Doublet Group distance statistics: 50597

back

Distances from reference structure (by RMSD)

3, 4, 4, 2, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.004, 0.008, 0.011, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.008 std_dev=0.003
N3	A	0, 0.002, 0.006, 0.010, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.006 std_dev=0.004
N1	A	0, 0.003, 0.011, 0.019, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.004, 0.015, 0.027, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.015 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.003, 0.015, 0.027, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.015 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.003, 0.015, 0.027, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.015 std_dev=0.012
C6	A	0, 0.004, 0.016, 0.028, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.016 std_dev=0.012
O2	A	0, 0.004, 0.033, 0.063, 0.106 max_d=0.106 avg_d=0.033 std_dev=0.029
O4'	A	0, 0.019, 0.053, 0.088, 0.123 max_d=0.123 avg_d=0.053 std_dev=0.034
C2'	A	0, 0.034, 0.074, 0.115, 0.152 max_d=0.152 avg_d=0.074 std_dev=0.041
O4	A	0, -0.003, 0.044, 0.091, 0.190 max_d=0.190 avg_d=0.044 std_dev=0.047
C4'	A	0, 0.047, 0.100, 0.154, 0.204 max_d=0.204 avg_d=0.100 std_dev=0.053
C3'	A	0, 0.064, 0.119, 0.174, 0.223 max_d=0.223 avg_d=0.119 std_dev=0.055
O2'	A	0, 0.036, 0.097, 0.157, 0.247 max_d=0.247 avg_d=0.097 std_dev=0.060
O3'	A	0, 0.095, 0.176, 0.258, 0.366 max_d=0.366 avg_d=0.176 std_dev=0.082
C5'	A	0, 0.082, 0.166, 0.250, 0.306 max_d=0.306 avg_d=0.166 std_dev=0.084
O5'	A	0, 0.059, 0.158, 0.257, 0.354 max_d=0.354 avg_d=0.158 std_dev=0.099
P	A	0, 0.083, 0.208, 0.334, 0.444 max_d=0.444 avg_d=0.208 std_dev=0.125
O2	B	0, 0.079, 0.205, 0.330, 0.521 max_d=0.521 avg_d=0.205 std_dev=0.126
OP1	A	0, 0.082, 0.224, 0.367, 0.533 max_d=0.533 avg_d=0.224 std_dev=0.142
C2	B	0, 0.053, 0.198, 0.343, 0.581 max_d=0.581 avg_d=0.198 std_dev=0.145
N3	B	0, 0.051, 0.197, 0.343, 0.579 max_d=0.579 avg_d=0.197 std_dev=0.146
OP2	A	0, 0.101, 0.247, 0.393, 0.578 max_d=0.578 avg_d=0.247 std_dev=0.146
C1'	B	0, 0.097, 0.260, 0.424, 0.645 max_d=0.645 avg_d=0.260 std_dev=0.163
N1	B	0, 0.056, 0.224, 0.392, 0.669 max_d=0.669 avg_d=0.224 std_dev=0.168
C4	B	0, 0.051, 0.220, 0.389, 0.680 max_d=0.680 avg_d=0.220 std_dev=0.169
O2'	B	0, 0.166, 0.342, 0.517, 0.670 max_d=0.670 avg_d=0.342 std_dev=0.175
C2'	B	0, 0.119, 0.299, 0.479, 0.724 max_d=0.724 avg_d=0.299 std_dev=0.180
O4	B	0, 0.085, 0.266, 0.446, 0.743 max_d=0.743 avg_d=0.266 std_dev=0.180
C6	B	0, 0.067, 0.255, 0.442, 0.773 max_d=0.773 avg_d=0.255 std_dev=0.187
C5	B	0, 0.056, 0.248, 0.440, 0.783 max_d=0.783 avg_d=0.248 std_dev=0.192
O4'	B	0, 0.088, 0.285, 0.482, 0.782 max_d=0.782 avg_d=0.285 std_dev=0.197
C3'	B	0, 0.102, 0.314, 0.526, 0.883 max_d=0.883 avg_d=0.314 std_dev=0.212
C4'	B	0, 0.097, 0.316, 0.535, 0.905 max_d=0.905 avg_d=0.316 std_dev=0.219
O5'	B	0, 0.121, 0.343, 0.565, 0.998 max_d=0.998 avg_d=0.343 std_dev=0.222
O3'	B	0, 0.117, 0.342, 0.567, 0.941 max_d=0.941 avg_d=0.342 std_dev=0.225
OP2	B	0, 0.100, 0.352, 0.604, 1.123 max_d=1.123 avg_d=0.352 std_dev=0.252
C5'	B	0, 0.090, 0.349, 0.607, 1.120 max_d=1.120 avg_d=0.349 std_dev=0.258
P	B	0, 0.106, 0.368, 0.630, 1.169 max_d=1.169 avg_d=0.368 std_dev=0.262
OP1	B	0, 0.114, 0.437, 0.759, 1.438 max_d=1.438 avg_d=0.437 std_dev=0.323

