Doublet Group distance statistics: 50569

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.003, 0.010, 0.016, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.010 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.002, 0.012, 0.021, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.012 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.006, 0.022, 0.037, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.022 std_dev=0.015
C5	A	0, 0.007, 0.024, 0.040, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.024 std_dev=0.016
C6	A	0, 0.005, 0.022, 0.039, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.022 std_dev=0.017
C4	A	0, 0.001, 0.021, 0.042, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.021 std_dev=0.021
O2	A	0, 0.003, 0.028, 0.054, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.028 std_dev=0.026
C1'	A	0, 0.006, 0.032, 0.058, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.032 std_dev=0.026
O4	A	0, 0.016, 0.053, 0.090, 0.097 max_d=0.097 avg_d=0.053 std_dev=0.037
C1'	B	0, 0.157, 0.428, 0.700, 0.744 max_d=0.744 avg_d=0.428 std_dev=0.272
O4'	A	0, 0.051, 0.340, 0.629, 0.733 max_d=0.733 avg_d=0.340 std_dev=0.289
C2'	A	0, 0.059, 0.359, 0.660, 0.806 max_d=0.806 avg_d=0.359 std_dev=0.300
C2'	B	0, 0.171, 0.474, 0.778, 0.839 max_d=0.839 avg_d=0.474 std_dev=0.303
O2	B	0, 0.136, 0.459, 0.781, 0.830 max_d=0.830 avg_d=0.459 std_dev=0.323
N1	B	0, 0.186, 0.519, 0.852, 0.829 max_d=0.829 avg_d=0.519 std_dev=0.333
O2'	A	0, 0.061, 0.409, 0.756, 0.930 max_d=0.930 avg_d=0.409 std_dev=0.348
C2	B	0, 0.207, 0.559, 0.911, 0.879 max_d=0.879 avg_d=0.559 std_dev=0.352
C3'	B	0, 0.213, 0.584, 0.955, 1.007 max_d=1.007 avg_d=0.584 std_dev=0.371
O4'	B	0, 0.258, 0.635, 1.012, 0.948 max_d=0.948 avg_d=0.635 std_dev=0.377
O2'	B	0, 0.183, 0.582, 0.980, 1.004 max_d=1.004 avg_d=0.582 std_dev=0.398
C6	B	0, 0.290, 0.706, 1.121, 1.070 max_d=1.070 avg_d=0.706 std_dev=0.415
C4'	B	0, 0.213, 0.646, 1.080, 1.087 max_d=1.087 avg_d=0.646 std_dev=0.434
C4'	A	0, 0.049, 0.497, 0.945, 1.167 max_d=1.167 avg_d=0.497 std_dev=0.448
N3	B	0, 0.329, 0.794, 1.259, 1.177 max_d=1.177 avg_d=0.794 std_dev=0.465
C3'	A	0, 0.054, 0.526, 0.999, 1.216 max_d=1.216 avg_d=0.526 std_dev=0.472
C5'	B	0, 0.329, 0.863, 1.396, 1.445 max_d=1.445 avg_d=0.863 std_dev=0.533
O5'	A	0, 0.127, 0.667, 1.207, 1.273 max_d=1.273 avg_d=0.667 std_dev=0.540
C5	B	0, 0.360, 0.908, 1.455, 1.363 max_d=1.363 avg_d=0.908 std_dev=0.548
C4	B	0, 0.375, 0.946, 1.517, 1.409 max_d=1.409 avg_d=0.946 std_dev=0.571
