Doublet Group distance statistics: 50648

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 2, 1, 1, 0, 0, 2, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.013, 0.023, 0.032, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.023 std_dev=0.009
C6	A	0, 0.011, 0.022, 0.032, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.022 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.022, 0.037, 0.052, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.037 std_dev=0.015
C5	A	0, 0.016, 0.034, 0.052, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.034 std_dev=0.018
N3	A	0, 0.019, 0.037, 0.056, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.037 std_dev=0.018
N1	A	0, 0.022, 0.041, 0.060, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.041 std_dev=0.019
N2	A	0, 0.026, 0.047, 0.067, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.047 std_dev=0.020
C4	A	0, 0.026, 0.050, 0.075, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.050 std_dev=0.024
N9	A	0, 0.031, 0.059, 0.088, 0.099 max_d=0.099 avg_d=0.059 std_dev=0.029
O6	A	0, 0.029, 0.059, 0.089, 0.103 max_d=0.103 avg_d=0.059 std_dev=0.030
N7	A	0, 0.028, 0.070, 0.112, 0.129 max_d=0.129 avg_d=0.070 std_dev=0.042
C8	A	0, 0.043, 0.096, 0.149, 0.170 max_d=0.170 avg_d=0.096 std_dev=0.053
O4'	A	0, 0.143, 0.267, 0.391, 0.361 max_d=0.361 avg_d=0.267 std_dev=0.124
C2'	A	0, 0.270, 0.441, 0.613, 0.637 max_d=0.637 avg_d=0.441 std_dev=0.172
C4'	A	0, 0.264, 0.437, 0.609, 0.646 max_d=0.646 avg_d=0.437 std_dev=0.173
C3'	A	0, 0.394, 0.643, 0.891, 0.957 max_d=0.957 avg_d=0.643 std_dev=0.249
O2'	A	0, 0.414, 0.688, 0.962, 1.016 max_d=1.016 avg_d=0.688 std_dev=0.274
C6	B	0, 0.283, 0.572, 0.862, 1.124 max_d=1.124 avg_d=0.572 std_dev=0.290
C5	B	0, 0.534, 0.848, 1.161, 1.154 max_d=1.154 avg_d=0.848 std_dev=0.313
O6	B	0, 0.250, 0.564, 0.877, 1.214 max_d=1.214 avg_d=0.564 std_dev=0.314
C5'	A	0, 0.484, 0.828, 1.171, 1.200 max_d=1.200 avg_d=0.828 std_dev=0.343
N1	B	0, 0.265, 0.617, 0.970, 1.158 max_d=1.158 avg_d=0.617 std_dev=0.352
N7	B	0, 0.645, 1.006, 1.367, 1.327 max_d=1.327 avg_d=1.006 std_dev=0.361
O3'	A	0, 0.608, 1.000, 1.392, 1.492 max_d=1.492 avg_d=1.000 std_dev=0.392
C4	B	0, 0.705, 1.136, 1.568, 1.635 max_d=1.635 avg_d=1.136 std_dev=0.431
O5'	A	0, 0.643, 1.097, 1.550, 1.639 max_d=1.639 avg_d=1.097 std_dev=0.453
C8	B	0, 0.864, 1.324, 1.784, 1.643 max_d=1.643 avg_d=1.324 std_dev=0.460
C2	B	0, 0.427, 0.915, 1.403, 1.678 max_d=1.678 avg_d=0.915 std_dev=0.488
OP2	A	0, 0.435, 0.929, 1.422, 1.703 max_d=1.703 avg_d=0.929 std_dev=0.494
N9	B	0, 0.931, 1.442, 1.952, 1.922 max_d=1.922 avg_d=1.442 std_dev=0.510
N3	B	0, 0.655, 1.196, 1.737, 2.004 max_d=2.004 avg_d=1.196 std_dev=0.541
OP2	B	0, 0.700, 1.248, 1.795, 1.889 max_d=1.889 avg_d=1.248 std_dev=0.548
P	A	0, 0.529, 1.104, 1.679, 1.943 max_d=1.943 avg_d=1.104 std_dev=0.575
N2	B	0, 0.396, 1.024, 1.653, 2.106 max_d=2.106 avg_d=1.024 std_dev=0.628
OP1	A	0, 0.641, 1.319, 1.997, 2.310 max_d=2.310 avg_d=1.319 std_dev=0.678
C1'	B	0, 1.195, 1.879, 2.564, 2.609 max_d=2.609 avg_d=1.879 std_dev=0.685
