Doublet Group distance statistics: 50650

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.002, 0.004, 0.006, 0.005 max_d=0.005 avg_d=0.004 std_dev=0.002
C6	A	0, 0.003, 0.006, 0.010, 0.009 max_d=0.009 avg_d=0.006 std_dev=0.004
C1'	A	0, 0.001, 0.006, 0.010, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.006 std_dev=0.004
C5	A	0, 0.002, 0.007, 0.012, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.007 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.003, 0.009, 0.014, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.009 std_dev=0.006
N3	A	0, 0.004, 0.010, 0.016, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.010 std_dev=0.006
N2	A	0, 0.005, 0.011, 0.017, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.011 std_dev=0.006
C4	A	0, 0.003, 0.009, 0.016, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.009 std_dev=0.007
N9	A	0, 0.005, 0.012, 0.019, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.012 std_dev=0.007
C8	A	0, 0.003, 0.011, 0.018, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.011 std_dev=0.008
N7	A	0, 0.001, 0.009, 0.016, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.009 std_dev=0.008
O6	A	0, 0.008, 0.019, 0.030, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.019 std_dev=0.011
C4'	B	0, 0.242, 0.572, 0.902, 0.777 max_d=0.777 avg_d=0.572 std_dev=0.330
C3'	B	0, 0.193, 0.588, 0.984, 0.959 max_d=0.959 avg_d=0.588 std_dev=0.395
O2'	A	0, 0.156, 0.557, 0.958, 0.943 max_d=0.943 avg_d=0.557 std_dev=0.401
N1	B	0, 0.160, 0.565, 0.969, 0.951 max_d=0.951 avg_d=0.565 std_dev=0.405
O3'	B	0, 0.235, 0.645, 1.055, 1.140 max_d=1.140 avg_d=0.645 std_dev=0.410
O4'	B	0, 0.262, 0.674, 1.086, 1.022 max_d=1.022 avg_d=0.674 std_dev=0.412
O4'	A	0, 0.116, 0.543, 0.970, 0.964 max_d=0.964 avg_d=0.543 std_dev=0.427
C2'	A	0, 0.118, 0.552, 0.986, 0.981 max_d=0.981 avg_d=0.552 std_dev=0.434
C5'	B	0, 0.298, 0.781, 1.264, 1.324 max_d=1.324 avg_d=0.781 std_dev=0.483
C4	B	0, 0.193, 0.682, 1.172, 1.148 max_d=1.148 avg_d=0.682 std_dev=0.489
C1'	B	0, 0.248, 0.776, 1.304, 1.271 max_d=1.271 avg_d=0.776 std_dev=0.528
N3	B	0, 0.235, 0.765, 1.296, 1.265 max_d=1.265 avg_d=0.765 std_dev=0.531
C2	B	0, 0.224, 0.797, 1.370, 1.348 max_d=1.348 avg_d=0.797 std_dev=0.573
C2'	B	0, 0.318, 0.939, 1.561, 1.505 max_d=1.505 avg_d=0.939 std_dev=0.622
C6	B	0, 0.128, 0.760, 1.393, 1.394 max_d=1.394 avg_d=0.760 std_dev=0.633
N9	B	0, 0.206, 0.839, 1.473, 1.456 max_d=1.456 avg_d=0.839 std_dev=0.634
