Doublet Group distance statistics: 50555

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 2, 1, 2, 5, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.007, 0.011, 0.015, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.011 std_dev=0.004
C5	A	0, 0.002, 0.007, 0.012, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.007 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.005, 0.013, 0.021, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.013 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.008, 0.017, 0.025, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.017 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.006, 0.015, 0.024, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.015 std_dev=0.009
C6	A	0, 0.004, 0.013, 0.023, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.013 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.002, 0.012, 0.022, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.012 std_dev=0.010
O2	A	0, 0.014, 0.039, 0.065, 0.119 max_d=0.119 avg_d=0.039 std_dev=0.026
O4	A	0, 0.011, 0.042, 0.073, 0.122 max_d=0.122 avg_d=0.042 std_dev=0.031
C5	B	0, 0.195, 0.303, 0.410, 0.432 max_d=0.432 avg_d=0.303 std_dev=0.107
C4	B	0, 0.114, 0.227, 0.340, 0.414 max_d=0.414 avg_d=0.227 std_dev=0.113
N3	B	0, 0.119, 0.259, 0.399, 0.529 max_d=0.529 avg_d=0.259 std_dev=0.140
N4	B	0, 0.173, 0.335, 0.496, 0.575 max_d=0.575 avg_d=0.335 std_dev=0.162
C6	B	0, 0.254, 0.432, 0.610, 0.710 max_d=0.710 avg_d=0.432 std_dev=0.178
C2	B	0, 0.166, 0.364, 0.561, 0.617 max_d=0.617 avg_d=0.364 std_dev=0.198
N1	B	0, 0.234, 0.459, 0.683, 0.767 max_d=0.767 avg_d=0.459 std_dev=0.225
O2	B	0, 0.200, 0.460, 0.720, 0.770 max_d=0.770 avg_d=0.460 std_dev=0.260
O5'	B	0, 0.364, 0.645, 0.926, 1.144 max_d=1.144 avg_d=0.645 std_dev=0.281
C3'	B	0, 0.349, 0.641, 0.934, 1.069 max_d=1.069 avg_d=0.641 std_dev=0.293
O4'	B	0, 0.444, 0.750, 1.056, 1.176 max_d=1.176 avg_d=0.750 std_dev=0.306
OP2	B	0, 0.358, 0.674, 0.989, 1.205 max_d=1.205 avg_d=0.674 std_dev=0.315
C1'	B	0, 0.319, 0.643, 0.968, 1.086 max_d=1.086 avg_d=0.643 std_dev=0.325
C4'	B	0, 0.436, 0.761, 1.086, 1.218 max_d=1.218 avg_d=0.761 std_dev=0.325
O3'	B	0, 0.418, 0.744, 1.070, 1.201 max_d=1.201 avg_d=0.744 std_dev=0.326
P	B	0, 0.403, 0.738, 1.073, 1.302 max_d=1.302 avg_d=0.738 std_dev=0.335
C5'	B	0, 0.453, 0.792, 1.132, 1.199 max_d=1.199 avg_d=0.792 std_dev=0.340
C2'	B	0, 0.321, 0.672, 1.023, 1.179 max_d=1.179 avg_d=0.672 std_dev=0.351
OP1	B	0, 0.470, 0.825, 1.180, 1.488 max_d=1.488 avg_d=0.825 std_dev=0.355
