Doublet Group distance statistics: 50561

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 4, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.007, 0.016, 0.025, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.016 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.011, 0.022, 0.034, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.022 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.018, 0.030, 0.041, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.030 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.010, 0.023, 0.037, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.023 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.016, 0.030, 0.045, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.030 std_dev=0.014
C6	A	0, 0.006, 0.023, 0.039, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.023 std_dev=0.017
N1	A	0, 0.011, 0.032, 0.053, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.032 std_dev=0.021
O2	A	0, 0.016, 0.052, 0.089, 0.140 max_d=0.140 avg_d=0.052 std_dev=0.036
O4	A	0, 0.102, 0.170, 0.238, 0.230 max_d=0.230 avg_d=0.170 std_dev=0.068
N1	B	0, 0.403, 0.678, 0.952, 0.999 max_d=0.999 avg_d=0.678 std_dev=0.275
C1'	B	0, 0.418, 0.712, 1.007, 1.154 max_d=1.154 avg_d=0.712 std_dev=0.295
C2'	A	0, 0.514, 0.832, 1.150, 1.242 max_d=1.242 avg_d=0.832 std_dev=0.318
C2	B	0, 0.535, 0.858, 1.181, 1.125 max_d=1.125 avg_d=0.858 std_dev=0.323
O4'	B	0, 0.392, 0.719, 1.045, 1.248 max_d=1.248 avg_d=0.719 std_dev=0.326
O4'	A	0, 0.531, 0.862, 1.193, 1.257 max_d=1.257 avg_d=0.862 std_dev=0.331
C5	B	0, 0.356, 0.689, 1.022, 1.081 max_d=1.081 avg_d=0.689 std_dev=0.333
C6	B	0, 0.372, 0.708, 1.043, 1.205 max_d=1.205 avg_d=0.708 std_dev=0.335
C4	B	0, 0.458, 0.806, 1.154, 1.195 max_d=1.195 avg_d=0.806 std_dev=0.348
N3	B	0, 0.569, 0.954, 1.339, 1.293 max_d=1.293 avg_d=0.954 std_dev=0.385
C2'	B	0, 0.563, 0.950, 1.337, 1.545 max_d=1.545 avg_d=0.950 std_dev=0.387
O2	B	0, 0.658, 1.052, 1.446, 1.404 max_d=1.404 avg_d=1.052 std_dev=0.394
O2'	B	0, 0.681, 1.109, 1.537, 1.560 max_d=1.560 avg_d=1.109 std_dev=0.428
C4'	B	0, 0.507, 0.936, 1.365, 1.626 max_d=1.626 avg_d=0.936 std_dev=0.429
C3'	B	0, 0.567, 1.022, 1.477, 1.819 max_d=1.819 avg_d=1.022 std_dev=0.455
N4	B	0, 0.503, 0.970, 1.436, 1.459 max_d=1.459 avg_d=0.970 std_dev=0.466
C5'	B	0, 0.565, 1.069, 1.572, 1.877 max_d=1.877 avg_d=1.069 std_dev=0.504
O5'	B	0, 0.613, 1.133, 1.653, 1.876 max_d=1.876 avg_d=1.133 std_dev=0.520
