Doublet Group distance statistics: 50662

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 2, 5, 3, 3, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.004, 0.011, 0.019, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.001, 0.016, 0.030, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.016 std_dev=0.015
C4	A	0, 0.003, 0.021, 0.040, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.021 std_dev=0.018
N1	A	0, 0.001, 0.020, 0.040, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.020 std_dev=0.019
N9	A	0, 0.007, 0.027, 0.047, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.027 std_dev=0.020
N3	A	0, 0.002, 0.025, 0.048, 0.106 max_d=0.106 avg_d=0.025 std_dev=0.023
C2	A	0, -0.004, 0.019, 0.043, 0.101 max_d=0.101 avg_d=0.019 std_dev=0.023
N7	A	0, 0.006, 0.031, 0.055, 0.101 max_d=0.101 avg_d=0.031 std_dev=0.025
C8	A	0, 0.009, 0.035, 0.062, 0.108 max_d=0.108 avg_d=0.035 std_dev=0.026
C1'	A	0, -0.001, 0.029, 0.058, 0.129 max_d=0.129 avg_d=0.029 std_dev=0.029
N6	A	0, 0.008, 0.045, 0.083, 0.129 max_d=0.129 avg_d=0.045 std_dev=0.038
C6	B	0, 0.236, 0.350, 0.465, 0.519 max_d=0.519 avg_d=0.350 std_dev=0.114
N1	B	0, 0.192, 0.328, 0.464, 0.555 max_d=0.555 avg_d=0.328 std_dev=0.136
C2	B	0, 0.167, 0.343, 0.519, 0.870 max_d=0.870 avg_d=0.343 std_dev=0.176
C5	B	0, 0.193, 0.373, 0.554, 0.750 max_d=0.750 avg_d=0.373 std_dev=0.180
N3	B	0, 0.172, 0.359, 0.545, 0.853 max_d=0.853 avg_d=0.359 std_dev=0.186
C4	B	0, 0.168, 0.372, 0.576, 0.874 max_d=0.874 avg_d=0.372 std_dev=0.204
O2	B	0, 0.165, 0.403, 0.641, 1.142 max_d=1.142 avg_d=0.403 std_dev=0.238
C1'	B	0, 0.158, 0.413, 0.668, 0.881 max_d=0.881 avg_d=0.413 std_dev=0.255
C2'	A	0, 0.038, 0.299, 0.560, 0.929 max_d=0.929 avg_d=0.299 std_dev=0.261
O4'	A	0, 0.095, 0.358, 0.620, 0.952 max_d=0.952 avg_d=0.358 std_dev=0.262
O4'	B	0, 0.209, 0.481, 0.753, 0.952 max_d=0.952 avg_d=0.481 std_dev=0.272
C3'	B	0, 0.223, 0.513, 0.803, 0.981 max_d=0.981 avg_d=0.513 std_dev=0.290
C4'	B	0, 0.357, 0.648, 0.939, 1.072 max_d=1.072 avg_d=0.648 std_dev=0.291
O4	B	0, 0.123, 0.426, 0.729, 1.354 max_d=1.354 avg_d=0.426 std_dev=0.303
C2'	B	0, 0.313, 0.629, 0.945, 1.390 max_d=1.390 avg_d=0.629 std_dev=0.316
O3'	B	0, 0.209, 0.620, 1.031, 1.355 max_d=1.355 avg_d=0.620 std_dev=0.411
C4'	A	0, 0.154, 0.581, 1.009, 1.585 max_d=1.585 avg_d=0.581 std_dev=0.428
C5'	A	0, 0.377, 0.834, 1.292, 1.726 max_d=1.726 avg_d=0.834 std_dev=0.457
C5'	B	0, 0.728, 1.202, 1.676, 1.910 max_d=1.910 avg_d=1.202 std_dev=0.474
O2'	B	0, 0.559, 1.043, 1.528, 1.988 max_d=1.988 avg_d=1.043 std_dev=0.485
C3'	A	0, 0.099, 0.584, 1.069, 1.777 max_d=1.777 avg_d=0.584 std_dev=0.485
O5'	B	0, 0.976, 1.475, 1.973, 2.416 max_d=2.416 avg_d=1.475 std_dev=0.499
