Doublet Group distance statistics: 50616

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C4	A	0, 0.003, 0.015, 0.028, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.015 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.004, 0.017, 0.031, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.017 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.003, 0.017, 0.032, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.017 std_dev=0.015
C5	A	0, 0.009, 0.032, 0.055, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.032 std_dev=0.023
C1'	A	0, 0.010, 0.033, 0.056, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.033 std_dev=0.023
C6	A	0, 0.008, 0.032, 0.056, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.032 std_dev=0.024
N1	A	0, 0.002, 0.028, 0.054, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.028 std_dev=0.026
O4	A	0, 0.006, 0.039, 0.073, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.039 std_dev=0.033
O2	A	0, 0.020, 0.069, 0.118, 0.109 max_d=0.109 avg_d=0.069 std_dev=0.049
O4'	A	0, 0.031, 0.143, 0.255, 0.273 max_d=0.273 avg_d=0.143 std_dev=0.112
C2'	A	0, 0.013, 0.146, 0.280, 0.322 max_d=0.322 avg_d=0.146 std_dev=0.133
C4'	A	0, 0.020, 0.164, 0.309, 0.352 max_d=0.352 avg_d=0.164 std_dev=0.145
C1'	B	0, 0.068, 0.244, 0.419, 0.407 max_d=0.407 avg_d=0.244 std_dev=0.176
N1	B	0, 0.077, 0.262, 0.448, 0.400 max_d=0.400 avg_d=0.262 std_dev=0.186
C3'	A	0, 0.018, 0.225, 0.432, 0.499 max_d=0.499 avg_d=0.225 std_dev=0.207
O2'	A	0, 0.015, 0.233, 0.451, 0.524 max_d=0.524 avg_d=0.233 std_dev=0.218
C6	B	0, 0.088, 0.309, 0.530, 0.501 max_d=0.501 avg_d=0.309 std_dev=0.221
C2	B	0, 0.049, 0.283, 0.518, 0.574 max_d=0.574 avg_d=0.283 std_dev=0.234
O4'	B	0, 0.097, 0.341, 0.585, 0.556 max_d=0.556 avg_d=0.341 std_dev=0.244
O2	B	0, 0.023, 0.285, 0.547, 0.632 max_d=0.632 avg_d=0.285 std_dev=0.262
C5	B	0, 0.108, 0.374, 0.639, 0.593 max_d=0.593 avg_d=0.374 std_dev=0.265
N3	B	0, 0.029, 0.326, 0.622, 0.718 max_d=0.718 avg_d=0.326 std_dev=0.297
C5'	A	0, 0.043, 0.343, 0.642, 0.730 max_d=0.730 avg_d=0.343 std_dev=0.300
C4	B	0, 0.076, 0.387, 0.698, 0.761 max_d=0.761 avg_d=0.387 std_dev=0.311
O3'	A	0, 0.028, 0.360, 0.692, 0.801 max_d=0.801 avg_d=0.360 std_dev=0.332
C2'	B	0, 0.069, 0.450, 0.832, 0.932 max_d=0.932 avg_d=0.450 std_dev=0.381
C4'	B	0, 0.108, 0.501, 0.894, 0.961 max_d=0.961 avg_d=0.501 std_dev=0.393
O4	B	0, 0.083, 0.486, 0.890, 0.988 max_d=0.988 avg_d=0.486 std_dev=0.403
O2'	B	0, 0.072, 0.505, 0.939, 1.059 max_d=1.059 avg_d=0.505 std_dev=0.434
