Doublet Group distance statistics: 50570

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.001, 0.005, 0.009, 0.009 max_d=0.009 avg_d=0.005 std_dev=0.004
C5	A	0, 0.003, 0.011, 0.019, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.011 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.001, 0.010, 0.018, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.010 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.003, 0.012, 0.020, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.012 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.004, 0.013, 0.023, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.013 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.004, 0.013, 0.023, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.013 std_dev=0.010
C6	A	0, 0.004, 0.014, 0.024, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.014 std_dev=0.010
O2	A	0, 0.007, 0.023, 0.039, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.023 std_dev=0.016
O4	A	0, 0.011, 0.038, 0.066, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.038 std_dev=0.028
O4'	A	0, 0.013, 0.079, 0.146, 0.163 max_d=0.163 avg_d=0.079 std_dev=0.067
C2'	A	0, 0.017, 0.107, 0.198, 0.222 max_d=0.222 avg_d=0.107 std_dev=0.091
C3'	A	0, 0.058, 0.228, 0.398, 0.409 max_d=0.409 avg_d=0.228 std_dev=0.170
C4	B	0, 0.089, 0.307, 0.526, 0.489 max_d=0.489 avg_d=0.307 std_dev=0.219
N3	B	0, 0.101, 0.346, 0.591, 0.537 max_d=0.537 avg_d=0.346 std_dev=0.245
N4	B	0, 0.057, 0.302, 0.548, 0.602 max_d=0.602 avg_d=0.302 std_dev=0.246
C5	B	0, 0.094, 0.349, 0.605, 0.602 max_d=0.602 avg_d=0.349 std_dev=0.255
O2'	A	0, 0.035, 0.293, 0.551, 0.628 max_d=0.628 avg_d=0.293 std_dev=0.258
O3'	A	0, 0.102, 0.392, 0.681, 0.692 max_d=0.692 avg_d=0.392 std_dev=0.290
C2	B	0, 0.075, 0.367, 0.659, 0.714 max_d=0.714 avg_d=0.367 std_dev=0.292
C4'	A	0, 0.003, 0.326, 0.648, 0.765 max_d=0.765 avg_d=0.326 std_dev=0.323
O5'	A	0, 0.058, 0.384, 0.711, 0.799 max_d=0.799 avg_d=0.384 std_dev=0.327
C6	B	0, 0.072, 0.401, 0.729, 0.805 max_d=0.805 avg_d=0.401 std_dev=0.329
O2	B	0, 0.089, 0.432, 0.774, 0.838 max_d=0.838 avg_d=0.432 std_dev=0.343
N1	B	0, 0.041, 0.384, 0.728, 0.834 max_d=0.834 avg_d=0.384 std_dev=0.344
C1'	B	0, 0.005, 0.439, 0.874, 1.031 max_d=1.031 avg_d=0.439 std_dev=0.435
O4'	B	0, 0.066, 0.503, 0.941, 1.067 max_d=1.067 avg_d=0.503 std_dev=0.437
C4'	B	0, 0.061, 0.535, 1.010, 1.154 max_d=1.154 avg_d=0.535 std_dev=0.475
C3'	B	0, -0.014, 0.484, 0.981, 1.168 max_d=1.168 avg_d=0.484 std_dev=0.498
C5'	B	0, 0.135, 0.636, 1.138, 1.225 max_d=1.225 avg_d=0.636 std_dev=0.501