C4'	A	0, 0.174, 0.844, 1.515, 1.508 max_d=1.508 avg_d=0.844 std_dev=0.670
C3'	A	0, 0.184, 0.896, 1.609, 1.602 max_d=1.602 avg_d=0.896 std_dev=0.713
C5	B	0, 0.149, 0.895, 1.642, 1.639 max_d=1.639 avg_d=0.895 std_dev=0.746
O2'	B	0, 0.507, 1.315, 2.123, 1.979 max_d=1.979 avg_d=1.315 std_dev=0.808
O6	B	0, 0.121, 0.993, 1.865, 1.873 max_d=1.873 avg_d=0.993 std_dev=0.872
N2	B	0, 0.291, 1.245, 2.200, 2.181 max_d=2.181 avg_d=1.245 std_dev=0.954
O5'	A	0, 0.351, 1.355, 2.360, 2.328 max_d=2.328 avg_d=1.355 std_dev=1.005
O3'	A	0, 0.249, 1.267, 2.286, 2.278 max_d=2.278 avg_d=1.267 std_dev=1.018
C8	B	0, 0.171, 1.251, 2.330, 2.324 max_d=2.324 avg_d=1.251 std_dev=1.079
O5'	B	0, 0.437, 1.521, 2.605, 2.561 max_d=2.561 avg_d=1.521 std_dev=1.084
C5'	A	0, 0.302, 1.401, 2.500, 2.483 max_d=2.483 avg_d=1.401 std_dev=1.099
OP1	B	0, 0.469, 1.633, 2.797, 2.750 max_d=2.750 avg_d=1.633 std_dev=1.164
N7	B	0, 0.141, 1.336, 2.531, 2.532 max_d=2.532 avg_d=1.336 std_dev=1.195
OP1	A	0, 0.138, 1.385, 2.633, 2.630 max_d=2.630 avg_d=1.385 std_dev=1.247
P	B	0, 0.187, 1.475, 2.763, 2.768 max_d=2.768 avg_d=1.475 std_dev=1.288
P	A	0, 0.210, 1.507, 2.804, 2.798 max_d=2.798 avg_d=1.507 std_dev=1.297
OP2	B	0, 0.511, 1.956, 3.400, 3.351 max_d=3.351 avg_d=1.956 std_dev=1.444
OP2	A	0, 0.158, 1.830, 3.503, 3.501 max_d=3.501 avg_d=1.830 std_dev=1.673

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.04	0.00	0.43	0.29	0.06
C2	0.01	0.00	0.21	0.35	0.00	0.17	0.00	0.23	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.44	0.01	0.29	0.00	0.79	0.56	0.16
C2'	0.00	0.21	0.00	0.00	0.10	0.00	0.04	0.01	0.08	0.10	0.15	0.26	0.22	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.06	0.17	0.27	0.09
C3'	0.01	0.35	0.00	0.00	0.19	0.01	0.12	0.02	0.19	0.11	0.29	0.41	0.32	0.03	0.04	0.01	0.00	0.00	0.08	0.16	0.10	0.14	0.10
C4	0.01	0.00	0.10	0.19	0.00	0.10	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.22	0.00	0.20	0.00	0.75	0.60	0.08
C4'	0.00	0.17	0.00	0.01	0.10	0.00	0.08	0.00	0.12	0.04	0.15	0.20	0.15	0.01	0.02	0.05	0.02	0.00	0.01	0.11	0.03	0.15	0.05
C5	0.00	0.00	0.04	0.12	0.00	0.08	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.15	0.00	0.20	0.00	0.87	0.80	0.08
C5'	0.01	0.23	0.01	0.02	0.14	0.00	0.13	0.00	0.18	0.04	0.22	0.26	0.19	0.06	0.05	0.04	0.04	0.01	0.00	0.18	0.21	0.40	0.01
C6	0.00	0.00	0.08	0.19	0.00	0.12	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.24	0.01	0.25	0.00	0.92	0.82	0.14
