Doublet Group distance statistics: 50618

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.000, 0.004, 0.009, 0.009 max_d=0.009 avg_d=0.004 std_dev=0.004
N3	A	0, 0.000, 0.007, 0.015, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.007 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.000, 0.011, 0.022, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.011 std_dev=0.011
C6	A	0, 0.000, 0.012, 0.024, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.012 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.000, 0.012, 0.024, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.012 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.000, 0.013, 0.025, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.013 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.000, 0.013, 0.026, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.013 std_dev=0.013
O2	A	0, 0.000, 0.014, 0.029, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.014 std_dev=0.014
O4	A	0, 0.000, 0.094, 0.188, 0.188 max_d=0.188 avg_d=0.094 std_dev=0.094
N3	B	0, 0.000, 0.152, 0.305, 0.305 max_d=0.305 avg_d=0.152 std_dev=0.152
C4	B	0, 0.000, 0.169, 0.338, 0.338 max_d=0.338 avg_d=0.169 std_dev=0.169
O4	B	0, 0.000, 0.171, 0.341, 0.341 max_d=0.341 avg_d=0.171 std_dev=0.171
O2'	A	0, 0.000, 0.172, 0.344, 0.344 max_d=0.344 avg_d=0.172 std_dev=0.172
O5'	A	0, 0.000, 0.219, 0.439, 0.439 max_d=0.439 avg_d=0.219 std_dev=0.219
C5	B	0, 0.000, 0.223, 0.445, 0.445 max_d=0.445 avg_d=0.223 std_dev=0.223
C2'	A	0, 0.000, 0.229, 0.458, 0.458 max_d=0.458 avg_d=0.229 std_dev=0.229
C2	B	0, 0.000, 0.259, 0.517, 0.517 max_d=0.517 avg_d=0.259 std_dev=0.259
O4'	A	0, 0.000, 0.259, 0.517, 0.517 max_d=0.517 avg_d=0.259 std_dev=0.259
C6	B	0, 0.000, 0.289, 0.577, 0.577 max_d=0.577 avg_d=0.289 std_dev=0.289
P	A	0, 0.000, 0.293, 0.585, 0.585 max_d=0.585 avg_d=0.293 std_dev=0.293
O2	B	0, 0.000, 0.300, 0.600, 0.600 max_d=0.600 avg_d=0.300 std_dev=0.300
N1	B	0, 0.000, 0.338, 0.676, 0.676 max_d=0.676 avg_d=0.338 std_dev=0.338
OP1	A	0, 0.000, 0.342, 0.683, 0.683 max_d=0.683 avg_d=0.342 std_dev=0.342
OP2	A	0, 0.000, 0.352, 0.705, 0.705 max_d=0.705 avg_d=0.352 std_dev=0.352
O4'	B	0, 0.000, 0.381, 0.762, 0.762 max_d=0.762 avg_d=0.381 std_dev=0.381
C4'	A	0, 0.000, 0.419, 0.837, 0.837 max_d=0.837 avg_d=0.419 std_dev=0.419
C5'	B	0, 0.000, 0.423, 0.846, 0.846 max_d=0.846 avg_d=0.423 std_dev=0.423
C3'	A	0, 0.000, 0.424, 0.848, 0.848 max_d=0.848 avg_d=0.424 std_dev=0.424
O5'	B	0, 0.000, 0.493, 0.985, 0.985 max_d=0.985 avg_d=0.493 std_dev=0.493
OP2	B	0, 0.000, 0.497, 0.994, 0.994 max_d=0.994 avg_d=0.497 std_dev=0.497
C4'	B	0, 0.000, 0.507, 1.014, 1.014 max_d=1.014 avg_d=0.507 std_dev=0.507
C1'	B	0, 0.000, 0.513, 1.026, 1.026 max_d=1.026 avg_d=0.513 std_dev=0.513
P	B	0, 0.000, 0.538, 1.076, 1.076 max_d=1.076 avg_d=0.538 std_dev=0.538
C5'	A	0, 0.000, 0.576, 1.151, 1.151 max_d=1.151 avg_d=0.576 std_dev=0.576
O3'	A	0, 0.000, 0.704, 1.407, 1.407 max_d=1.407 avg_d=0.704 std_dev=0.704
C3'	B	0, 0.000, 0.724, 1.448, 1.448 max_d=1.448 avg_d=0.724 std_dev=0.724
C2'	B	0, 0.000, 0.754, 1.508, 1.508 max_d=1.508 avg_d=0.754 std_dev=0.754
OP1	B	0, 0.000, 0.776, 1.552, 1.552 max_d=1.552 avg_d=0.776 std_dev=0.776
O2'	B	0, 0.000, 0.934, 1.869, 1.869 max_d=1.869 avg_d=0.934 std_dev=0.934
O3'	B	0, 0.000, 0.940, 1.880, 1.880 max_d=1.880 avg_d=0.940 std_dev=0.940

