Doublet Group distance statistics: 50563

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 1, 3, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C4	A	0, 0.005, 0.015, 0.026, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.015 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.001, 0.014, 0.027, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.014 std_dev=0.013
C5	A	0, -0.001, 0.012, 0.025, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.012 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.007, 0.020, 0.033, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.020 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.005, 0.019, 0.034, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.019 std_dev=0.015
C6	A	0, 0.001, 0.019, 0.037, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.019 std_dev=0.018
C1'	A	0, 0.003, 0.022, 0.040, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.022 std_dev=0.018
O2	A	0, 0.008, 0.033, 0.057, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.033 std_dev=0.025
O4	A	0, 0.020, 0.073, 0.127, 0.194 max_d=0.194 avg_d=0.073 std_dev=0.053
N3	B	0, 0.218, 0.380, 0.543, 0.530 max_d=0.530 avg_d=0.380 std_dev=0.162
C2	B	0, 0.254, 0.439, 0.625, 0.644 max_d=0.644 avg_d=0.439 std_dev=0.185
N1	B	0, 0.261, 0.457, 0.652, 0.670 max_d=0.670 avg_d=0.457 std_dev=0.196
O2'	A	0, 0.272, 0.481, 0.689, 0.681 max_d=0.681 avg_d=0.481 std_dev=0.209
C2'	A	0, 0.299, 0.518, 0.738, 0.687 max_d=0.687 avg_d=0.518 std_dev=0.219
C4	B	0, 0.175, 0.417, 0.659, 0.837 max_d=0.837 avg_d=0.417 std_dev=0.242
C6	B	0, 0.293, 0.547, 0.801, 0.900 max_d=0.900 avg_d=0.547 std_dev=0.254
O4'	A	0, 0.401, 0.655, 0.910, 0.796 max_d=0.796 avg_d=0.655 std_dev=0.255
O2	B	0, 0.358, 0.663, 0.968, 1.103 max_d=1.103 avg_d=0.663 std_dev=0.305
C1'	B	0, 0.303, 0.611, 0.920, 0.986 max_d=0.986 avg_d=0.611 std_dev=0.308
C5	B	0, 0.203, 0.545, 0.886, 1.021 max_d=1.021 avg_d=0.545 std_dev=0.341
N4	B	0, 0.201, 0.551, 0.901, 1.264 max_d=1.264 avg_d=0.551 std_dev=0.350
O4'	B	0, 0.373, 0.736, 1.100, 1.166 max_d=1.166 avg_d=0.736 std_dev=0.364
O5'	B	0, 0.493, 0.883, 1.273, 1.312 max_d=1.312 avg_d=0.883 std_dev=0.390
C2'	B	0, 0.383, 0.774, 1.165, 1.198 max_d=1.198 avg_d=0.774 std_dev=0.391
C3'	A	0, 0.699, 1.129, 1.558, 1.377 max_d=1.377 avg_d=1.129 std_dev=0.430
C4'	A	0, 0.720, 1.167, 1.614, 1.417 max_d=1.417 avg_d=1.167 std_dev=0.447
C3'	B	0, 0.454, 0.927, 1.400, 1.595 max_d=1.595 avg_d=0.927 std_dev=0.473
O2'	B	0, 0.397, 0.870, 1.344, 1.439 max_d=1.439 avg_d=0.870 std_dev=0.474