O3'	B	0, 0.648, 1.178, 1.709, 2.137 max_d=2.137 avg_d=1.178 std_dev=0.530
P	B	0, 0.627, 1.165, 1.704, 1.920 max_d=1.920 avg_d=1.165 std_dev=0.539
OP1	B	0, 0.594, 1.142, 1.690, 1.895 max_d=1.895 avg_d=1.142 std_dev=0.548
OP2	B	0, 0.649, 1.212, 1.775, 2.027 max_d=2.027 avg_d=1.212 std_dev=0.563
C4'	A	0, 1.022, 1.598, 2.175, 2.013 max_d=2.013 avg_d=1.598 std_dev=0.577
C3'	A	0, 1.033, 1.613, 2.194, 2.024 max_d=2.024 avg_d=1.613 std_dev=0.580
O2'	A	0, 1.074, 1.675, 2.275, 2.050 max_d=2.050 avg_d=1.675 std_dev=0.600
O5'	A	0, 1.323, 2.075, 2.827, 2.628 max_d=2.628 avg_d=2.075 std_dev=0.752
C5'	A	0, 1.341, 2.102, 2.864, 2.663 max_d=2.663 avg_d=2.102 std_dev=0.761
OP1	A	0, 1.603, 2.516, 3.429, 3.266 max_d=3.266 avg_d=2.516 std_dev=0.913
O3'	A	0, 1.649, 2.566, 3.484, 3.121 max_d=3.121 avg_d=2.566 std_dev=0.917
P	A	0, 1.681, 2.657, 3.634, 3.322 max_d=3.322 avg_d=2.657 std_dev=0.977
OP2	A	0, 3.199, 5.009, 6.818, 5.919 max_d=5.919 avg_d=5.009 std_dev=1.809

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.03	0.03	0.01	0.02	0.06	0.02	0.08	0.04	0.01	0.07	0.17	0.14	0.08
C2	0.02	0.00	0.07	0.09	0.02	0.02	0.02	0.07	0.02	0.01	0.01	0.01	0.07	0.12	0.03	0.03	0.14	0.20	0.25	0.16
C2'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.04	0.03	0.04	0.04	0.05	0.01	0.06	0.12	0.01	0.01	0.05	0.01	0.11	0.24	0.22	0.15
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.11	0.01	0.12	0.02	0.11	0.07	0.10	0.11	0.02	0.01	0.12	0.02	0.10	0.23	0.20	0.14
C4	0.03	0.02	0.04	0.11	0.00	0.08	0.01	0.18	0.02	0.02	0.01	0.03	0.10	0.10	0.01	0.05	0.23	0.24	0.36	0.25
C4'	0.01	0.02	0.03	0.01	0.08	0.00	0.11	0.01	0.10	0.04	0.04	0.07	0.12	0.02	0.09	0.01	0.02	0.13	0.08	0.02
C5	0.03	0.02	0.04	0.12	0.01	0.11	0.00	0.22	0.01	0.01	0.02	0.03	0.10	0.10	0.02	0.06	0.25	0.24	0.34	0.24
C5'	0.03	0.07	0.04	0.02	0.18	0.01	0.22	0.00	0.18	0.10	0.13	0.05	0.11	0.07	0.19	0.02	0.01	0.11	0.11	0.02
C6	0.03	0.02	0.05	0.11	0.02	0.10	0.01	0.18	0.00	0.01	0.04	0.03	0.09	0.08	0.03	0.06	0.22	0.23	0.25	0.19
N1	0.01	0.01	0.01	0.07	0.02	0.04	0.01	0.10	0.01	0.00	0.03	0.03	0.05	0.05	0.03	0.01	0.15	0.20	0.22	0.14
N3	0.02	0.01	0.06	0.10	0.01	0.04	0.02	0.13	0.04	0.03	0.00	0.02	0.09	0.11	0.03	0.05	0.19	0.23	0.32	0.21
O2	0.06	0.01	0.12	0.11	0.03	0.07	0.03	0.05	0.03	0.03	0.02	0.00	0.11	0.18	0.05	0.07	0.11	0.19	0.23	0.14
O2'	0.02	0.07	0.01	0.02	0.10	0.12	0.10	0.11	0.09	0.05	0.09	0.11	0.00	0.03	0.10	0.08	0.08	0.17	0.15	0.08
O3'	0.08	0.12	0.01	0.01	0.10	0.02	0.10	0.07	0.08	0.05	0.11	0.18	0.03	0.00	0.12	0.05	0.15	0.33	0.25	0.20
