Doublet Group distance statistics: 50653

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 5, 13, 24, 26, 19, 22, 12, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.006, 0.013, 0.020, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.013 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.006, 0.014, 0.023, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.014 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.011, 0.020, 0.030, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.020 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.008, 0.019, 0.030, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.019 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.011, 0.023, 0.035, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.023 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.012, 0.025, 0.037, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.025 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.013, 0.027, 0.042, 0.092 max_d=0.092 avg_d=0.027 std_dev=0.015
N9	A	0, 0.013, 0.028, 0.044, 0.090 max_d=0.090 avg_d=0.028 std_dev=0.016
N7	A	0, 0.013, 0.034, 0.055, 0.110 max_d=0.110 avg_d=0.034 std_dev=0.021
N6	A	0, 0.020, 0.041, 0.063, 0.154 max_d=0.154 avg_d=0.041 std_dev=0.021
C8	A	0, 0.015, 0.041, 0.067, 0.138 max_d=0.138 avg_d=0.041 std_dev=0.026
O4'	A	0, 0.030, 0.142, 0.255, 0.671 max_d=0.671 avg_d=0.142 std_dev=0.113
C2'	A	0, 0.051, 0.169, 0.286, 0.745 max_d=0.745 avg_d=0.169 std_dev=0.118
N3	B	0, 0.225, 0.375, 0.524, 0.770 max_d=0.770 avg_d=0.375 std_dev=0.149
C4	B	0, 0.272, 0.429, 0.586, 0.779 max_d=0.779 avg_d=0.429 std_dev=0.157
C2	B	0, 0.238, 0.398, 0.557, 0.900 max_d=0.900 avg_d=0.398 std_dev=0.159
C4'	A	0, 0.106, 0.274, 0.441, 1.113 max_d=1.113 avg_d=0.274 std_dev=0.168
O2'	A	0, 0.066, 0.240, 0.413, 1.348 max_d=1.348 avg_d=0.240 std_dev=0.174
O4	B	0, 0.324, 0.505, 0.687, 1.084 max_d=1.084 avg_d=0.505 std_dev=0.182
N1	B	0, 0.259, 0.446, 0.634, 0.844 max_d=0.844 avg_d=0.446 std_dev=0.188
O2	B	0, 0.260, 0.448, 0.637, 1.289 max_d=1.289 avg_d=0.448 std_dev=0.188
C5	B	0, 0.285, 0.482, 0.679, 0.970 max_d=0.970 avg_d=0.482 std_dev=0.197
C3'	A	0, 0.054, 0.253, 0.453, 1.251 max_d=1.251 avg_d=0.253 std_dev=0.200
C6	B	0, 0.276, 0.486, 0.695, 0.951 max_d=0.951 avg_d=0.486 std_dev=0.209
C1'	B	0, 0.314, 0.545, 0.776, 1.137 max_d=1.137 avg_d=0.545 std_dev=0.231
O4'	B	0, 0.347, 0.615, 0.883, 1.298 max_d=1.298 avg_d=0.615 std_dev=0.268
C2'	B	0, 0.345, 0.635, 0.925, 1.459 max_d=1.459 avg_d=0.635 std_dev=0.290
O3'	A	0, 0.089, 0.400, 0.710, 2.698 max_d=2.698 avg_d=0.400 std_dev=0.310
C4'	B	0, 0.369, 0.685, 1.001, 1.713 max_d=1.713 avg_d=0.685 std_dev=0.316
C5'	A	0, 0.260, 0.580, 0.899, 2.296 max_d=2.296 avg_d=0.580 std_dev=0.319
