Doublet Group distance statistics: 50632

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.002, 0.014, 0.027, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.014 std_dev=0.013
C6	A	0, 0.008, 0.029, 0.049, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.029 std_dev=0.020
N1	A	0, 0.009, 0.032, 0.056, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.032 std_dev=0.023
N2	A	0, 0.010, 0.034, 0.058, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.034 std_dev=0.024
C1'	A	0, 0.009, 0.035, 0.061, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.035 std_dev=0.026
N3	A	0, 0.010, 0.041, 0.071, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.041 std_dev=0.030
C5	A	0, 0.014, 0.049, 0.084, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.049 std_dev=0.035
C4	A	0, 0.017, 0.060, 0.102, 0.096 max_d=0.096 avg_d=0.060 std_dev=0.043
N7	A	0, 0.026, 0.089, 0.153, 0.143 max_d=0.143 avg_d=0.089 std_dev=0.064
N9	A	0, 0.028, 0.097, 0.166, 0.147 max_d=0.147 avg_d=0.097 std_dev=0.069
C8	A	0, 0.032, 0.109, 0.186, 0.170 max_d=0.170 avg_d=0.109 std_dev=0.077
O6	A	0, 0.033, 0.118, 0.203, 0.198 max_d=0.198 avg_d=0.118 std_dev=0.085
O4	B	0, 0.075, 0.266, 0.456, 0.436 max_d=0.436 avg_d=0.266 std_dev=0.190
N3	B	0, 0.065, 0.265, 0.466, 0.485 max_d=0.485 avg_d=0.265 std_dev=0.200
C4	B	0, 0.104, 0.371, 0.637, 0.614 max_d=0.614 avg_d=0.371 std_dev=0.266
O2	B	0, 0.134, 0.492, 0.849, 0.838 max_d=0.838 avg_d=0.492 std_dev=0.357
C2	B	0, 0.141, 0.530, 0.920, 0.925 max_d=0.925 avg_d=0.530 std_dev=0.389
C5	B	0, 0.197, 0.718, 1.240, 1.222 max_d=1.222 avg_d=0.718 std_dev=0.521
N1	B	0, 0.251, 0.897, 1.543, 1.494 max_d=1.494 avg_d=0.897 std_dev=0.646
C6	B	0, 0.264, 0.957, 1.649, 1.617 max_d=1.617 avg_d=0.957 std_dev=0.693
C2'	A	0, 0.329, 1.123, 1.918, 1.686 max_d=1.686 avg_d=1.123 std_dev=0.794
O3'	A	0, 0.337, 1.157, 1.976, 1.798 max_d=1.798 avg_d=1.157 std_dev=0.819
O4'	A	0, 0.343, 1.171, 2.000, 1.763 max_d=1.763 avg_d=1.171 std_dev=0.828
C1'	B	0, 0.353, 1.241, 2.130, 2.030 max_d=2.030 avg_d=1.241 std_dev=0.888
C3'	A	0, 0.370, 1.263, 2.156, 1.918 max_d=1.918 avg_d=1.263 std_dev=0.893
O4'	B	0, 0.431, 1.496, 2.561, 2.394 max_d=2.394 avg_d=1.496 std_dev=1.065
C2'	B	0, 0.438, 1.537, 2.636, 2.505 max_d=2.505 avg_d=1.537 std_dev=1.099
C4'	A	0, 0.466, 1.593, 2.720, 2.420 max_d=2.420 avg_d=1.593 std_dev=1.127
O2'	B	0, 0.495, 1.740, 2.985, 2.844 max_d=2.844 avg_d=1.740 std_dev=1.245
O2'	A	0, 0.583, 1.991, 3.399, 2.995 max_d=2.995 avg_d=1.991 std_dev=1.408
C4'	B	0, 0.678, 2.342, 4.006, 3.715 max_d=3.715 avg_d=2.342 std_dev=1.664
C3'	B	0, 0.709, 2.448, 4.187, 3.877 max_d=3.877 avg_d=2.448 std_dev=1.739
C5'	A	0, 0.760, 2.593, 4.427, 3.902 max_d=3.902 avg_d=2.593 std_dev=1.834
C5'	B	0, 0.772, 2.660, 4.548, 4.194 max_d=4.194 avg_d=2.660 std_dev=1.888
