Doublet Group distance statistics: 50621

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
O4	A	0, 0.000, 1.704, 3.408, 3.408 max_d=3.408 avg_d=1.704 std_dev=1.704
O4	B	0, 0.000, 1.803, 3.606, 3.606 max_d=3.606 avg_d=1.803 std_dev=1.803
N3	B	0, 0.000, 1.886, 3.772, 3.772 max_d=3.772 avg_d=1.886 std_dev=1.886
N3	A	0, 0.000, 1.891, 3.781, 3.781 max_d=3.781 avg_d=1.891 std_dev=1.891
O2	B	0, 0.000, 1.913, 3.827, 3.827 max_d=3.827 avg_d=1.913 std_dev=1.913
O2	A	0, 0.000, 2.003, 4.006, 4.006 max_d=4.006 avg_d=2.003 std_dev=2.003
C4	A	0, 0.000, 2.331, 4.662, 4.662 max_d=4.662 avg_d=2.331 std_dev=2.331
C4	B	0, 0.000, 2.348, 4.697, 4.697 max_d=4.697 avg_d=2.348 std_dev=2.348
C2	B	0, 0.000, 2.407, 4.814, 4.814 max_d=4.814 avg_d=2.407 std_dev=2.407
C2	A	0, 0.000, 2.463, 4.926, 4.926 max_d=4.926 avg_d=2.463 std_dev=2.463
C5	B	0, 0.000, 3.627, 7.255, 7.255 max_d=7.255 avg_d=3.627 std_dev=3.627
C5	A	0, 0.000, 3.648, 7.295, 7.295 max_d=7.295 avg_d=3.648 std_dev=3.648
N1	B	0, 0.000, 3.656, 7.312, 7.312 max_d=7.312 avg_d=3.656 std_dev=3.656
N1	A	0, 0.000, 3.710, 7.420, 7.420 max_d=7.420 avg_d=3.710 std_dev=3.710
C6	B	0, 0.000, 4.251, 8.503, 8.503 max_d=8.503 avg_d=4.251 std_dev=4.251
C6	A	0, 0.000, 4.294, 8.588, 8.588 max_d=8.588 avg_d=4.294 std_dev=4.294
O2'	A	0, 0.000, 4.372, 8.745, 8.745 max_d=8.745 avg_d=4.372 std_dev=4.372
C1'	B	0, 0.000, 4.386, 8.771, 8.771 max_d=8.771 avg_d=4.386 std_dev=4.386
C2'	A	0, 0.000, 4.422, 8.844, 8.844 max_d=8.844 avg_d=4.422 std_dev=4.422
C1'	A	0, 0.000, 4.457, 8.913, 8.913 max_d=8.913 avg_d=4.457 std_dev=4.457
O2'	B	0, 0.000, 4.835, 9.671, 9.671 max_d=9.671 avg_d=4.835 std_dev=4.835
C2'	B	0, 0.000, 4.905, 9.809, 9.809 max_d=9.809 avg_d=4.905 std_dev=4.905
O4'	B	0, 0.000, 5.606, 11.213, 11.213 max_d=11.213 avg_d=5.606 std_dev=5.606
O4'	A	0, 0.000, 5.804, 11.608, 11.608 max_d=11.608 avg_d=5.804 std_dev=5.804
C3'	A	0, 0.000, 5.808, 11.616, 11.616 max_d=11.616 avg_d=5.808 std_dev=5.808
C3'	B	0, 0.000, 6.274, 12.548, 12.548 max_d=12.548 avg_d=6.274 std_dev=6.274
O3'	A	0, 0.000, 6.529, 13.058, 13.058 max_d=13.058 avg_d=6.529 std_dev=6.529
C4'	A	0, 0.000, 6.568, 13.136, 13.136 max_d=13.136 avg_d=6.568 std_dev=6.568
C4'	B	0, 0.000, 6.628, 13.255, 13.255 max_d=13.255 avg_d=6.628 std_dev=6.628
O3'	B	0, 0.000, 7.222, 14.443, 14.443 max_d=14.443 avg_d=7.222 std_dev=7.222
O5'	A	0, 0.000, 7.456, 14.912, 14.912 max_d=14.912 avg_d=7.456 std_dev=7.456
O5'	B	0, 0.000, 7.628, 15.255, 15.255 max_d=15.255 avg_d=7.628 std_dev=7.628
C5'	A	0, 0.000, 7.774, 15.548, 15.548 max_d=15.548 avg_d=7.774 std_dev=7.774
C5'	B	0, 0.000, 7.781, 15.561, 15.561 max_d=15.561 avg_d=7.781 std_dev=7.781
OP2	A	0, 0.000, 7.894, 15.789, 15.789 max_d=15.789 avg_d=7.894 std_dev=7.894
P	A	0, 0.000, 8.457, 16.914, 16.914 max_d=16.914 avg_d=8.457 std_dev=8.457
P	B	0, 0.000, 8.720, 17.440, 17.440 max_d=17.440 avg_d=8.720 std_dev=8.720
OP2	B	0, 0.000, 9.083, 18.167, 18.167 max_d=18.167 avg_d=9.083 std_dev=9.083
OP1	B	0, 0.000, 9.544, 19.087, 19.087 max_d=19.087 avg_d=9.544 std_dev=9.544
OP1	A	0, 0.000, 9.744, 19.489, 19.489 max_d=19.489 avg_d=9.744 std_dev=9.744

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.06
