Doublet Group distance statistics: 50633

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.000, 0.045, 0.090, 0.090 max_d=0.090 avg_d=0.045 std_dev=0.045
N1	A	0, 0.000, 0.052, 0.103, 0.103 max_d=0.103 avg_d=0.052 std_dev=0.052
C4	A	0, 0.000, 0.055, 0.110, 0.110 max_d=0.110 avg_d=0.055 std_dev=0.055
C5	A	0, 0.000, 0.068, 0.137, 0.137 max_d=0.137 avg_d=0.068 std_dev=0.068
C1'	A	0, 0.000, 0.071, 0.142, 0.142 max_d=0.142 avg_d=0.071 std_dev=0.071
N3	A	0, 0.000, 0.077, 0.155, 0.155 max_d=0.155 avg_d=0.077 std_dev=0.077
C2	A	0, 0.000, 0.081, 0.161, 0.161 max_d=0.161 avg_d=0.081 std_dev=0.081
C8	A	0, 0.000, 0.081, 0.162, 0.162 max_d=0.162 avg_d=0.081 std_dev=0.081
N9	A	0, 0.000, 0.086, 0.171, 0.171 max_d=0.171 avg_d=0.086 std_dev=0.086
O6	A	0, 0.000, 0.089, 0.179, 0.179 max_d=0.179 avg_d=0.089 std_dev=0.089
N7	A	0, 0.000, 0.091, 0.182, 0.182 max_d=0.182 avg_d=0.091 std_dev=0.091
N2	A	0, 0.000, 0.142, 0.285, 0.285 max_d=0.285 avg_d=0.142 std_dev=0.142
C6	B	0, 0.000, 0.200, 0.399, 0.399 max_d=0.399 avg_d=0.200 std_dev=0.200
N1	B	0, 0.000, 0.286, 0.572, 0.572 max_d=0.572 avg_d=0.286 std_dev=0.286
C1'	B	0, 0.000, 0.315, 0.630, 0.630 max_d=0.630 avg_d=0.315 std_dev=0.315
O4'	B	0, 0.000, 0.358, 0.717, 0.717 max_d=0.717 avg_d=0.358 std_dev=0.358
C5	B	0, 0.000, 0.384, 0.768, 0.768 max_d=0.768 avg_d=0.384 std_dev=0.384
C2	B	0, 0.000, 0.476, 0.951, 0.951 max_d=0.951 avg_d=0.476 std_dev=0.476
P	B	0, 0.000, 0.482, 0.965, 0.965 max_d=0.965 avg_d=0.482 std_dev=0.482
C2'	B	0, 0.000, 0.529, 1.059, 1.059 max_d=1.059 avg_d=0.529 std_dev=0.529
C4'	B	0, 0.000, 0.542, 1.084, 1.084 max_d=1.084 avg_d=0.542 std_dev=0.542
C4	B	0, 0.000, 0.583, 1.167, 1.167 max_d=1.167 avg_d=0.583 std_dev=0.583
N3	B	0, 0.000, 0.586, 1.172, 1.172 max_d=1.172 avg_d=0.586 std_dev=0.586
C3'	B	0, 0.000, 0.601, 1.202, 1.202 max_d=1.202 avg_d=0.601 std_dev=0.601
O5'	B	0, 0.000, 0.616, 1.231, 1.231 max_d=1.231 avg_d=0.616 std_dev=0.616
O2	B	0, 0.000, 0.627, 1.255, 1.255 max_d=1.255 avg_d=0.627 std_dev=0.627
OP2	B	0, 0.000, 0.700, 1.401, 1.401 max_d=1.401 avg_d=0.700 std_dev=0.700
O2'	B	0, 0.000, 0.720, 1.439, 1.439 max_d=1.439 avg_d=0.720 std_dev=0.720
C5'	B	0, 0.000, 0.746, 1.492, 1.492 max_d=1.492 avg_d=0.746 std_dev=0.746
O4	B	0, 0.000, 0.769, 1.538, 1.538 max_d=1.538 avg_d=0.769 std_dev=0.769
O3'	B	0, 0.000, 0.875, 1.750, 1.750 max_d=1.750 avg_d=0.875 std_dev=0.875
OP1	B	0, 0.000, 0.953, 1.906, 1.906 max_d=1.906 avg_d=0.953 std_dev=0.953
C3'	A	0, 0.000, 1.060, 2.120, 2.120 max_d=2.120 avg_d=1.060 std_dev=1.060
O3'	A	0, 0.000, 1.125, 2.251, 2.251 max_d=2.251 avg_d=1.125 std_dev=1.125
O4'	A	0, 0.000, 1.227, 2.454, 2.454 max_d=2.454 avg_d=1.227 std_dev=1.227
C4'	A	0, 0.000, 1.228, 2.456, 2.456 max_d=2.456 avg_d=1.228 std_dev=1.228
C2'	A	0, 0.000, 1.347, 2.695, 2.695 max_d=2.695 avg_d=1.347 std_dev=1.347