O5'	A	0, 0.814, 2.780, 4.746, 4.173 max_d=4.173 avg_d=2.780 std_dev=1.966
O5'	B	0, 0.983, 3.414, 5.845, 5.470 max_d=5.470 avg_d=3.414 std_dev=2.431
P	A	0, 1.015, 3.467, 5.919, 5.256 max_d=5.256 avg_d=3.467 std_dev=2.452
O3'	B	0, 1.023, 3.517, 6.012, 5.509 max_d=5.509 avg_d=3.517 std_dev=2.494
OP2	A	0, 1.064, 3.638, 6.212, 5.558 max_d=5.558 avg_d=3.638 std_dev=2.574
OP1	A	0, 1.184, 4.043, 6.902, 6.074 max_d=6.074 avg_d=4.043 std_dev=2.859
P	B	0, 1.281, 4.409, 7.537, 6.922 max_d=6.922 avg_d=4.409 std_dev=3.128
OP1	B	0, 1.367, 4.711, 8.055, 7.421 max_d=7.421 avg_d=4.711 std_dev=3.344
OP2	B	0, 1.398, 4.792, 8.187, 7.436 max_d=7.436 avg_d=4.792 std_dev=3.395

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.03	0.03	0.02	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.20	0.00	0.06	0.03	0.22	0.12	0.08
C2	0.03	0.00	0.22	0.05	0.01	0.19	0.01	0.24	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.23	0.22	0.27	0.07	0.03	0.14	0.30	0.07
C2'	0.00	0.22	0.00	0.01	0.11	0.01	0.06	0.10	0.10	0.11	0.17	0.27	0.21	0.06	0.01	0.01	0.03	0.02	0.22	0.08	0.47	0.32	0.32
C3'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.10	0.01	0.16	0.02	0.15	0.19	0.10	0.03	0.04	0.20	0.11	0.02	0.00	0.02	0.02	0.19	0.35	0.12	0.15
C4	0.02	0.01	0.11	0.10	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.15	0.12	0.04	0.01	0.08	0.35	0.17
C4'	0.00	0.19	0.01	0.01	0.05	0.00	0.05	0.01	0.02	0.22	0.12	0.27	0.19	0.18	0.05	0.16	0.01	0.01	0.02	0.05	0.22	0.06	0.06
C5	0.02	0.01	0.06	0.16	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.14	0.08	0.03	0.18	0.01	0.23	0.55	0.36
C5'	0.03	0.24	0.10	0.02	0.06	0.01	0.07	0.00	0.02	0.28	0.14	0.33	0.23	0.24	0.05	0.05	0.14	0.01	0.01	0.08	0.10	0.03	0.02
C6	0.03	0.01	0.10	0.15	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.09	0.11	0.08	0.15	0.00	0.24	0.59	0.36
C8	0.02	0.02	0.11	0.19	0.01	0.22	0.02	0.28	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.00	0.00	0.37	0.03	0.19	0.32	0.03	0.33	0.55	0.46
N1	0.04	0.01	0.17	0.10	0.01	0.12	0.01	0.14	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.01	0.03	0.09	0.17	0.19	0.03	0.02	0.09	0.45	0.21
N2	0.01	0.00	0.27	0.03	0.01	0.27	0.01	0.33	0.03	0.02	0.03	0.00	0.03	0.01	0.02	0.36	0.27	0.33	0.15	0.05	0.25	0.23	0.06
N3	0.04	0.01	0.21	0.04	0.01	0.19	0.00	0.23	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.03	0.24	0.23	0.27	0.09	0.02	0.18	0.22	0.03
N7	0.01	0.01	0.06	0.20	0.01	0.18	0.00	0.24	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.33	0.02	0.12	0.33	0.03	0.41	0.69	0.53
N9	0.01	0.03	0.01	0.11	0.02	0.05	0.02	0.05	0.03	0.00	0.03	0.02	0.03	0.00	0.00	0.13	0.10	0.02	0.09	0.02	0.10	0.30	0.19
O2'	0.01	0.23	0.01	0.02	0.02	0.16	0.14	0.05	0.09	0.37	0.09	0.36	0.24	0.33	0.13	0.00	0.04	0.10	0.17	0.14	0.50	0.43	0.33