C3'	B	0, 0.349, 0.682, 1.015, 1.712 max_d=1.712 avg_d=0.682 std_dev=0.333
O5'	B	0, 0.339, 0.679, 1.018, 2.453 max_d=2.453 avg_d=0.679 std_dev=0.340
O2'	B	0, 0.393, 0.748, 1.103, 1.795 max_d=1.795 avg_d=0.748 std_dev=0.355
C5'	B	0, 0.343, 0.699, 1.054, 1.792 max_d=1.792 avg_d=0.699 std_dev=0.355
O5'	A	0, 0.360, 0.721, 1.082, 2.907 max_d=2.907 avg_d=0.721 std_dev=0.361
P	B	0, 0.393, 0.781, 1.170, 2.434 max_d=2.434 avg_d=0.781 std_dev=0.389
O3'	B	0, 0.390, 0.831, 1.273, 2.602 max_d=2.602 avg_d=0.831 std_dev=0.442
OP1	B	0, 0.483, 0.983, 1.482, 3.593 max_d=3.593 avg_d=0.983 std_dev=0.499
OP2	B	0, 0.373, 0.889, 1.404, 4.533 max_d=4.533 avg_d=0.889 std_dev=0.515
P	A	0, 0.581, 1.102, 1.623, 4.688 max_d=4.688 avg_d=1.102 std_dev=0.521
OP2	A	0, 0.789, 1.371, 1.954, 3.446 max_d=3.446 avg_d=1.371 std_dev=0.582
OP1	A	0, 0.650, 1.360, 2.070, 6.650 max_d=6.650 avg_d=1.360 std_dev=0.710

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.07	0.00	0.12	0.26	0.21	0.14
C2	0.02	0.00	0.12	0.15	0.01	0.06	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.13	0.19	0.03	0.29	0.46	0.34	0.28
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.07	0.01	0.06	0.06	0.08	0.06	0.10	0.12	0.08	0.06	0.03	0.00	0.02	0.01	0.16	0.23	0.17	0.12
C3'	0.01	0.15	0.00	0.00	0.10	0.00	0.11	0.03	0.13	0.11	0.15	0.13	0.14	0.11	0.06	0.02	0.01	0.01	0.22	0.27	0.18	0.18
C4	0.01	0.01	0.07	0.10	0.00	0.04	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.09	0.11	0.02	0.29	0.42	0.31	0.26
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.07	0.06	0.06	0.07	0.07	0.03	0.08	0.02	0.00	0.02	0.15	0.19	0.06
C5	0.01	0.01	0.06	0.11	0.00	0.06	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.09	0.12	0.02	0.36	0.49	0.40	0.32
C5'	0.04	0.11	0.06	0.03	0.10	0.01	0.13	0.00	0.14	0.13	0.13	0.09	0.16	0.15	0.09	0.05	0.06	0.01	0.01	0.15	0.22	0.02
C6	0.01	0.01	0.08	0.13	0.01	0.06	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.16	0.03	0.37	0.53	0.44	0.36
C8	0.02	0.01	0.06	0.11	0.00	0.07	0.01	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.06	0.11	0.04	0.34	0.42	0.34	0.28
N1	0.02	0.01	0.10	0.15	0.01	0.06	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.18	0.03	0.34	0.51	0.40	0.33
N3	0.02	0.00	0.12	0.13	0.00	0.06	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.16	0.03	0.25	0.40	0.29	0.24
N6	0.02	0.01	0.08	0.14	0.01	0.07	0.01	0.16	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.12	0.17	0.04	0.40	0.57	0.50	0.40
N7	0.01	0.01	0.06	0.11	0.01	0.07	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.08	0.13	0.04	0.39	0.49	0.43	0.34
N9	0.01	0.01	0.03	0.06	0.00	0.03	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.05	0.06	0.01	0.25	0.36	0.26	0.21
O2'	0.02	0.13	0.00	0.02	0.09	0.08	0.09	0.05	0.11	0.06	0.13	0.11	0.12	0.08	0.05	0.00	0.05	0.05	0.08	0.20	0.18	0.09