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.03	0.03
C2	0.01	0.00	0.03	0.04	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.05	0.01	0.01	0.05	0.07	0.05	0.06
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.04	0.00	0.01	0.03	0.00	0.02	0.04	0.03	0.03
C3'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.05	0.00	0.05	0.01	0.04	0.03	0.05	0.05	0.01	0.00	0.06	0.00	0.03	0.05	0.04	0.04
C4	0.01	0.00	0.03	0.05	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.06	0.00	0.01	0.06	0.08	0.07	0.07
C4'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.03	0.02	0.03	0.02	0.02	0.01	0.04	0.00	0.01	0.02	0.03	0.01
C5	0.01	0.00	0.02	0.05	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.02	0.06	0.07	0.07	0.07
C5'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.05	0.00	0.05	0.00	0.04	0.03	0.04	0.03	0.02	0.02	0.05	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01
C6	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.03	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.02	0.05	0.06	0.06	0.06
N1	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.04	0.06	0.05	0.05
N3	0.01	0.00	0.03	0.05	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.06	0.01	0.01	0.06	0.08	0.06	0.07
O2	0.01	0.00	0.04	0.05	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.06	0.01	0.01	0.04	0.07	0.04	0.05
O2'	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.04	0.00	0.03	0.02	0.02	0.03	0.03	0.04	0.03
O3'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.06	0.01	0.05	0.02	0.04	0.03	0.06	0.06	0.03	0.00	0.07	0.01	0.05	0.07	0.06	0.06
O4	0.01	0.01	0.03	0.06	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.07	0.00	0.02	0.06	0.09	0.08	0.08
O4'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.03	0.05	0.04	0.03
O5'	0.02	0.05	0.02	0.03	0.06	0.01	0.06	0.00	0.05	0.04	0.06	0.04	0.03	0.05	0.06	0.03	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.04	0.07	0.04	0.05	0.08	0.02	0.07	0.02	0.06	0.06	0.08	0.07	0.03	0.07	0.09	0.05	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.03	0.05	0.03	0.04	0.07	0.03	0.07	0.03	0.06	0.05	0.06	0.04	0.04	0.06	0.08	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.03	0.06	0.03	0.04	0.07	0.01	0.07	0.01	0.06	0.05	0.07	0.05	0.03	0.06	0.08	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.07	0.07	0.07	0.06	0.09	0.06	0.08	0.05	0.07	0.07	0.08	0.07	0.10	0.06	0.11	0.07	0.04	0.04	0.07	0.05
C2	0.08	0.08	0.09	0.07	0.08	0.07	0.08	0.05	0.08	0.08	0.08	0.09	0.12	0.08	0.09	0.07	0.05	0.04	0.06	0.04
C2'	0.07	0.08	0.07	0.06	0.09	0.07	0.08	0.06	0.07	0.07	0.09	0.08	0.10	0.06	0.13	0.08	0.04	0.04	0.07	0.05
C3'	0.07	0.07	0.07	0.06	0.08	0.07	0.07	0.06	0.07	0.07	0.08	0.08	0.10	0.06	0.11	0.08	0.04	0.04	0.05	0.04
C4	0.09	0.09	0.10	0.09	0.09	0.08	0.10	0.07	0.09	0.09	0.09	0.10	0.12	0.09	0.10	0.09	0.08	0.08	0.09	0.08
C4'	0.07	0.07	0.07	0.05	0.09	0.06	0.08	0.05	0.07	0.07	0.08	0.07	0.10	0.06	0.11	0.07	0.04	0.04	0.05	0.04
C5	0.09	0.09	0.10	0.09	0.10	0.08	0.11	0.07	0.10	0.09	0.09	0.10	0.12	0.09	0.11	0.09	0.07	0.07	0.09	0.08
C5'	0.06	0.07	0.06	0.05	0.08	0.06	0.07	0.05	0.07	0.06	0.07	0.07	0.09	0.05	0.10	0.07	0.04	0.03	0.05	0.04
C6	0.09	0.09	0.09	0.08	0.10	0.08	0.10	0.06	0.09	0.09	0.09	0.09	0.11	0.08	0.11	0.08	0.06	0.06	0.08	0.06
N1	0.08	0.08	0.08	0.07	0.09	0.07	0.09	0.05	0.08	0.08	0.08	0.08	0.11	0.07	0.11	0.08	0.05	0.04	0.07	0.05
N3	0.09	0.09	0.10	0.08	0.08	0.08	0.09	0.06	0.08	0.08	0.09	0.10	0.12	0.09	0.10	0.08	0.06	0.06	0.07	0.06
O2	0.08	0.07	0.08	0.06	0.09	0.06	0.08	0.04	0.07	0.07	0.07	0.09	0.11	0.07	0.10	0.07	0.04	0.03	0.06	0.03
O2'	0.09	0.11	0.08	0.07	0.13	0.09	0.11	0.09	0.10	0.10	0.13	0.11	0.10	0.07	0.15	0.10	0.07	0.08	0.11	0.08
O3'	0.08	0.09	0.07	0.06	0.09	0.08	0.08	0.07	0.08	0.08	0.09	0.09	0.10	0.07	0.12	0.09	0.05	0.05	0.05	0.04
O4	0.09	0.10	0.11	0.10	0.10	0.09	0.10	0.09	0.09	0.09	0.10	0.11	0.12	0.10	0.12	0.09	0.10	0.10	0.12	0.10
O4'	0.07	0.07	0.07	0.06	0.09	0.06	0.08	0.05	0.07	0.07	0.08	0.07	0.10	0.06	0.11	0.07	0.04	0.04	0.06	0.05
O5'	0.06	0.06	0.06	0.05	0.07	0.05	0.06	0.04	0.06	0.06	0.06	0.06	0.09	0.05	0.09	0.06	0.05	0.03	0.04	0.04
OP1	0.09	0.09	0.09	0.08	0.10	0.08	0.10	0.07	0.09	0.09	0.10	0.09	0.11	0.08	0.11	0.09	0.07	0.05	0.06	0.05
OP2	0.06	0.07	0.06	0.05	0.08	0.06	0.07	0.04	0.07	0.06	0.07	0.07	0.09	0.05	0.10	0.07	0.05	0.02	0.04	0.03
P	0.07	0.07	0.07	0.06	0.08	0.06	0.08	0.05	0.07	0.07	0.08	0.07	0.09	0.06	0.10	0.07	0.05	0.02	0.04	0.02