C3'	B	0, 1.227, 1.919, 2.610, 2.616 max_d=2.616 avg_d=1.919 std_dev=0.692
C2'	B	0, 1.262, 1.963, 2.665, 2.587 max_d=2.587 avg_d=1.963 std_dev=0.702
O4'	B	0, 1.345, 2.092, 2.840, 2.757 max_d=2.757 avg_d=2.092 std_dev=0.747
P	B	0, 0.929, 1.680, 2.431, 2.526 max_d=2.526 avg_d=1.680 std_dev=0.751
C4'	B	0, 1.352, 2.107, 2.862, 2.834 max_d=2.834 avg_d=2.107 std_dev=0.755
C5'	B	0, 1.182, 1.965, 2.749, 2.969 max_d=2.969 avg_d=1.965 std_dev=0.783
O3'	B	0, 1.446, 2.262, 3.078, 3.051 max_d=3.051 avg_d=2.262 std_dev=0.816
O5'	B	0, 1.072, 1.902, 2.731, 2.898 max_d=2.898 avg_d=1.902 std_dev=0.830
O2'	B	0, 1.470, 2.395, 3.321, 3.536 max_d=3.536 avg_d=2.395 std_dev=0.926
OP1	B	0, 1.001, 2.004, 3.007, 3.138 max_d=3.138 avg_d=2.004 std_dev=1.003

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.02	0.00	0.10	0.02	0.09	0.15	0.11
C2	0.02	0.00	0.06	0.07	0.01	0.02	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.08	0.03	0.17	0.02	0.19	0.34	0.25
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.02	0.04	0.04	0.05	0.07	0.06	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.08	0.05	0.12	0.13	0.09
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.05	0.00	0.07	0.02	0.08	0.08	0.07	0.08	0.06	0.09	0.04	0.02	0.01	0.01	0.05	0.09	0.13	0.10	0.08
C4	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.02	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.05	0.01	0.18	0.01	0.20	0.32	0.24
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.04	0.07	0.03	0.03	0.02	0.07	0.03	0.03	0.01	0.00	0.02	0.05	0.07	0.03	0.02
C5	0.01	0.01	0.03	0.07	0.00	0.04	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.08	0.01	0.23	0.01	0.28	0.41	0.31
C5'	0.03	0.06	0.02	0.02	0.08	0.01	0.12	0.00	0.12	0.14	0.10	0.04	0.05	0.15	0.09	0.03	0.02	0.02	0.01	0.14	0.05	0.01	0.01
C6	0.01	0.01	0.04	0.08	0.01	0.04	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.10	0.02	0.23	0.01	0.30	0.44	0.34
C8	0.00	0.01	0.04	0.08	0.00	0.07	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.09	0.02	0.23	0.02	0.26	0.34	0.29
N1	0.02	0.01	0.05	0.07	0.01	0.03	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.09	0.02	0.21	0.01	0.25	0.40	0.30
N2	0.02	0.01	0.07	0.08	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.11	0.03	0.16	0.02	0.16	0.33	0.23
N3	0.01	0.00	0.06	0.06	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.09	0.07	0.02	0.15	0.01	0.15	0.29	0.21
N7	0.00	0.01	0.04	0.09	0.00	0.07	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.11	0.01	0.25	0.02	0.32	0.43	0.35
N9	0.00	0.01	0.02	0.04	0.00	0.03	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.04	0.01	0.17	0.01	0.17	0.26	0.21
O2'	0.02	0.09	0.00	0.02	0.05	0.03	0.04	0.03	0.05	0.03	0.07	0.12	0.09	0.03	0.02	0.00	0.04	0.03	0.05	0.05	0.10	0.10	0.05
O3'	0.02	0.08	0.02	0.01	0.05	0.01	0.08	0.02	0.10	0.09	0.09	0.11	0.07	0.11	0.04	0.04	0.00	0.01	0.05	0.12	0.18	0.13	0.10
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.06	0.02	0.06	0.12	0.09
O5'	0.10	0.17	0.08	0.05	0.18	0.02	0.23	0.01	0.23	0.23	0.21	0.16	0.15	0.25	0.17	0.05	0.05	0.06	0.00	0.25	0.01	0.01	0.01