O3'	0.20	0.22	0.03	0.00	0.15	0.01	0.08	0.14	0.11	0.03	0.17	0.27	0.23	0.02	0.10	0.04	0.00	0.11	0.15	0.07	0.20	0.09	0.06
O4'	0.00	0.27	0.02	0.02	0.12	0.01	0.03	0.01	0.08	0.19	0.19	0.33	0.27	0.12	0.02	0.10	0.11	0.00	0.05	0.03	0.13	0.18	0.11
O5'	0.06	0.07	0.22	0.02	0.04	0.02	0.18	0.01	0.15	0.32	0.03	0.15	0.09	0.33	0.09	0.17	0.15	0.05	0.00	0.24	0.04	0.02	0.01
O6	0.03	0.03	0.08	0.19	0.01	0.05	0.01	0.08	0.00	0.03	0.02	0.05	0.02	0.03	0.02	0.14	0.07	0.03	0.24	0.00	0.38	0.73	0.48
OP1	0.22	0.14	0.47	0.35	0.08	0.22	0.23	0.10	0.24	0.33	0.09	0.25	0.18	0.41	0.10	0.50	0.20	0.13	0.04	0.38	0.00	0.02	0.02
OP2	0.12	0.30	0.32	0.12	0.35	0.06	0.55	0.03	0.59	0.55	0.45	0.23	0.22	0.69	0.30	0.43	0.09	0.18	0.02	0.73	0.02	0.00	0.01
P	0.08	0.07	0.32	0.15	0.17	0.06	0.36	0.02	0.36	0.46	0.21	0.06	0.03	0.53	0.19	0.33	0.06	0.11	0.01	0.48	0.02	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.06	0.05	0.03	0.17	0.10	0.02	0.10	0.13	0.07	0.04	0.06	0.07	0.27	0.12	0.12	0.06	0.32	0.43	0.69	0.49
C2	0.03	0.03	0.07	0.24	0.11	0.09	0.12	0.21	0.09	0.05	0.05	0.03	0.18	0.22	0.13	0.03	0.40	0.52	0.75	0.59
C2'	0.13	0.13	0.07	0.07	0.14	0.08	0.13	0.02	0.13	0.13	0.14	0.13	0.32	0.06	0.15	0.15	0.21	0.31	0.56	0.37
C3'	0.23	0.22	0.20	0.06	0.12	0.17	0.10	0.03	0.13	0.19	0.17	0.28	0.51	0.12	0.10	0.22	0.21	0.33	0.64	0.40
C4	0.07	0.06	0.05	0.16	0.12	0.05	0.12	0.13	0.09	0.07	0.08	0.06	0.26	0.12	0.13	0.07	0.31	0.41	0.65	0.46
C4'	0.09	0.07	0.08	0.10	0.18	0.04	0.20	0.14	0.13	0.06	0.08	0.15	0.41	0.05	0.24	0.07	0.37	0.49	0.80	0.56
C5	0.09	0.09	0.07	0.12	0.13	0.07	0.12	0.09	0.11	0.09	0.10	0.08	0.30	0.09	0.14	0.10	0.26	0.32	0.55	0.38
C5'	0.16	0.11	0.19	0.07	0.18	0.13	0.20	0.06	0.11	0.09	0.08	0.22	0.55	0.21	0.26	0.12	0.29	0.39	0.73	0.48
C6	0.09	0.08	0.07	0.13	0.13	0.07	0.13	0.10	0.11	0.09	0.11	0.07	0.28	0.09	0.14	0.09	0.27	0.33	0.55	0.39
C8	0.11	0.09	0.08	0.09	0.11	0.09	0.10	0.06	0.09	0.09	0.10	0.10	0.34	0.09	0.12	0.11	0.22	0.28	0.53	0.34
N1	0.06	0.05	0.06	0.19	0.13	0.06	0.13	0.17	0.10	0.07	0.07	0.04	0.21	0.16	0.15	0.06	0.35	0.44	0.66	0.50
N2	0.04	0.04	0.11	0.31	0.07	0.15	0.10	0.29	0.08	0.05	0.04	0.06	0.13	0.30	0.08	0.04	0.47	0.63	0.85	0.69
N3	0.05	0.05	0.07	0.23	0.12	0.08	0.13	0.20	0.10	0.06	0.07	0.04	0.21	0.20	0.14	0.05	0.39	0.51	0.74	0.57
N7	0.12	0.10	0.10	0.08	0.12	0.11	0.11	0.06	0.10	0.10	0.11	0.10	0.35	0.12	0.12	0.12	0.20	0.24	0.48	0.30
N9	0.08	0.07	0.04	0.13	0.10	0.04	0.10	0.09	0.08	0.06	0.08	0.08	0.30	0.08	0.11	0.08	0.28	0.36	0.62	0.42
O2'	0.12	0.11	0.26	0.38	0.07	0.18	0.06	0.25	0.07	0.10	0.09	0.15	0.03	0.41	0.10	0.07	0.42	0.52	0.71	0.55
O3'	0.07	0.08	0.11	0.29	0.24	0.16	0.26	0.31	0.21	0.12	0.14	0.02	0.22	0.25	0.28	0.10	0.57	0.71	1.03	0.78
O4'	0.04	0.06	0.04	0.17	0.24	0.05	0.25	0.20	0.18	0.08	0.13	0.06	0.32	0.08	0.30	0.04	0.40	0.52	0.81	0.58
O5'	0.37	0.31	0.43	0.32	0.14	0.36	0.14	0.21	0.19	0.28	0.22	0.42	0.78	0.47	0.14	0.33	0.13	0.17	0.47	0.24
