Doublet Group distance statistics: 50576

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N1	A	0, 0.000, 0.008, 0.015, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.008 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.000, 0.010, 0.021, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.010 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.000, 0.012, 0.023, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.012 std_dev=0.012
C6	A	0, 0.000, 0.013, 0.026, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.013 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.000, 0.015, 0.031, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.015 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.000, 0.017, 0.035, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.017 std_dev=0.017
O4	A	0, 0.000, 0.025, 0.050, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.025 std_dev=0.025
O2	A	0, 0.000, 0.025, 0.050, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.025 std_dev=0.025
N3	A	0, 0.000, 0.027, 0.053, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.027 std_dev=0.027
O4'	A	0, 0.000, 0.079, 0.158, 0.158 max_d=0.158 avg_d=0.079 std_dev=0.079
C2'	A	0, 0.000, 0.080, 0.161, 0.161 max_d=0.161 avg_d=0.080 std_dev=0.080
C4'	A	0, 0.000, 0.097, 0.194, 0.194 max_d=0.194 avg_d=0.097 std_dev=0.097
C3'	A	0, 0.000, 0.150, 0.299, 0.299 max_d=0.299 avg_d=0.150 std_dev=0.150
O5'	A	0, 0.000, 0.156, 0.313, 0.313 max_d=0.313 avg_d=0.156 std_dev=0.156
C5'	A	0, 0.000, 0.180, 0.361, 0.361 max_d=0.361 avg_d=0.180 std_dev=0.180
O2'	A	0, 0.000, 0.191, 0.382, 0.382 max_d=0.382 avg_d=0.191 std_dev=0.191
N4	B	0, 0.000, 0.224, 0.448, 0.448 max_d=0.448 avg_d=0.224 std_dev=0.224
O3'	A	0, 0.000, 0.257, 0.514, 0.514 max_d=0.514 avg_d=0.257 std_dev=0.257
N3	B	0, 0.000, 0.290, 0.579, 0.579 max_d=0.579 avg_d=0.290 std_dev=0.290
C4	B	0, 0.000, 0.294, 0.588, 0.588 max_d=0.588 avg_d=0.294 std_dev=0.294
O2	B	0, 0.000, 0.345, 0.690, 0.690 max_d=0.690 avg_d=0.345 std_dev=0.345
C2	B	0, 0.000, 0.346, 0.693, 0.693 max_d=0.693 avg_d=0.346 std_dev=0.346
P	A	0, 0.000, 0.360, 0.720, 0.720 max_d=0.720 avg_d=0.360 std_dev=0.360
C5	B	0, 0.000, 0.376, 0.753, 0.753 max_d=0.753 avg_d=0.376 std_dev=0.376
N1	B	0, 0.000, 0.423, 0.845, 0.845 max_d=0.845 avg_d=0.423 std_dev=0.423
C6	B	0, 0.000, 0.437, 0.874, 0.874 max_d=0.874 avg_d=0.437 std_dev=0.437
O5'	B	0, 0.000, 0.456, 0.912, 0.912 max_d=0.912 avg_d=0.456 std_dev=0.456
C1'	B	0, 0.000, 0.470, 0.940, 0.940 max_d=0.940 avg_d=0.470 std_dev=0.470
OP2	B	0, 0.000, 0.474, 0.949, 0.949 max_d=0.949 avg_d=0.474 std_dev=0.474
C2'	B	0, 0.000, 0.479, 0.959, 0.959 max_d=0.959 avg_d=0.479 std_dev=0.479
O2'	B	0, 0.000, 0.488, 0.977, 0.977 max_d=0.977 avg_d=0.488 std_dev=0.488
OP1	A	0, 0.000, 0.498, 0.996, 0.996 max_d=0.996 avg_d=0.498 std_dev=0.498
OP2	A	0, 0.000, 0.501, 1.001, 1.001 max_d=1.001 avg_d=0.501 std_dev=0.501
P	B	0, 0.000, 0.506, 1.013, 1.013 max_d=1.013 avg_d=0.506 std_dev=0.506
O4'	B	0, 0.000, 0.547, 1.094, 1.094 max_d=1.094 avg_d=0.547 std_dev=0.547
C3'	B	0, 0.000, 0.553, 1.105, 1.105 max_d=1.105 avg_d=0.553 std_dev=0.553
OP1	B	0, 0.000, 0.595, 1.190, 1.190 max_d=1.190 avg_d=0.595 std_dev=0.595
C4'	B	0, 0.000, 0.599, 1.198, 1.198 max_d=1.198 avg_d=0.599 std_dev=0.599