O3'	B	0, 0.247, 0.832, 1.417, 1.407 max_d=1.407 avg_d=0.832 std_dev=0.585
O5'	B	0, 0.276, 0.900, 1.524, 1.578 max_d=1.578 avg_d=0.900 std_dev=0.624
O3'	A	0, 0.075, 0.793, 1.512, 1.853 max_d=1.853 avg_d=0.793 std_dev=0.719
C5'	A	0, 0.082, 0.818, 1.555, 1.876 max_d=1.876 avg_d=0.818 std_dev=0.737
N4	B	0, 0.440, 1.178, 1.917, 1.895 max_d=1.895 avg_d=1.178 std_dev=0.738
P	A	0, 0.172, 0.935, 1.698, 1.788 max_d=1.788 avg_d=0.935 std_dev=0.763
OP1	B	0, 0.472, 1.236, 1.999, 2.019 max_d=2.019 avg_d=1.236 std_dev=0.764
OP2	A	0, 0.254, 1.058, 1.862, 1.968 max_d=1.968 avg_d=1.058 std_dev=0.804
P	B	0, 0.363, 1.238, 2.112, 2.303 max_d=2.303 avg_d=1.238 std_dev=0.874
OP1	A	0, 0.184, 1.142, 2.100, 2.310 max_d=2.310 avg_d=1.142 std_dev=0.958
OP2	B	0, 0.323, 1.477, 2.632, 3.101 max_d=3.101 avg_d=1.477 std_dev=1.155

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.05	0.01	0.05	0.02	0.04	0.02	0.02	0.03	0.01	0.01	0.06	0.00	0.06	0.07	0.23	0.10
C2	0.02	0.00	0.12	0.10	0.02	0.02	0.01	0.09	0.02	0.01	0.00	0.01	0.12	0.14	0.04	0.04	0.05	0.13	0.39	0.20
C2'	0.00	0.12	0.00	0.01	0.07	0.02	0.07	0.01	0.09	0.03	0.10	0.19	0.00	0.01	0.08	0.00	0.07	0.03	0.21	0.09
C3'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.05	0.01	0.09	0.01	0.10	0.01	0.08	0.16	0.02	0.01	0.06	0.02	0.10	0.05	0.15	0.09
C4	0.05	0.02	0.07	0.05	0.00	0.09	0.01	0.20	0.01	0.04	0.01	0.01	0.08	0.06	0.01	0.07	0.10	0.34	0.52	0.32
C4'	0.01	0.02	0.02	0.01	0.09	0.00	0.13	0.01	0.11	0.04	0.05	0.04	0.05	0.00	0.10	0.00	0.02	0.13	0.12	0.02
C5	0.05	0.01	0.07	0.09	0.01	0.13	0.00	0.23	0.01	0.03	0.01	0.01	0.06	0.09	0.02	0.09	0.13	0.36	0.52	0.33
C5'	0.02	0.09	0.01	0.01	0.20	0.01	0.23	0.00	0.18	0.09	0.15	0.04	0.05	0.02	0.22	0.01	0.01	0.17	0.09	0.01
C6	0.04	0.02	0.09	0.10	0.01	0.11	0.01	0.18	0.00	0.01	0.02	0.03	0.07	0.10	0.02	0.08	0.08	0.22	0.40	0.23
N1	0.02	0.01	0.03	0.01	0.04	0.04	0.03	0.09	0.01	0.00	0.00	0.02	0.04	0.03	0.04	0.03	0.05	0.10	0.33	0.16
N3	0.02	0.00	0.10	0.08	0.01	0.05	0.01	0.15	0.02	0.00	0.00	0.00	0.10	0.12	0.03	0.05	0.07	0.24	0.47	0.27
O2	0.03	0.01	0.19	0.16	0.01	0.04	0.01	0.04	0.03	0.02	0.00	0.00	0.19	0.22	0.03	0.06	0.05	0.06	0.36	0.16
O2'	0.01	0.12	0.00	0.02	0.08	0.05	0.06	0.05	0.07	0.04	0.10	0.19	0.00	0.01	0.09	0.00	0.04	0.10	0.16	0.04
O3'	0.01	0.14	0.01	0.01	0.06	0.00	0.09	0.02	0.10	0.03	0.12	0.22	0.01	0.00	0.08	0.01	0.13	0.13	0.10	0.10
O4	0.06	0.04	0.08	0.06	0.01	0.10	0.02	0.22	0.02	0.04	0.03	0.03	0.09	0.08	0.00	0.07	0.13	0.41	0.56	0.36
O4'	0.00	0.04	0.00	0.02	0.07	0.00	0.09	0.01	0.08	0.03	0.05	0.06	0.00	0.01	0.07	0.00	0.13	0.17	0.15	0.11