C8	0.00	0.00	0.10	0.11	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.11	0.01	0.07	0.01	0.74	0.79	0.08
N1	0.01	0.00	0.15	0.29	0.00	0.15	0.00	0.22	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.37	0.01	0.29	0.00	0.88	0.70	0.17
N2	0.01	0.00	0.26	0.41	0.00	0.20	0.00	0.26	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.10	0.54	0.01	0.31	0.00	0.77	0.49	0.19
N3	0.01	0.00	0.22	0.32	0.00	0.15	0.00	0.19	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.38	0.01	0.25	0.00	0.71	0.49	0.12
N7	0.00	0.00	0.06	0.03	0.00	0.01	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.03	0.01	0.11	0.01	0.88	0.94	0.02
N9	0.01	0.00	0.01	0.04	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.03	0.00	0.10	0.01	0.64	0.55	0.03
O2'	0.01	0.07	0.00	0.01	0.03	0.05	0.03	0.04	0.03	0.05	0.05	0.10	0.07	0.05	0.02	0.00	0.02	0.06	0.02	0.04	0.15	0.05	0.04
O3'	0.01	0.44	0.01	0.00	0.22	0.02	0.15	0.04	0.24	0.11	0.37	0.54	0.38	0.03	0.03	0.02	0.00	0.01	0.11	0.21	0.32	0.03	0.10
O4'	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.06	0.01	0.00	0.04	0.01	0.34	0.09	0.07
O5'	0.04	0.29	0.04	0.08	0.20	0.01	0.20	0.00	0.25	0.07	0.29	0.31	0.25	0.11	0.10	0.02	0.11	0.04	0.00	0.25	0.01	0.02	0.01
O6	0.00	0.00	0.06	0.16	0.00	0.11	0.00	0.18	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.21	0.01	0.25	0.00	0.98	0.92	0.14
OP1	0.43	0.79	0.17	0.10	0.75	0.03	0.87	0.21	0.92	0.74	0.88	0.77	0.71	0.88	0.64	0.15	0.32	0.34	0.01	0.98	0.00	0.01	0.00
OP2	0.29	0.56	0.27	0.14	0.60	0.15	0.80	0.40	0.82	0.79	0.70	0.49	0.49	0.94	0.55	0.05	0.03	0.09	0.02	0.92	0.01	0.00	0.00
P	0.06	0.16	0.09	0.10	0.08	0.05	0.08	0.01	0.14	0.08	0.17	0.19	0.12	0.02	0.03	0.04	0.10	0.07	0.01	0.14	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.30	0.12	0.16	0.22	0.32	0.33	0.44	0.39	0.43	0.49	0.24	0.12	0.16	0.55	0.37	0.37	0.28	0.40	0.38	0.54	0.16	0.93	0.34
C2	0.13	0.05	0.08	0.18	0.14	0.25	0.23	0.34	0.23	0.25	0.09	0.15	0.05	0.30	0.17	0.59	0.24	0.28	0.30	0.34	0.39	1.01	0.49
C2'	0.25	0.05	0.07	0.18	0.30	0.30	0.48	0.37	0.48	0.54	0.24	0.21	0.09	0.62	0.36	0.54	0.31	0.38	0.36	0.66	0.19	0.93	0.34
C3'	0.36	0.08	0.20	0.28	0.43	0.38	0.68	0.46	0.67	0.77	0.33	0.28	0.14	0.88	0.52	0.44	0.23	0.46	0.44	0.90	0.08	0.83	0.23
C4	0.25	0.08	0.11	0.22	0.28	0.31	0.41	0.38	0.41	0.44	0.21	0.17	0.12	0.51	0.33	0.44	0.27	0.37	0.36	0.54	0.21	0.95	0.37
C4'	0.41	0.12	0.30	0.32	0.44	0.40	0.65	0.47	0.62	0.75	0.32	0.22	0.19	0.84	0.53	0.28	0.22	0.48	0.44	0.80	0.07	0.84	0.23
C5	0.28	0.08	0.14	0.23	0.31	0.32	0.47	0.39	0.47	0.50	0.24	0.23	0.13	0.57	0.37	0.41	0.27	0.38	0.37	0.61	0.14	0.93	0.34