C2	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.03	0.05	0.13	0.11
C2'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.06	0.02	0.03
C3'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.04	0.03	0.03	0.00	0.00	0.01	0.03	0.00	0.03	0.08	0.00	0.00
C4	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.00	0.01	0.06	0.13	0.20	0.17
C4'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.04	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.04	0.01	0.02
C5	0.01	0.01	0.01	0.05	0.00	0.04	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.06	0.01	0.02	0.07	0.15	0.20	0.18
C5'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.06	0.00	0.07	0.00	0.06	0.03	0.04	0.00	0.01	0.01	0.06	0.00	0.00	0.04	0.01	0.00
C6	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.01	0.02	0.05	0.10	0.15	0.14
N1	0.00	0.00	0.01	0.03	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.01	0.03	0.05	0.11	0.11
N3	0.00	0.00	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.05	0.09	0.17	0.14
O2	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.10	0.09
O2'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.06	0.02	0.03
O3'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.05	0.01	0.06	0.01	0.06	0.03	0.03	0.00	0.00	0.00	0.05	0.01	0.05	0.12	0.02	0.02
O4	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.00	0.01	0.07	0.15	0.21	0.18
O4'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.05	0.06
O5'	0.00	0.03	0.02	0.03	0.06	0.00	0.07	0.00	0.05	0.03	0.05	0.01	0.02	0.05	0.07	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00
OP1	0.00	0.05	0.06	0.08	0.13	0.04	0.15	0.04	0.10	0.05	0.09	0.02	0.06	0.12	0.15	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00
OP2	0.06	0.13	0.02	0.00	0.20	0.01	0.20	0.01	0.15	0.11	0.17	0.10	0.02	0.02	0.21	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.06	0.11	0.03	0.00	0.17	0.02	0.18	0.00	0.14	0.11	0.14	0.09	0.03	0.02	0.18	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.04	0.33	0.13	0.03	0.77	0.01	0.66	0.17	0.45	0.28	0.61	0.13	0.47	0.20	0.98	0.11	0.34	0.62	0.00	0.41
C2	0.24	0.04	0.39	0.21	0.72	0.19	0.58	0.01	0.30	0.04	0.44	0.28	0.75	0.35	1.02	0.13	0.22	0.53	0.10	0.32
C2'	0.18	0.47	0.01	0.09	0.91	0.14	0.81	0.30	0.61	0.43	0.75	0.25	0.35	0.09	1.10	0.25	0.48	0.80	0.13	0.53
C3'	0.10	0.31	0.07	0.03	0.73	0.08	0.66	0.24	0.48	0.31	0.55	0.12	0.38	0.13	0.91	0.18	0.41	0.77	0.01	0.46
C4	0.69	0.65	0.77	0.53	0.01	0.52	0.01	0.30	0.26	0.53	0.41	0.90	1.03	0.59	0.33	0.55	0.09	0.31	0.51	0.04
C4'	0.09	0.31	0.08	0.01	0.66	0.06	0.59	0.20	0.42	0.28	0.52	0.15	0.37	0.15	0.83	0.16	0.36	0.67	0.04	0.41
C5	0.58	0.51	0.67	0.46	0.02	0.45	0.02	0.24	0.19	0.42	0.29	0.72	0.93	0.53	0.30	0.46	0.06	0.34	0.51	0.06
C5'	0.03	0.14	0.19	0.08	0.47	0.04	0.42	0.11	0.27	0.13	0.32	0.00	0.46	0.23	0.63	0.04	0.25	0.59	0.19	0.30
C6	0.37	0.22	0.49	0.32	0.30	0.29	0.25	0.10	0.03	0.18	0.03	0.45	0.78	0.42	0.56	0.26	0.08	0.44	0.34	0.18
N1	0.20	0.04	0.35	0.19	0.59	0.16	0.49	0.02	0.25	0.04	0.35	0.21	0.67	0.33	0.85	0.10	0.21	0.53	0.16	0.30
N3	0.53	0.38	0.64	0.41	0.42	0.39	0.32	0.17	0.02	0.29	0.00	0.71	0.95	0.50	0.81	0.38	0.06	0.42	0.29	0.19
O2	0.02	0.40	0.21	0.06	1.02	0.04	0.83	0.15	0.55	0.32	0.84	0.07	0.61	0.24	1.26	0.06	0.37	0.62	0.10	0.46
