Doublet Group distance statistics: 50654

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 12, 8, 21, 12, 5, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.014, 0.021, 0.028, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.021 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.015, 0.027, 0.038, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.027 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.010, 0.022, 0.033, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.022 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.007, 0.020, 0.032, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.020 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.011, 0.025, 0.039, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.025 std_dev=0.014
N3	A	0, 0.013, 0.027, 0.041, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.027 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.017, 0.031, 0.046, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.031 std_dev=0.015
N9	A	0, 0.018, 0.038, 0.057, 0.092 max_d=0.092 avg_d=0.038 std_dev=0.019
N6	A	0, 0.040, 0.065, 0.090, 0.134 max_d=0.134 avg_d=0.065 std_dev=0.025
N7	A	0, 0.028, 0.053, 0.079, 0.143 max_d=0.143 avg_d=0.053 std_dev=0.026
C8	A	0, 0.031, 0.063, 0.094, 0.159 max_d=0.159 avg_d=0.063 std_dev=0.031
C2'	A	0, 0.087, 0.181, 0.275, 0.408 max_d=0.408 avg_d=0.181 std_dev=0.094
O4'	A	0, 0.059, 0.157, 0.255, 0.413 max_d=0.413 avg_d=0.157 std_dev=0.098
N3	B	0, 0.145, 0.250, 0.355, 0.512 max_d=0.512 avg_d=0.250 std_dev=0.105
C2	B	0, 0.166, 0.295, 0.423, 0.670 max_d=0.670 avg_d=0.295 std_dev=0.129
C4	B	0, 0.172, 0.334, 0.496, 0.715 max_d=0.715 avg_d=0.334 std_dev=0.162
N1	B	0, 0.205, 0.368, 0.532, 0.713 max_d=0.713 avg_d=0.368 std_dev=0.164
C4'	A	0, 0.105, 0.292, 0.479, 1.034 max_d=1.034 avg_d=0.292 std_dev=0.187
O2	B	0, 0.160, 0.367, 0.574, 1.063 max_d=1.063 avg_d=0.367 std_dev=0.207
C1'	B	0, 0.267, 0.481, 0.695, 0.948 max_d=0.948 avg_d=0.481 std_dev=0.214
O4	B	0, 0.169, 0.387, 0.605, 0.821 max_d=0.821 avg_d=0.387 std_dev=0.218
C6	B	0, 0.227, 0.450, 0.673, 0.997 max_d=0.997 avg_d=0.450 std_dev=0.223
C5	B	0, 0.226, 0.454, 0.682, 1.004 max_d=1.004 avg_d=0.454 std_dev=0.228
C5'	A	0, 0.232, 0.467, 0.701, 1.041 max_d=1.041 avg_d=0.467 std_dev=0.235
O2'	A	0, 0.067, 0.313, 0.559, 1.602 max_d=1.602 avg_d=0.313 std_dev=0.246
C3'	A	0, 0.050, 0.326, 0.601, 1.669 max_d=1.669 avg_d=0.326 std_dev=0.275
C2'	B	0, 0.380, 0.663, 0.946, 1.323 max_d=1.323 avg_d=0.663 std_dev=0.283
O4'	B	0, 0.304, 0.608, 0.912, 1.400 max_d=1.400 avg_d=0.608 std_dev=0.304
C3'	B	0, 0.427, 0.825, 1.223, 1.861 max_d=1.861 avg_d=0.825 std_dev=0.398
O2'	B	0, 0.349, 0.748, 1.147, 1.783 max_d=1.783 avg_d=0.748 std_dev=0.399