O2'	A	0, 0.000, 2.355, 4.711, 4.711 max_d=4.711 avg_d=2.355 std_dev=2.355
C5'	A	0, 0.000, 2.675, 5.350, 5.350 max_d=5.350 avg_d=2.675 std_dev=2.675
O5'	A	0, 0.000, 3.348, 6.695, 6.695 max_d=6.695 avg_d=3.348 std_dev=3.348
P	A	0, 0.000, 4.903, 9.805, 9.805 max_d=9.805 avg_d=4.903 std_dev=4.903
OP1	A	0, 0.000, 5.257, 10.515, 10.515 max_d=10.515 avg_d=5.257 std_dev=5.257
OP2	A	0, 0.000, 5.588, 11.176, 11.176 max_d=11.176 avg_d=5.588 std_dev=5.588

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.09	0.00	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.06	0.06	0.12	0.10	0.06	0.01	0.00	0.07	0.01	0.36	0.03	0.11	0.38	0.36
C2	0.09	0.00	0.33	0.27	0.01	0.27	0.03	0.71	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.02	0.10	0.11	0.10	1.43	0.04	1.59	2.27	1.88
C2'	0.00	0.33	0.00	0.01	0.21	0.02	0.16	0.05	0.23	0.08	0.29	0.36	0.32	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.55	0.22	0.15	0.59	0.48
C3'	0.02	0.27	0.01	0.00	0.16	0.00	0.12	0.00	0.19	0.07	0.23	0.32	0.25	0.00	0.02	0.02	0.00	0.00	0.24	0.18	0.09	0.20	0.13
C4	0.03	0.01	0.21	0.16	0.00	0.13	0.02	0.29	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.13	0.04	0.05	0.88	0.03	0.75	1.21	1.06
C4'	0.01	0.27	0.02	0.00	0.13	0.00	0.06	0.00	0.13	0.16	0.20	0.34	0.26	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.10	0.10	0.10	0.01
C5	0.02	0.03	0.16	0.12	0.02	0.06	0.00	0.11	0.02	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.02	0.19	0.12	0.01	0.71	0.03	0.56	1.00	0.88
C5'	0.01	0.71	0.05	0.00	0.29	0.00	0.11	0.00	0.28	0.37	0.53	0.93	0.65	0.23	0.02	0.05	0.02	0.01	0.00	0.21	0.02	0.23	0.01
C6	0.01	0.03	0.23	0.19	0.02	0.13	0.02	0.28	0.00	0.03	0.02	0.03	0.04	0.04	0.03	0.22	0.09	0.04	0.93	0.01	0.91	1.43	1.22
C8	0.06	0.00	0.08	0.07	0.00	0.16	0.01	0.37	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.13	0.20	0.11	0.09	0.05	0.24	0.03	0.07
N1	0.06	0.01	0.29	0.23	0.01	0.20	0.01	0.53	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.16	0.03	0.06	1.23	0.03	1.35	1.98	1.64
N2	0.12	0.00	0.36	0.32	0.01	0.34	0.02	0.93	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.03	0.05	0.21	0.13	1.68	0.04	2.06	2.85	2.31
N3	0.10	0.00	0.32	0.25	0.01	0.26	0.04	0.65	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.07	0.10	0.11	1.31	0.05	1.32	1.91	1.63
N7	0.06	0.03	0.01	0.00	0.02	0.09	0.01	0.23	0.04	0.01	0.03	0.03	0.03	0.00	0.03	0.19	0.20	0.07	0.28	0.06	0.00	0.33	0.33
N9	0.01	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.00	0.06	0.09	0.01	0.46	0.05	0.21	0.54	0.51
O2'	0.00	0.10	0.01	0.02	0.13	0.01	0.19	0.05	0.22	0.13	0.16	0.05	0.07	0.19	0.06	0.00	0.01	0.00	0.56	0.25	0.15	0.73	0.51
O3'	0.07	0.11	0.02	0.00	0.04	0.01	0.12	0.02	0.09	0.20	0.03	0.21	0.10	0.20	0.09	0.01	0.00	0.02	0.02	0.13	0.25	0.05	0.06