O3'	B	0, 0.000, 0.621, 1.241, 1.241 max_d=1.241 avg_d=0.621 std_dev=0.621
C5'	B	0, 0.000, 0.649, 1.298, 1.298 max_d=1.298 avg_d=0.649 std_dev=0.649

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.00	0.06	0.07	0.02	0.02
C2	0.00	0.00	0.03	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.04	0.02	0.06	0.02
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.00	0.00	0.02	0.00	0.04	0.10	0.02	0.03
C3'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.05	0.01	0.07	0.02	0.06	0.03	0.05	0.01	0.00	0.00	0.04	0.01	0.00	0.10	0.01	0.02
C4	0.02	0.00	0.02	0.05	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.05	0.06	0.01	0.02	0.02	0.03	0.08	0.03
C4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.02	0.08	0.02	0.01
C5	0.01	0.01	0.00	0.07	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.08	0.01	0.03	0.01	0.03	0.08	0.03
C5'	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.00	0.07	0.01	0.00
C6	0.01	0.02	0.01	0.06	0.00	0.03	0.00	0.02	0.00	0.00	0.03	0.02	0.00	0.07	0.01	0.03	0.03	0.00	0.06	0.01
N1	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.03	0.02	0.01	0.04	0.03	0.05	0.00
N3	0.00	0.01	0.01	0.05	0.00	0.03	0.02	0.03	0.03	0.01	0.00	0.02	0.05	0.04	0.01	0.01	0.01	0.02	0.09	0.04
O2	0.00	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.11	0.04	0.01	0.01	0.05	0.05	0.06	0.01
O2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.05	0.04	0.01	0.03	0.00	0.03	0.05	0.11	0.00	0.01	0.06	0.04	0.00	0.06	0.01	0.00
O3'	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.01	0.08	0.02	0.07	0.03	0.04	0.04	0.01	0.00	0.05	0.01	0.04	0.09	0.01	0.01
O4	0.03	0.01	0.02	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.06	0.05	0.00	0.03	0.03	0.03	0.08	0.03
O4'	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.03	0.00	0.08	0.07	0.01	0.03
O5'	0.06	0.04	0.04	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.03	0.04	0.01	0.05	0.00	0.04	0.03	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00
OP1	0.07	0.02	0.10	0.10	0.03	0.08	0.03	0.07	0.00	0.03	0.02	0.05	0.06	0.09	0.03	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00
OP2	0.02	0.06	0.02	0.01	0.08	0.02	0.08	0.01	0.06	0.05	0.09	0.06	0.01	0.01	0.08	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.02	0.02	0.03	0.02	0.03	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.03	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.02	0.05	0.02	0.02	0.03	0.04	0.03	0.04	0.04	0.04	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.04	0.03	0.05	0.10	0.06
C2	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.00	0.01	0.03	0.04	0.06	0.11	0.07
C2'	0.01	0.04	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.03	0.03	0.00	0.06	0.01	0.01	0.03	0.05	0.06	0.12	0.08
C3'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.04	0.02	0.05	0.04	0.05	0.04	0.04	0.03	0.05	0.03	0.02	0.04	0.04	0.04	0.09	0.06
C4	0.03	0.03	0.03	0.05	0.04	0.06	0.03	0.07	0.03	0.03	0.03	0.03	0.04	0.02	0.04	0.06	0.01	0.04	0.08	0.04
C4'	0.00	0.03	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03	0.02	0.03	0.01	0.05	0.04	0.03	0.02	0.05	0.06	0.11	0.07
C5	0.04	0.05	0.04	0.05	0.05	0.07	0.05	0.08	0.05	0.05	0.05	0.04	0.06	0.03	0.03	0.07	0.00	0.03	0.08	0.04
C5'	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.04	0.04	0.03	0.01	0.05	0.06	0.11	0.07
C6	0.04	0.06	0.03	0.04	0.05	0.06	0.05	0.07	0.06	0.05	0.06	0.04	0.07	0.02	0.03	0.07	0.01	0.03	0.08	0.04