O4'	A	0, 0.098, 0.541, 0.984, 1.128 max_d=1.128 avg_d=0.541 std_dev=0.443
C2'	A	0, 0.150, 0.617, 1.085, 1.188 max_d=1.188 avg_d=0.617 std_dev=0.467
O2'	B	0, 0.396, 0.899, 1.403, 1.580 max_d=1.580 avg_d=0.899 std_dev=0.504
C3'	A	0, 0.213, 0.980, 1.746, 1.798 max_d=1.798 avg_d=0.980 std_dev=0.766
C4'	A	0, 0.163, 0.978, 1.793, 1.858 max_d=1.858 avg_d=0.978 std_dev=0.815
O2'	A	0, 0.283, 1.154, 2.025, 2.028 max_d=2.028 avg_d=1.154 std_dev=0.871
O5'	A	0, 0.275, 1.352, 2.428, 2.474 max_d=2.474 avg_d=1.352 std_dev=1.076
C5'	A	0, 0.290, 1.394, 2.498, 2.596 max_d=2.596 avg_d=1.394 std_dev=1.104
O3'	A	0, 0.343, 1.479, 2.615, 2.607 max_d=2.607 avg_d=1.479 std_dev=1.136
OP2	A	0, 0.574, 1.852, 3.129, 3.292 max_d=3.292 avg_d=1.852 std_dev=1.277
P	A	0, 0.452, 1.740, 3.028, 3.146 max_d=3.146 avg_d=1.740 std_dev=1.288
OP1	A	0, 0.522, 1.997, 3.472, 3.579 max_d=3.579 avg_d=1.997 std_dev=1.475

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.30	0.01	0.01	0.09	0.09	0.15	0.11
C2	0.01	0.00	0.19	0.25	0.01	0.01	0.01	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.15	0.13	0.01	0.12	0.17	0.19	0.25	0.23
C2'	0.00	0.19	0.00	0.00	0.05	0.02	0.11	0.14	0.16	0.02	0.15	0.32	0.00	0.01	0.06	0.03	0.33	0.39	0.41	0.33
C3'	0.00	0.25	0.00	0.00	0.42	0.00	0.43	0.02	0.36	0.25	0.35	0.14	0.01	0.01	0.46	0.02	0.06	0.09	0.10	0.05
C4	0.01	0.01	0.05	0.42	0.00	0.18	0.00	0.25	0.00	0.00	0.01	0.01	0.40	0.20	0.00	0.02	0.40	0.45	0.51	0.49
C4'	0.01	0.01	0.02	0.00	0.18	0.00	0.26	0.00	0.25	0.10	0.07	0.10	0.32	0.03	0.19	0.00	0.02	0.06	0.05	0.05
C5	0.00	0.01	0.11	0.43	0.00	0.26	0.00	0.34	0.00	0.00	0.01	0.01	0.47	0.28	0.00	0.10	0.45	0.49	0.52	0.54
C5'	0.03	0.05	0.14	0.02	0.25	0.00	0.34	0.00	0.29	0.11	0.13	0.10	0.16	0.19	0.28	0.01	0.01	0.09	0.02	0.02
C6	0.01	0.00	0.16	0.36	0.00	0.25	0.00	0.29	0.00	0.00	0.00	0.01	0.41	0.19	0.00	0.14	0.35	0.36	0.33	0.41
N1	0.01	0.00	0.02	0.25	0.00	0.10	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.01	0.24	0.07	0.00	0.01	0.17	0.19	0.20	0.23
N3	0.01	0.00	0.15	0.35	0.01	0.07	0.01	0.13	0.00	0.00	0.00	0.01	0.26	0.05	0.01	0.09	0.28	0.32	0.38	0.35
O2	0.02	0.00	0.32	0.14	0.01	0.10	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.11	0.32	0.01	0.20	0.10	0.11	0.20	0.15
O2'	0.01	0.15	0.00	0.01	0.40	0.32	0.47	0.16	0.41	0.24	0.26	0.11	0.00	0.02	0.43	0.20	0.18	0.24	0.40	0.21
O3'	0.30	0.13	0.01	0.01	0.20	0.03	0.28	0.19	0.19	0.07	0.05	0.32	0.02	0.00	0.25	0.19	0.27	0.32	0.34	0.29
O4	0.01	0.01	0.06	0.46	0.00	0.19	0.00	0.28	0.00	0.00	0.01	0.01	0.43	0.25	0.00	0.02	0.45	0.53	0.60	0.55
