Doublet Group distance statistics: 50603

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 3, 2, 1, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.006, 0.010, 0.014, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.010 std_dev=0.004
N3	A	0, 0.008, 0.014, 0.020, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.014 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.016, 0.029, 0.042, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.029 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.024, 0.043, 0.061, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.043 std_dev=0.019
C1'	A	0, 0.024, 0.043, 0.062, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.043 std_dev=0.019
C6	A	0, 0.022, 0.041, 0.060, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.041 std_dev=0.019
C4	A	0, 0.023, 0.042, 0.061, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.042 std_dev=0.019
O2	A	0, 0.062, 0.104, 0.145, 0.148 max_d=0.148 avg_d=0.104 std_dev=0.042
C2'	A	0, 0.096, 0.168, 0.239, 0.263 max_d=0.263 avg_d=0.168 std_dev=0.071
O4'	A	0, 0.037, 0.109, 0.181, 0.229 max_d=0.229 avg_d=0.109 std_dev=0.072
C4'	A	0, 0.150, 0.246, 0.343, 0.356 max_d=0.356 avg_d=0.246 std_dev=0.097
O4	A	0, 0.089, 0.189, 0.289, 0.381 max_d=0.381 avg_d=0.189 std_dev=0.100
C3'	A	0, 0.173, 0.282, 0.392, 0.402 max_d=0.402 avg_d=0.282 std_dev=0.110
C5'	A	0, 0.161, 0.295, 0.429, 0.494 max_d=0.494 avg_d=0.295 std_dev=0.134
O2'	A	0, 0.112, 0.248, 0.384, 0.423 max_d=0.423 avg_d=0.248 std_dev=0.136
C6	B	0, 0.159, 0.297, 0.435, 0.519 max_d=0.519 avg_d=0.297 std_dev=0.138
O5'	A	0, 0.150, 0.292, 0.434, 0.595 max_d=0.595 avg_d=0.292 std_dev=0.142
N1	B	0, 0.082, 0.238, 0.394, 0.610 max_d=0.610 avg_d=0.238 std_dev=0.156
C1'	B	0, 0.146, 0.312, 0.478, 0.634 max_d=0.634 avg_d=0.312 std_dev=0.166
O4'	B	0, 0.200, 0.387, 0.574, 0.693 max_d=0.693 avg_d=0.387 std_dev=0.187
C2	B	0, 0.053, 0.256, 0.458, 0.701 max_d=0.701 avg_d=0.256 std_dev=0.202
O2	B	0, 0.108, 0.314, 0.520, 0.786 max_d=0.786 avg_d=0.314 std_dev=0.206
C5	B	0, 0.160, 0.368, 0.575, 0.735 max_d=0.735 avg_d=0.368 std_dev=0.208
O3'	A	0, 0.322, 0.530, 0.738, 0.729 max_d=0.729 avg_d=0.530 std_dev=0.208
P	A	0, 0.127, 0.349, 0.571, 0.638 max_d=0.638 avg_d=0.349 std_dev=0.222
C2'	B	0, 0.156, 0.390, 0.624, 0.880 max_d=0.880 avg_d=0.390 std_dev=0.234
N3	B	0, 0.089, 0.336, 0.583, 0.775 max_d=0.775 avg_d=0.336 std_dev=0.247
C4'	B	0, 0.268, 0.517, 0.766, 0.907 max_d=0.907 avg_d=0.517 std_dev=0.249
C3'	B	0, 0.274, 0.527, 0.780, 0.851 max_d=0.851 avg_d=0.527 std_dev=0.253
C4	B	0, 0.113, 0.390, 0.666, 0.949 max_d=0.949 avg_d=0.390 std_dev=0.276
C5'	B	0, 0.330, 0.656, 0.981, 1.183 max_d=1.183 avg_d=0.656 std_dev=0.325
O5'	B	0, 0.317, 0.649, 0.981, 1.356 max_d=1.356 avg_d=0.649 std_dev=0.332
O4	B	0, 0.209, 0.550, 0.891, 1.249 max_d=1.249 avg_d=0.550 std_dev=0.341
O2'	B	0, 0.204, 0.555, 0.907, 1.216 max_d=1.216 avg_d=0.555 std_dev=0.352
O3'	B	0, 0.378, 0.824, 1.270, 1.417 max_d=1.417 avg_d=0.824 std_dev=0.446
P	B	0, 0.301, 0.785, 1.269, 1.981 max_d=1.981 avg_d=0.785 std_dev=0.484
OP2	B	0, 0.329, 0.858, 1.387, 2.166 max_d=2.166 avg_d=0.858 std_dev=0.529
OP2	A	0, 0.232, 0.825, 1.419, 1.886 max_d=1.886 avg_d=0.825 std_dev=0.594
OP1	B	0, 0.286, 0.885, 1.485, 2.391 max_d=2.391 avg_d=0.885 std_dev=0.600
OP1	A	0, 0.326, 1.150, 1.974, 2.334 max_d=2.334 avg_d=1.150 std_dev=0.824

