Doublet Group distance statistics: 50559

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 1, 5, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.002, 0.013, 0.023, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.013 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.005, 0.018, 0.030, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.018 std_dev=0.013
C6	A	0, 0.007, 0.020, 0.033, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.020 std_dev=0.013
N3	A	0, -0.001, 0.014, 0.028, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.014 std_dev=0.015
C4	A	0, 0.006, 0.022, 0.037, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.022 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.007, 0.026, 0.045, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.026 std_dev=0.019
C2	A	0, 0.005, 0.030, 0.055, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.030 std_dev=0.025
O2	A	0, 0.008, 0.069, 0.129, 0.213 max_d=0.213 avg_d=0.069 std_dev=0.060
O4	A	0, 0.024, 0.092, 0.161, 0.213 max_d=0.213 avg_d=0.092 std_dev=0.069
O4'	A	0, 0.061, 0.132, 0.204, 0.271 max_d=0.271 avg_d=0.132 std_dev=0.071
C2'	A	0, 0.066, 0.154, 0.242, 0.293 max_d=0.293 avg_d=0.154 std_dev=0.088
O2'	A	0, 0.108, 0.207, 0.305, 0.315 max_d=0.315 avg_d=0.207 std_dev=0.098
C4'	A	0, 0.142, 0.248, 0.354, 0.423 max_d=0.423 avg_d=0.248 std_dev=0.106
C3'	A	0, 0.129, 0.257, 0.386, 0.458 max_d=0.458 avg_d=0.257 std_dev=0.128
N3	B	0, 0.249, 0.391, 0.534, 0.546 max_d=0.546 avg_d=0.391 std_dev=0.143
C2	B	0, 0.300, 0.458, 0.617, 0.583 max_d=0.583 avg_d=0.458 std_dev=0.159
N4	B	0, 0.201, 0.379, 0.558, 0.626 max_d=0.626 avg_d=0.379 std_dev=0.178
C4	B	0, 0.206, 0.384, 0.563, 0.640 max_d=0.640 avg_d=0.384 std_dev=0.178
O2	B	0, 0.319, 0.516, 0.714, 0.712 max_d=0.712 avg_d=0.516 std_dev=0.197
O3'	A	0, 0.208, 0.410, 0.612, 0.648 max_d=0.648 avg_d=0.410 std_dev=0.202
N1	B	0, 0.328, 0.532, 0.735, 0.766 max_d=0.766 avg_d=0.532 std_dev=0.204
C5'	A	0, 0.156, 0.384, 0.612, 0.758 max_d=0.758 avg_d=0.384 std_dev=0.228
C1'	B	0, 0.383, 0.626, 0.868, 0.933 max_d=0.933 avg_d=0.626 std_dev=0.242
O5'	A	0, 0.229, 0.484, 0.739, 0.798 max_d=0.798 avg_d=0.484 std_dev=0.255
C5	B	0, 0.225, 0.483, 0.742, 1.061 max_d=1.061 avg_d=0.483 std_dev=0.258
C2'	B	0, 0.436, 0.697, 0.957, 0.958 max_d=0.958 avg_d=0.697 std_dev=0.261
C6	B	0, 0.276, 0.550, 0.823, 1.081 max_d=1.081 avg_d=0.550 std_dev=0.274
O2'	B	0, 0.472, 0.775, 1.078, 1.204 max_d=1.204 avg_d=0.775 std_dev=0.303