C2'	B	0, -0.091, 0.417, 0.926, 1.133 max_d=1.133 avg_d=0.417 std_dev=0.508
O3'	B	0, 0.063, 0.572, 1.081, 1.237 max_d=1.237 avg_d=0.572 std_dev=0.509
P	A	0, 0.125, 0.646, 1.167, 1.275 max_d=1.275 avg_d=0.646 std_dev=0.521
O5'	B	0, 0.068, 0.631, 1.194, 1.366 max_d=1.366 avg_d=0.631 std_dev=0.563
OP2	A	0, 0.226, 0.794, 1.363, 1.300 max_d=1.300 avg_d=0.794 std_dev=0.569
O2'	B	0, 0.051, 0.633, 1.216, 1.407 max_d=1.407 avg_d=0.633 std_dev=0.583
P	B	0, 0.094, 0.744, 1.393, 1.582 max_d=1.582 avg_d=0.744 std_dev=0.649
OP1	B	0, 0.178, 0.870, 1.562, 1.693 max_d=1.693 avg_d=0.870 std_dev=0.692
C5'	A	0, -0.055, 0.642, 1.339, 1.611 max_d=1.611 avg_d=0.642 std_dev=0.697
OP2	B	0, 0.049, 0.785, 1.520, 1.768 max_d=1.768 avg_d=0.785 std_dev=0.736
OP1	A	0, 0.088, 0.899, 1.709, 1.964 max_d=1.964 avg_d=0.899 std_dev=0.810

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.26	0.29	0.07	0.16
C2	0.01	0.00	0.07	0.07	0.00	0.08	0.00	0.32	0.00	0.00	0.00	0.00	0.19	0.00	0.00	0.01	0.19	0.08	0.28	0.05
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.03	0.02	0.01	0.04	0.02	0.02	0.06	0.11	0.00	0.03	0.03	0.01	0.09	0.16	0.13	0.04
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.18	0.00	0.21	0.03	0.19	0.11	0.12	0.01	0.01	0.00	0.19	0.04	0.02	0.11	0.19	0.03
C4	0.01	0.00	0.03	0.18	0.00	0.23	0.01	0.59	0.01	0.00	0.00	0.01	0.11	0.16	0.00	0.02	0.10	0.19	0.47	0.20
C4'	0.01	0.08	0.02	0.00	0.23	0.00	0.29	0.00	0.27	0.13	0.15	0.03	0.03	0.02	0.25	0.00	0.00	0.23	0.20	0.01
C5	0.01	0.00	0.01	0.21	0.01	0.29	0.00	0.65	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.22	0.01	0.02	0.11	0.18	0.45	0.20
C5'	0.09	0.32	0.04	0.03	0.59	0.00	0.65	0.00	0.57	0.35	0.45	0.18	0.04	0.03	0.63	0.01	0.00	0.39	0.31	0.01
C6	0.01	0.00	0.02	0.19	0.01	0.27	0.00	0.57	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.20	0.01	0.02	0.16	0.08	0.31	0.10
N1	0.01	0.00	0.02	0.11	0.00	0.13	0.00	0.35	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.07	0.01	0.01	0.21	0.13	0.22	0.06
N3	0.01	0.00	0.06	0.12	0.00	0.15	0.00	0.45	0.00	0.00	0.00	0.01	0.18	0.06	0.00	0.01	0.14	0.08	0.39	0.12
O2	0.02	0.00	0.11	0.01	0.01	0.03	0.00	0.18	0.00	0.00	0.01	0.00	0.28	0.11	0.01	0.01	0.21	0.15	0.22	0.06
O2'	0.02	0.19	0.00	0.01	0.11	0.03	0.03	0.04	0.00	0.07	0.18	0.28	0.00	0.05	0.12	0.09	0.03	0.11	0.17	0.03
O3'	0.01	0.00	0.03	0.00	0.16	0.02	0.22	0.03	0.20	0.07	0.06	0.11	0.05	0.00	0.18	0.00	0.30	0.11	0.31	0.24
O4	0.01	0.00	0.03	0.19	0.00	0.25	0.01	0.63	0.01	0.01	0.00	0.01	0.12	0.18	0.00	0.02	0.08	0.28	0.55	0.26