O5'	0.06	0.05	0.07	0.10	0.10	0.02	0.13	0.01	0.08	0.05	0.07	0.05	0.04	0.13	0.13	0.13	0.00	0.03	0.03	0.00
OP1	0.07	0.13	0.03	0.05	0.34	0.13	0.36	0.17	0.22	0.10	0.24	0.06	0.10	0.13	0.41	0.17	0.03	0.00	0.04	0.03
OP2	0.23	0.39	0.21	0.15	0.52	0.12	0.52	0.09	0.40	0.33	0.47	0.36	0.16	0.10	0.56	0.15	0.03	0.04	0.00	0.01
P	0.10	0.20	0.09	0.09	0.32	0.02	0.33	0.01	0.23	0.16	0.27	0.16	0.04	0.10	0.36	0.11	0.00	0.03	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.17	0.09	0.29	0.29	0.23	0.21	0.19	0.20	0.12	0.09	0.17	0.32	0.14	0.33	0.38	0.14	0.20	0.29	0.23	0.20
C2	0.12	0.09	0.21	0.20	0.23	0.14	0.20	0.14	0.13	0.09	0.17	0.32	0.15	0.24	0.27	0.10	0.16	0.24	0.20	0.17
C2'	0.38	0.28	0.52	0.51	0.28	0.43	0.26	0.40	0.27	0.29	0.27	0.32	0.33	0.60	0.61	0.35	0.36	0.39	0.34	0.36
C3'	0.41	0.30	0.52	0.49	0.28	0.45	0.28	0.41	0.29	0.32	0.27	0.33	0.36	0.62	0.59	0.39	0.35	0.37	0.32	0.36
C4	0.09	0.08	0.13	0.13	0.20	0.09	0.21	0.12	0.14	0.07	0.09	0.31	0.17	0.17	0.17	0.10	0.16	0.20	0.14	0.13
C4'	0.26	0.16	0.36	0.35	0.26	0.30	0.23	0.27	0.17	0.17	0.21	0.36	0.22	0.45	0.45	0.24	0.23	0.29	0.21	0.23
C5	0.09	0.07	0.15	0.14	0.21	0.08	0.22	0.11	0.15	0.07	0.11	0.31	0.15	0.20	0.20	0.09	0.14	0.20	0.13	0.12
C5'	0.17	0.12	0.25	0.23	0.32	0.20	0.29	0.16	0.18	0.12	0.22	0.43	0.15	0.36	0.33	0.16	0.11	0.17	0.07	0.11
C6	0.09	0.06	0.18	0.17	0.23	0.10	0.22	0.11	0.14	0.07	0.14	0.33	0.13	0.23	0.24	0.08	0.14	0.21	0.15	0.13
N1	0.11	0.08	0.21	0.21	0.24	0.14	0.21	0.13	0.13	0.08	0.16	0.33	0.13	0.25	0.29	0.09	0.15	0.24	0.18	0.15
N3	0.10	0.09	0.15	0.15	0.23	0.10	0.21	0.12	0.14	0.08	0.13	0.32	0.18	0.18	0.19	0.10	0.15	0.21	0.17	0.15
O2	0.14	0.10	0.24	0.24	0.23	0.17	0.19	0.17	0.12	0.09	0.19	0.29	0.14	0.26	0.31	0.12	0.19	0.26	0.23	0.20
O2'	0.41	0.28	0.58	0.59	0.26	0.49	0.26	0.46	0.27	0.30	0.26	0.31	0.32	0.67	0.71	0.38	0.43	0.46	0.41	0.42
O3'	0.57	0.41	0.67	0.66	0.32	0.62	0.34	0.58	0.39	0.44	0.34	0.33	0.49	0.81	0.76	0.54	0.49	0.51	0.43	0.49
O4	0.09	0.11	0.12	0.14	0.15	0.10	0.19	0.15	0.13	0.08	0.08	0.25	0.21	0.14	0.17	0.12	0.19	0.22	0.15	0.15
O4'	0.12	0.06	0.23	0.24	0.25	0.16	0.21	0.15	0.11	0.05	0.17	0.36	0.11	0.27	0.33	0.10	0.16	0.27	0.18	0.15
O5'	0.19	0.13	0.26	0.23	0.27	0.19	0.26	0.17	0.18	0.14	0.19	0.38	0.18	0.36	0.32	0.18	0.15	0.19	0.11	0.13
OP1	0.15	0.13	0.20	0.14	0.40	0.14	0.39	0.10	0.27	0.15	0.25	0.53	0.13	0.37	0.25	0.16	0.13	0.14	0.20	0.16
OP2	0.24	0.31	0.21	0.29	0.55	0.27	0.56	0.34	0.46	0.35	0.42	0.65	0.20	0.07	0.28	0.31	0.44	0.44	0.47	0.42
P	0.06	0.13	0.10	0.11	0.38	0.05	0.38	0.11	0.27	0.15	0.25	0.50	0.07	0.20	0.19	0.12	0.20	0.24	0.23	0.19