O6	0.09	0.09	0.08	0.10	0.12	0.08	0.12	0.08	0.11	0.09	0.11	0.07	0.30	0.10	0.11	0.09	0.23	0.26	0.47	0.32
OP1	0.61	0.51	0.69	0.59	0.24	0.62	0.24	0.46	0.34	0.48	0.37	0.65	1.08	0.77	0.20	0.56	0.25	0.22	0.37	0.18
OP2	0.98	0.88	1.07	1.01	0.60	1.03	0.62	0.89	0.74	0.87	0.74	1.00	1.43	1.20	0.48	0.95	0.68	0.66	0.27	0.53
P	0.69	0.60	0.77	0.67	0.32	0.71	0.33	0.56	0.44	0.57	0.46	0.72	1.14	0.86	0.22	0.65	0.34	0.30	0.19	0.19

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.02	0.04	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.05	0.04	0.01	0.09	0.09	0.11	0.09
C2	0.01	0.00	0.00	0.09	0.02	0.02	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.17	0.03	0.03	0.02	0.21	0.19	0.36	0.27
C2'	0.00	0.00	0.00	0.01	0.06	0.01	0.08	0.01	0.08	0.03	0.02	0.06	0.00	0.01	0.07	0.01	0.15	0.08	0.23	0.14
C3'	0.02	0.09	0.01	0.00	0.21	0.00	0.25	0.00	0.22	0.13	0.14	0.04	0.02	0.01	0.23	0.02	0.23	0.10	0.30	0.19
C4	0.04	0.02	0.06	0.21	0.00	0.10	0.00	0.19	0.01	0.03	0.01	0.02	0.13	0.19	0.00	0.05	0.34	0.39	0.59	0.48
C4'	0.02	0.02	0.01	0.00	0.10	0.00	0.13	0.00	0.12	0.05	0.06	0.03	0.12	0.03	0.11	0.01	0.01	0.08	0.03	0.03
C5	0.03	0.01	0.08	0.25	0.00	0.13	0.00	0.22	0.01	0.02	0.01	0.01	0.07	0.25	0.01	0.04	0.36	0.41	0.58	0.51
C5'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.19	0.00	0.22	0.00	0.19	0.10	0.13	0.03	0.10	0.00	0.21	0.02	0.01	0.09	0.03	0.01
C6	0.02	0.01	0.08	0.22	0.01	0.12	0.01	0.19	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.21	0.01	0.03	0.30	0.31	0.43	0.40
N1	0.01	0.00	0.03	0.13	0.03	0.05	0.02	0.10	0.01	0.00	0.02	0.01	0.07	0.08	0.03	0.02	0.21	0.19	0.31	0.26
N3	0.02	0.01	0.02	0.14	0.01	0.06	0.01	0.13	0.01	0.02	0.00	0.01	0.17	0.10	0.02	0.04	0.27	0.29	0.48	0.38
O2	0.01	0.00	0.06	0.04	0.02	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.24	0.11	0.03	0.00	0.16	0.13	0.29	0.19
O2'	0.01	0.17	0.00	0.02	0.13	0.12	0.07	0.10	0.04	0.07	0.17	0.24	0.00	0.03	0.13	0.10	0.16	0.12	0.21	0.14
O3'	0.05	0.03	0.01	0.01	0.19	0.03	0.25	0.00	0.21	0.08	0.10	0.11	0.03	0.00	0.22	0.04	0.23	0.12	0.30	0.17
O4	0.04	0.03	0.07	0.23	0.00	0.11	0.01	0.21	0.01	0.03	0.02	0.03	0.13	0.22	0.00	0.05	0.36	0.45	0.66	0.54
O4'	0.01	0.02	0.01	0.02	0.05	0.01	0.04	0.02	0.03	0.02	0.04	0.00	0.10	0.04	0.05	0.00	0.14	0.14	0.12	0.10
O5'	0.09	0.21	0.15	0.23	0.34	0.01	0.36	0.01	0.30	0.21	0.27	0.16	0.16	0.23	0.36	0.14	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.09	0.19	0.08	0.10	0.39	0.08	0.41	0.09	0.31	0.19	0.29	0.13	0.12	0.12	0.45	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.11	0.36	0.23	0.30	0.59	0.03	0.58	0.03	0.43	0.31	0.48	0.29	0.21	0.30	0.66	0.12	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.09	0.27	0.14	0.19	0.48	0.03	0.51	0.01	0.40	0.26	0.38	0.19	0.14	0.17	0.54	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00