O4'	B	0, 0.403, 0.721, 1.039, 1.056 max_d=1.056 avg_d=0.721 std_dev=0.318
C3'	B	0, 0.488, 0.829, 1.171, 1.185 max_d=1.185 avg_d=0.829 std_dev=0.342
P	A	0, 0.246, 0.606, 0.966, 1.067 max_d=1.067 avg_d=0.606 std_dev=0.360
OP2	A	0, 0.316, 0.684, 1.052, 1.143 max_d=1.143 avg_d=0.684 std_dev=0.368
C4'	B	0, 0.446, 0.817, 1.188, 1.250 max_d=1.250 avg_d=0.817 std_dev=0.371
OP1	A	0, 0.306, 0.709, 1.113, 1.211 max_d=1.211 avg_d=0.709 std_dev=0.403
O3'	B	0, 0.586, 1.000, 1.415, 1.434 max_d=1.434 avg_d=1.000 std_dev=0.415
C5'	B	0, 0.366, 0.856, 1.346, 1.563 max_d=1.563 avg_d=0.856 std_dev=0.490
O5'	B	0, 0.308, 0.846, 1.384, 1.646 max_d=1.646 avg_d=0.846 std_dev=0.538
OP2	B	0, 0.291, 0.951, 1.611, 2.259 max_d=2.259 avg_d=0.951 std_dev=0.660
P	B	0, 0.252, 0.920, 1.587, 2.165 max_d=2.165 avg_d=0.920 std_dev=0.667
OP1	B	0, 0.213, 1.008, 1.803, 2.628 max_d=2.628 avg_d=1.008 std_dev=0.795

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.09	0.03	0.03	0.01	0.01	0.12	0.13	0.11	0.10
C2	0.04	0.00	0.07	0.09	0.02	0.05	0.03	0.05	0.02	0.02	0.01	0.01	0.05	0.11	0.01	0.04	0.18	0.19	0.23	0.19
C2'	0.00	0.07	0.00	0.01	0.06	0.03	0.07	0.02	0.06	0.03	0.07	0.14	0.01	0.03	0.07	0.02	0.06	0.11	0.12	0.07
C3'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.09	0.01	0.10	0.04	0.09	0.05	0.09	0.14	0.04	0.01	0.11	0.02	0.07	0.11	0.11	0.07
C4	0.01	0.02	0.06	0.09	0.00	0.04	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.13	0.01	0.03	0.27	0.31	0.36	0.31
C4'	0.01	0.05	0.03	0.01	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.02	0.03	0.11	0.11	0.03	0.04	0.00	0.01	0.09	0.03	0.02
C5	0.01	0.03	0.07	0.10	0.01	0.06	0.00	0.15	0.00	0.01	0.01	0.04	0.05	0.14	0.01	0.04	0.29	0.32	0.34	0.32
C5'	0.02	0.05	0.02	0.04	0.12	0.01	0.15	0.00	0.12	0.06	0.07	0.08	0.11	0.04	0.13	0.02	0.01	0.09	0.03	0.01
C6	0.02	0.02	0.06	0.09	0.01	0.06	0.00	0.12	0.00	0.01	0.01	0.04	0.04	0.11	0.01	0.04	0.25	0.26	0.25	0.25
N1	0.01	0.02	0.03	0.05	0.01	0.02	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.05	0.02	0.06	0.01	0.02	0.19	0.19	0.19	0.18
N3	0.03	0.01	0.07	0.09	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.12	0.01	0.03	0.22	0.25	0.30	0.25
O2	0.09	0.01	0.14	0.14	0.02	0.11	0.04	0.08	0.04	0.05	0.01	0.00	0.10	0.17	0.02	0.09	0.14	0.15	0.20	0.14
O2'	0.03	0.05	0.01	0.04	0.05	0.11	0.05	0.11	0.04	0.02	0.05	0.10	0.00	0.06	0.06	0.07	0.07	0.08	0.09	0.07
O3'	0.03	0.11	0.03	0.01	0.13	0.03	0.14	0.04	0.11	0.06	0.12	0.17	0.06	0.00	0.16	0.03	0.13	0.12	0.16	0.11
O4	0.01	0.01	0.07	0.11	0.01	0.04	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.02	0.06	0.16	0.00	0.04	0.28	0.33	0.39	0.34