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.04	0.02
C2	0.01	0.00	0.04	0.04	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.04	0.00	0.01	0.06	0.06	0.05	0.05
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.04	0.05	0.00	0.01	0.04	0.00	0.02	0.03	0.06	0.02
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.04	0.00	0.03	0.01	0.03	0.02	0.05	0.05	0.01	0.01	0.06	0.01	0.03	0.04	0.05	0.02
C4	0.01	0.00	0.03	0.04	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.05	0.00	0.02	0.09	0.09	0.08	0.08
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.03	0.02	0.03	0.01	0.03	0.01	0.04	0.00	0.00	0.04	0.03	0.01
C5	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.02	0.09	0.08	0.07	0.08
C5'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.06	0.00	0.06	0.00	0.05	0.03	0.05	0.02	0.02	0.02	0.07	0.00	0.00	0.05	0.01	0.01
C6	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.02	0.07	0.06	0.05	0.06
N1	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.05	0.05	0.04	0.04
N3	0.01	0.00	0.04	0.05	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.05	0.00	0.01	0.08	0.07	0.06	0.07
O2	0.01	0.00	0.05	0.05	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.05	0.01	0.02	0.05	0.05	0.05	0.04
O2'	0.01	0.04	0.00	0.01	0.03	0.03	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.05	0.00	0.02	0.04	0.02	0.02	0.04	0.05	0.02
O3'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.05	0.01	0.04	0.02	0.04	0.03	0.05	0.05	0.02	0.00	0.07	0.01	0.04	0.06	0.05	0.03
O4	0.01	0.00	0.04	0.06	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.07	0.00	0.02	0.10	0.10	0.09	0.09
O4'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.05	0.04	0.02
O5'	0.02	0.06	0.02	0.03	0.09	0.00	0.09	0.00	0.07	0.05	0.08	0.05	0.02	0.04	0.10	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.04	0.06	0.03	0.04	0.09	0.04	0.08	0.05	0.06	0.05	0.07	0.05	0.04	0.06	0.10	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.04	0.05	0.06	0.05	0.08	0.03	0.07	0.01	0.05	0.04	0.06	0.05	0.05	0.05	0.09	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.02	0.05	0.02	0.02	0.08	0.01	0.08	0.01	0.06	0.04	0.07	0.04	0.02	0.03	0.09	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00