Doublet Group distance statistics: 50587

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 4, 14, 7, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.010, 0.016, 0.022, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.016 std_dev=0.006
C4	A	0, 0.009, 0.017, 0.024, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.017 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.013, 0.021, 0.030, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.021 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.027, 0.036, 0.045, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.036 std_dev=0.009
C6	A	0, 0.010, 0.019, 0.029, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.019 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.009, 0.020, 0.031, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.020 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.024, 0.036, 0.048, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.036 std_dev=0.012
O2	A	0, 0.026, 0.049, 0.072, 0.098 max_d=0.098 avg_d=0.049 std_dev=0.023
O4	A	0, 0.026, 0.051, 0.077, 0.116 max_d=0.116 avg_d=0.051 std_dev=0.026
O4'	A	0, 0.046, 0.147, 0.247, 0.478 max_d=0.478 avg_d=0.147 std_dev=0.101
N1	B	0, 0.130, 0.241, 0.352, 0.509 max_d=0.509 avg_d=0.241 std_dev=0.111
C2'	A	0, 0.051, 0.164, 0.276, 0.515 max_d=0.515 avg_d=0.164 std_dev=0.112
N3	B	0, 0.212, 0.327, 0.442, 0.561 max_d=0.561 avg_d=0.327 std_dev=0.115
C2	B	0, 0.161, 0.291, 0.422, 0.582 max_d=0.582 avg_d=0.291 std_dev=0.130
C4'	A	0, 0.115, 0.248, 0.382, 0.678 max_d=0.678 avg_d=0.248 std_dev=0.134
O2'	A	0, 0.074, 0.221, 0.369, 0.621 max_d=0.621 avg_d=0.221 std_dev=0.148
C3'	A	0, 0.128, 0.287, 0.447, 0.795 max_d=0.795 avg_d=0.287 std_dev=0.160
C4	B	0, 0.215, 0.379, 0.544, 0.858 max_d=0.858 avg_d=0.379 std_dev=0.165
O5'	A	0, 0.354, 0.525, 0.696, 0.857 max_d=0.857 avg_d=0.525 std_dev=0.171
C6	B	0, 0.096, 0.268, 0.439, 0.702 max_d=0.702 avg_d=0.268 std_dev=0.171
C5	B	0, 0.199, 0.376, 0.552, 0.978 max_d=0.978 avg_d=0.376 std_dev=0.177
C1'	B	0, 0.234, 0.420, 0.607, 0.821 max_d=0.821 avg_d=0.420 std_dev=0.187
O4'	B	0, 0.278, 0.469, 0.660, 0.830 max_d=0.830 avg_d=0.469 std_dev=0.191
O3'	A	0, 0.279, 0.489, 0.699, 1.097 max_d=1.097 avg_d=0.489 std_dev=0.210
O4	B	0, 0.320, 0.537, 0.754, 1.029 max_d=1.029 avg_d=0.537 std_dev=0.217
O2	B	0, 0.210, 0.429, 0.648, 0.998 max_d=0.998 avg_d=0.429 std_dev=0.219
P	A	0, 0.449, 0.704, 0.959, 1.159 max_d=1.159 avg_d=0.704 std_dev=0.255
C5'	A	0, 0.171, 0.430, 0.690, 1.248 max_d=1.248 avg_d=0.430 std_dev=0.260
O5'	B	0, 0.613, 0.877, 1.141, 1.310 max_d=1.310 avg_d=0.877 std_dev=0.264