O4'	0.01	0.04	0.02	0.02	0.03	0.00	0.04	0.02	0.04	0.02	0.03	0.09	0.07	0.03	0.04	0.00	0.13	0.13	0.07	0.09
O5'	0.12	0.18	0.06	0.07	0.27	0.01	0.29	0.01	0.25	0.19	0.22	0.14	0.07	0.13	0.28	0.13	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.13	0.19	0.11	0.11	0.31	0.09	0.32	0.09	0.26	0.19	0.25	0.15	0.08	0.12	0.33	0.13	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.11	0.23	0.12	0.11	0.36	0.03	0.34	0.03	0.25	0.19	0.30	0.20	0.09	0.16	0.39	0.07	0.01	0.02	0.00	0.01
P	0.10	0.19	0.07	0.07	0.31	0.02	0.32	0.01	0.25	0.18	0.25	0.14	0.07	0.11	0.34	0.09	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.15	0.13	0.16	0.15	0.10	0.13	0.10	0.13	0.11	0.12	0.11	0.10	0.17	0.18	0.21	0.15	0.17	0.20	0.28	0.19
C2	0.14	0.14	0.13	0.12	0.10	0.12	0.10	0.14	0.12	0.13	0.12	0.11	0.19	0.15	0.17	0.15	0.19	0.23	0.31	0.21
C2'	0.12	0.08	0.13	0.14	0.08	0.11	0.10	0.11	0.10	0.09	0.07	0.11	0.11	0.14	0.19	0.13	0.14	0.16	0.24	0.14
C3'	0.11	0.07	0.14	0.15	0.09	0.10	0.11	0.10	0.10	0.08	0.07	0.13	0.09	0.14	0.20	0.12	0.14	0.16	0.25	0.14
C4	0.13	0.13	0.16	0.17	0.10	0.12	0.10	0.14	0.10	0.12	0.12	0.11	0.15	0.16	0.23	0.12	0.19	0.24	0.31	0.22
C4'	0.13	0.10	0.16	0.15	0.09	0.12	0.11	0.12	0.11	0.11	0.09	0.11	0.13	0.17	0.21	0.14	0.17	0.20	0.29	0.19
C5	0.13	0.13	0.16	0.18	0.11	0.12	0.10	0.14	0.11	0.12	0.13	0.11	0.16	0.16	0.24	0.13	0.19	0.24	0.31	0.22
C5'	0.15	0.14	0.11	0.09	0.14	0.12	0.16	0.16	0.16	0.15	0.13	0.16	0.17	0.15	0.15	0.18	0.21	0.26	0.37	0.27
C6	0.14	0.13	0.15	0.16	0.10	0.12	0.10	0.14	0.11	0.12	0.12	0.11	0.17	0.16	0.22	0.14	0.19	0.24	0.31	0.22
N1	0.14	0.14	0.14	0.14	0.10	0.12	0.10	0.13	0.11	0.12	0.12	0.11	0.18	0.16	0.20	0.15	0.18	0.22	0.30	0.21
N3	0.14	0.14	0.14	0.14	0.10	0.12	0.10	0.14	0.11	0.12	0.12	0.11	0.17	0.15	0.18	0.14	0.19	0.23	0.31	0.22
O2	0.15	0.16	0.12	0.11	0.11	0.12	0.12	0.15	0.14	0.15	0.13	0.12	0.22	0.15	0.14	0.17	0.21	0.24	0.32	0.23
O2'	0.14	0.11	0.12	0.12	0.08	0.13	0.10	0.14	0.11	0.12	0.08	0.10	0.16	0.15	0.15	0.16	0.17	0.18	0.26	0.18
O3'	0.11	0.09	0.15	0.17	0.11	0.11	0.12	0.10	0.10	0.08	0.11	0.15	0.12	0.14	0.21	0.11	0.13	0.13	0.23	0.12
O4	0.13	0.12	0.17	0.18	0.10	0.12	0.09	0.14	0.10	0.11	0.12	0.10	0.13	0.16	0.25	0.11	0.19	0.24	0.30	0.22
O4'	0.16	0.15	0.17	0.16	0.11	0.14	0.11	0.14	0.12	0.13	0.13	0.11	0.19	0.20	0.23	0.16	0.18	0.22	0.31	0.21
O5'	0.24	0.25	0.14	0.12	0.26	0.22	0.29	0.28	0.29	0.26	0.24	0.27	0.28	0.18	0.08	0.29	0.33	0.39	0.49	0.39
OP1	0.30	0.31	0.19	0.17	0.33	0.30	0.36	0.37	0.36	0.33	0.30	0.34	0.32	0.21	0.10	0.37	0.41	0.48	0.57	0.49
