Doublet Group distance statistics: 50620

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
O4	B	0, 0.000, 1.370, 2.739, 2.739 max_d=2.739 avg_d=1.370 std_dev=1.370
O4	A	0, 0.000, 1.436, 2.873, 2.873 max_d=2.873 avg_d=1.436 std_dev=1.436
N3	B	0, 0.000, 1.849, 3.697, 3.697 max_d=3.697 avg_d=1.849 std_dev=1.849
N3	A	0, 0.000, 1.860, 3.720, 3.720 max_d=3.720 avg_d=1.860 std_dev=1.860
C4	B	0, 0.000, 2.104, 4.209, 4.209 max_d=4.209 avg_d=2.104 std_dev=2.104
C4	A	0, 0.000, 2.134, 4.268, 4.268 max_d=4.268 avg_d=2.134 std_dev=2.134
O2	B	0, 0.000, 2.310, 4.621, 4.621 max_d=4.621 avg_d=2.310 std_dev=2.310
O2	A	0, 0.000, 2.319, 4.637, 4.637 max_d=4.637 avg_d=2.319 std_dev=2.319
C2	A	0, 0.000, 2.617, 5.234, 5.234 max_d=5.234 avg_d=2.617 std_dev=2.617
C2	B	0, 0.000, 2.636, 5.272, 5.272 max_d=5.272 avg_d=2.636 std_dev=2.636
C5	B	0, 0.000, 3.396, 6.792, 6.792 max_d=6.792 avg_d=3.396 std_dev=3.396
C5	A	0, 0.000, 3.428, 6.856, 6.856 max_d=6.856 avg_d=3.428 std_dev=3.428
N1	A	0, 0.000, 3.856, 7.713, 7.713 max_d=7.713 avg_d=3.856 std_dev=3.856
N1	B	0, 0.000, 3.892, 7.783, 7.783 max_d=7.783 avg_d=3.892 std_dev=3.892
C6	A	0, 0.000, 4.244, 8.487, 8.487 max_d=8.487 avg_d=4.244 std_dev=4.244
C6	B	0, 0.000, 4.250, 8.501, 8.501 max_d=8.501 avg_d=4.250 std_dev=4.250
C1'	A	0, 0.000, 4.808, 9.616, 9.616 max_d=9.616 avg_d=4.808 std_dev=4.808
C1'	B	0, 0.000, 4.863, 9.726, 9.726 max_d=9.726 avg_d=4.863 std_dev=4.863
C2'	A	0, 0.000, 5.032, 10.064, 10.064 max_d=10.064 avg_d=5.032 std_dev=5.032
C2'	B	0, 0.000, 5.086, 10.171, 10.171 max_d=10.171 avg_d=5.086 std_dev=5.086
O2'	A	0, 0.000, 5.186, 10.372, 10.372 max_d=10.372 avg_d=5.186 std_dev=5.186
O2'	B	0, 0.000, 5.432, 10.864, 10.864 max_d=10.864 avg_d=5.432 std_dev=5.432
O4'	A	0, 0.000, 6.067, 12.133, 12.133 max_d=12.133 avg_d=6.067 std_dev=6.067
O4'	B	0, 0.000, 6.109, 12.218, 12.218 max_d=12.218 avg_d=6.109 std_dev=6.109
C3'	B	0, 0.000, 6.236, 12.471, 12.471 max_d=12.471 avg_d=6.236 std_dev=6.236
C3'	A	0, 0.000, 6.333, 12.667, 12.667 max_d=12.667 avg_d=6.333 std_dev=6.333
C4'	B	0, 0.000, 6.948, 13.896, 13.896 max_d=13.896 avg_d=6.948 std_dev=6.948
C4'	A	0, 0.000, 6.988, 13.975, 13.975 max_d=13.975 avg_d=6.988 std_dev=6.988
O3'	A	0, 0.000, 7.235, 14.469, 14.469 max_d=14.469 avg_d=7.235 std_dev=7.235
O3'	B	0, 0.000, 7.241, 14.483, 14.483 max_d=14.483 avg_d=7.241 std_dev=7.241
O5'	A	0, 0.000, 7.371, 14.742, 14.742 max_d=14.742 avg_d=7.371 std_dev=7.371
OP2	B	0, 0.000, 7.462, 14.925, 14.925 max_d=14.925 avg_d=7.462 std_dev=7.462
OP2	A	0, 0.000, 7.465, 14.931, 14.931 max_d=14.931 avg_d=7.465 std_dev=7.465
C5'	B	0, 0.000, 7.723, 15.447, 15.447 max_d=15.447 avg_d=7.723 std_dev=7.723
C5'	A	0, 0.000, 7.961, 15.922, 15.922 max_d=15.922 avg_d=7.961 std_dev=7.961
P	A	0, 0.000, 8.284, 16.569, 16.569 max_d=16.569 avg_d=8.284 std_dev=8.284
O5'	B	0, 0.000, 8.460, 16.920, 16.920 max_d=16.920 avg_d=8.460 std_dev=8.460
P	B	0, 0.000, 8.741, 17.482, 17.482 max_d=17.482 avg_d=8.741 std_dev=8.741
OP1	A	0, 0.000, 9.420, 18.839, 18.839 max_d=18.839 avg_d=9.420 std_dev=9.420
OP1	B	0, 0.000, 9.917, 19.835, 19.835 max_d=19.835 avg_d=9.917 std_dev=9.917