O4'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.04	0.11	0.06	0.13	0.11	0.07	0.01	0.00	0.02	0.00	0.16	0.03	0.05	0.08	0.19
O5'	0.36	1.43	0.55	0.24	0.88	0.00	0.71	0.00	0.93	0.09	1.23	1.68	1.31	0.28	0.46	0.56	0.02	0.16	0.00	0.86	0.01	0.01	0.00
O6	0.03	0.04	0.22	0.18	0.03	0.10	0.03	0.21	0.01	0.05	0.03	0.04	0.05	0.06	0.05	0.25	0.13	0.03	0.86	0.00	0.82	1.32	1.13
OP1	0.11	1.59	0.15	0.09	0.75	0.10	0.56	0.02	0.91	0.24	1.35	2.06	1.32	0.00	0.21	0.15	0.25	0.05	0.01	0.82	0.00	0.00	0.00
OP2	0.38	2.27	0.59	0.20	1.21	0.10	1.00	0.23	1.43	0.03	1.98	2.85	1.91	0.33	0.54	0.73	0.05	0.08	0.01	1.32	0.00	0.00	0.00
P	0.36	1.88	0.48	0.13	1.06	0.01	0.88	0.01	1.22	0.07	1.64	2.31	1.63	0.33	0.51	0.51	0.06	0.19	0.00	1.13	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.16	0.23	0.27	0.13	0.01	0.07	0.08	0.02	0.00	0.12	0.16	0.39	0.38	0.17	0.09	0.04	0.26	0.30	0.44	0.22
C2	0.24	0.36	0.32	0.18	0.16	0.16	0.04	0.09	0.11	0.23	0.34	0.49	0.39	0.17	0.10	0.15	0.37	0.21	0.32	0.12
C2'	0.58	0.62	0.61	0.51	0.46	0.53	0.42	0.50	0.49	0.56	0.56	0.72	0.69	0.50	0.39	0.54	0.78	0.24	0.12	0.34
C3'	0.47	0.53	0.53	0.42	0.41	0.41	0.35	0.37	0.40	0.46	0.49	0.62	0.60	0.43	0.37	0.41	0.68	0.14	0.06	0.24
C4	0.18	0.25	0.29	0.16	0.00	0.11	0.06	0.04	0.03	0.15	0.18	0.40	0.38	0.19	0.10	0.08	0.31	0.22	0.40	0.16
C4'	0.18	0.28	0.32	0.22	0.24	0.12	0.17	0.06	0.17	0.21	0.30	0.36	0.36	0.27	0.26	0.06	0.43	0.08	0.13	0.00
C5	0.16	0.20	0.28	0.16	0.10	0.11	0.12	0.04	0.01	0.12	0.09	0.37	0.38	0.21	0.23	0.07	0.31	0.18	0.43	0.16
C5'	0.32	0.43	0.48	0.46	0.59	0.33	0.55	0.34	0.48	0.41	0.51	0.41	0.44	0.51	0.67	0.24	0.78	0.37	0.35	0.42
C6	0.17	0.22	0.28	0.16	0.13	0.12	0.15	0.06	0.02	0.12	0.10	0.40	0.37	0.19	0.31	0.08	0.30	0.18	0.45	0.17
C8	0.16	0.18	0.29	0.18	0.09	0.11	0.11	0.03	0.01	0.11	0.07	0.34	0.40	0.25	0.21	0.06	0.30	0.17	0.43	0.16
N1	0.23	0.33	0.32	0.18	0.04	0.16	0.04	0.10	0.07	0.21	0.29	0.48	0.39	0.19	0.11	0.14	0.36	0.18	0.38	0.13
N2	0.28	0.41	0.33	0.19	0.30	0.18	0.13	0.12	0.17	0.28	0.44	0.51	0.39	0.15	0.31	0.19	0.40	0.22	0.23	0.08
N3	0.22	0.32	0.31	0.17	0.12	0.14	0.02	0.06	0.09	0.21	0.29	0.46	0.39	0.18	0.06	0.12	0.35	0.22	0.33	0.13
N7	0.15	0.16	0.29	0.19	0.14	0.12	0.14	0.05	0.02	0.10	0.03	0.33	0.40	0.26	0.27	0.06	0.30	0.14	0.44	0.15
N9	0.17	0.22	0.29	0.16	0.02	0.10	0.08	0.02	0.01	0.13	0.14	0.38	0.39	0.21	0.12	0.06	0.30	0.22	0.41	0.17
O2'	0.76	0.75	0.71	0.57	0.44	0.68	0.41	0.62	0.54	0.68	0.63	0.91	0.85	0.54	0.29	0.74	0.83	0.23	0.08	0.36
O3'	0.36	0.42	0.42	0.24	0.14	0.25	0.05	0.13	0.15	0.31	0.34	0.60	0.56	0.25	0.05	0.26	0.39	0.25	0.33	0.12
O4'	0.01	0.12	0.19	0.07	0.02	0.06	0.06	0.14	0.04	0.03	0.12	0.23	0.25	0.14	0.02	0.13	0.21	0.31	0.40	0.25
O5'	1.01	1.13	1.17	1.16	1.35	1.02	1.31	1.03	1.21	1.12	1.24	1.07	1.10	1.21	1.46	0.93	1.51	1.09	1.11	1.16
O6	0.15	0.15	0.27	0.16	0.27	0.12	0.23	0.06	0.07	0.08	0.04	0.37	0.37	0.21	0.47	0.07	0.28	0.15	0.50	0.18