O2'	A	0, -0.077, 0.429, 0.935, 1.730 max_d=1.730 avg_d=0.429 std_dev=0.506
O5'	A	0, 0.277, 0.794, 1.312, 1.931 max_d=1.931 avg_d=0.794 std_dev=0.518
OP2	A	0, 0.393, 1.060, 1.726, 2.961 max_d=2.961 avg_d=1.060 std_dev=0.666
P	A	0, 0.305, 0.989, 1.674, 2.814 max_d=2.814 avg_d=0.989 std_dev=0.684
P	B	0, 1.675, 2.423, 3.171, 3.502 max_d=3.502 avg_d=2.423 std_dev=0.748
O3'	A	0, 0.077, 0.893, 1.708, 2.964 max_d=2.964 avg_d=0.893 std_dev=0.816
OP2	B	0, 1.932, 2.771, 3.611, 3.896 max_d=3.896 avg_d=2.771 std_dev=0.840
OP1	A	0, 0.410, 1.322, 2.235, 3.811 max_d=3.811 avg_d=1.322 std_dev=0.912
OP1	B	0, 2.246, 3.186, 4.125, 4.346 max_d=4.346 avg_d=3.186 std_dev=0.939

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.09	0.04	0.02	0.06	0.06	0.04	0.01	0.01	0.02	0.29	0.00	0.24	0.21	0.33	0.21
C2	0.06	0.00	0.22	0.13	0.01	0.11	0.01	0.15	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.13	0.32	0.21	0.29	0.17	0.27	0.20
C2'	0.01	0.22	0.00	0.00	0.13	0.01	0.08	0.19	0.13	0.10	0.19	0.22	0.11	0.05	0.02	0.00	0.05	0.02	0.45	0.50	0.54	0.45
C3'	0.02	0.13	0.00	0.00	0.18	0.01	0.27	0.01	0.26	0.30	0.20	0.10	0.31	0.33	0.18	0.01	0.01	0.02	0.22	0.35	0.12	0.13
C4	0.03	0.01	0.13	0.18	0.00	0.02	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.12	0.18	0.11	0.31	0.17	0.26	0.19
C4'	0.01	0.11	0.01	0.01	0.02	0.00	0.08	0.00	0.05	0.20	0.05	0.12	0.09	0.18	0.07	0.24	0.02	0.00	0.02	0.15	0.26	0.08
C5	0.02	0.01	0.08	0.27	0.00	0.08	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.21	0.05	0.05	0.38	0.23	0.29	0.24
C5'	0.09	0.15	0.19	0.01	0.09	0.00	0.11	0.00	0.11	0.17	0.11	0.15	0.14	0.18	0.07	0.06	0.19	0.02	0.01	0.22	0.25	0.02
C6	0.04	0.01	0.13	0.26	0.01	0.05	0.01	0.11	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.19	0.08	0.10	0.38	0.25	0.33	0.26
C8	0.02	0.01	0.10	0.30	0.01	0.20	0.01	0.17	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.00	0.00	0.28	0.13	0.13	0.39	0.23	0.23	0.22
N1	0.06	0.00	0.19	0.20	0.01	0.05	0.01	0.11	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.14	0.20	0.17	0.34	0.20	0.30	0.22
N3	0.06	0.00	0.22	0.10	0.00	0.12	0.01	0.15	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.35	0.21	0.28	0.18	0.27	0.20
N6	0.04	0.01	0.11	0.31	0.02	0.09	0.02	0.14	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.04	0.03	0.23	0.05	0.07	0.44	0.33	0.41	0.33
N7	0.01	0.02	0.05	0.33	0.01	0.18	0.01	0.18	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.00	0.01	0.30	0.14	0.07	0.44	0.29	0.31	0.30
N9	0.01	0.02	0.02	0.18	0.01	0.07	0.01	0.07	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.15	0.11	0.01	0.30	0.17	0.26	0.17
O2'	0.02	0.13	0.00	0.01	0.12	0.24	0.21	0.06	0.19	0.28	0.14	0.12	0.23	0.30	0.15	0.00	0.07	0.18	0.31	0.38	0.63	0.38