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.08	0.11	0.03	0.05
C2	0.01	0.00	0.08	0.09	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.10	0.01	0.05	0.12	0.11	0.06	0.08
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.02	0.03	0.08	0.11	0.00	0.02	0.07	0.01	0.05	0.00	0.04	0.04
C3'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.11	0.00	0.07	0.02	0.04	0.06	0.11	0.10	0.01	0.01	0.13	0.01	0.12	0.05	0.03	0.09
C4	0.00	0.01	0.06	0.11	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.15	0.00	0.02	0.14	0.12	0.08	0.11
C4'	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.03	0.00	0.01	0.09	0.03	0.01
C5	0.00	0.00	0.01	0.07	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.10	0.00	0.01	0.14	0.12	0.08	0.12
C5'	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.00	0.06	0.00	0.06	0.03	0.02	0.01	0.01	0.05	0.05	0.02	0.01	0.12	0.05	0.01
C6	0.00	0.00	0.02	0.04	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.05	0.00	0.03	0.14	0.13	0.06	0.11
N1	0.00	0.00	0.03	0.06	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.00	0.01	0.12	0.12	0.05	0.08
N3	0.00	0.00	0.08	0.11	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.14	0.01	0.04	0.13	0.12	0.07	0.10
O2	0.01	0.00	0.11	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.10	0.01	0.07	0.11	0.11	0.05	0.07
O2'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.04	0.07	0.00	0.06	0.05	0.01	0.03	0.03	0.02	0.03
O3'	0.03	0.10	0.02	0.01	0.15	0.05	0.10	0.05	0.05	0.05	0.14	0.10	0.06	0.00	0.18	0.04	0.18	0.11	0.02	0.13
O4	0.00	0.01	0.07	0.13	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.18	0.00	0.03	0.14	0.12	0.09	0.11
O4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.03	0.01	0.04	0.07	0.01	0.04	0.03	0.00	0.15	0.18	0.06	0.10
O5'	0.08	0.12	0.05	0.12	0.14	0.01	0.14	0.01	0.14	0.12	0.13	0.11	0.03	0.18	0.14	0.15	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.11	0.11	0.00	0.05	0.12	0.09	0.12	0.12	0.13	0.12	0.12	0.11	0.03	0.11	0.12	0.18	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.03	0.06	0.04	0.03	0.08	0.03	0.08	0.05	0.06	0.05	0.07	0.05	0.02	0.02	0.09	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.05	0.08	0.04	0.09	0.11	0.01	0.12	0.01	0.11	0.08	0.10	0.07	0.03	0.13	0.11	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.05	0.04	0.10	0.14	0.01	0.08	0.02	0.12	0.03	0.04	0.03	0.05	0.07	0.15	0.00	0.04	0.20	0.39	0.27	0.25
C2	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.02	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.04	0.01	0.00	0.15	0.35	0.24	0.21
C2'	0.27	0.24	0.34	0.36	0.17	0.29	0.19	0.31	0.22	0.25	0.20	0.26	0.32	0.38	0.13	0.24	0.39	0.54	0.44	0.42
C3'	0.35	0.29	0.39	0.40	0.21	0.35	0.23	0.37	0.28	0.31	0.25	0.31	0.38	0.42	0.16	0.32	0.43	0.56	0.47	0.45
C4	0.01	0.02	0.02	0.01	0.06	0.00	0.06	0.03	0.04	0.02	0.04	0.01	0.02	0.02	0.08	0.00	0.09	0.27	0.18	0.14
C4'	0.18	0.14	0.21	0.23	0.07	0.19	0.08	0.21	0.12	0.15	0.10	0.16	0.20	0.24	0.03	0.16	0.27	0.42	0.31	0.30
C5	0.02	0.00	0.02	0.03	0.05	0.03	0.05	0.05	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.03	0.07	0.02	0.11	0.28	0.19	0.16
C5'	0.19	0.15	0.21	0.21	0.07	0.19	0.08	0.21	0.12	0.15	0.10	0.17	0.20	0.22	0.03	0.18	0.26	0.41	0.29	0.29
C6	0.03	0.01	0.06	0.07	0.03	0.05	0.03	0.07	0.01	0.02	0.01	0.03	0.04	0.07	0.05	0.02	0.14	0.32	0.22	0.19
N1	0.02	0.01	0.05	0.08	0.02	0.05	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.02	0.03	0.09	0.03	0.02	0.16	0.35	0.24	0.21