O4'	0.01	0.12	0.03	0.02	0.02	0.00	0.10	0.01	0.14	0.01	0.09	0.20	0.20	0.19	0.02	0.00	0.07	0.13	0.15	0.14
O5'	0.09	0.17	0.33	0.06	0.40	0.02	0.45	0.01	0.35	0.17	0.28	0.10	0.18	0.27	0.45	0.07	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.09	0.19	0.39	0.09	0.45	0.06	0.49	0.09	0.36	0.19	0.32	0.11	0.24	0.32	0.53	0.13	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.15	0.25	0.41	0.10	0.51	0.05	0.52	0.02	0.33	0.20	0.38	0.20	0.40	0.34	0.60	0.15	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.11	0.23	0.33	0.05	0.49	0.05	0.54	0.02	0.41	0.23	0.35	0.15	0.21	0.29	0.55	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.20	0.20	0.26	0.21	0.14	0.19	0.14	0.13	0.16	0.19	0.17	0.13	0.24	0.31	0.26	0.18	0.10	0.09	0.08	0.09
C2	0.21	0.22	0.26	0.21	0.15	0.20	0.15	0.14	0.17	0.20	0.19	0.13	0.26	0.31	0.25	0.19	0.11	0.10	0.08	0.09
C2'	0.50	0.48	0.56	0.48	0.31	0.47	0.30	0.38	0.37	0.45	0.41	0.23	0.57	0.65	0.53	0.46	0.29	0.27	0.22	0.26
C3'	0.60	0.60	0.57	0.53	0.58	0.59	0.58	0.55	0.60	0.60	0.59	0.55	0.61	0.61	0.53	0.62	0.49	0.50	0.50	0.52
C4	0.20	0.21	0.22	0.17	0.17	0.16	0.16	0.10	0.18	0.20	0.20	0.15	0.24	0.25	0.18	0.19	0.09	0.08	0.07	0.08
C4'	0.26	0.27	0.23	0.20	0.26	0.24	0.26	0.19	0.27	0.27	0.26	0.25	0.27	0.27	0.20	0.28	0.14	0.14	0.15	0.16
C5	0.19	0.21	0.22	0.17	0.17	0.15	0.16	0.10	0.17	0.19	0.20	0.16	0.24	0.26	0.18	0.18	0.09	0.08	0.07	0.08
C5'	0.33	0.33	0.27	0.23	0.34	0.30	0.35	0.25	0.35	0.34	0.33	0.33	0.33	0.30	0.21	0.36	0.19	0.20	0.22	0.23
C6	0.20	0.21	0.24	0.19	0.17	0.17	0.16	0.10	0.17	0.20	0.20	0.15	0.25	0.28	0.21	0.18	0.09	0.08	0.07	0.08
N1	0.21	0.22	0.25	0.21	0.16	0.19	0.15	0.12	0.17	0.20	0.19	0.14	0.25	0.30	0.24	0.19	0.10	0.09	0.08	0.08
N3	0.21	0.22	0.24	0.20	0.16	0.19	0.16	0.13	0.18	0.21	0.20	0.13	0.26	0.29	0.22	0.20	0.10	0.09	0.08	0.09
O2	0.22	0.21	0.27	0.23	0.14	0.22	0.14	0.16	0.17	0.20	0.17	0.12	0.25	0.33	0.28	0.20	0.12	0.11	0.09	0.11
O2'	0.15	0.13	0.20	0.16	0.25	0.15	0.28	0.20	0.22	0.15	0.16	0.33	0.16	0.30	0.22	0.17	0.27	0.27	0.31	0.29
O3'	0.24	0.24	0.18	0.17	0.29	0.24	0.30	0.22	0.29	0.26	0.25	0.30	0.21	0.19	0.17	0.28	0.18	0.20	0.24	0.24
O4	0.19	0.20	0.19	0.14	0.17	0.14	0.16	0.10	0.17	0.19	0.20	0.16	0.22	0.22	0.15	0.18	0.10	0.08	0.07	0.08
O4'	0.10	0.11	0.13	0.12	0.12	0.09	0.12	0.08	0.12	0.11	0.11	0.14	0.12	0.16	0.16	0.10	0.12	0.12	0.11	0.10
O5'	0.55	0.55	0.49	0.44	0.55	0.52	0.56	0.47	0.57	0.56	0.55	0.54	0.54	0.52	0.42	0.58	0.41	0.43	0.44	0.45
OP1	0.62	0.62	0.54	0.51	0.66	0.60	0.68	0.57	0.67	0.64	0.63	0.67	0.59	0.56	0.47	0.67	0.52	0.56	0.58	0.58