O3'	0.29	0.32	0.05	0.01	0.18	0.02	0.05	0.19	0.08	0.13	0.20	0.35	0.05	0.14	0.11	0.07	0.00	0.21	0.24	0.50	0.23	0.27
O4'	0.00	0.21	0.02	0.02	0.11	0.00	0.05	0.02	0.10	0.13	0.17	0.21	0.07	0.07	0.01	0.18	0.21	0.00	0.08	0.12	0.35	0.20
O5'	0.24	0.29	0.45	0.22	0.31	0.02	0.38	0.01	0.38	0.39	0.34	0.28	0.44	0.44	0.30	0.31	0.24	0.08	0.00	0.05	0.01	0.01
OP1	0.21	0.17	0.50	0.35	0.17	0.15	0.23	0.22	0.25	0.23	0.20	0.18	0.33	0.29	0.17	0.38	0.50	0.12	0.05	0.00	0.01	0.01
OP2	0.33	0.27	0.54	0.12	0.26	0.26	0.29	0.25	0.33	0.23	0.30	0.27	0.41	0.31	0.26	0.63	0.23	0.35	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.21	0.20	0.45	0.13	0.19	0.08	0.24	0.02	0.26	0.22	0.22	0.20	0.33	0.30	0.17	0.38	0.27	0.20	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.12	0.12	0.16	0.20	0.17	0.12	0.15	0.12	0.13	0.12	0.14	0.15	0.29	0.23	0.21	0.12	0.34	0.17	0.73	0.39
C2	0.14	0.16	0.16	0.18	0.19	0.14	0.17	0.14	0.15	0.15	0.17	0.20	0.34	0.19	0.23	0.14	0.37	0.20	0.73	0.42
C2'	0.40	0.33	0.43	0.42	0.25	0.40	0.25	0.38	0.30	0.34	0.28	0.39	0.52	0.47	0.24	0.40	0.39	0.33	0.66	0.39
C3'	0.30	0.28	0.26	0.26	0.29	0.29	0.29	0.30	0.29	0.29	0.28	0.28	0.33	0.28	0.31	0.33	0.39	0.29	0.73	0.43
C4	0.13	0.14	0.15	0.18	0.17	0.13	0.16	0.12	0.13	0.13	0.14	0.17	0.34	0.19	0.21	0.13	0.39	0.21	0.79	0.46
C4'	0.10	0.11	0.15	0.18	0.15	0.09	0.14	0.08	0.12	0.11	0.13	0.13	0.26	0.23	0.19	0.11	0.34	0.15	0.75	0.39
C5	0.12	0.12	0.13	0.15	0.15	0.11	0.15	0.11	0.13	0.12	0.12	0.16	0.35	0.15	0.20	0.12	0.43	0.29	0.88	0.54
C5'	0.12	0.13	0.15	0.18	0.17	0.11	0.16	0.11	0.14	0.13	0.14	0.14	0.29	0.22	0.20	0.14	0.41	0.23	0.85	0.49
C6	0.11	0.12	0.13	0.13	0.15	0.10	0.15	0.11	0.12	0.11	0.11	0.16	0.37	0.12	0.21	0.11	0.44	0.32	0.91	0.57
C8	0.13	0.13	0.14	0.16	0.16	0.12	0.16	0.12	0.14	0.13	0.13	0.16	0.34	0.18	0.20	0.13	0.42	0.27	0.88	0.53
N1	0.11	0.13	0.13	0.14	0.18	0.11	0.16	0.11	0.13	0.12	0.15	0.17	0.36	0.14	0.23	0.11	0.41	0.26	0.82	0.50
N3	0.15	0.16	0.18	0.20	0.18	0.15	0.17	0.15	0.15	0.15	0.16	0.19	0.33	0.23	0.22	0.15	0.36	0.19	0.71	0.39
N6	0.11	0.12	0.15	0.12	0.13	0.11	0.13	0.12	0.11	0.10	0.11	0.16	0.39	0.12	0.19	0.12	0.48	0.42	1.00	0.66
N7	0.12	0.13	0.13	0.15	0.15	0.12	0.15	0.12	0.13	0.12	0.12	0.16	0.36	0.15	0.19	0.13	0.45	0.33	0.93	0.59
N9	0.13	0.13	0.16	0.18	0.16	0.13	0.15	0.12	0.13	0.13	0.14	0.16	0.33	0.21	0.21	0.13	0.38	0.21	0.80	0.46
O2'	0.18	0.15	0.31	0.31	0.23	0.22	0.20	0.19	0.15	0.14	0.18	0.19	0.40	0.42	0.30	0.17	0.21	0.20	0.52	0.21
O3'	0.22	0.21	0.32	0.31	0.20	0.23	0.19	0.20	0.19	0.20	0.20	0.24	0.38	0.39	0.21	0.21	0.33	0.18	0.65	0.34
O4'	0.15	0.18	0.20	0.24	0.23	0.17	0.22	0.16	0.19	0.17	0.21	0.18	0.31	0.27	0.26	0.15	0.41	0.24	0.81	0.46