O4'	0.00	0.01	0.01	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.09	0.00	0.02	0.00	0.37	0.44	0.07	0.29
O5'	0.26	0.19	0.09	0.02	0.10	0.00	0.11	0.00	0.16	0.21	0.14	0.21	0.03	0.30	0.08	0.37	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.29	0.08	0.16	0.11	0.19	0.23	0.18	0.39	0.08	0.13	0.08	0.15	0.11	0.11	0.28	0.44	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.07	0.28	0.13	0.19	0.47	0.20	0.45	0.31	0.31	0.22	0.39	0.22	0.17	0.31	0.55	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.16	0.05	0.04	0.03	0.20	0.01	0.20	0.01	0.10	0.06	0.12	0.06	0.03	0.24	0.26	0.29	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.28	0.25	0.32	0.32	0.09	0.28	0.10	0.30	0.13	0.21	0.14	0.18	0.39	0.34	0.32	0.25	0.36	0.37	0.31	0.32
C2	0.28	0.27	0.31	0.30	0.09	0.28	0.10	0.30	0.13	0.22	0.14	0.20	0.41	0.32	0.29	0.26	0.35	0.36	0.31	0.32
C2'	0.17	0.14	0.21	0.20	0.14	0.17	0.13	0.18	0.08	0.11	0.07	0.25	0.26	0.24	0.21	0.15	0.24	0.23	0.19	0.19
C3'	0.31	0.30	0.35	0.34	0.13	0.31	0.13	0.33	0.20	0.27	0.22	0.08	0.41	0.35	0.34	0.28	0.41	0.40	0.37	0.37
C4	0.23	0.28	0.22	0.21	0.07	0.22	0.08	0.26	0.11	0.20	0.22	0.13	0.40	0.22	0.20	0.21	0.32	0.31	0.28	0.28
C4'	0.36	0.37	0.39	0.40	0.22	0.37	0.21	0.41	0.27	0.33	0.30	0.15	0.46	0.37	0.39	0.34	0.50	0.51	0.50	0.48
C5	0.24	0.28	0.23	0.22	0.08	0.22	0.08	0.26	0.11	0.20	0.22	0.09	0.40	0.23	0.21	0.21	0.32	0.31	0.28	0.29
C5'	0.70	0.72	0.71	0.74	0.62	0.72	0.60	0.78	0.64	0.69	0.68	0.56	0.78	0.66	0.72	0.69	0.88	0.91	0.91	0.88
C6	0.26	0.28	0.27	0.26	0.08	0.25	0.09	0.28	0.13	0.22	0.20	0.11	0.41	0.28	0.26	0.23	0.34	0.34	0.30	0.31
N1	0.28	0.27	0.31	0.30	0.08	0.28	0.10	0.30	0.13	0.22	0.17	0.16	0.41	0.32	0.29	0.25	0.35	0.36	0.31	0.32
N3	0.26	0.28	0.27	0.26	0.09	0.25	0.10	0.28	0.13	0.22	0.17	0.19	0.41	0.27	0.24	0.24	0.34	0.33	0.29	0.30
O2	0.30	0.25	0.34	0.34	0.10	0.31	0.10	0.32	0.14	0.23	0.11	0.22	0.40	0.36	0.33	0.28	0.37	0.38	0.32	0.33
O2'	0.10	0.10	0.07	0.04	0.28	0.08	0.27	0.07	0.19	0.13	0.19	0.38	0.07	0.13	0.04	0.12	0.08	0.09	0.08	0.07
O3'	0.20	0.20	0.23	0.23	0.08	0.20	0.08	0.22	0.12	0.17	0.13	0.09	0.27	0.23	0.22	0.18	0.31	0.30	0.29	0.27
O4	0.20	0.27	0.16	0.15	0.07	0.18	0.07	0.23	0.09	0.18	0.24	0.10	0.37	0.16	0.13	0.18	0.28	0.27	0.24	0.26
O4'	0.30	0.29	0.35	0.35	0.09	0.31	0.11	0.34	0.16	0.24	0.18	0.13	0.42	0.36	0.36	0.27	0.40	0.41	0.36	0.36
O5'	0.14	0.17	0.14	0.16	0.01	0.14	0.05	0.18	0.02	0.11	0.11	0.09	0.28	0.14	0.16	0.12	0.25	0.25	0.22	0.22
OP1	0.40	0.44	0.36	0.39	0.34	0.41	0.31	0.48	0.35	0.40	0.40	0.29	0.50	0.33	0.35	0.41	0.57	0.58	0.59	0.57