C4'	B	0, 0.443, 0.931, 1.419, 1.553 max_d=1.553 avg_d=0.931 std_dev=0.488
P	B	0, 0.441, 0.935, 1.430, 1.457 max_d=1.457 avg_d=0.935 std_dev=0.494
OP1	B	0, 0.482, 0.985, 1.488, 1.459 max_d=1.459 avg_d=0.985 std_dev=0.503
C5'	B	0, 0.554, 1.081, 1.607, 1.922 max_d=1.922 avg_d=1.081 std_dev=0.527
O3'	B	0, 0.555, 1.164, 1.773, 2.082 max_d=2.082 avg_d=1.164 std_dev=0.609
O3'	A	0, 0.999, 1.616, 2.234, 1.970 max_d=1.970 avg_d=1.616 std_dev=0.618
OP2	B	0, 0.332, 0.985, 1.638, 1.721 max_d=1.721 avg_d=0.985 std_dev=0.653
O5'	A	0, 1.055, 1.751, 2.448, 2.226 max_d=2.226 avg_d=1.751 std_dev=0.697
C5'	A	0, 1.080, 1.781, 2.482, 2.210 max_d=2.210 avg_d=1.781 std_dev=0.701
P	A	0, 1.318, 2.193, 3.067, 2.898 max_d=2.898 avg_d=2.193 std_dev=0.875
OP2	A	0, 1.335, 2.253, 3.171, 3.112 max_d=3.112 avg_d=2.253 std_dev=0.918
OP1	A	0, 1.526, 2.526, 3.526, 3.171 max_d=3.171 avg_d=2.526 std_dev=1.000

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.03	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.02	0.00	0.09	0.05	0.25	0.17
C2	0.02	0.00	0.06	0.06	0.01	0.02	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.07	0.07	0.01	0.02	0.17	0.20	0.43	0.30
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.04	0.02	0.06	0.02	0.07	0.02	0.05	0.11	0.00	0.02	0.05	0.01	0.04	0.09	0.12	0.07
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.11	0.01	0.14	0.02	0.12	0.06	0.08	0.08	0.01	0.01	0.13	0.02	0.04	0.15	0.08	0.07
C4	0.01	0.01	0.04	0.11	0.00	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.14	0.00	0.03	0.20	0.34	0.55	0.39
C4'	0.01	0.02	0.02	0.01	0.05	0.00	0.07	0.01	0.06	0.02	0.02	0.04	0.08	0.01	0.06	0.00	0.01	0.09	0.05	0.03
C5	0.03	0.01	0.06	0.14	0.01	0.07	0.00	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.05	0.18	0.03	0.04	0.21	0.36	0.55	0.40
C5'	0.02	0.06	0.02	0.02	0.10	0.01	0.12	0.00	0.11	0.06	0.07	0.04	0.08	0.03	0.11	0.01	0.01	0.07	0.03	0.02
C6	0.03	0.01	0.07	0.12	0.01	0.06	0.00	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.15	0.02	0.04	0.20	0.28	0.45	0.35
N1	0.01	0.01	0.02	0.06	0.01	0.02	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.06	0.01	0.01	0.16	0.18	0.38	0.28
N3	0.02	0.01	0.05	0.08	0.00	0.02	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.10	0.02	0.02	0.19	0.27	0.50	0.35
O2	0.03	0.00	0.11	0.08	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.13	0.11	0.02	0.04	0.14	0.14	0.39	0.26
O2'	0.01	0.07	0.00	0.01	0.04	0.08	0.05	0.08	0.06	0.02	0.07	0.13	0.00	0.05	0.05	0.05	0.06	0.19	0.10	0.08
O3'	0.02	0.07	0.02	0.01	0.14	0.01	0.18	0.03	0.15	0.06	0.10	0.11	0.05	0.00	0.18	0.01	0.12	0.31	0.23	0.20