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.03	0.02
C2	0.01	0.00	0.03	0.03	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.04	0.00	0.01	0.05	0.08	0.08	0.07
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01
C3'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.00
C4	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.10	0.10	0.08
C4'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00
C5	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.05	0.08	0.09	0.07
C5'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.03	0.02	0.03	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00
C6	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.04	0.06	0.06	0.06
N1	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.06	0.06	0.05
N3	0.01	0.00	0.03	0.03	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.03	0.00	0.01	0.06	0.10	0.09	0.07
O2	0.02	0.00	0.05	0.05	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.06	0.00	0.01	0.06	0.08	0.07	0.07
O2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00
O3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.06	0.02
O4	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.10	0.10	0.08
O4'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02
O5'	0.02	0.05	0.01	0.00	0.06	0.00	0.05	0.00	0.04	0.04	0.06	0.06	0.00	0.02	0.05	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00
OP1	0.02	0.08	0.02	0.01	0.10	0.01	0.08	0.02	0.06	0.06	0.10	0.08	0.00	0.01	0.10	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00
OP2	0.03	0.08	0.00	0.03	0.10	0.00	0.09	0.00	0.06	0.06	0.09	0.07	0.01	0.06	0.10	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.02	0.07	0.01	0.00	0.08	0.00	0.07	0.00	0.06	0.05	0.07	0.07	0.00	0.02	0.08	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.05	0.10	0.30	0.24	0.56	0.09	0.51	0.03	0.32	0.13	0.34	0.13	0.45	0.41	0.77	0.04	0.09	0.28	0.38	0.26
C2	0.15	0.00	0.39	0.29	0.63	0.15	0.55	0.00	0.31	0.06	0.32	0.32	0.56	0.45	0.90	0.04	0.07	0.27	0.40	0.26
C2'	0.05	0.16	0.35	0.26	0.65	0.09	0.58	0.07	0.37	0.17	0.43	0.08	0.55	0.47	0.87	0.07	0.06	0.24	0.38	0.23
C3'	0.18	0.01	0.43	0.32	0.48	0.17	0.43	0.01	0.23	0.02	0.24	0.24	0.63	0.50	0.70	0.04	0.02	0.18	0.30	0.15
C4	0.58	0.65	0.67	0.49	0.02	0.42	0.09	0.23	0.15	0.45	0.45	0.93	0.80	0.54	0.36	0.43	0.16	0.11	0.19	0.06
C4'	0.13	0.01	0.36	0.28	0.40	0.15	0.38	0.01	0.21	0.03	0.19	0.21	0.51	0.44	0.58	0.03	0.02	0.21	0.30	0.18
C5	0.55	0.59	0.64	0.47	0.05	0.41	0.02	0.23	0.17	0.43	0.42	0.84	0.77	0.52	0.21	0.41	0.17	0.09	0.15	0.03
C5'	0.27	0.19	0.44	0.34	0.20	0.24	0.21	0.10	0.05	0.13	0.01	0.38	0.58	0.47	0.38	0.17	0.07	0.14	0.20	0.09
C6	0.39	0.36	0.53	0.40	0.17	0.30	0.19	0.14	0.00	0.24	0.15	0.61	0.67	0.49	0.41	0.26	0.09	0.15	0.22	0.10
N1	0.20	0.10	0.42	0.31	0.45	0.19	0.41	0.04	0.20	0.02	0.16	0.37	0.57	0.45	0.70	0.09	0.02	0.23	0.33	0.20
N3	0.36	0.32	0.55	0.39	0.45	0.28	0.41	0.10	0.14	0.17	0.01	0.67	0.70	0.50	0.81	0.22	0.02	0.21	0.33	0.18
O2	0.08	0.33	0.24	0.18	0.88	0.02	0.76	0.11	0.53	0.32	0.67	0.03	0.43	0.39	1.10	0.16	0.19	0.36	0.51	0.36
O2'	0.14	0.38	0.20	0.17	0.79	0.03	0.70	0.16	0.52	0.36	0.63	0.19	0.40	0.41	0.97	0.24	0.16	0.30	0.46	0.32