C4'	B	0, 0.382, 0.785, 1.189, 1.954 max_d=1.954 avg_d=0.785 std_dev=0.404
O5'	B	0, 0.543, 1.013, 1.484, 2.385 max_d=2.385 avg_d=1.013 std_dev=0.470
C5'	B	0, 0.465, 0.940, 1.415, 2.493 max_d=2.493 avg_d=0.940 std_dev=0.475
O3'	A	0, -0.009, 0.536, 1.080, 3.319 max_d=3.319 avg_d=0.536 std_dev=0.544
O5'	A	0, 0.057, 0.632, 1.206, 2.780 max_d=2.780 avg_d=0.632 std_dev=0.574
O3'	B	0, 0.513, 1.116, 1.720, 2.859 max_d=2.859 avg_d=1.116 std_dev=0.603
P	B	0, 0.585, 1.192, 1.798, 3.405 max_d=3.405 avg_d=1.192 std_dev=0.607
P	A	0, 0.154, 0.918, 1.682, 3.604 max_d=3.604 avg_d=0.918 std_dev=0.764
OP1	B	0, 0.656, 1.502, 2.347, 4.197 max_d=4.197 avg_d=1.502 std_dev=0.845
OP2	B	0, 0.455, 1.303, 2.151, 4.779 max_d=4.779 avg_d=1.303 std_dev=0.848
OP2	A	0, 0.241, 1.091, 1.940, 3.816 max_d=3.816 avg_d=1.091 std_dev=0.849
OP1	A	0, 0.176, 1.078, 1.981, 4.462 max_d=4.462 avg_d=1.078 std_dev=0.902

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.02	0.03	0.04	0.03	0.02	0.01	0.02	0.13	0.01	0.14	0.15	0.17	0.13
C2	0.04	0.00	0.12	0.14	0.01	0.06	0.01	0.08	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.21	0.21	0.04	0.31	0.31	0.36	0.29
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.07	0.01	0.05	0.08	0.08	0.04	0.10	0.12	0.07	0.04	0.02	0.01	0.02	0.01	0.15	0.22	0.17	0.12
C3'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.12	0.00	0.16	0.02	0.16	0.17	0.15	0.12	0.18	0.19	0.11	0.02	0.01	0.02	0.24	0.33	0.21	0.21
C4	0.02	0.01	0.07	0.12	0.00	0.05	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.15	0.12	0.03	0.32	0.30	0.32	0.28
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.07	0.09	0.06	0.06	0.08	0.09	0.05	0.13	0.02	0.01	0.02	0.13	0.17	0.05
C5	0.02	0.01	0.05	0.16	0.01	0.07	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.16	0.11	0.03	0.42	0.40	0.43	0.38
C5'	0.04	0.08	0.08	0.02	0.08	0.01	0.11	0.00	0.11	0.13	0.09	0.07	0.14	0.14	0.07	0.07	0.09	0.02	0.01	0.16	0.23	0.02
C6	0.02	0.01	0.08	0.16	0.01	0.07	0.01	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.19	0.14	0.03	0.43	0.43	0.48	0.41
C8	0.02	0.02	0.04	0.17	0.01	0.09	0.01	0.13	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.09	0.12	0.04	0.42	0.37	0.34	0.35
N1	0.03	0.01	0.10	0.15	0.01	0.06	0.01	0.09	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.21	0.17	0.04	0.38	0.38	0.44	0.36
N3	0.04	0.01	0.12	0.12	0.01	0.06	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.19	0.20	0.04	0.27	0.26	0.30	0.24
N6	0.03	0.02	0.07	0.18	0.01	0.08	0.02	0.14	0.01	0.03	0.02	0.02	0.00	0.03	0.02	0.19	0.16	0.05	0.47	0.49	0.55	0.47
N7	0.02	0.02	0.04	0.19	0.01	0.09	0.01	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.12	0.14	0.04	0.47	0.45	0.46	0.43
N9	0.01	0.02	0.02	0.11	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.09	0.06	0.02	0.30	0.27	0.25	0.24