O4	0.02	0.01	0.05	0.13	0.00	0.06	0.03	0.11	0.02	0.01	0.02	0.02	0.05	0.18	0.00	0.05	0.20	0.37	0.56	0.39
O4'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.02	0.04	0.05	0.01	0.05	0.00	0.07	0.05	0.20	0.15
O5'	0.09	0.17	0.04	0.04	0.20	0.01	0.21	0.01	0.20	0.16	0.19	0.14	0.06	0.12	0.20	0.07	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.05	0.20	0.09	0.15	0.34	0.09	0.36	0.07	0.28	0.18	0.27	0.14	0.19	0.31	0.37	0.05	0.02	0.00	0.03	0.01
OP2	0.25	0.43	0.12	0.08	0.55	0.05	0.55	0.03	0.45	0.38	0.50	0.39	0.10	0.23	0.56	0.20	0.02	0.03	0.00	0.02
P	0.17	0.30	0.07	0.07	0.39	0.03	0.40	0.02	0.35	0.28	0.35	0.26	0.08	0.20	0.39	0.15	0.01	0.01	0.02	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.17	0.14	0.22	0.21	0.09	0.14	0.08	0.16	0.08	0.12	0.10	0.15	0.20	0.29	0.27	0.15	0.29	0.21	0.14	0.17
C2	0.15	0.13	0.21	0.20	0.09	0.13	0.08	0.16	0.07	0.11	0.09	0.14	0.19	0.26	0.25	0.13	0.29	0.21	0.14	0.18
C2'	0.22	0.17	0.23	0.21	0.15	0.19	0.14	0.20	0.15	0.17	0.16	0.21	0.21	0.29	0.25	0.22	0.29	0.22	0.14	0.17
C3'	0.24	0.20	0.24	0.22	0.17	0.21	0.16	0.22	0.18	0.20	0.18	0.21	0.24	0.30	0.25	0.25	0.32	0.23	0.14	0.19
C4	0.10	0.11	0.14	0.18	0.06	0.12	0.08	0.24	0.06	0.08	0.09	0.10	0.16	0.16	0.22	0.09	0.26	0.15	0.12	0.14
C4'	0.18	0.15	0.21	0.19	0.10	0.14	0.09	0.17	0.10	0.13	0.11	0.14	0.20	0.28	0.25	0.18	0.29	0.19	0.10	0.15
C5	0.11	0.11	0.15	0.18	0.07	0.12	0.09	0.25	0.07	0.09	0.09	0.11	0.17	0.17	0.22	0.10	0.26	0.14	0.13	0.14
C5'	0.19	0.16	0.17	0.14	0.08	0.14	0.10	0.19	0.12	0.15	0.11	0.09	0.21	0.25	0.19	0.21	0.34	0.24	0.14	0.21
C6	0.13	0.12	0.17	0.18	0.08	0.11	0.08	0.21	0.07	0.09	0.09	0.12	0.18	0.21	0.23	0.11	0.26	0.15	0.12	0.14
N1	0.15	0.13	0.20	0.19	0.08	0.12	0.08	0.17	0.07	0.11	0.09	0.14	0.19	0.25	0.25	0.13	0.28	0.19	0.12	0.16
N3	0.13	0.12	0.17	0.18	0.08	0.11	0.08	0.18	0.06	0.10	0.09	0.13	0.18	0.21	0.22	0.10	0.28	0.19	0.13	0.16
O2	0.18	0.14	0.24	0.22	0.11	0.16	0.10	0.15	0.10	0.13	0.10	0.16	0.20	0.31	0.28	0.16	0.32	0.26	0.18	0.22
O2'	0.21	0.18	0.23	0.22	0.18	0.19	0.16	0.22	0.16	0.17	0.18	0.23	0.21	0.29	0.26	0.22	0.28	0.23	0.18	0.18
O3'	0.28	0.23	0.26	0.25	0.21	0.26	0.20	0.26	0.22	0.24	0.22	0.25	0.26	0.32	0.27	0.30	0.34	0.26	0.18	0.22
O4	0.10	0.11	0.13	0.20	0.07	0.16	0.09	0.29	0.09	0.09	0.10	0.07	0.15	0.11	0.23	0.10	0.26	0.16	0.14	0.15
O4'	0.16	0.13	0.22	0.21	0.08	0.13	0.08	0.17	0.07	0.11	0.09	0.13	0.20	0.29	0.28	0.13	0.28	0.19	0.13	0.16
O5'	0.28	0.25	0.20	0.17	0.18	0.24	0.21	0.28	0.24	0.25	0.21	0.15	0.28	0.27	0.15	0.32	0.45	0.35	0.27	0.33
OP1	0.36	0.32	0.25	0.25	0.32	0.35	0.37	0.41	0.37	0.35	0.30	0.31	0.31	0.28	0.19	0.42	0.62	0.54	0.50	0.53