O4	0.04	0.03	0.05	0.12	0.01	0.09	0.02	0.19	0.03	0.03	0.03	0.05	0.10	0.12	0.00	0.06	0.24	0.25	0.39	0.27
O4'	0.01	0.03	0.01	0.02	0.05	0.01	0.06	0.02	0.06	0.01	0.05	0.07	0.08	0.05	0.06	0.00	0.10	0.11	0.16	0.12
O5'	0.07	0.14	0.11	0.10	0.23	0.02	0.25	0.01	0.22	0.15	0.19	0.11	0.08	0.15	0.24	0.10	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.17	0.20	0.24	0.23	0.24	0.13	0.24	0.11	0.23	0.20	0.23	0.19	0.17	0.33	0.25	0.11	0.02	0.00	0.03	0.01
OP2	0.14	0.25	0.22	0.20	0.36	0.08	0.34	0.11	0.25	0.22	0.32	0.23	0.15	0.25	0.39	0.16	0.02	0.03	0.00	0.01
P	0.08	0.16	0.15	0.14	0.25	0.02	0.24	0.02	0.19	0.14	0.21	0.14	0.08	0.20	0.27	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.21	0.19	0.22	0.24	0.15	0.22	0.16	0.21	0.17	0.19	0.16	0.18	0.21	0.19	0.24	0.21	0.18	0.16	0.14	0.17
C2	0.20	0.19	0.20	0.21	0.16	0.21	0.17	0.20	0.18	0.19	0.17	0.18	0.20	0.17	0.21	0.21	0.17	0.16	0.14	0.17
C2'	0.18	0.16	0.20	0.22	0.10	0.20	0.11	0.18	0.13	0.16	0.13	0.11	0.20	0.14	0.22	0.18	0.15	0.16	0.13	0.15
C3'	0.20	0.19	0.22	0.23	0.15	0.21	0.14	0.19	0.15	0.18	0.17	0.16	0.22	0.18	0.24	0.19	0.17	0.17	0.17	0.17
C4	0.14	0.13	0.13	0.13	0.10	0.13	0.11	0.12	0.12	0.13	0.12	0.13	0.14	0.16	0.13	0.15	0.10	0.11	0.12	0.10
C4'	0.21	0.19	0.24	0.26	0.16	0.23	0.16	0.21	0.17	0.19	0.17	0.19	0.21	0.21	0.28	0.21	0.19	0.18	0.16	0.18
C5	0.15	0.13	0.14	0.14	0.11	0.14	0.11	0.12	0.12	0.13	0.12	0.14	0.15	0.16	0.13	0.15	0.10	0.12	0.13	0.11
C5'	0.23	0.21	0.24	0.26	0.23	0.24	0.22	0.23	0.21	0.21	0.21	0.29	0.23	0.21	0.27	0.23	0.21	0.19	0.19	0.20
C6	0.18	0.16	0.16	0.17	0.13	0.17	0.13	0.15	0.14	0.16	0.14	0.16	0.18	0.16	0.17	0.18	0.13	0.13	0.13	0.13
N1	0.20	0.18	0.19	0.21	0.15	0.20	0.15	0.19	0.17	0.18	0.16	0.17	0.20	0.17	0.20	0.20	0.16	0.15	0.13	0.15
N3	0.17	0.16	0.15	0.16	0.13	0.17	0.14	0.15	0.15	0.16	0.14	0.15	0.16	0.16	0.16	0.17	0.13	0.12	0.12	0.13
O2	0.25	0.23	0.25	0.27	0.20	0.26	0.21	0.25	0.22	0.23	0.21	0.21	0.24	0.20	0.26	0.25	0.23	0.21	0.18	0.22
O2'	0.16	0.14	0.18	0.20	0.11	0.18	0.11	0.16	0.12	0.14	0.11	0.14	0.16	0.13	0.20	0.15	0.14	0.14	0.11	0.14
O3'	0.26	0.23	0.31	0.32	0.18	0.28	0.19	0.26	0.21	0.24	0.20	0.16	0.27	0.30	0.35	0.25	0.25	0.26	0.24	0.24
O4	0.13	0.13	0.14	0.12	0.11	0.12	0.11	0.10	0.12	0.12	0.12	0.14	0.13	0.17	0.12	0.13	0.09	0.12	0.14	0.10
O4'	0.24	0.21	0.26	0.28	0.19	0.26	0.20	0.24	0.21	0.22	0.19	0.23	0.23	0.23	0.29	0.24	0.22	0.20	0.18	0.20
O5'	0.24	0.22	0.21	0.22	0.23	0.24	0.23	0.22	0.22	0.22	0.22	0.28	0.24	0.20	0.22	0.25	0.18	0.14	0.14	0.16