O3'	0.07	0.19	0.02	0.01	0.11	0.02	0.12	0.06	0.16	0.11	0.18	0.16	0.17	0.13	0.06	0.05	0.00	0.06	0.20	0.38	0.23	0.23
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.03	0.04	0.04	0.01	0.05	0.06	0.00	0.07	0.26	0.27	0.17
O5'	0.12	0.29	0.16	0.22	0.29	0.02	0.36	0.01	0.37	0.34	0.34	0.25	0.40	0.39	0.25	0.08	0.20	0.07	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.26	0.46	0.23	0.27	0.42	0.15	0.49	0.15	0.53	0.42	0.51	0.40	0.57	0.49	0.36	0.20	0.38	0.26	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.21	0.34	0.17	0.18	0.31	0.19	0.40	0.22	0.44	0.34	0.40	0.29	0.50	0.43	0.26	0.18	0.23	0.27	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.14	0.28	0.12	0.18	0.26	0.06	0.32	0.02	0.36	0.28	0.33	0.24	0.40	0.34	0.21	0.09	0.23	0.17	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.16	0.12	0.22	0.22	0.12	0.17	0.11	0.17	0.11	0.12	0.10	0.16	0.25	0.26	0.16	0.16	0.23	0.28	0.35	0.25
C2	0.15	0.11	0.19	0.19	0.12	0.15	0.10	0.16	0.10	0.11	0.10	0.15	0.21	0.21	0.15	0.14	0.22	0.25	0.33	0.23
C2'	0.22	0.18	0.27	0.26	0.17	0.23	0.16	0.22	0.16	0.18	0.16	0.21	0.31	0.31	0.19	0.21	0.23	0.27	0.31	0.22
C3'	0.25	0.22	0.29	0.28	0.20	0.25	0.20	0.24	0.20	0.22	0.20	0.24	0.33	0.31	0.22	0.25	0.25	0.28	0.32	0.24
C4	0.14	0.11	0.20	0.20	0.11	0.15	0.11	0.16	0.10	0.11	0.10	0.15	0.22	0.23	0.15	0.13	0.23	0.27	0.36	0.25
C4'	0.18	0.14	0.23	0.22	0.13	0.18	0.13	0.17	0.12	0.14	0.12	0.17	0.27	0.26	0.16	0.18	0.22	0.27	0.34	0.23
C5	0.13	0.12	0.19	0.20	0.12	0.14	0.12	0.16	0.10	0.11	0.10	0.15	0.20	0.23	0.15	0.12	0.24	0.29	0.39	0.27
C5'	0.20	0.17	0.23	0.22	0.18	0.19	0.18	0.18	0.17	0.17	0.16	0.19	0.27	0.26	0.20	0.20	0.22	0.26	0.36	0.24
C6	0.13	0.12	0.18	0.20	0.12	0.13	0.12	0.16	0.11	0.11	0.11	0.15	0.19	0.22	0.15	0.12	0.24	0.28	0.39	0.27
C8	0.13	0.11	0.20	0.21	0.12	0.14	0.12	0.16	0.10	0.11	0.10	0.15	0.22	0.24	0.16	0.13	0.24	0.29	0.39	0.27
N1	0.13	0.12	0.17	0.19	0.11	0.13	0.10	0.15	0.10	0.11	0.10	0.15	0.19	0.20	0.15	0.12	0.23	0.26	0.36	0.25
N3	0.15	0.11	0.20	0.20	0.11	0.16	0.10	0.16	0.10	0.12	0.10	0.15	0.23	0.23	0.15	0.15	0.22	0.26	0.33	0.24
N6	0.13	0.14	0.18	0.21	0.14	0.14	0.14	0.18	0.13	0.13	0.13	0.16	0.18	0.23	0.16	0.13	0.26	0.31	0.43	0.30
N7	0.13	0.12	0.19	0.21	0.12	0.14	0.12	0.16	0.11	0.11	0.11	0.15	0.20	0.24	0.16	0.12	0.25	0.30	0.41	0.29
N9	0.15	0.11	0.20	0.21	0.11	0.15	0.11	0.16	0.10	0.11	0.10	0.15	0.23	0.24	0.15	0.14	0.23	0.28	0.37	0.26
O2'	0.23	0.19	0.28	0.28	0.19	0.25	0.19	0.23	0.19	0.20	0.19	0.21	0.32	0.32	0.21	0.23	0.24	0.29	0.31	0.24
O3'	0.30	0.27	0.34	0.32	0.25	0.31	0.25	0.29	0.26	0.27	0.25	0.29	0.38	0.36	0.27	0.29	0.27	0.30	0.31	0.25
O4'	0.16	0.12	0.21	0.22	0.12	0.16	0.11	0.17	0.10	0.12	0.10	0.15	0.25	0.26	0.16	0.15	0.24	0.29	0.38	0.27