C3'	B	0, 0.066, 0.583, 1.101, 1.258 max_d=1.258 avg_d=0.583 std_dev=0.518
C5'	B	0, 0.085, 0.771, 1.456, 1.665 max_d=1.665 avg_d=0.771 std_dev=0.685
O3'	B	0, 0.027, 0.783, 1.539, 1.804 max_d=1.804 avg_d=0.783 std_dev=0.756
O5'	B	0, 0.014, 0.812, 1.610, 1.897 max_d=1.897 avg_d=0.812 std_dev=0.798
OP2	B	0, -0.003, 0.884, 1.771, 2.096 max_d=2.096 avg_d=0.884 std_dev=0.887
O5'	A	0, -0.027, 0.871, 1.770, 2.108 max_d=2.108 avg_d=0.871 std_dev=0.899
P	A	0, -0.086, 0.946, 1.978, 2.381 max_d=2.381 avg_d=0.946 std_dev=1.032
P	B	0, -0.037, 1.012, 2.062, 2.459 max_d=2.459 avg_d=1.012 std_dev=1.050
OP2	A	0, -0.193, 1.014, 2.221, 2.710 max_d=2.710 avg_d=1.014 std_dev=1.207
OP1	B	0, -0.139, 1.352, 2.843, 3.430 max_d=3.430 avg_d=1.352 std_dev=1.491
OP1	A	0, -0.325, 1.605, 3.535, 4.319 max_d=4.319 avg_d=1.605 std_dev=1.930

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.04	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.04	0.03	0.01	0.01	0.04	0.00	0.06	0.01	0.20	0.10
C2	0.03	0.00	0.03	0.05	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.05	0.02	0.03	0.14	0.06	0.53	0.20
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.07	0.01	0.07	0.01	0.06	0.02	0.06	0.01	0.00	0.01	0.08	0.00	0.18	0.23	0.11	0.18
C3'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.12	0.01	0.13	0.02	0.12	0.05	0.09	0.00	0.01	0.00	0.12	0.01	0.27	0.43	0.01	0.23
C4	0.04	0.01	0.07	0.12	0.00	0.09	0.00	0.13	0.00	0.02	0.01	0.02	0.05	0.14	0.00	0.03	0.16	0.13	0.80	0.27
C4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.09	0.00	0.09	0.01	0.09	0.04	0.07	0.01	0.02	0.02	0.08	0.00	0.02	0.12	0.21	0.03
C5	0.03	0.01	0.07	0.13	0.00	0.09	0.00	0.15	0.00	0.02	0.01	0.01	0.04	0.15	0.01	0.03	0.15	0.12	0.76	0.25
C5'	0.00	0.07	0.01	0.02	0.13	0.01	0.15	0.00	0.14	0.07	0.10	0.03	0.03	0.04	0.13	0.01	0.01	0.28	0.41	0.02
C6	0.02	0.01	0.06	0.12	0.00	0.09	0.00	0.14	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.13	0.00	0.03	0.12	0.07	0.56	0.20
N1	0.01	0.00	0.02	0.05	0.02	0.04	0.02	0.07	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.05	0.03	0.01	0.12	0.05	0.44	0.17
N3	0.04	0.01	0.06	0.09	0.01	0.07	0.01	0.10	0.01	0.02	0.00	0.02	0.03	0.10	0.02	0.03	0.15	0.10	0.68	0.24
O2	0.03	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.03	0.13	0.05	0.45	0.18
O2'	0.01	0.02	0.00	0.01	0.05	0.02	0.04	0.03	0.04	0.01	0.03	0.02	0.00	0.01	0.06	0.01	0.07	0.08	0.07	0.07
O3'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.14	0.02	0.15	0.04	0.13	0.05	0.10	0.01	0.01	0.00	0.15	0.01	0.28	0.56	0.19	0.22
O4	0.04	0.02	0.08	0.12	0.00	0.08	0.01	0.13	0.00	0.03	0.02	0.04	0.06	0.15	0.00	0.03	0.18	0.17	0.90	0.31