O6	0.02	0.02	0.05	0.09	0.01	0.05	0.01	0.14	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.05	0.12	0.02	0.25	0.00	0.35	0.49	0.37
OP1	0.09	0.19	0.12	0.13	0.20	0.07	0.28	0.05	0.30	0.26	0.25	0.16	0.15	0.32	0.17	0.10	0.18	0.06	0.01	0.35	0.00	0.01	0.01
OP2	0.15	0.34	0.13	0.10	0.32	0.03	0.41	0.01	0.44	0.34	0.40	0.33	0.29	0.43	0.26	0.10	0.13	0.12	0.01	0.49	0.01	0.00	0.00
P	0.11	0.25	0.09	0.08	0.24	0.02	0.31	0.01	0.34	0.29	0.30	0.23	0.21	0.35	0.21	0.05	0.10	0.09	0.01	0.37	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.21	0.10	0.15	0.14	0.15	0.20	0.16	0.25	0.10	0.25	0.09	0.14	0.12	0.24	0.21	0.19	0.17	0.26	0.60	0.09	0.32	0.33	0.41
C2	0.16	0.12	0.12	0.13	0.13	0.15	0.15	0.23	0.10	0.20	0.10	0.16	0.11	0.20	0.16	0.16	0.15	0.19	0.67	0.11	0.39	0.41	0.48
C2'	0.16	0.09	0.12	0.17	0.11	0.19	0.12	0.27	0.09	0.20	0.08	0.12	0.08	0.19	0.16	0.15	0.20	0.21	0.66	0.10	0.38	0.38	0.47
C3'	0.18	0.12	0.11	0.14	0.12	0.16	0.11	0.22	0.08	0.18	0.11	0.15	0.12	0.16	0.16	0.17	0.18	0.22	0.61	0.08	0.34	0.32	0.42
C4	0.24	0.15	0.17	0.14	0.19	0.20	0.19	0.24	0.13	0.26	0.14	0.18	0.17	0.24	0.23	0.22	0.16	0.28	0.61	0.10	0.33	0.35	0.43
C4'	0.23	0.10	0.15	0.12	0.15	0.20	0.15	0.23	0.09	0.25	0.08	0.12	0.12	0.22	0.21	0.20	0.15	0.28	0.55	0.07	0.28	0.26	0.35
C5	0.31	0.21	0.22	0.17	0.25	0.24	0.23	0.26	0.18	0.31	0.19	0.22	0.24	0.28	0.29	0.27	0.19	0.34	0.58	0.14	0.33	0.33	0.41
C5'	0.33	0.20	0.23	0.15	0.26	0.27	0.24	0.27	0.19	0.34	0.18	0.21	0.23	0.30	0.31	0.29	0.11	0.38	0.43	0.16	0.24	0.17	0.23
C6	0.32	0.25	0.23	0.18	0.28	0.24	0.26	0.25	0.21	0.31	0.23	0.26	0.27	0.29	0.31	0.29	0.19	0.34	0.59	0.17	0.35	0.36	0.42
C8	0.32	0.19	0.23	0.18	0.25	0.26	0.23	0.28	0.17	0.32	0.17	0.20	0.22	0.29	0.30	0.28	0.20	0.37	0.54	0.13	0.31	0.29	0.37
N1	0.23	0.20	0.17	0.14	0.20	0.18	0.19	0.23	0.16	0.24	0.18	0.22	0.20	0.23	0.22	0.22	0.16	0.24	0.65	0.11	0.38	0.41	0.47
N2	0.10	0.08	0.08	0.14	0.09	0.15	0.14	0.23	0.12	0.17	0.07	0.14	0.06	0.20	0.12	0.10	0.15	0.14	0.71	0.19	0.43	0.44	0.51
N3	0.17	0.11	0.12	0.12	0.13	0.16	0.15	0.23	0.10	0.21	0.09	0.15	0.11	0.21	0.17	0.16	0.15	0.21	0.65	0.10	0.36	0.38	0.46
N7	0.36	0.23	0.26	0.20	0.28	0.28	0.26	0.29	0.20	0.35	0.21	0.24	0.27	0.31	0.33	0.31	0.21	0.40	0.53	0.17	0.32	0.30	0.37
N9	0.26	0.15	0.18	0.15	0.19	0.22	0.19	0.26	0.13	0.28	0.13	0.17	0.17	0.25	0.24	0.22	0.17	0.30	0.59	0.10	0.31	0.32	0.40
O2'	0.18	0.13	0.16	0.21	0.16	0.23	0.18	0.31	0.17	0.23	0.14	0.14	0.13	0.23	0.19	0.16	0.23	0.23	0.69	0.19	0.42	0.42	0.51
O3'	0.15	0.13	0.11	0.17	0.11	0.17	0.11	0.25	0.11	0.16	0.13	0.17	0.11	0.15	0.13	0.15	0.21	0.19	0.66	0.12	0.37	0.34	0.45
O4'	0.26	0.13	0.18	0.14	0.19	0.23	0.20	0.27	0.14	0.29	0.12	0.16	0.15	0.27	0.25	0.22	0.16	0.31	0.56	0.12	0.27	0.28	0.36
O5'	0.44	0.35	0.33	0.21	0.38	0.35	0.35	0.30	0.32	0.42	0.33	0.36	0.37	0.38	0.42	0.40	0.14	0.48	0.36	0.29	0.25	0.14	0.15
O6	0.40	0.32	0.30	0.22	0.35	0.29	0.32	0.27	0.28	0.38	0.29	0.32	0.35	0.34	0.38	0.35	0.23	0.42	0.56	0.24	0.35	0.35	0.41
OP1	0.53	0.41	0.41	0.30	0.45	0.42	0.42	0.36	0.37	0.49	0.38	0.41	0.44	0.44	0.49	0.49	0.23	0.56	0.34	0.34	0.35	0.25	0.17
OP2	0.68	0.61	0.55	0.42	0.62	0.54	0.59	0.44	0.56	0.62	0.58	0.62	0.63	0.58	0.64	0.64	0.34	0.70	0.38	0.54	0.39	0.34	0.25