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.19	0.21	0.05
C2	0.01	0.00	0.04	0.04	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.05	0.01	0.02	0.06	0.21	0.37	0.09
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.03	0.01	0.04	0.07	0.00	0.02	0.05	0.01	0.03	0.06	0.09	0.04
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.05	0.00	0.06	0.02	0.06	0.03	0.04	0.07	0.02	0.00	0.07	0.01	0.05	0.16	0.13	0.05
C4	0.01	0.01	0.04	0.05	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.06	0.00	0.02	0.10	0.26	0.56	0.15
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.06	0.02	0.02	0.03	0.04	0.02	0.05	0.00	0.02	0.08	0.08	0.02
C5	0.01	0.01	0.04	0.06	0.00	0.06	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.07	0.01	0.03	0.11	0.31	0.57	0.16
C5'	0.01	0.03	0.01	0.02	0.08	0.00	0.10	0.00	0.08	0.04	0.05	0.03	0.03	0.04	0.09	0.01	0.01	0.08	0.16	0.01
C6	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.06	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.06	0.01	0.02	0.09	0.30	0.46	0.13
N1	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.05	0.23	0.34	0.08
N3	0.01	0.00	0.04	0.04	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.06	0.01	0.02	0.07	0.22	0.46	0.12
O2	0.02	0.01	0.07	0.07	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.10	0.09	0.02	0.02	0.06	0.18	0.31	0.08
O2'	0.02	0.06	0.00	0.02	0.04	0.04	0.03	0.03	0.02	0.02	0.06	0.10	0.00	0.05	0.06	0.04	0.02	0.06	0.07	0.02
O3'	0.01	0.05	0.02	0.00	0.06	0.02	0.07	0.04	0.06	0.03	0.06	0.09	0.05	0.00	0.09	0.01	0.08	0.34	0.32	0.10
O4	0.01	0.01	0.05	0.07	0.00	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.02	0.06	0.09	0.00	0.03	0.11	0.26	0.61	0.17
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.03	0.00	0.06	0.28	0.18	0.06
O5'	0.03	0.06	0.03	0.05	0.10	0.02	0.11	0.01	0.09	0.05	0.07	0.06	0.02	0.08	0.11	0.06	0.00	0.03	0.02	0.00
OP1	0.19	0.21	0.06	0.16	0.26	0.08	0.31	0.08	0.30	0.23	0.22	0.18	0.06	0.34	0.26	0.28	0.03	0.00	0.02	0.01
OP2	0.21	0.37	0.09	0.13	0.56	0.08	0.57	0.16	0.46	0.34	0.46	0.31	0.07	0.32	0.61	0.18	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.05	0.09	0.04	0.05	0.15	0.02	0.16	0.01	0.13	0.08	0.12	0.08	0.02	0.10	0.17	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.12	0.15	0.18	0.16	0.11	0.15	0.10	0.12	0.12	0.14	0.12	0.12	0.25	0.18	0.18	0.15	0.21	0.27	0.17
C2	0.11	0.12	0.15	0.18	0.16	0.09	0.15	0.08	0.12	0.11	0.15	0.11	0.13	0.24	0.19	0.16	0.13	0.18	0.24	0.14
C2'	0.15	0.12	0.13	0.13	0.15	0.16	0.13	0.16	0.12	0.12	0.13	0.12	0.14	0.18	0.17	0.23	0.09	0.13	0.17	0.09
C3'	0.14	0.10	0.13	0.13	0.14	0.16	0.12	0.16	0.10	0.10	0.12	0.10	0.14	0.19	0.17	0.23	0.09	0.12	0.19	0.08
C4	0.08	0.05	0.15	0.21	0.15	0.07	0.13	0.08	0.08	0.06	0.11	0.08	0.11	0.26	0.19	0.12	0.18	0.23	0.29	0.19
C4'	0.12	0.10	0.15	0.18	0.15	0.12	0.14	0.10	0.11	0.10	0.13	0.10	0.12	0.25	0.19	0.18	0.14	0.20	0.28	0.16
C5	0.08	0.06	0.15	0.21	0.14	0.06	0.12	0.08	0.08	0.06	0.09	0.08	0.10	0.28	0.18	0.12	0.19	0.25	0.32	0.22
C5'	0.10	0.10	0.17	0.21	0.18	0.10	0.16	0.09	0.12	0.09	0.14	0.09	0.12	0.28	0.23	0.15	0.18	0.25	0.35	0.22
C6	0.09	0.08	0.15	0.21	0.15	0.07	0.13	0.07	0.10	0.08	0.11	0.09	0.10	0.28	0.18	0.14	0.18	0.24	0.31	0.20
N1	0.11	0.10	0.15	0.19	0.16	0.09	0.14	0.08	0.11	0.10	0.13	0.10	0.11	0.26	0.18	0.16	0.15	0.21	0.28	0.17
N3	0.09	0.09	0.16	0.18	0.17	0.07	0.14	0.06	0.10	0.08	0.14	0.08	0.13	0.24	0.19	0.14	0.14	0.18	0.24	0.15