O4'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.06	0.11	0.07	0.03
O5'	0.06	0.14	0.18	0.27	0.16	0.02	0.15	0.01	0.12	0.12	0.15	0.13	0.07	0.28	0.18	0.06	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.01	0.06	0.23	0.43	0.13	0.12	0.12	0.28	0.07	0.05	0.10	0.05	0.08	0.56	0.17	0.11	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.20	0.53	0.11	0.01	0.80	0.21	0.76	0.41	0.56	0.44	0.68	0.45	0.07	0.19	0.90	0.07	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.10	0.20	0.18	0.23	0.27	0.03	0.25	0.02	0.20	0.17	0.24	0.18	0.07	0.22	0.31	0.03	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.06	0.13	0.36	0.44	0.20	0.20	0.17	0.24	0.13	0.11	0.19	0.10	0.33	0.60	0.23	0.01	0.35	0.44	0.45	0.34
C2	0.01	0.08	0.28	0.37	0.17	0.16	0.13	0.22	0.10	0.07	0.15	0.04	0.23	0.50	0.20	0.02	0.33	0.43	0.45	0.33
C2'	0.09	0.20	0.38	0.43	0.27	0.18	0.23	0.19	0.18	0.16	0.27	0.18	0.36	0.58	0.32	0.02	0.30	0.34	0.41	0.28
C3'	0.08	0.21	0.37	0.39	0.31	0.13	0.25	0.12	0.19	0.16	0.30	0.18	0.35	0.54	0.38	0.04	0.24	0.27	0.37	0.21
C4	0.08	0.04	0.15	0.21	0.11	0.06	0.08	0.11	0.02	0.03	0.05	0.14	0.11	0.30	0.17	0.09	0.22	0.35	0.37	0.24
C4'	0.05	0.15	0.35	0.40	0.24	0.15	0.20	0.16	0.14	0.12	0.23	0.12	0.33	0.56	0.30	0.04	0.27	0.34	0.39	0.25
C5	0.07	0.03	0.17	0.22	0.11	0.05	0.07	0.09	0.02	0.03	0.06	0.11	0.14	0.32	0.18	0.11	0.19	0.32	0.34	0.20
C5'	0.05	0.16	0.34	0.38	0.28	0.12	0.22	0.13	0.15	0.12	0.25	0.11	0.32	0.54	0.35	0.05	0.25	0.32	0.39	0.23
C6	0.04	0.02	0.22	0.28	0.13	0.08	0.09	0.12	0.04	0.01	0.09	0.05	0.19	0.41	0.19	0.09	0.23	0.34	0.36	0.23
N1	0.01	0.08	0.28	0.36	0.17	0.14	0.13	0.18	0.09	0.06	0.14	0.04	0.24	0.50	0.21	0.04	0.30	0.40	0.42	0.29
N3	0.04	0.02	0.21	0.29	0.14	0.11	0.11	0.17	0.06	0.02	0.11	0.08	0.15	0.39	0.19	0.04	0.29	0.40	0.42	0.30
O2	0.07	0.14	0.35	0.46	0.20	0.23	0.17	0.29	0.15	0.13	0.19	0.11	0.28	0.60	0.22	0.06	0.40	0.48	0.49	0.40
O2'	0.12	0.21	0.40	0.47	0.26	0.23	0.22	0.24	0.19	0.17	0.25	0.19	0.39	0.64	0.29	0.05	0.34	0.38	0.44	0.32
O3'	0.12	0.26	0.39	0.40	0.37	0.13	0.30	0.11	0.23	0.20	0.35	0.23	0.38	0.55	0.44	0.03	0.23	0.21	0.36	0.19
O4	0.09	0.09	0.11	0.16	0.08	0.05	0.06	0.10	0.02	0.05	0.02	0.18	0.07	0.22	0.16	0.08	0.20	0.34	0.37	0.24
O4'	0.03	0.09	0.33	0.41	0.16	0.17	0.13	0.20	0.09	0.08	0.14	0.07	0.31	0.58	0.20	0.03	0.31	0.41	0.42	0.30
O5'	0.36	0.25	0.00	0.06	0.15	0.25	0.21	0.24	0.27	0.30	0.17	0.29	0.02	0.24	0.12	0.46	0.11	0.02	0.04	0.15
OP1	0.46	0.33	0.03	0.04	0.25	0.34	0.33	0.34	0.39	0.39	0.25	0.34	0.06	0.27	0.19	0.60	0.19	0.09	0.10	0.25