C5'	0.52	0.16	0.45	0.42	0.56	0.49	0.80	0.54	0.76	0.94	0.40	0.27	0.24	1.03	0.67	0.13	0.16	0.56	0.51	0.96	0.19	0.75	0.12
C6	0.21	0.06	0.08	0.21	0.25	0.29	0.41	0.37	0.43	0.43	0.18	0.29	0.08	0.50	0.30	0.49	0.26	0.34	0.34	0.59	0.21	0.96	0.39
C8	0.37	0.13	0.25	0.25	0.40	0.36	0.55	0.42	0.53	0.61	0.30	0.18	0.19	0.67	0.46	0.28	0.29	0.44	0.41	0.66	0.05	0.87	0.25
N1	0.13	0.07	0.07	0.18	0.15	0.26	0.26	0.35	0.27	0.28	0.09	0.22	0.05	0.34	0.19	0.58	0.24	0.29	0.30	0.42	0.35	1.01	0.47
N2	0.06	0.06	0.14	0.16	0.06	0.22	0.11	0.32	0.11	0.13	0.04	0.12	0.05	0.16	0.08	0.66	0.23	0.23	0.26	0.18	0.51	1.04	0.56
N3	0.18	0.06	0.06	0.20	0.20	0.28	0.31	0.36	0.31	0.34	0.15	0.13	0.09	0.39	0.24	0.53	0.25	0.32	0.33	0.42	0.32	0.99	0.44
N7	0.36	0.11	0.24	0.25	0.40	0.36	0.56	0.41	0.55	0.62	0.30	0.24	0.18	0.68	0.46	0.29	0.29	0.44	0.41	0.68	0.05	0.87	0.25
N9	0.31	0.12	0.18	0.23	0.34	0.34	0.47	0.40	0.46	0.52	0.26	0.14	0.17	0.58	0.39	0.36	0.28	0.41	0.39	0.58	0.13	0.91	0.32
O2'	0.18	0.03	0.04	0.12	0.21	0.24	0.35	0.31	0.34	0.39	0.16	0.17	0.06	0.46	0.26	0.59	0.35	0.31	0.30	0.48	0.31	1.01	0.44
O3'	0.37	0.07	0.19	0.30	0.46	0.40	0.74	0.49	0.73	0.84	0.36	0.30	0.13	0.98	0.55	0.48	0.20	0.49	0.46	1.00	0.10	0.78	0.19
O4'	0.36	0.12	0.26	0.27	0.37	0.35	0.51	0.41	0.48	0.59	0.26	0.16	0.18	0.65	0.44	0.26	0.27	0.42	0.39	0.61	0.09	0.91	0.30
O5'	0.58	0.20	0.51	0.47	0.63	0.53	0.90	0.59	0.85	1.04	0.47	0.29	0.29	1.15	0.75	0.10	0.14	0.61	0.56	1.07	0.29	0.68	0.05
O6	0.22	0.09	0.09	0.21	0.27	0.30	0.47	0.38	0.51	0.47	0.20	0.42	0.06	0.56	0.32	0.48	0.26	0.35	0.34	0.66	0.16	0.95	0.36
OP1	1.44	1.04	1.37	1.23	1.48	1.32	1.71	1.37	1.63	1.86	1.28	0.61	1.14	1.93	1.60	0.85	0.72	1.43	1.36	1.78	1.22	0.30	0.85
OP2	0.63	1.08	0.63	0.74	0.59	0.73	0.28	0.67	0.32	0.12	0.75	1.55	0.98	0.03	0.45	1.15	1.24	0.65	0.74	0.06	0.84	1.89	1.23
P	0.57	0.10	0.56	0.45	0.59	0.49	0.87	0.53	0.80	1.05	0.38	0.39	0.21	1.14	0.74	0.05	0.18	0.55	0.49	1.01	0.32	0.73	0.06

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.07	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.28	0.00	0.13	0.01	0.15	1.16	0.53
C2	0.01	0.00	0.22	0.08	0.00	0.12	0.00	0.21	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.63	0.56	0.23	0.25	0.01	0.20	0.99	0.38
C2'	0.00	0.22	0.00	0.00	0.11	0.01	0.04	0.18	0.09	0.15	0.17	0.28	0.22	0.09	0.01	0.00	0.03	0.01	0.20	0.07	0.05	1.10	0.42
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.08	0.00	0.22	0.00	0.17	0.42	0.03	0.19	0.10	0.39	0.19	0.02	0.01	0.02	0.19	0.22	0.43	0.55	0.12