C2'	B	0, 0.346, 0.639, 0.931, 1.209 max_d=1.209 avg_d=0.639 std_dev=0.292
C5'	B	0, 0.516, 0.811, 1.105, 1.584 max_d=1.584 avg_d=0.811 std_dev=0.295
C4'	B	0, 0.423, 0.723, 1.024, 1.506 max_d=1.506 avg_d=0.723 std_dev=0.300
OP1	A	0, 0.585, 0.905, 1.224, 1.610 max_d=1.610 avg_d=0.905 std_dev=0.320
C3'	B	0, 0.394, 0.749, 1.104, 1.637 max_d=1.637 avg_d=0.749 std_dev=0.355
OP2	A	0, 0.362, 0.727, 1.092, 1.342 max_d=1.342 avg_d=0.727 std_dev=0.365
P	B	0, 0.876, 1.281, 1.686, 1.829 max_d=1.829 avg_d=1.281 std_dev=0.405
O2'	B	0, 0.409, 0.841, 1.273, 1.511 max_d=1.511 avg_d=0.841 std_dev=0.432
OP2	B	0, 0.962, 1.474, 1.987, 2.221 max_d=2.221 avg_d=1.474 std_dev=0.513
O3'	B	0, 0.476, 1.004, 1.532, 2.352 max_d=2.352 avg_d=1.004 std_dev=0.528
OP1	B	0, 1.032, 1.562, 2.092, 2.190 max_d=2.190 avg_d=1.562 std_dev=0.530

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.02	0.02	0.00	0.06	0.06	0.15	0.09
C2	0.01	0.00	0.08	0.09	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.11	0.02	0.03	0.10	0.12	0.24	0.14
C2'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.06	0.01	0.06	0.02	0.06	0.03	0.08	0.14	0.00	0.02	0.06	0.01	0.03	0.11	0.05	0.04
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.10	0.01	0.11	0.02	0.10	0.05	0.10	0.12	0.02	0.01	0.11	0.01	0.04	0.14	0.08	0.07
C4	0.01	0.01	0.06	0.10	0.00	0.05	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.12	0.01	0.02	0.12	0.19	0.29	0.18
C4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.05	0.00	0.07	0.01	0.06	0.03	0.04	0.05	0.04	0.02	0.06	0.00	0.01	0.10	0.04	0.02
C5	0.01	0.01	0.06	0.11	0.01	0.07	0.00	0.10	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.13	0.01	0.02	0.12	0.19	0.28	0.18
C5'	0.02	0.05	0.02	0.02	0.08	0.01	0.10	0.00	0.08	0.05	0.06	0.05	0.05	0.04	0.09	0.01	0.01	0.08	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.06	0.10	0.01	0.06	0.00	0.08	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.11	0.01	0.02	0.10	0.13	0.23	0.14
N1	0.00	0.01	0.03	0.05	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.06	0.02	0.01	0.08	0.10	0.21	0.13
N3	0.01	0.01	0.08	0.10	0.00	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.02	0.08	0.12	0.01	0.03	0.11	0.16	0.27	0.16
O2	0.03	0.01	0.14	0.12	0.02	0.05	0.02	0.05	0.02	0.02	0.02	0.00	0.14	0.15	0.03	0.04	0.10	0.11	0.23	0.14
O2'	0.02	0.08	0.00	0.02	0.05	0.04	0.04	0.05	0.04	0.03	0.08	0.14	0.00	0.05	0.06	0.03	0.04	0.15	0.05	0.04
O3'	0.02	0.11	0.02	0.01	0.12	0.02	0.13	0.04	0.11	0.06	0.12	0.15	0.05	0.00	0.15	0.02	0.07	0.21	0.17	0.13
O4	0.02	0.02	0.06	0.11	0.01	0.06	0.01	0.09	0.01	0.02	0.01	0.03	0.06	0.15	0.00	0.02	0.13	0.23	0.31	0.19