OP1	0.33	0.28	0.31	0.32	0.25	0.33	0.27	0.31	0.29	0.29	0.25	0.28	0.31	0.32	0.32	0.34	0.28	0.25	0.22	0.26
OP2	0.39	0.33	0.28	0.28	0.35	0.36	0.37	0.35	0.38	0.36	0.32	0.38	0.33	0.30	0.24	0.42	0.31	0.27	0.27	0.30
P	0.28	0.24	0.22	0.22	0.25	0.27	0.27	0.25	0.26	0.25	0.23	0.30	0.25	0.22	0.21	0.30	0.21	0.17	0.17	0.20

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.05	0.05	0.02	0.02	0.01	0.02	0.04	0.07	0.02
C2	0.03	0.00	0.04	0.06	0.03	0.04	0.02	0.04	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.07	0.07	0.03	0.04	0.06	0.09	0.05
C2'	0.01	0.04	0.00	0.01	0.05	0.02	0.03	0.02	0.03	0.02	0.05	0.06	0.07	0.00	0.01	0.02	0.04	0.07	0.08	0.05
C3'	0.02	0.06	0.01	0.00	0.10	0.01	0.10	0.01	0.09	0.06	0.08	0.11	0.07	0.03	0.01	0.02	0.06	0.08	0.07	0.05
C4	0.03	0.03	0.05	0.10	0.00	0.06	0.01	0.05	0.02	0.02	0.01	0.02	0.04	0.04	0.12	0.06	0.07	0.07	0.08	0.06
C4'	0.01	0.04	0.02	0.01	0.06	0.00	0.06	0.01	0.06	0.03	0.04	0.08	0.06	0.09	0.02	0.01	0.01	0.05	0.04	0.02
C5	0.03	0.02	0.03	0.10	0.01	0.06	0.00	0.06	0.01	0.02	0.01	0.03	0.04	0.02	0.13	0.06	0.08	0.07	0.06	0.06
C5'	0.01	0.04	0.02	0.01	0.05	0.01	0.06	0.00	0.05	0.03	0.04	0.08	0.06	0.10	0.03	0.01	0.01	0.05	0.04	0.02
C6	0.03	0.02	0.03	0.09	0.02	0.06	0.01	0.05	0.00	0.01	0.01	0.03	0.04	0.03	0.11	0.06	0.06	0.05	0.05	0.03
N1	0.01	0.01	0.02	0.06	0.02	0.03	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.04	0.04	0.03	0.06	0.02	0.02	0.04	0.07	0.04
N3	0.03	0.01	0.05	0.08	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.04	0.02	0.07	0.10	0.03	0.04	0.06	0.08	0.05
N4	0.05	0.04	0.06	0.11	0.02	0.08	0.03	0.08	0.03	0.04	0.04	0.00	0.06	0.06	0.15	0.07	0.10	0.11	0.12	0.11
O2	0.05	0.02	0.07	0.07	0.04	0.06	0.04	0.06	0.04	0.04	0.02	0.06	0.00	0.11	0.08	0.05	0.06	0.08	0.11	0.08
O2'	0.02	0.07	0.00	0.03	0.04	0.09	0.02	0.10	0.03	0.03	0.07	0.06	0.11	0.00	0.02	0.07	0.04	0.10	0.05	0.06
O3'	0.02	0.07	0.01	0.01	0.12	0.02	0.13	0.03	0.11	0.06	0.10	0.15	0.08	0.02	0.00	0.02	0.07	0.11	0.09	0.08
O4'	0.01	0.03	0.02	0.02	0.06	0.01	0.06	0.01	0.06	0.02	0.03	0.07	0.05	0.07	0.02	0.00	0.05	0.05	0.06	0.03
O5'	0.02	0.04	0.04	0.06	0.07	0.01	0.08	0.01	0.06	0.02	0.04	0.10	0.06	0.04	0.07	0.05	0.00	0.03	0.04	0.01
OP1	0.04	0.06	0.07	0.08	0.07	0.05	0.07	0.05	0.05	0.04	0.06	0.11	0.08	0.10	0.11	0.05	0.03	0.00	0.04	0.02
OP2	0.07	0.09	0.08	0.07	0.08	0.04	0.06	0.04	0.05	0.07	0.08	0.12	0.11	0.05	0.09	0.06	0.04	0.04	0.00	0.02
P	0.02	0.05	0.05	0.05	0.06	0.02	0.06	0.02	0.03	0.04	0.05	0.11	0.08	0.06	0.08	0.03	0.01	0.02	0.02	0.00