OP2	0.70	0.74	0.69	0.69	0.61	0.70	0.56	0.74	0.61	0.68	0.70	0.55	0.81	0.67	0.67	0.68	0.82	0.80	0.78	0.79
P	0.41	0.45	0.39	0.41	0.31	0.41	0.27	0.47	0.32	0.39	0.40	0.25	0.53	0.36	0.38	0.40	0.55	0.55	0.54	0.53

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.03	0.02	0.06	0.02	0.04	0.00	0.07	0.07	0.03	0.03
C2	0.03	0.00	0.03	0.05	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.07	0.06	0.05	0.13	0.13	0.12	0.10
C2'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.06	0.01	0.09	0.02	0.10	0.04	0.04	0.06	0.05	0.00	0.04	0.01	0.03	0.07	0.06	0.03
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.05	0.00	0.04	0.01	0.04	0.03	0.06	0.05	0.05	0.01	0.01	0.02	0.04	0.07	0.06	0.04
C4	0.01	0.00	0.06	0.05	0.00	0.05	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.10	0.07	0.02	0.24	0.25	0.26	0.24
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.06	0.02	0.01	0.05	0.07	0.05	0.01	0.00	0.00	0.05	0.02	0.00
C5	0.00	0.01	0.09	0.04	0.00	0.07	0.00	0.17	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.10	0.06	0.06	0.26	0.26	0.25	0.26
C5'	0.02	0.04	0.02	0.01	0.14	0.01	0.17	0.00	0.15	0.07	0.08	0.16	0.04	0.05	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.00
C6	0.00	0.01	0.10	0.04	0.00	0.06	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.09	0.06	0.07	0.21	0.20	0.16	0.19
N1	0.01	0.02	0.04	0.03	0.00	0.02	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.06	0.04	0.01	0.14	0.13	0.10	0.11
N3	0.03	0.00	0.04	0.06	0.00	0.01	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.09	0.07	0.03	0.19	0.20	0.20	0.18
N4	0.02	0.00	0.06	0.05	0.00	0.05	0.00	0.16	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.11	0.08	0.02	0.27	0.29	0.31	0.28
O2	0.06	0.01	0.05	0.05	0.01	0.07	0.01	0.04	0.02	0.03	0.00	0.00	0.00	0.04	0.05	0.11	0.07	0.06	0.07	0.04
O2'	0.02	0.07	0.00	0.01	0.10	0.05	0.10	0.05	0.09	0.06	0.09	0.11	0.04	0.00	0.04	0.04	0.01	0.07	0.02	0.02
O3'	0.04	0.06	0.04	0.01	0.07	0.01	0.06	0.01	0.06	0.04	0.07	0.08	0.05	0.04	0.00	0.02	0.06	0.09	0.05	0.04
O4'	0.00	0.05	0.01	0.02	0.02	0.00	0.06	0.01	0.07	0.01	0.03	0.02	0.11	0.04	0.02	0.00	0.05	0.05	0.03	0.02
O5'	0.07	0.13	0.03	0.04	0.24	0.00	0.26	0.01	0.21	0.14	0.19	0.27	0.07	0.01	0.06	0.05	0.00	0.00	0.01	0.00
OP1	0.07	0.13	0.07	0.07	0.25	0.05	0.26	0.05	0.20	0.13	0.20	0.29	0.06	0.07	0.09	0.05	0.00	0.00	0.01	0.00
OP2	0.03	0.12	0.06	0.06	0.26	0.02	0.25	0.01	0.16	0.10	0.20	0.31	0.07	0.02	0.05	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.03	0.10	0.03	0.04	0.24	0.00	0.26	0.00	0.19	0.11	0.18	0.28	0.04	0.02	0.04	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00