C4	0.00	0.00	0.11	0.08	0.00	0.10	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.41	0.27	0.11	0.09	0.00	0.40	1.31	0.67
C4'	0.00	0.12	0.01	0.00	0.10	0.00	0.10	0.00	0.12	0.06	0.13	0.12	0.11	0.09	0.06	0.26	0.02	0.00	0.00	0.12	0.30	0.51	0.09
C5	0.00	0.00	0.04	0.22	0.00	0.10	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.37	0.09	0.05	0.19	0.00	0.68	1.54	0.91
C5'	0.07	0.21	0.18	0.00	0.11	0.00	0.10	0.00	0.14	0.11	0.19	0.24	0.17	0.06	0.05	0.09	0.19	0.01	0.01	0.13	0.22	0.26	0.01
C6	0.00	0.00	0.09	0.17	0.00	0.12	0.00	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.47	0.16	0.10	0.12	0.00	0.66	1.43	0.83
C8	0.01	0.00	0.15	0.42	0.00	0.06	0.01	0.11	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.31	0.14	0.49	0.01	0.85	1.89	1.19
N1	0.01	0.00	0.17	0.03	0.00	0.13	0.00	0.19	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.58	0.38	0.18	0.16	0.01	0.41	1.17	0.58
N2	0.01	0.00	0.28	0.19	0.00	0.12	0.00	0.24	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.70	0.74	0.27	0.38	0.01	0.09	0.80	0.20
N3	0.01	0.00	0.22	0.10	0.00	0.11	0.00	0.17	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.57	0.55	0.22	0.22	0.00	0.15	1.01	0.37
N7	0.00	0.00	0.09	0.39	0.00	0.09	0.00	0.06	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.18	0.27	0.07	0.42	0.01	0.95	1.86	1.21
N9	0.01	0.00	0.01	0.19	0.00	0.06	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.18	0.10	0.01	0.22	0.00	0.46	1.47	0.80
O2'	0.01	0.63	0.00	0.02	0.41	0.26	0.37	0.09	0.47	0.07	0.58	0.70	0.57	0.18	0.18	0.00	0.03	0.18	0.24	0.45	0.49	0.79	0.03
O3'	0.28	0.56	0.03	0.01	0.27	0.02	0.09	0.19	0.16	0.31	0.38	0.74	0.55	0.27	0.10	0.03	0.00	0.20	0.21	0.09	0.94	0.24	0.29
O4'	0.00	0.23	0.01	0.02	0.11	0.00	0.05	0.01	0.10	0.14	0.18	0.27	0.22	0.07	0.01	0.18	0.20	0.00	0.06	0.06	0.13	0.94	0.45
O5'	0.13	0.25	0.20	0.19	0.09	0.00	0.19	0.01	0.12	0.49	0.16	0.38	0.22	0.42	0.22	0.24	0.21	0.06	0.00	0.17	0.01	0.02	0.00
O6	0.01	0.01	0.07	0.22	0.00	0.12	0.00	0.13	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.45	0.09	0.06	0.17	0.00	0.82	1.52	0.95
OP1	0.15	0.20	0.05	0.43	0.40	0.30	0.68	0.22	0.66	0.85	0.41	0.09	0.15	0.95	0.46	0.49	0.94	0.13	0.01	0.82	0.00	0.00	0.00
OP2	1.16	0.99	1.10	0.55	1.31	0.51	1.54	0.26	1.43	1.89	1.17	0.80	1.01	1.86	1.47	0.79	0.24	0.94	0.02	1.52	0.00	0.00	0.00
P	0.53	0.38	0.42	0.12	0.67	0.09	0.91	0.01	0.83	1.19	0.58	0.20	0.37	1.21	0.80	0.03	0.29	0.45	0.00	0.95	0.00	0.00	0.00