OP2	0.58	0.54	0.48	0.47	0.53	0.56	0.56	0.59	0.57	0.57	0.52	0.50	0.54	0.49	0.42	0.62	0.82	0.72	0.67	0.71
P	0.41	0.38	0.30	0.29	0.36	0.38	0.39	0.42	0.40	0.40	0.36	0.34	0.39	0.34	0.23	0.46	0.64	0.54	0.48	0.53

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.00	0.12	0.14	0.13	0.08
C2	0.02	0.00	0.03	0.07	0.02	0.03	0.02	0.09	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.07	0.03	0.24	0.21	0.03	0.14
C2'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.03	0.02	0.04	0.04	0.04	0.02	0.03	0.04	0.06	0.00	0.01	0.01	0.19	0.26	0.08	0.14
C3'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.07	0.01	0.06	0.05	0.05	0.04	0.07	0.08	0.08	0.02	0.01	0.02	0.25	0.32	0.07	0.19
C4	0.02	0.02	0.03	0.07	0.00	0.06	0.01	0.16	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.08	0.02	0.32	0.24	0.10	0.20
C4'	0.01	0.03	0.02	0.01	0.06	0.00	0.07	0.01	0.06	0.03	0.04	0.07	0.03	0.06	0.03	0.01	0.01	0.10	0.22	0.03
C5	0.01	0.02	0.04	0.06	0.01	0.07	0.00	0.17	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.04	0.08	0.03	0.33	0.22	0.09	0.20
C5'	0.03	0.09	0.04	0.05	0.16	0.01	0.17	0.00	0.14	0.09	0.12	0.17	0.06	0.06	0.07	0.01	0.01	0.13	0.32	0.02
C6	0.01	0.02	0.04	0.05	0.01	0.06	0.01	0.14	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.03	0.07	0.03	0.29	0.19	0.06	0.16
N1	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.03	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.04	0.01	0.22	0.18	0.06	0.12
N3	0.02	0.01	0.03	0.07	0.01	0.04	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.04	0.08	0.02	0.28	0.23	0.06	0.17
N4	0.02	0.02	0.04	0.08	0.01	0.07	0.01	0.17	0.02	0.02	0.02	0.00	0.03	0.05	0.09	0.03	0.34	0.26	0.15	0.22
O2	0.03	0.01	0.06	0.08	0.02	0.03	0.03	0.06	0.03	0.02	0.02	0.03	0.00	0.04	0.08	0.05	0.20	0.21	0.04	0.13
O2'	0.02	0.03	0.00	0.02	0.05	0.06	0.04	0.06	0.03	0.02	0.04	0.05	0.04	0.00	0.04	0.04	0.07	0.19	0.12	0.07
O3'	0.02	0.07	0.01	0.01	0.08	0.03	0.08	0.07	0.07	0.04	0.08	0.09	0.08	0.04	0.00	0.03	0.19	0.37	0.10	0.19
O4'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.05	0.04	0.03	0.00	0.04	0.07	0.23	0.10
O5'	0.12	0.24	0.19	0.25	0.32	0.01	0.33	0.01	0.29	0.22	0.28	0.34	0.20	0.07	0.19	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.14	0.21	0.26	0.32	0.24	0.10	0.22	0.13	0.19	0.18	0.23	0.26	0.21	0.19	0.37	0.07	0.01	0.00	0.02	0.01
OP2	0.13	0.03	0.08	0.07	0.10	0.22	0.09	0.32	0.06	0.06	0.06	0.15	0.04	0.12	0.10	0.23	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.08	0.14	0.14	0.19	0.20	0.03	0.20	0.02	0.16	0.12	0.17	0.22	0.13	0.07	0.19	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00