OP1	1.25	1.31	1.39	1.49	1.70	1.38	1.75	1.50	1.61	1.40	1.46	1.14	1.24	1.52	1.85	1.26	2.04	1.76	1.81	1.80
OP2	1.65	1.76	1.82	1.93	2.27	1.77	2.30	1.89	2.11	1.85	1.96	1.52	1.62	1.98	2.48	1.63	2.47	2.22	2.27	2.24
P	1.40	1.50	1.57	1.63	1.88	1.48	1.88	1.56	1.74	1.55	1.66	1.35	1.43	1.69	2.04	1.35	2.09	1.77	1.82	1.81

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.02	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.08	0.01	0.03	0.04	0.01	0.16	0.06	0.42	0.10
C2	0.04	0.00	0.01	0.04	0.01	0.03	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.04	0.24	0.01	0.40	0.10
C2'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.01	0.06	0.00	0.05	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.06	0.00	0.02	0.02	0.49	0.18
C3'	0.02	0.04	0.00	0.00	0.09	0.00	0.11	0.01	0.11	0.06	0.05	0.03	0.01	0.01	0.09	0.01	0.10	0.00	0.53	0.24
C4	0.03	0.01	0.05	0.09	0.00	0.00	0.00	0.05	0.01	0.02	0.01	0.00	0.04	0.13	0.01	0.01	0.35	0.05	0.29	0.03
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.06	0.03	0.00	0.00	0.01	0.14	0.34	0.10
C5	0.00	0.01	0.06	0.11	0.00	0.02	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.17	0.01	0.05	0.37	0.06	0.30	0.02
C5'	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.00	0.08	0.00	0.06	0.01	0.03	0.06	0.06	0.01	0.06	0.00	0.01	0.22	0.17	0.01
C6	0.01	0.00	0.05	0.11	0.01	0.01	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.00	0.04	0.15	0.01	0.06	0.32	0.04	0.40	0.07
N1	0.01	0.01	0.01	0.06	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.05	0.03	0.00	0.24	0.01	0.43	0.11
N3	0.03	0.00	0.02	0.05	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.06	0.02	0.01	0.31	0.03	0.34	0.06
O2	0.08	0.01	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.06	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.00	0.10	0.17	0.02	0.43	0.13
O2'	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.06	0.05	0.06	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.10	0.05	0.04	0.08	0.02	0.49	0.20
O3'	0.03	0.02	0.03	0.01	0.13	0.03	0.17	0.01	0.15	0.05	0.06	0.02	0.10	0.00	0.15	0.03	0.33	0.11	0.62	0.36
O4	0.04	0.02	0.06	0.09	0.01	0.00	0.01	0.06	0.01	0.03	0.02	0.00	0.05	0.15	0.00	0.01	0.36	0.07	0.22	0.01
O4'	0.01	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00	0.05	0.00	0.06	0.00	0.01	0.10	0.04	0.03	0.01	0.00	0.18	0.12	0.32	0.05
O5'	0.16	0.24	0.02	0.10	0.35	0.01	0.37	0.01	0.32	0.24	0.31	0.17	0.08	0.33	0.36	0.18	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.06	0.01	0.02	0.00	0.05	0.14	0.06	0.22	0.04	0.01	0.03	0.02	0.02	0.11	0.07	0.12	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.42	0.40	0.49	0.53	0.29	0.34	0.30	0.17	0.40	0.43	0.34	0.43	0.49	0.62	0.22	0.32	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.10	0.10	0.18	0.24	0.03	0.10	0.02	0.01	0.07	0.11	0.06	0.13	0.20	0.36	0.01	0.05	0.01	0.00	0.00	0.00