O2'	0.44	0.77	0.23	0.29	1.10	0.34	1.00	0.47	0.82	0.69	1.00	0.61	0.10	0.07	1.25	0.49	0.63	0.90	0.33	0.67
O3'	0.23	0.43	0.05	0.14	0.80	0.20	0.76	0.35	0.59	0.43	0.64	0.25	0.25	0.04	0.96	0.31	0.51	0.89	0.11	0.55
O4	0.90	0.95	0.94	0.69	0.39	0.68	0.31	0.45	0.52	0.80	0.80	1.13	1.16	0.70	0.07	0.75	0.25	0.19	0.69	0.10
O4'	0.00	0.25	0.16	0.06	0.63	0.02	0.54	0.13	0.35	0.21	0.48	0.09	0.47	0.22	0.82	0.07	0.29	0.56	0.09	0.35
O5'	0.23	0.10	0.36	0.23	0.26	0.20	0.23	0.03	0.08	0.08	0.08	0.26	0.62	0.35	0.43	0.15	0.12	0.49	0.36	0.18
OP1	0.24	0.15	0.39	0.27	0.11	0.21	0.11	0.06	0.01	0.13	0.02	0.26	0.61	0.38	0.23	0.15	0.06	0.45	0.49	0.10
OP2	0.59	0.53	0.70	0.55	0.22	0.50	0.20	0.33	0.33	0.48	0.40	0.66	0.92	0.63	0.08	0.49	0.20	0.23	0.77	0.13
P	0.41	0.31	0.54	0.40	0.00	0.36	0.01	0.20	0.14	0.28	0.16	0.44	0.77	0.51	0.14	0.31	0.06	0.32	0.60	0.01

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.11	0.19	0.04
C2	0.01	0.00	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.05	0.00	0.02	0.07	0.25	0.39	0.00
C2'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.00	0.00
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.08	0.00	0.08	0.00	0.07	0.05	0.07	0.03	0.00	0.00	0.09	0.00	0.00	0.11	0.19	0.05
C4	0.01	0.00	0.00	0.08	0.00	0.05	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.10	0.00	0.00	0.14	0.39	0.58	0.06
C4'	0.00	0.01	0.01	0.00	0.05	0.00	0.07	0.00	0.07	0.03	0.03	0.03	0.04	0.01	0.06	0.00	0.00	0.01	0.14	0.01
C5	0.00	0.00	0.01	0.08	0.00	0.07	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.10	0.00	0.02	0.15	0.39	0.59	0.07
C5'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.10	0.00	0.12	0.00	0.10	0.05	0.06	0.01	0.03	0.01	0.11	0.00	0.00	0.03	0.21	0.00
C6	0.00	0.00	0.01	0.07	0.00	0.07	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.08	0.00	0.02	0.11	0.30	0.48	0.03
N1	0.00	0.00	0.00	0.05	0.01	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.05	0.01	0.00	0.06	0.22	0.36	0.01
N3	0.01	0.00	0.01	0.07	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.08	0.00	0.01	0.11	0.33	0.50	0.03
O2	0.02	0.00	0.01	0.03	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.02	0.00	0.04	0.03	0.19	0.33	0.03
O2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.05	0.04	0.03	0.03	0.02	0.03	0.06	0.06	0.00	0.02	0.06	0.04	0.01	0.04	0.15	0.04
O3'	0.00	0.05	0.01	0.00	0.10	0.01	0.10	0.01	0.08	0.05	0.08	0.02	0.02	0.00	0.11	0.00	0.03	0.21	0.49	0.13
O4	0.01	0.00	0.00	0.09	0.00	0.06	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.00	0.06	0.11	0.00	0.00	0.16	0.43	0.64	0.08
O4'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.01	0.04	0.04	0.00	0.00	0.00	0.02	0.14	0.17	0.08
O5'	0.00	0.07	0.01	0.00	0.14	0.00	0.15	0.00	0.11	0.06	0.11	0.03	0.01	0.03	0.16	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00
OP1	0.11	0.25	0.05	0.11	0.39	0.01	0.39	0.03	0.30	0.22	0.33	0.19	0.04	0.21	0.43	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00
OP2	0.19	0.39	0.00	0.19	0.58	0.14	0.59	0.21	0.48	0.36	0.50	0.33	0.15	0.49	0.64	0.17	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.04	0.00	0.00	0.05	0.06	0.01	0.07	0.00	0.03	0.01	0.03	0.03	0.04	0.13	0.08	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00