OP2	0.74	0.74	0.66	0.63	0.76	0.71	0.77	0.67	0.77	0.76	0.74	0.76	0.72	0.68	0.58	0.79	0.61	0.64	0.65	0.66
P	0.64	0.64	0.56	0.52	0.66	0.61	0.68	0.57	0.67	0.66	0.65	0.67	0.62	0.58	0.48	0.68	0.51	0.53	0.55	0.56

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.02	0.00	0.02	0.04	0.07	0.04
C2	0.02	0.00	0.05	0.07	0.01	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.05	0.06	0.02	0.12	0.12	0.07	0.08
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.05	0.01	0.05	0.01	0.04	0.03	0.05	0.05	0.08	0.00	0.02	0.01	0.02	0.09	0.05	0.03
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.10	0.00	0.10	0.01	0.09	0.06	0.08	0.11	0.08	0.01	0.01	0.02	0.04	0.11	0.09	0.06
C4	0.01	0.01	0.05	0.10	0.00	0.07	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.11	0.01	0.19	0.15	0.12	0.14
C4'	0.00	0.05	0.01	0.00	0.07	0.00	0.08	0.00	0.07	0.05	0.06	0.08	0.04	0.03	0.02	0.00	0.01	0.07	0.04	0.02
C5	0.00	0.01	0.05	0.10	0.00	0.08	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.12	0.03	0.19	0.15	0.10	0.14
C5'	0.01	0.09	0.01	0.01	0.13	0.00	0.15	0.00	0.13	0.09	0.11	0.15	0.07	0.04	0.04	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.04	0.09	0.00	0.07	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.10	0.03	0.16	0.12	0.06	0.09
N1	0.01	0.01	0.03	0.06	0.00	0.05	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.05	0.01	0.11	0.10	0.05	0.06
N3	0.02	0.00	0.05	0.08	0.00	0.06	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.04	0.09	0.01	0.16	0.14	0.10	0.12
N4	0.01	0.01	0.05	0.11	0.00	0.08	0.00	0.15	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.04	0.13	0.01	0.20	0.17	0.15	0.17
O2	0.04	0.00	0.08	0.08	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.08	0.08	0.04	0.10	0.11	0.07	0.07
O2'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.04	0.03	0.03	0.04	0.03	0.02	0.04	0.04	0.08	0.00	0.05	0.02	0.04	0.10	0.06	0.04
O3'	0.02	0.06	0.02	0.01	0.11	0.02	0.12	0.04	0.10	0.05	0.09	0.13	0.08	0.05	0.00	0.03	0.09	0.21	0.18	0.14
O4'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.04	0.02	0.03	0.00	0.04	0.03	0.15	0.10
O5'	0.02	0.12	0.02	0.04	0.19	0.01	0.19	0.01	0.16	0.11	0.16	0.20	0.10	0.04	0.09	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.04	0.12	0.09	0.11	0.15	0.07	0.15	0.05	0.12	0.10	0.14	0.17	0.11	0.10	0.21	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.07	0.07	0.05	0.09	0.12	0.04	0.10	0.02	0.06	0.05	0.10	0.15	0.07	0.06	0.18	0.15	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.04	0.08	0.03	0.06	0.14	0.02	0.14	0.01	0.09	0.06	0.12	0.17	0.07	0.04	0.14	0.10	0.00	0.01	0.01	0.00