OP2	0.91	0.87	0.57	0.59	0.90	0.87	0.94	0.93	0.95	0.92	0.86	0.84	0.49	0.40	0.87	1.06	0.87	0.83	0.82	0.95
P	0.47	0.38	0.11	0.07	0.30	0.37	0.36	0.38	0.41	0.42	0.31	0.40	0.11	0.12	0.25	0.58	0.26	0.17	0.16	0.30

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.00	0.01	0.03	0.00	0.04	0.02	0.16	0.07
C2	0.02	0.00	0.11	0.08	0.00	0.04	0.01	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.12	0.10	0.01	0.01	0.09	0.13	0.21	0.11
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.02	0.01	0.09	0.00	0.10	0.00	0.07	0.23	0.00	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.09	0.04
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.07	0.00	0.19	0.00	0.20	0.04	0.03	0.21	0.01	0.00	0.07	0.00	0.02	0.04	0.02	0.02
C4	0.02	0.00	0.02	0.07	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.09	0.01	0.02	0.03	0.07	0.13	0.02
C4'	0.00	0.04	0.01	0.00	0.04	0.00	0.10	0.00	0.10	0.02	0.01	0.11	0.05	0.00	0.04	0.00	0.01	0.06	0.06	0.02
C5	0.02	0.01	0.09	0.19	0.01	0.10	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.22	0.02	0.03	0.13	0.03	0.07	0.05
C5'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.04	0.00	0.11	0.00	0.11	0.03	0.02	0.11	0.04	0.01	0.05	0.01	0.00	0.08	0.02	0.00
C6	0.02	0.00	0.10	0.20	0.01	0.10	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.00	0.06	0.21	0.02	0.03	0.12	0.05	0.10	0.04
N1	0.01	0.00	0.00	0.04	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.04	0.02	0.00	0.03	0.05	0.18	0.07
N3	0.01	0.00	0.07	0.03	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.09	0.04	0.02	0.00	0.05	0.12	0.18	0.08
O2	0.04	0.00	0.23	0.21	0.00	0.11	0.01	0.11	0.00	0.01	0.01	0.00	0.22	0.27	0.02	0.03	0.16	0.19	0.25	0.16
O2'	0.00	0.12	0.00	0.01	0.04	0.05	0.05	0.04	0.06	0.02	0.09	0.22	0.00	0.02	0.05	0.04	0.02	0.08	0.06	0.01
O3'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.09	0.00	0.22	0.01	0.21	0.04	0.04	0.27	0.02	0.00	0.10	0.01	0.05	0.10	0.11	0.07
O4	0.03	0.01	0.02	0.07	0.01	0.04	0.02	0.05	0.02	0.02	0.02	0.02	0.05	0.10	0.00	0.03	0.05	0.09	0.12	0.04
O4'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.00	0.00	0.03	0.04	0.01	0.03	0.00	0.05	0.02	0.17	0.08
O5'	0.04	0.09	0.03	0.02	0.03	0.01	0.13	0.00	0.12	0.03	0.05	0.16	0.02	0.05	0.05	0.05	0.00	0.00	0.01	0.00
OP1	0.02	0.13	0.01	0.04	0.07	0.06	0.03	0.08	0.05	0.05	0.12	0.19	0.08	0.10	0.09	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00
OP2	0.16	0.21	0.09	0.02	0.13	0.06	0.07	0.02	0.10	0.18	0.18	0.25	0.06	0.11	0.12	0.17	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.11	0.04	0.02	0.02	0.02	0.05	0.00	0.04	0.07	0.08	0.16	0.01	0.07	0.04	0.08	0.00	0.00	0.01	0.00