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.05	0.02	0.02	0.00	0.03	0.06	0.09	0.08
C2	0.02	0.00	0.05	0.07	0.00	0.03	0.02	0.07	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.10	0.08	0.01	0.13	0.17	0.17	0.11
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.02	0.01	0.05	0.00	0.06	0.01	0.04	0.02	0.10	0.01	0.03	0.01	0.04	0.18	0.10	0.06
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.12	0.01	0.15	0.02	0.13	0.06	0.09	0.12	0.09	0.02	0.00	0.01	0.05	0.24	0.13	0.11
C4	0.02	0.00	0.02	0.12	0.00	0.11	0.01	0.18	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.06	0.11	0.06	0.24	0.25	0.24	0.19
C4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.11	0.00	0.14	0.01	0.13	0.05	0.06	0.11	0.05	0.03	0.02	0.00	0.01	0.09	0.03	0.01
C5	0.03	0.02	0.05	0.15	0.01	0.14	0.00	0.22	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.04	0.15	0.07	0.27	0.23	0.20	0.19
C5'	0.01	0.07	0.00	0.02	0.18	0.01	0.22	0.00	0.18	0.08	0.12	0.20	0.05	0.03	0.03	0.01	0.00	0.04	0.01	0.01
C6	0.04	0.02	0.06	0.13	0.01	0.13	0.01	0.18	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.05	0.13	0.06	0.20	0.16	0.12	0.11
N1	0.01	0.01	0.01	0.06	0.02	0.05	0.01	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.06	0.01	0.11	0.13	0.13	0.09
N3	0.01	0.00	0.04	0.09	0.01	0.06	0.02	0.12	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.10	0.09	0.03	0.19	0.22	0.21	0.15
N4	0.02	0.02	0.02	0.12	0.01	0.11	0.02	0.20	0.02	0.01	0.02	0.00	0.03	0.07	0.11	0.06	0.27	0.29	0.28	0.23
O2	0.05	0.00	0.10	0.09	0.01	0.05	0.02	0.05	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.15	0.12	0.04	0.09	0.16	0.16	0.10
O2'	0.02	0.10	0.01	0.02	0.06	0.03	0.04	0.03	0.05	0.04	0.10	0.07	0.15	0.00	0.05	0.04	0.03	0.18	0.08	0.05
O3'	0.02	0.08	0.03	0.00	0.11	0.02	0.15	0.03	0.13	0.06	0.09	0.11	0.12	0.05	0.00	0.02	0.06	0.34	0.18	0.17
O4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.00	0.07	0.01	0.06	0.01	0.03	0.06	0.04	0.04	0.02	0.00	0.03	0.05	0.14	0.14
O5'	0.03	0.13	0.04	0.05	0.24	0.01	0.27	0.00	0.20	0.11	0.19	0.27	0.09	0.03	0.06	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.06	0.17	0.18	0.24	0.25	0.09	0.23	0.04	0.16	0.13	0.22	0.29	0.16	0.18	0.34	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.09	0.17	0.10	0.13	0.24	0.03	0.20	0.01	0.12	0.13	0.21	0.28	0.16	0.08	0.18	0.14	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.08	0.11	0.06	0.11	0.19	0.01	0.19	0.01	0.11	0.09	0.15	0.23	0.10	0.05	0.17	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00