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.02	0.02	0.00	0.07	0.06	0.18	0.11
O5'	0.06	0.10	0.03	0.04	0.12	0.01	0.12	0.01	0.10	0.08	0.11	0.10	0.04	0.07	0.13	0.07	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.06	0.12	0.11	0.14	0.19	0.10	0.19	0.08	0.13	0.10	0.16	0.11	0.15	0.21	0.23	0.06	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.15	0.24	0.05	0.08	0.29	0.04	0.28	0.02	0.23	0.21	0.27	0.23	0.05	0.17	0.31	0.18	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.09	0.14	0.04	0.07	0.18	0.02	0.18	0.01	0.14	0.13	0.16	0.14	0.04	0.13	0.19	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.11	0.09	0.18	0.19	0.14	0.13	0.11	0.13	0.09	0.08	0.12	0.09	0.23	0.26	0.17	0.11	0.15	0.27	0.22	0.17
C2	0.11	0.08	0.18	0.19	0.13	0.14	0.10	0.13	0.08	0.08	0.12	0.09	0.23	0.25	0.16	0.11	0.15	0.25	0.21	0.16
C2'	0.19	0.15	0.29	0.30	0.13	0.23	0.12	0.23	0.13	0.15	0.14	0.19	0.33	0.38	0.15	0.18	0.24	0.35	0.27	0.24
C3'	0.24	0.18	0.33	0.33	0.12	0.27	0.13	0.27	0.16	0.19	0.14	0.24	0.37	0.40	0.14	0.23	0.27	0.36	0.27	0.26
C4	0.13	0.11	0.19	0.17	0.12	0.14	0.11	0.14	0.10	0.10	0.10	0.16	0.22	0.20	0.16	0.12	0.16	0.21	0.21	0.17
C4'	0.14	0.10	0.21	0.22	0.12	0.17	0.10	0.17	0.09	0.10	0.10	0.12	0.26	0.28	0.16	0.14	0.18	0.27	0.21	0.18
C5	0.13	0.11	0.19	0.17	0.12	0.13	0.11	0.14	0.10	0.10	0.10	0.15	0.23	0.21	0.16	0.11	0.16	0.21	0.22	0.17
C5'	0.15	0.10	0.21	0.21	0.13	0.17	0.12	0.17	0.10	0.11	0.11	0.13	0.27	0.27	0.18	0.15	0.17	0.25	0.20	0.17
C6	0.11	0.09	0.18	0.18	0.12	0.13	0.11	0.13	0.09	0.09	0.10	0.12	0.23	0.23	0.16	0.11	0.15	0.23	0.22	0.17
N1	0.11	0.08	0.18	0.18	0.13	0.13	0.11	0.13	0.08	0.08	0.11	0.10	0.23	0.24	0.17	0.10	0.15	0.25	0.21	0.16
N3	0.12	0.09	0.19	0.18	0.13	0.14	0.10	0.14	0.09	0.09	0.11	0.12	0.23	0.22	0.16	0.11	0.16	0.23	0.20	0.16
O2	0.12	0.10	0.18	0.20	0.13	0.14	0.10	0.14	0.08	0.08	0.13	0.11	0.23	0.27	0.16	0.12	0.15	0.28	0.21	0.17
O2'	0.18	0.15	0.26	0.28	0.15	0.21	0.13	0.21	0.14	0.15	0.15	0.18	0.29	0.37	0.16	0.18	0.23	0.36	0.28	0.24
O3'	0.31	0.24	0.39	0.39	0.15	0.34	0.17	0.33	0.21	0.25	0.17	0.30	0.44	0.46	0.14	0.30	0.33	0.41	0.31	0.31
O4	0.14	0.14	0.18	0.17	0.13	0.14	0.12	0.14	0.11	0.12	0.11	0.19	0.21	0.18	0.17	0.13	0.17	0.20	0.22	0.17
O4'	0.10	0.08	0.15	0.16	0.15	0.12	0.13	0.11	0.09	0.08	0.12	0.08	0.22	0.22	0.19	0.10	0.13	0.23	0.19	0.14
O5'	0.22	0.17	0.27	0.27	0.14	0.23	0.14	0.23	0.15	0.18	0.14	0.21	0.33	0.31	0.16	0.21	0.23	0.28	0.24	0.22
OP1	0.30	0.28	0.33	0.32	0.23	0.31	0.24	0.31	0.26	0.28	0.25	0.31	0.37	0.35	0.22	0.30	0.32	0.36	0.32	0.30