O5'	0.36	0.35	0.34	0.34	0.38	0.34	0.38	0.34	0.37	0.36	0.36	0.35	0.36	0.35	0.40	0.37	0.45	0.47	0.53	0.46
OP1	0.55	0.54	0.53	0.53	0.58	0.55	0.59	0.54	0.58	0.56	0.55	0.53	0.54	0.53	0.59	0.58	0.63	0.63	0.70	0.64
OP2	0.40	0.41	0.36	0.37	0.48	0.40	0.49	0.41	0.46	0.42	0.43	0.38	0.38	0.37	0.51	0.44	0.54	0.56	0.65	0.57
P	0.36	0.35	0.33	0.32	0.39	0.34	0.40	0.34	0.38	0.36	0.36	0.34	0.36	0.33	0.41	0.38	0.46	0.47	0.56	0.48

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.07	0.02	0.01	0.10	0.11	0.13	0.09
C2	0.02	0.00	0.06	0.09	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.08	0.09	0.01	0.03	0.18	0.19	0.26	0.18
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.05	0.01	0.06	0.04	0.06	0.02	0.05	0.11	0.00	0.02	0.06	0.01	0.13	0.18	0.17	0.13
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.13	0.00	0.15	0.03	0.13	0.08	0.11	0.11	0.02	0.01	0.14	0.01	0.12	0.18	0.14	0.11
C4	0.02	0.01	0.05	0.13	0.00	0.08	0.01	0.15	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.13	0.00	0.03	0.26	0.27	0.40	0.28
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.08	0.00	0.09	0.01	0.08	0.04	0.05	0.05	0.08	0.02	0.08	0.00	0.02	0.11	0.13	0.02
C5	0.02	0.01	0.06	0.15	0.01	0.09	0.00	0.16	0.00	0.01	0.01	0.02	0.08	0.16	0.01	0.04	0.28	0.27	0.39	0.29
C5'	0.03	0.08	0.04	0.03	0.15	0.01	0.16	0.00	0.14	0.08	0.11	0.07	0.05	0.06	0.16	0.01	0.01	0.15	0.18	0.01
C6	0.01	0.01	0.06	0.13	0.01	0.08	0.00	0.14	0.00	0.01	0.01	0.02	0.07	0.13	0.01	0.04	0.24	0.22	0.29	0.22
N1	0.01	0.01	0.02	0.08	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.06	0.01	0.02	0.17	0.17	0.22	0.16
N3	0.02	0.00	0.05	0.11	0.01	0.05	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01	0.09	0.10	0.01	0.03	0.22	0.23	0.34	0.24
O2	0.03	0.00	0.11	0.11	0.01	0.05	0.02	0.07	0.02	0.01	0.01	0.00	0.12	0.15	0.02	0.04	0.15	0.17	0.23	0.16
O2'	0.01	0.08	0.00	0.02	0.09	0.08	0.08	0.05	0.07	0.05	0.09	0.12	0.00	0.05	0.10	0.06	0.08	0.15	0.18	0.09
O3'	0.07	0.09	0.02	0.01	0.13	0.02	0.16	0.06	0.13	0.06	0.10	0.15	0.05	0.00	0.15	0.05	0.14	0.25	0.24	0.16
O4	0.02	0.01	0.06	0.14	0.00	0.08	0.01	0.16	0.01	0.01	0.01	0.02	0.10	0.15	0.00	0.04	0.28	0.30	0.45	0.32
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.03	0.04	0.06	0.05	0.04	0.00	0.09	0.12	0.13	0.10
O5'	0.10	0.18	0.13	0.12	0.26	0.02	0.28	0.01	0.24	0.17	0.22	0.15	0.08	0.14	0.28	0.09	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.11	0.19	0.18	0.18	0.27	0.11	0.27	0.15	0.22	0.17	0.23	0.17	0.15	0.25	0.30	0.12	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.13	0.26	0.17	0.14	0.40	0.13	0.39	0.18	0.29	0.22	0.34	0.23	0.18	0.24	0.45	0.13	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.18	0.13	0.11	0.28	0.02	0.29	0.01	0.22	0.16	0.24	0.16	0.09	0.16	0.32	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00