P	0.58	0.48	0.46	0.34	0.51	0.47	0.48	0.41	0.44	0.54	0.45	0.48	0.51	0.50	0.55	0.53	0.26	0.62	0.34	0.42	0.35	0.24	0.17

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.03	0.04	0.03	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.20	0.03	0.10	0.51	0.12
C2	0.03	0.00	0.09	0.08	0.01	0.03	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.11	0.03	0.48	0.01	0.27	0.24	0.20
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.04	0.01	0.03	0.01	0.05	0.06	0.07	0.11	0.09	0.05	0.02	0.00	0.03	0.01	0.30	0.05	0.36	0.21	0.11
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.04	0.00	0.07	0.02	0.06	0.13	0.06	0.10	0.07	0.12	0.06	0.02	0.01	0.01	0.37	0.07	0.52	0.08	0.27
C4	0.01	0.01	0.04	0.04	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.05	0.01	0.50	0.02	0.24	0.26	0.19
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.04	0.08	0.03	0.05	0.03	0.07	0.03	0.04	0.02	0.00	0.01	0.05	0.18	0.45	0.10
C5	0.01	0.01	0.03	0.07	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.09	0.01	0.63	0.02	0.31	0.22	0.33
C5'	0.02	0.04	0.01	0.02	0.05	0.01	0.09	0.00	0.09	0.12	0.06	0.03	0.03	0.13	0.06	0.03	0.03	0.02	0.00	0.11	0.23	0.38	0.01
C6	0.02	0.00	0.05	0.06	0.01	0.04	0.01	0.09	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.08	0.08	0.02	0.66	0.01	0.35	0.25	0.38
C8	0.00	0.01	0.06	0.13	0.00	0.08	0.00	0.12	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.03	0.15	0.03	0.61	0.02	0.25	0.27	0.27
N1	0.03	0.00	0.07	0.06	0.01	0.03	0.01	0.06	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.11	0.09	0.02	0.59	0.01	0.33	0.23	0.31
N2	0.04	0.01	0.11	0.10	0.01	0.05	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.16	0.16	0.04	0.43	0.02	0.27	0.25	0.17
N3	0.03	0.01	0.09	0.07	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.11	0.03	0.41	0.02	0.23	0.28	0.13
N7	0.00	0.01	0.05	0.12	0.00	0.07	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.15	0.02	0.70	0.02	0.33	0.23	0.40
N9	0.00	0.01	0.02	0.06	0.01	0.03	0.01	0.06	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.06	0.01	0.45	0.02	0.19	0.35	0.13
O2'	0.01	0.13	0.00	0.02	0.07	0.04	0.05	0.03	0.08	0.03	0.11	0.16	0.12	0.03	0.02	0.00	0.06	0.04	0.11	0.08	0.28	0.33	0.05
O3'	0.02	0.11	0.03	0.01	0.05	0.02	0.09	0.03	0.08	0.15	0.09	0.16	0.11	0.15	0.06	0.06	0.00	0.02	0.28	0.10	0.67	0.20	0.35
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.04	0.03	0.02	0.01	0.04	0.02	0.00	0.02	0.03	0.07	0.73	0.30
O5'	0.20	0.48	0.30	0.37	0.50	0.01	0.63	0.00	0.66	0.61	0.59	0.43	0.41	0.70	0.45	0.11	0.28	0.02	0.00	0.72	0.02	0.01	0.00
O6	0.03	0.01	0.05	0.07	0.02	0.05	0.02	0.11	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.08	0.10	0.03	0.72	0.00	0.39	0.32	0.47
OP1	0.10	0.27	0.36	0.52	0.24	0.18	0.31	0.23	0.35	0.25	0.33	0.27	0.23	0.33	0.19	0.28	0.67	0.07	0.02	0.39	0.00	0.01	0.00
OP2	0.51	0.24	0.21	0.08	0.26	0.45	0.22	0.38	0.25	0.27	0.23	0.25	0.28	0.23	0.35	0.33	0.20	0.73	0.01	0.32	0.01	0.00	0.00
P	0.12	0.20	0.11	0.27	0.19	0.10	0.33	0.01	0.38	0.27	0.31	0.17	0.13	0.40	0.13	0.05	0.35	0.30	0.00	0.47	0.00	0.00	0.00