OP2	0.39	0.38	0.44	0.43	0.33	0.40	0.33	0.40	0.35	0.37	0.36	0.42	0.46	0.46	0.31	0.37	0.42	0.44	0.41	0.39
P	0.28	0.25	0.33	0.32	0.20	0.29	0.21	0.29	0.23	0.25	0.22	0.29	0.37	0.36	0.20	0.27	0.30	0.34	0.30	0.28

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.06	0.01	0.01	0.02	0.01	0.06	0.10	0.09	0.06
C2	0.02	0.00	0.08	0.08	0.02	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.07	0.09	0.02	0.03	0.07	0.11	0.12	0.08
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.05	0.01	0.07	0.01	0.07	0.02	0.06	0.14	0.00	0.01	0.05	0.01	0.03	0.13	0.10	0.06
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.10	0.00	0.13	0.01	0.12	0.04	0.08	0.14	0.02	0.00	0.11	0.01	0.06	0.15	0.12	0.08
C4	0.02	0.02	0.05	0.10	0.00	0.06	0.01	0.10	0.01	0.02	0.01	0.03	0.04	0.12	0.01	0.03	0.14	0.15	0.19	0.15
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.06	0.00	0.09	0.01	0.08	0.03	0.03	0.07	0.05	0.02	0.08	0.01	0.01	0.10	0.03	0.02
C5	0.02	0.01	0.07	0.13	0.01	0.09	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.15	0.02	0.05	0.18	0.18	0.20	0.17
C5'	0.02	0.04	0.01	0.01	0.10	0.01	0.12	0.00	0.11	0.05	0.06	0.07	0.05	0.02	0.12	0.02	0.01	0.08	0.02	0.02
C6	0.02	0.01	0.07	0.12	0.01	0.08	0.01	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.13	0.02	0.05	0.16	0.15	0.16	0.13
N1	0.00	0.01	0.02	0.04	0.02	0.03	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.04	0.02	0.01	0.08	0.10	0.11	0.08
N3	0.02	0.01	0.06	0.08	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.02	0.06	0.10	0.01	0.02	0.09	0.12	0.15	0.11
O2	0.06	0.00	0.14	0.14	0.03	0.07	0.02	0.07	0.01	0.02	0.02	0.00	0.14	0.17	0.04	0.06	0.08	0.13	0.12	0.09
O2'	0.01	0.07	0.00	0.02	0.04	0.05	0.04	0.05	0.05	0.02	0.06	0.14	0.00	0.03	0.04	0.04	0.04	0.13	0.08	0.05
O3'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.12	0.02	0.15	0.02	0.13	0.04	0.10	0.17	0.03	0.00	0.14	0.02	0.11	0.20	0.17	0.13
O4	0.02	0.02	0.05	0.11	0.01	0.08	0.02	0.12	0.02	0.02	0.01	0.04	0.04	0.14	0.00	0.04	0.16	0.19	0.22	0.19
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.01	0.05	0.02	0.05	0.01	0.02	0.06	0.04	0.02	0.04	0.00	0.09	0.09	0.12	0.09
O5'	0.06	0.07	0.03	0.06	0.14	0.01	0.18	0.01	0.16	0.08	0.09	0.08	0.04	0.11	0.16	0.09	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.10	0.11	0.13	0.15	0.15	0.10	0.18	0.08	0.15	0.10	0.12	0.13	0.13	0.20	0.19	0.09	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.09	0.12	0.10	0.12	0.19	0.03	0.20	0.02	0.16	0.11	0.15	0.12	0.08	0.17	0.22	0.12	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.08	0.06	0.08	0.15	0.02	0.17	0.02	0.13	0.08	0.11	0.09	0.05	0.13	0.19	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00