	0.15
O2	0.25	0.19	0.28	0.27	0.13	0.25	0.15	0.23	0.19	0.21	0.14	0.12	0.22	0.33	0.31	0.24	0.22	0.22	0.21	0.20
O2'	0.09	0.08	0.13	0.15	0.11	0.10	0.11	0.09	0.09	0.08	0.09	0.14	0.09	0.15	0.18	0.09	0.09	0.10	0.11	0.10
O3'	0.13	0.14	0.15	0.15	0.12	0.12	0.09	0.12	0.09	0.12	0.14	0.13	0.18	0.17	0.18	0.12	0.11	0.09	0.10	0.09
O4	0.18	0.19	0.19	0.20	0.12	0.16	0.11	0.14	0.13	0.17	0.18	0.09	0.22	0.21	0.22	0.16	0.13	0.13	0.12	0.11
O4'	0.26	0.21	0.30	0.29	0.12	0.25	0.14	0.22	0.18	0.22	0.16	0.09	0.26	0.36	0.34	0.23	0.20	0.19	0.18	0.17
O5'	0.20	0.19	0.16	0.19	0.24	0.21	0.27	0.23	0.26	0.22	0.20	0.26	0.16	0.13	0.18	0.24	0.26	0.28	0.28	0.29
OP1	0.19	0.18	0.12	0.11	0.20	0.17	0.22	0.20	0.22	0.19	0.18	0.20	0.18	0.14	0.09	0.23	0.21	0.21	0.22	0.24
OP2	0.31	0.31	0.26	0.20	0.28	0.27	0.29	0.28	0.29	0.30	0.30	0.27	0.34	0.30	0.17	0.33	0.28	0.25	0.25	0.28
P	0.20	0.19	0.13	0.11	0.21	0.18	0.23	0.20	0.22	0.20	0.19	0.21	0.19	0.15	0.08	0.23	0.21	0.21	0.22	0.24

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.04	0.03	0.03
C2	0.01	0.00	0.07	0.07	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.09	0.02	0.05	0.05	0.06	0.05
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.05	0.02	0.07	0.05	0.11	0.01	0.01	0.01	0.03	0.07	0.08	0.04
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.07	0.00	0.07	0.01	0.07	0.03	0.08	0.09	0.10	0.01	0.00	0.01	0.05	0.09	0.10	0.06
C4	0.00	0.00	0.04	0.07	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.09	0.01	0.07	0.08	0.09	0.07
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.04	0.03	0.05	0.01	0.00	0.01	0.04	0.02	0.01
C5	0.01	0.01	0.04	0.07	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.08	0.02	0.07	0.08	0.08	0.07
C5'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.00	0.05	0.00	0.05	0.03	0.03	0.05	0.02	0.05	0.02	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01
C6	0.01	0.00	0.05	0.07	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.08	0.03	0.07	0.06	0.06	0.06
N1	0.00	0.00	0.02	0.03	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.04	0.01	0.05	0.05	0.05	0.04
N3	0.01	0.00	0.07	0.08	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.10	0.02	0.06	0.07	0.07	0.06
N4	0.01	0.00	0.05	0.09	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.11	0.02	0.07	0.09	0.10	0.08
O2	0.01	0.00	0.11	0.10	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.10	0.12	0.04	0.04	0.05	0.05	0.04
O2'	0.02	0.06	0.01	0.01	0.03	0.05	0.03	0.05	0.03	0.02	0.05	0.04	0.10	0.00	0.02	0.04	0.02	0.05	0.06	0.02
O3'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.09	0.01	0.08	0.02	0.08	0.04	0.10	0.11	0.12	0.02	0.00	0.01	0.06	0.11	0.14	0.09
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.04	0.04	0.01	0.00	0.04	0.04	0.06	0.06
O5'	0.03	0.05	0.03	0.05	0.07	0.01	0.07	0.01	0.07	0.05	0.06	0.07	0.04	0.02	0.06	0.04	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.04	0.05	0.07	0.09	0.08	0.04	0.08	0.04	0.06	0.05	0.07	0.09	0.05	0.05	0.11	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.03	0.06	0.08	0.10	0.09	0.02	0.08	0.01	0.06	0.05	0.07	0.10	0.05	0.06	0.14	0.06	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.03	0.05	0.04	0.06	0.07	0.01	0.07	0.01	0.06	0.04	0.06	0.08	0.04	0.02	0.09	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00