O3'	0.13	0.07	0.42	0.31	0.54	0.14	0.49	0.05	0.28	0.08	0.32	0.15	0.64	0.51	0.75	0.01	0.02	0.17	0.31	0.16
O4	0.76	0.92	0.78	0.57	0.30	0.53	0.14	0.33	0.36	0.68	0.81	1.14	0.89	0.57	0.04	0.59	0.25	0.05	0.10	0.02
O4'	0.10	0.00	0.31	0.25	0.40	0.13	0.38	0.02	0.22	0.04	0.19	0.20	0.43	0.40	0.58	0.02	0.06	0.25	0.33	0.22
O5'	0.44	0.39	0.58	0.45	0.04	0.36	0.06	0.19	0.11	0.31	0.21	0.60	0.73	0.54	0.22	0.32	0.19	0.05	0.10	0.02
OP1	0.60	0.53	0.70	0.54	0.13	0.48	0.10	0.28	0.26	0.46	0.36	0.72	0.87	0.63	0.05	0.47	0.34	0.09	0.04	0.17
OP2	0.74	0.73	0.79	0.61	0.34	0.57	0.27	0.37	0.42	0.63	0.59	0.92	0.94	0.65	0.17	0.60	0.41	0.14	0.12	0.23
P	0.59	0.56	0.68	0.52	0.16	0.46	0.12	0.29	0.27	0.47	0.40	0.75	0.83	0.59	0.00	0.46	0.31	0.05	0.02	0.13

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.14	0.12	0.13	0.14
C2	0.00	0.00	0.08	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.10	0.00	0.03	0.11	0.10	0.11	0.12
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.05	0.00	0.12	0.00	0.13	0.02	0.03	0.19	0.00	0.00	0.05	0.00	0.15	0.19	0.18	0.16
C3'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.08	0.00	0.17	0.01	0.18	0.03	0.02	0.18	0.01	0.00	0.08	0.00	0.33	0.31	0.34	0.34
C4	0.01	0.00	0.05	0.08	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.08	0.00	0.01	0.04	0.05	0.06	0.06
C4'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.00	0.08	0.00	0.08	0.02	0.00	0.05	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.06	0.01	0.01
C5	0.01	0.00	0.12	0.17	0.00	0.08	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.09	0.19	0.00	0.01	0.04	0.06	0.07	0.06
C5'	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.00	0.09	0.00	0.08	0.03	0.02	0.03	0.02	0.02	0.06	0.02	0.00	0.19	0.03	0.00
C6	0.01	0.00	0.13	0.18	0.01	0.08	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.09	0.19	0.01	0.02	0.07	0.09	0.11	0.10
N1	0.00	0.00	0.02	0.03	0.01	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.11	0.11	0.12	0.12
N3	0.00	0.00	0.03	0.02	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.04	0.00	0.02	0.08	0.07	0.08	0.09
O2	0.01	0.00	0.19	0.18	0.00	0.05	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.16	0.22	0.00	0.05	0.13	0.11	0.12	0.13
O2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.04	0.02	0.09	0.02	0.09	0.01	0.03	0.16	0.00	0.01	0.05	0.02	0.11	0.18	0.15	0.12
O3'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.08	0.00	0.19	0.02	0.19	0.03	0.04	0.22	0.01	0.00	0.09	0.00	0.55	0.59	0.53	0.56
O4	0.01	0.00	0.05	0.08	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.09	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.04
O4'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.05	0.02	0.00	0.01	0.00	0.30	0.30	0.28	0.30
O5'	0.14	0.11	0.15	0.33	0.04	0.00	0.04	0.00	0.07	0.11	0.08	0.13	0.11	0.55	0.02	0.30	0.00	0.00	0.01	0.00
OP1	0.12	0.10	0.19	0.31	0.05	0.06	0.06	0.19	0.09	0.11	0.07	0.11	0.18	0.59	0.02	0.30	0.00	0.00	0.00	0.00
OP2	0.13	0.11	0.18	0.34	0.06	0.01	0.07	0.03	0.11	0.12	0.08	0.12	0.15	0.53	0.03	0.28	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.14	0.12	0.16	0.34	0.06	0.01	0.06	0.00	0.10	0.12	0.09	0.13	0.12	0.56	0.04	0.30	0.00	0.00	0.00	0.00