O2	0.13	0.14	0.16	0.16	0.17	0.12	0.16	0.12	0.14	0.13	0.16	0.14	0.14	0.22	0.18	0.19	0.12	0.16	0.21	0.13
O2'	0.19	0.15	0.15	0.14	0.16	0.20	0.15	0.20	0.15	0.16	0.15	0.15	0.18	0.19	0.17	0.26	0.13	0.17	0.17	0.13
O3'	0.18	0.12	0.12	0.11	0.15	0.22	0.13	0.23	0.12	0.13	0.13	0.11	0.15	0.15	0.18	0.28	0.11	0.13	0.14	0.10
O4	0.09	0.05	0.16	0.22	0.17	0.09	0.13	0.11	0.08	0.06	0.11	0.10	0.12	0.28	0.22	0.12	0.21	0.25	0.31	0.21
O4'	0.11	0.11	0.16	0.22	0.16	0.10	0.15	0.10	0.12	0.11	0.13	0.11	0.12	0.30	0.19	0.16	0.19	0.26	0.33	0.22
O5'	0.08	0.10	0.17	0.22	0.18	0.09	0.16	0.09	0.12	0.09	0.15	0.08	0.10	0.29	0.23	0.13	0.20	0.25	0.36	0.22
OP1	0.19	0.24	0.36	0.46	0.37	0.26	0.35	0.30	0.29	0.24	0.31	0.20	0.18	0.55	0.42	0.19	0.43	0.51	0.62	0.46
OP2	0.49	0.53	0.41	0.38	0.64	0.47	0.62	0.48	0.58	0.53	0.59	0.48	0.48	0.34	0.69	0.54	0.46	0.47	0.53	0.51
P	0.08	0.14	0.21	0.28	0.26	0.12	0.24	0.14	0.18	0.13	0.21	0.10	0.10	0.34	0.31	0.11	0.27	0.34	0.46	0.31

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.02	0.02	0.00	0.05	0.08	0.08	0.07
C2	0.02	0.00	0.09	0.15	0.01	0.06	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.16	0.01	0.03	0.18	0.20	0.20	0.18
C2'	0.00	0.09	0.00	0.01	0.06	0.01	0.05	0.01	0.05	0.03	0.09	0.12	0.00	0.01	0.08	0.01	0.04	0.08	0.08	0.05
C3'	0.01	0.15	0.01	0.00	0.18	0.00	0.14	0.01	0.11	0.10	0.18	0.14	0.02	0.00	0.20	0.01	0.04	0.10	0.10	0.06
C4	0.01	0.01	0.06	0.18	0.00	0.11	0.00	0.18	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.22	0.00	0.02	0.27	0.30	0.31	0.29
C4'	0.00	0.06	0.01	0.00	0.11	0.00	0.11	0.00	0.10	0.06	0.08	0.04	0.07	0.03	0.12	0.00	0.01	0.08	0.04	0.02
C5	0.01	0.01	0.05	0.14	0.00	0.11	0.00	0.19	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.17	0.01	0.04	0.27	0.28	0.28	0.29
C5'	0.02	0.10	0.01	0.01	0.18	0.00	0.19	0.00	0.16	0.10	0.13	0.06	0.07	0.02	0.19	0.01	0.01	0.08	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.11	0.01	0.10	0.01	0.16	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.12	0.01	0.05	0.22	0.21	0.18	0.21
N1	0.00	0.01	0.03	0.10	0.01	0.06	0.01	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.10	0.01	0.01	0.15	0.16	0.14	0.15
N3	0.01	0.00	0.09	0.18	0.00	0.08	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.21	0.01	0.02	0.23	0.26	0.27	0.24
O2	0.03	0.00	0.12	0.14	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.08	0.16	0.01	0.05	0.14	0.17	0.17	0.14
O2'	0.02	0.05	0.00	0.02	0.03	0.07	0.04	0.07	0.04	0.03	0.04	0.08	0.00	0.03	0.04	0.06	0.05	0.13	0.09	0.06
O3'	0.02	0.16	0.01	0.00	0.22	0.03	0.17	0.02	0.12	0.10	0.21	0.16	0.03	0.00	0.26	0.03	0.07	0.17	0.17	0.12
O4	0.02	0.01	0.08	0.20	0.00	0.12	0.01	0.19	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.26	0.00	0.03	0.29	0.34	0.36	0.33
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.02	0.05	0.06	0.03	0.03	0.00	0.03	0.07	0.09	0.06
O5'	0.05	0.18	0.04	0.04	0.27	0.01	0.27	0.01	0.22	0.15	0.23	0.14	0.05	0.07	0.29	0.03	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.08	0.20	0.08	0.10	0.30	0.08	0.28	0.08	0.21	0.16	0.26	0.17	0.13	0.17	0.34	0.07	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.08	0.20	0.08	0.10	0.31	0.04	0.28	0.02	0.18	0.14	0.27	0.17	0.09	0.17	0.36	0.09	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.07	0.18	0.05	0.06	0.29	0.02	0.29	0.01	0.21	0.15	0.24	0.14	0.06	0.12	0.33	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00