O5'	0.34	0.36	0.23	0.25	0.35	0.31	0.35	0.33	0.36	0.35	0.36	0.37	0.35	0.22	0.35	0.38	0.52	0.40	0.94	0.61
OP1	0.27	0.28	0.21	0.24	0.29	0.25	0.29	0.27	0.29	0.28	0.28	0.28	0.33	0.27	0.30	0.31	0.54	0.43	1.03	0.67
OP2	0.39	0.39	0.38	0.41	0.39	0.40	0.40	0.42	0.40	0.39	0.39	0.38	0.46	0.41	0.39	0.42	0.69	0.62	1.19	0.84
P	0.28	0.28	0.26	0.28	0.29	0.27	0.29	0.28	0.29	0.28	0.28	0.28	0.38	0.30	0.29	0.30	0.58	0.46	1.07	0.70

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.04	0.01	0.07	0.02	0.00	0.13	0.11	0.26	0.10
C2	0.02	0.00	0.08	0.10	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.22	0.07	0.02	0.03	0.29	0.14	0.59	0.34
C2'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.09	0.03	0.12	0.05	0.13	0.06	0.07	0.14	0.01	0.02	0.09	0.02	0.23	0.22	0.35	0.18
C3'	0.02	0.10	0.00	0.00	0.13	0.01	0.16	0.02	0.16	0.09	0.11	0.13	0.02	0.01	0.14	0.02	0.23	0.18	0.25	0.13
C4	0.02	0.01	0.09	0.13	0.00	0.07	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.24	0.12	0.01	0.03	0.45	0.40	0.92	0.62
C4'	0.01	0.04	0.03	0.01	0.07	0.00	0.08	0.01	0.08	0.04	0.05	0.06	0.16	0.03	0.08	0.00	0.02	0.21	0.05	0.09
C5	0.02	0.01	0.12	0.16	0.01	0.08	0.00	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01	0.20	0.18	0.02	0.05	0.47	0.45	0.92	0.66
C5'	0.02	0.06	0.05	0.02	0.10	0.01	0.11	0.00	0.09	0.05	0.08	0.06	0.11	0.09	0.11	0.01	0.01	0.07	0.07	0.03
C6	0.02	0.01	0.13	0.16	0.01	0.08	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.16	0.16	0.02	0.05	0.40	0.32	0.71	0.51
N1	0.01	0.01	0.06	0.09	0.01	0.04	0.01	0.05	0.00	0.00	0.01	0.02	0.14	0.05	0.02	0.02	0.28	0.13	0.53	0.32
N3	0.02	0.00	0.07	0.11	0.00	0.05	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.25	0.07	0.01	0.03	0.38	0.26	0.77	0.48
O2	0.04	0.00	0.14	0.13	0.01	0.06	0.01	0.06	0.01	0.02	0.01	0.00	0.24	0.16	0.02	0.05	0.23	0.12	0.48	0.23
O2'	0.01	0.22	0.01	0.02	0.24	0.16	0.20	0.11	0.16	0.14	0.25	0.24	0.00	0.06	0.25	0.11	0.10	0.36	0.22	0.18
O3'	0.07	0.07	0.02	0.01	0.12	0.03	0.18	0.09	0.16	0.05	0.07	0.16	0.06	0.00	0.14	0.04	0.18	0.33	0.17	0.14
O4	0.02	0.02	0.09	0.14	0.01	0.08	0.02	0.11	0.02	0.02	0.01	0.02	0.25	0.14	0.00	0.04	0.48	0.48	1.02	0.70
O4'	0.00	0.03	0.02	0.02	0.03	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.03	0.05	0.11	0.04	0.04	0.00	0.08	0.13	0.11	0.07
O5'	0.13	0.29	0.23	0.23	0.45	0.02	0.47	0.01	0.40	0.28	0.38	0.23	0.10	0.18	0.48	0.08	0.00	0.03	0.02	0.01
OP1	0.11	0.14	0.22	0.18	0.40	0.21	0.45	0.07	0.32	0.13	0.26	0.12	0.36	0.33	0.48	0.13	0.03	0.00	0.01	0.01
OP2	0.26	0.59	0.35	0.25	0.92	0.05	0.92	0.07	0.71	0.53	0.77	0.48	0.22	0.17	1.02	0.11	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.10	0.34	0.18	0.13	0.62	0.09	0.66	0.03	0.51	0.32	0.48	0.23	0.18	0.14	0.70	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00