O2'	0.02	0.21	0.01	0.02	0.15	0.13	0.16	0.07	0.19	0.09	0.21	0.19	0.19	0.12	0.09	0.00	0.05	0.09	0.12	0.16	0.16	0.09
O3'	0.13	0.21	0.02	0.01	0.12	0.02	0.11	0.09	0.14	0.12	0.17	0.20	0.16	0.14	0.06	0.05	0.00	0.09	0.24	0.44	0.30	0.28
O4'	0.01	0.04	0.01	0.02	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03	0.04	0.04	0.04	0.05	0.04	0.02	0.09	0.09	0.00	0.11	0.15	0.24	0.17
O5'	0.14	0.31	0.15	0.24	0.32	0.02	0.42	0.01	0.43	0.42	0.38	0.27	0.47	0.47	0.30	0.12	0.24	0.11	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.15	0.31	0.22	0.33	0.30	0.13	0.40	0.16	0.43	0.37	0.38	0.26	0.49	0.45	0.27	0.16	0.44	0.15	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.17	0.36	0.17	0.21	0.32	0.17	0.43	0.23	0.48	0.34	0.44	0.30	0.55	0.46	0.25	0.16	0.30	0.24	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.13	0.29	0.12	0.21	0.28	0.05	0.38	0.02	0.41	0.35	0.36	0.24	0.47	0.43	0.24	0.09	0.28	0.17	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.17	0.12	0.24	0.26	0.12	0.17	0.11	0.16	0.10	0.12	0.10	0.16	0.24	0.27	0.16	0.17	0.30	0.52	0.57	0.33
C2	0.16	0.12	0.23	0.24	0.12	0.15	0.11	0.15	0.10	0.12	0.10	0.17	0.23	0.23	0.16	0.16	0.30	0.46	0.55	0.31
C2'	0.21	0.16	0.28	0.27	0.15	0.21	0.14	0.19	0.14	0.16	0.14	0.20	0.29	0.32	0.18	0.22	0.28	0.48	0.48	0.26
C3'	0.21	0.17	0.27	0.25	0.18	0.20	0.17	0.19	0.16	0.17	0.16	0.20	0.28	0.31	0.22	0.23	0.28	0.50	0.49	0.26
C4	0.15	0.12	0.21	0.24	0.11	0.15	0.11	0.15	0.10	0.12	0.10	0.17	0.23	0.22	0.16	0.15	0.31	0.52	0.60	0.35
C4'	0.17	0.12	0.25	0.26	0.11	0.17	0.11	0.16	0.10	0.12	0.10	0.16	0.25	0.28	0.16	0.17	0.29	0.53	0.56	0.31
C5	0.14	0.13	0.19	0.25	0.11	0.14	0.11	0.15	0.10	0.12	0.10	0.17	0.22	0.20	0.15	0.14	0.32	0.57	0.65	0.38
C5'	0.15	0.11	0.21	0.23	0.13	0.14	0.12	0.15	0.10	0.11	0.10	0.15	0.23	0.25	0.17	0.17	0.30	0.56	0.60	0.34
C6	0.14	0.14	0.18	0.24	0.11	0.13	0.10	0.15	0.10	0.12	0.11	0.18	0.22	0.18	0.15	0.14	0.32	0.56	0.65	0.38
C8	0.15	0.13	0.20	0.25	0.11	0.14	0.11	0.15	0.10	0.11	0.10	0.17	0.23	0.21	0.15	0.14	0.33	0.59	0.66	0.39
N1	0.15	0.13	0.19	0.24	0.11	0.14	0.10	0.15	0.10	0.12	0.10	0.18	0.22	0.18	0.16	0.14	0.31	0.50	0.59	0.35
N3	0.16	0.12	0.23	0.24	0.12	0.16	0.11	0.15	0.10	0.12	0.10	0.16	0.23	0.24	0.16	0.16	0.30	0.47	0.55	0.32
N6	0.15	0.15	0.17	0.26	0.11	0.14	0.11	0.17	0.11	0.13	0.14	0.18	0.23	0.20	0.14	0.14	0.33	0.61	0.70	0.42
N7	0.14	0.13	0.18	0.25	0.11	0.13	0.11	0.15	0.10	0.12	0.11	0.17	0.23	0.20	0.14	0.14	0.33	0.61	0.69	0.41
N9	0.15	0.12	0.22	0.25	0.11	0.15	0.11	0.15	0.10	0.12	0.10	0.16	0.23	0.23	0.16	0.15	0.32	0.54	0.61	0.35
O2'	0.29	0.25	0.38	0.37	0.26	0.30	0.25	0.30	0.25	0.26	0.25	0.27	0.36	0.43	0.28	0.29	0.37	0.52	0.52	0.35
O3'	0.28	0.23	0.40	0.39	0.22	0.31	0.22	0.30	0.22	0.24	0.21	0.27	0.41	0.47	0.25	0.29	0.35	0.53	0.49	0.31