OP2	0.39	0.39	0.28	0.26	0.40	0.39	0.43	0.45	0.44	0.41	0.38	0.40	0.40	0.30	0.19	0.45	0.49	0.56	0.64	0.57
P	0.30	0.31	0.19	0.17	0.33	0.29	0.36	0.36	0.36	0.33	0.31	0.34	0.33	0.21	0.10	0.36	0.41	0.48	0.58	0.49

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.02	0.11	0.02	0.02	0.01	0.05	0.05	0.09	0.07
C2	0.05	0.00	0.07	0.08	0.03	0.05	0.02	0.06	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.06	0.09	0.04	0.10	0.11	0.16	0.10
C2'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.06	0.02	0.08	0.02	0.08	0.03	0.06	0.07	0.15	0.01	0.01	0.01	0.05	0.09	0.07	0.05
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.10	0.01	0.13	0.02	0.13	0.06	0.08	0.11	0.14	0.02	0.01	0.02	0.05	0.12	0.05	0.05
C4	0.01	0.03	0.06	0.10	0.00	0.05	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.04	0.14	0.04	0.16	0.20	0.26	0.20
C4'	0.01	0.05	0.02	0.01	0.05	0.00	0.07	0.01	0.07	0.03	0.04	0.05	0.12	0.06	0.02	0.01	0.02	0.05	0.03	0.03
C5	0.01	0.02	0.08	0.13	0.01	0.07	0.00	0.13	0.00	0.01	0.01	0.03	0.03	0.06	0.17	0.04	0.17	0.21	0.26	0.20
C5'	0.03	0.06	0.02	0.02	0.11	0.01	0.13	0.00	0.11	0.06	0.09	0.11	0.11	0.08	0.06	0.02	0.02	0.04	0.03	0.02
C6	0.01	0.02	0.08	0.13	0.01	0.07	0.00	0.11	0.00	0.01	0.02	0.02	0.04	0.05	0.15	0.04	0.14	0.15	0.18	0.14
N1	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.02	0.02	0.05	0.02	0.07	0.02	0.09	0.10	0.13	0.09
N3	0.03	0.01	0.06	0.08	0.01	0.04	0.01	0.09	0.02	0.02	0.00	0.02	0.04	0.05	0.11	0.03	0.14	0.17	0.23	0.16
N4	0.02	0.03	0.07	0.11	0.01	0.05	0.03	0.11	0.02	0.02	0.02	0.00	0.05	0.05	0.16	0.04	0.16	0.22	0.29	0.21
O2	0.11	0.02	0.15	0.14	0.04	0.12	0.03	0.11	0.04	0.05	0.04	0.05	0.00	0.14	0.16	0.11	0.10	0.11	0.13	0.10
O2'	0.02	0.06	0.01	0.02	0.04	0.06	0.06	0.08	0.05	0.02	0.05	0.05	0.14	0.00	0.03	0.03	0.05	0.09	0.05	0.06
O3'	0.02	0.09	0.01	0.01	0.14	0.02	0.17	0.06	0.15	0.07	0.11	0.16	0.16	0.03	0.00	0.02	0.08	0.16	0.11	0.10
O4'	0.01	0.04	0.01	0.02	0.04	0.01	0.04	0.02	0.04	0.02	0.03	0.04	0.11	0.03	0.02	0.00	0.05	0.05	0.09	0.09
O5'	0.05	0.10	0.05	0.05	0.16	0.02	0.17	0.02	0.14	0.09	0.14	0.16	0.10	0.05	0.08	0.05	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.05	0.11	0.09	0.12	0.20	0.05	0.21	0.04	0.15	0.10	0.17	0.22	0.11	0.09	0.16	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.09	0.16	0.07	0.05	0.26	0.03	0.26	0.03	0.18	0.13	0.23	0.29	0.13	0.05	0.11	0.09	0.01	0.02	0.00	0.02
P	0.07	0.10	0.05	0.05	0.20	0.03	0.20	0.02	0.14	0.09	0.16	0.21	0.10	0.06	0.10	0.09	0.01	0.01	0.02	0.00