N1	0.03	0.04	0.02	0.03	0.04	0.05	0.04	0.05	0.04	0.04	0.04	0.02	0.06	0.01	0.02	0.05	0.02	0.04	0.10	0.05
N3	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.04	0.03	0.06	0.11	0.07
O2	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.06	0.11	0.07
O2'	0.07	0.05	0.08	0.08	0.07	0.07	0.06	0.07	0.06	0.05	0.06	0.09	0.02	0.09	0.10	0.06	0.14	0.14	0.21	0.16
O3'	0.02	0.01	0.05	0.03	0.03	0.00	0.04	0.01	0.03	0.02	0.02	0.02	0.02	0.07	0.06	0.01	0.07	0.07	0.11	0.08
O4	0.04	0.03	0.04	0.06	0.04	0.07	0.04	0.09	0.04	0.03	0.03	0.04	0.04	0.03	0.05	0.07	0.01	0.03	0.06	0.03
O4'	0.02	0.05	0.01	0.02	0.03	0.03	0.03	0.03	0.03	0.04	0.04	0.01	0.07	0.00	0.00	0.04	0.03	0.05	0.10	0.06
O5'	0.02	0.00	0.04	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.05	0.05	0.01	0.07	0.09	0.14	0.10
OP1	0.07	0.05	0.09	0.06	0.02	0.05	0.02	0.03	0.03	0.04	0.04	0.02	0.04	0.12	0.08	0.04	0.09	0.10	0.13	0.11
OP2	0.03	0.05	0.04	0.06	0.07	0.07	0.07	0.08	0.07	0.05	0.06	0.07	0.06	0.01	0.05	0.06	0.02	0.01	0.03	0.00
P	0.00	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.03	0.04	0.03	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.01	0.02	0.03	0.04	0.09	0.05

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.07	0.05	0.09	0.07
C2	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.10	0.10	0.15	0.11
C2'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.04	0.01
C3'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.06	0.01	0.00	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01
C4	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.07	0.08	0.14	0.10
C4'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.03	0.00	0.00	0.03	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00
C5	0.02	0.01	0.03	0.04	0.00	0.04	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.03	0.04	0.07	0.09	0.15	0.11
C5'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.02	0.02	0.00	0.04	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.00
C6	0.03	0.01	0.03	0.03	0.00	0.03	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.04	0.02	0.04	0.10	0.10	0.15	0.12
N1	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.10	0.09	0.14	0.11
N3	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.08	0.09	0.15	0.11
N4	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.05	0.07	0.12	0.08
O2	0.06	0.00	0.06	0.06	0.01	0.06	0.01	0.06	0.02	0.02	0.00	0.01	0.00	0.06	0.06	0.05	0.12	0.11	0.16	0.13
O2'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.02	0.01	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01
O3'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.06	0.01	0.00	0.00	0.07	0.06	0.04	0.06
O4'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.00	0.03	0.05	0.00	0.00	0.00	0.07	0.05	0.07	0.06
O5'	0.07	0.10	0.01	0.03	0.07	0.01	0.07	0.00	0.10	0.10	0.08	0.05	0.12	0.01	0.07	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00
OP1	0.05	0.10	0.00	0.01	0.08	0.01	0.09	0.03	0.10	0.09	0.09	0.07	0.11	0.02	0.06	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.09	0.15	0.04	0.01	0.14	0.01	0.15	0.01	0.15	0.14	0.15	0.12	0.16	0.02	0.04	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00
P	0.07	0.11	0.01	0.01	0.10	0.00	0.11	0.00	0.12	0.11	0.11	0.08	0.13	0.01	0.06	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00