O4'	0.17	0.13	0.25	0.28	0.13	0.17	0.13	0.18	0.12	0.13	0.11	0.17	0.24	0.27	0.17	0.17	0.33	0.56	0.62	0.37
O5'	0.33	0.35	0.28	0.30	0.42	0.31	0.41	0.36	0.38	0.35	0.38	0.33	0.31	0.28	0.47	0.38	0.45	0.70	0.72	0.51
OP1	0.35	0.36	0.26	0.28	0.44	0.32	0.44	0.37	0.40	0.36	0.39	0.34	0.32	0.26	0.49	0.41	0.46	0.72	0.73	0.53
OP2	0.43	0.43	0.34	0.36	0.50	0.41	0.50	0.47	0.47	0.44	0.45	0.41	0.40	0.35	0.54	0.49	0.53	0.81	0.80	0.61
P	0.32	0.33	0.24	0.27	0.41	0.29	0.41	0.34	0.37	0.34	0.36	0.31	0.31	0.25	0.46	0.37	0.44	0.71	0.73	0.52

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.05	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.16	0.02	0.01	0.14	0.18	0.30	0.14
C2	0.02	0.00	0.09	0.15	0.01	0.05	0.02	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.13	0.12	0.01	0.04	0.23	0.37	0.45	0.25
C2'	0.01	0.09	0.00	0.01	0.05	0.02	0.08	0.11	0.09	0.02	0.07	0.16	0.00	0.02	0.06	0.01	0.24	0.26	0.37	0.24
C3'	0.01	0.15	0.01	0.00	0.21	0.01	0.21	0.02	0.19	0.13	0.19	0.15	0.02	0.01	0.23	0.02	0.23	0.23	0.22	0.17
C4	0.02	0.01	0.05	0.21	0.00	0.09	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.02	0.19	0.15	0.01	0.04	0.31	0.56	0.65	0.40
C4'	0.01	0.05	0.02	0.01	0.09	0.00	0.10	0.01	0.09	0.05	0.06	0.06	0.18	0.03	0.09	0.01	0.02	0.17	0.20	0.06
C5	0.02	0.02	0.08	0.21	0.01	0.10	0.00	0.16	0.01	0.01	0.01	0.02	0.18	0.18	0.01	0.05	0.32	0.55	0.64	0.41
C5'	0.05	0.09	0.11	0.02	0.14	0.01	0.16	0.00	0.14	0.09	0.12	0.08	0.08	0.12	0.16	0.02	0.01	0.22	0.23	0.02
C6	0.02	0.01	0.09	0.19	0.01	0.09	0.01	0.14	0.00	0.01	0.01	0.02	0.15	0.14	0.02	0.05	0.28	0.40	0.51	0.32
N1	0.01	0.01	0.02	0.13	0.01	0.05	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.02	0.11	0.06	0.01	0.02	0.22	0.30	0.42	0.23
N3	0.02	0.00	0.07	0.19	0.01	0.06	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01	0.17	0.11	0.01	0.04	0.27	0.48	0.56	0.33
O2	0.04	0.01	0.16	0.15	0.02	0.06	0.02	0.08	0.02	0.02	0.01	0.00	0.13	0.21	0.02	0.07	0.20	0.32	0.40	0.21
O2'	0.02	0.13	0.00	0.02	0.19	0.18	0.18	0.08	0.15	0.11	0.17	0.13	0.00	0.05	0.20	0.12	0.15	0.26	0.34	0.19
O3'	0.16	0.12	0.02	0.01	0.15	0.03	0.18	0.12	0.14	0.06	0.11	0.21	0.05	0.00	0.18	0.12	0.26	0.39	0.25	0.26
O4	0.02	0.01	0.06	0.23	0.01	0.09	0.01	0.16	0.02	0.01	0.01	0.02	0.20	0.18	0.00	0.04	0.33	0.63	0.71	0.45
O4'	0.01	0.04	0.01	0.02	0.04	0.01	0.05	0.02	0.05	0.02	0.04	0.07	0.12	0.12	0.04	0.00	0.09	0.17	0.29	0.15
O5'	0.14	0.23	0.24	0.23	0.31	0.02	0.32	0.01	0.28	0.22	0.27	0.20	0.15	0.26	0.33	0.09	0.00	0.02	0.03	0.01
OP1	0.18	0.37	0.26	0.23	0.56	0.17	0.55	0.22	0.40	0.30	0.48	0.32	0.26	0.39	0.63	0.17	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.30	0.45	0.37	0.22	0.65	0.20	0.64	0.23	0.51	0.42	0.56	0.40	0.34	0.25	0.71	0.29	0.03	0.02	0.00	0.01
P	0.14	0.25	0.24	0.17	0.40	0.06	0.41	0.02	0.32	0.23	0.33	0.21	0.19	0.26	0.45	0.15	0.01	0.01	0.01	0.00