N3	0.03	0.04	0.04	0.01	0.05	0.01	0.05	0.04	0.04	0.03	0.04	0.03	0.06	0.01	0.05	0.02	0.11	0.30	0.21	0.17
O2	0.03	0.02	0.00	0.06	0.02	0.03	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.03	0.06	0.05	0.03	0.01	0.18	0.39	0.27	0.25
O2'	0.23	0.21	0.34	0.36	0.14	0.27	0.16	0.29	0.19	0.21	0.17	0.22	0.30	0.40	0.11	0.20	0.37	0.53	0.41	0.40
O3'	0.48	0.39	0.52	0.52	0.29	0.48	0.33	0.48	0.39	0.42	0.33	0.41	0.52	0.54	0.24	0.45	0.54	0.65	0.57	0.55
O4	0.00	0.02	0.04	0.04	0.06	0.01	0.06	0.02	0.04	0.02	0.03	0.00	0.03	0.05	0.08	0.01	0.07	0.23	0.16	0.12
O4'	0.03	0.01	0.06	0.08	0.03	0.05	0.03	0.08	0.01	0.01	0.01	0.03	0.03	0.09	0.05	0.02	0.15	0.33	0.20	0.19
O5'	0.20	0.17	0.23	0.24	0.12	0.21	0.12	0.23	0.15	0.17	0.14	0.18	0.21	0.25	0.09	0.18	0.30	0.47	0.37	0.34
OP1	0.25	0.20	0.28	0.27	0.12	0.25	0.13	0.26	0.17	0.21	0.16	0.23	0.28	0.29	0.08	0.23	0.31	0.46	0.35	0.34
OP2	0.19	0.14	0.19	0.18	0.06	0.18	0.07	0.19	0.12	0.15	0.10	0.16	0.20	0.19	0.03	0.18	0.24	0.38	0.29	0.26
P	0.18	0.15	0.20	0.20	0.08	0.18	0.09	0.20	0.12	0.15	0.11	0.16	0.19	0.21	0.05	0.17	0.26	0.42	0.32	0.29

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.06	0.08	0.08	0.07
C2	0.00	0.00	0.05	0.08	0.00	0.04	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.08	0.00	0.00	0.15	0.25	0.19	0.17
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.10	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.03	0.00
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00	0.04	0.07	0.12	0.00	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.09	0.03
C4	0.01	0.00	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.00	0.03	0.17	0.32	0.26	0.22
C4'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.03	0.03	0.04	0.04	0.01	0.02	0.04	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01
C5	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.04	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.15	0.28	0.25	0.20
C5'	0.02	0.07	0.01	0.01	0.09	0.00	0.09	0.00	0.07	0.06	0.09	0.07	0.01	0.01	0.09	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01
C6	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.13	0.20	0.17	0.15
N1	0.00	0.00	0.01	0.04	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.00	0.01	0.12	0.18	0.15	0.13
N3	0.01	0.00	0.03	0.07	0.00	0.04	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.07	0.00	0.01	0.17	0.31	0.24	0.21
O2	0.00	0.00	0.10	0.12	0.00	0.04	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.13	0.00	0.01	0.14	0.24	0.18	0.17
O2'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.03	0.00
O3'	0.02	0.08	0.01	0.00	0.03	0.02	0.00	0.01	0.00	0.04	0.07	0.13	0.01	0.00	0.02	0.02	0.07	0.07	0.15	0.08
O4	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.04	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.02	0.00	0.03	0.16	0.34	0.27	0.23
O4'	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.00	0.07	0.04	0.10	0.07
O5'	0.06	0.15	0.00	0.03	0.17	0.01	0.15	0.01	0.13	0.12	0.17	0.14	0.01	0.07	0.16	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00
OP1	0.08	0.25	0.04	0.00	0.32	0.02	0.28	0.03	0.20	0.18	0.31	0.24	0.00	0.07	0.34	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00
OP2	0.08	0.19	0.03	0.09	0.26	0.00	0.25	0.02	0.17	0.15	0.24	0.18	0.03	0.15	0.27	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.07	0.17	0.00	0.03	0.22	0.01	0.20	0.01	0.15	0.13	0.21	0.17	0.00	0.08	0.23	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00