Doublet Group distance statistics: 50664

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 2, 7, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.002, 0.006, 0.010, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.006 std_dev=0.004
C5	A	0, 0.011, 0.017, 0.024, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.017 std_dev=0.006
C4	A	0, 0.006, 0.014, 0.022, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.014 std_dev=0.008
N9	A	0, 0.008, 0.017, 0.025, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.017 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.010, 0.019, 0.028, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.019 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.009, 0.019, 0.029, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.019 std_dev=0.010
N7	A	0, 0.013, 0.024, 0.035, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.024 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.003, 0.015, 0.028, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.015 std_dev=0.012
C8	A	0, 0.011, 0.025, 0.039, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.025 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.007, 0.021, 0.035, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.021 std_dev=0.014
N6	A	0, 0.016, 0.033, 0.049, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.033 std_dev=0.017
C4	B	0, 0.232, 0.373, 0.514, 0.501 max_d=0.501 avg_d=0.373 std_dev=0.141
C5	B	0, 0.193, 0.336, 0.479, 0.577 max_d=0.577 avg_d=0.336 std_dev=0.143
C6	B	0, 0.145, 0.291, 0.437, 0.503 max_d=0.503 avg_d=0.291 std_dev=0.146
N1	B	0, 0.143, 0.305, 0.468, 0.532 max_d=0.532 avg_d=0.305 std_dev=0.163
O4	B	0, 0.323, 0.491, 0.659, 0.679 max_d=0.679 avg_d=0.491 std_dev=0.168
C2	B	0, 0.189, 0.369, 0.548, 0.725 max_d=0.725 avg_d=0.369 std_dev=0.180
C1'	B	0, 0.278, 0.479, 0.680, 0.751 max_d=0.751 avg_d=0.479 std_dev=0.201
N3	B	0, 0.151, 0.355, 0.558, 0.686 max_d=0.686 avg_d=0.355 std_dev=0.204
O2	B	0, 0.273, 0.491, 0.709, 0.917 max_d=0.917 avg_d=0.491 std_dev=0.218
C2'	B	0, 0.234, 0.537, 0.839, 0.933 max_d=0.933 avg_d=0.537 std_dev=0.302
O4'	A	0, 0.121, 0.431, 0.741, 0.937 max_d=0.937 avg_d=0.431 std_dev=0.310
C2'	A	0, 0.140, 0.455, 0.770, 0.928 max_d=0.928 avg_d=0.455 std_dev=0.315
O2'	A	0, 0.139, 0.478, 0.817, 1.017 max_d=1.017 avg_d=0.478 std_dev=0.339
O4'	B	0, 0.514, 0.952, 1.390, 1.564 max_d=1.564 avg_d=0.952 std_dev=0.438
C4'	A	0, 0.219, 0.687, 1.156, 1.376 max_d=1.376 avg_d=0.687 std_dev=0.468
C3'	A	0, 0.220, 0.728, 1.236, 1.485 max_d=1.485 avg_d=0.728 std_dev=0.508
C3'	B	0, 0.427, 0.961, 1.495, 2.103 max_d=2.103 avg_d=0.961 std_dev=0.534
O2'	B	0, 0.387, 0.968, 1.549, 2.274 max_d=2.274 avg_d=0.968 std_dev=0.581
P	B	0, 0.525, 1.126, 1.727, 1.957 max_d=1.957 avg_d=1.126 std_dev=0.601
OP1	B	0, 0.797, 1.404, 2.011, 2.383 max_d=2.383 avg_d=1.404 std_dev=0.607
O5'	B	0, 0.966, 1.591, 2.217, 2.523 max_d=2.523 avg_d=1.591 std_dev=0.626
O5'	A	0, 1.368, 2.050, 2.732, 2.566 max_d=2.566 avg_d=2.050 std_dev=0.682
C4'	B	0, 0.595, 1.286, 1.978, 2.570 max_d=2.570 avg_d=1.286 std_dev=0.692
O3'	A	0, 0.315, 1.024, 1.732, 2.084 max_d=2.084 avg_d=1.024 std_dev=0.709
P	A	0, 1.408, 2.146, 2.885, 2.954 max_d=2.954 avg_d=2.146 std_dev=0.739
O3'	B	0, 0.494, 1.249, 2.005, 3.083 max_d=3.083 avg_d=1.249 std_dev=0.756
OP2	A	0, 1.331, 2.101, 2.871, 3.045 max_d=3.045 avg_d=2.101 std_dev=0.770
C5'	A	0, 0.350, 1.153, 1.957, 2.388 max_d=2.388 avg_d=1.153 std_dev=0.803
OP1	A	0, 1.429, 2.242, 3.055, 3.180 max_d=3.180 avg_d=2.242 std_dev=0.813
OP2	B	0, 0.526, 1.475, 2.425, 3.336 max_d=3.336 avg_d=1.475 std_dev=0.949
C5'	B	0, 1.134, 2.131, 3.128, 3.568 max_d=3.568 avg_d=2.131 std_dev=0.997

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.03	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.07	0.09	0.09	0.09
C2	0.04	0.00	0.18	0.20	0.01	0.06	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.13	0.26	0.10	0.16	0.16	0.23	0.18
C2'	0.00	0.18	0.00	0.00	0.09	0.01	0.05	0.02	0.08	0.09	0.13	0.18	0.06	0.06	0.02	0.00	0.02	0.01	0.07	0.18	0.12	0.08
C3'	0.01	0.20	0.00	0.00	0.13	0.00	0.11	0.02	0.14	0.10	0.18	0.19	0.13	0.09	0.06	0.01	0.01	0.01	0.10	0.23	0.18	0.15
C4	0.02	0.01	0.09	0.13	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.14	0.05	0.16	0.15	0.20	0.18
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.06	0.05	0.06	0.05	0.07	0.06	0.03	0.04	0.01	0.00	0.02	0.11	0.07	0.02
C5	0.01	0.01	0.05	0.11	0.00	0.05	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.12	0.02	0.19	0.21	0.26	0.23
C5'	0.02	0.07	0.02	0.02	0.07	0.01	0.10	0.00	0.10	0.10	0.09	0.06	0.12	0.11	0.06	0.04	0.03	0.01	0.00	0.09	0.09	0.01
C6	0.02	0.00	0.08	0.14	0.01	0.06	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.06	0.17	0.04	0.21	0.23	0.30	0.25
C8	0.01	0.01	0.09	0.10	0.00	0.05	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.07	0.13	0.06	0.18	0.17	0.18	0.20
N1	0.03	0.00	0.13	0.18	0.01	0.06	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.10	0.23	0.07	0.19	0.20	0.28	0.22
N3	0.03	0.00	0.18	0.19	0.00	0.05	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.14	0.23	0.09	0.14	0.13	0.19	0.16
N6	0.01	0.01	0.06	0.13	0.00	0.07	0.00	0.12	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.16	0.02	0.23	0.28	0.35	0.29
N7	0.00	0.01	0.06	0.09	0.00	0.06	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.06	0.11	0.04	0.21	0.23	0.27	0.25
N9	0.00	0.01	0.02	0.06	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.05	0.01	0.13	0.13	0.15	0.15
O2'	0.02	0.13	0.00	0.01	0.06	0.04	0.04	0.04	0.06	0.07	0.10	0.14	0.05	0.06	0.02	0.00	0.04	0.04	0.06	0.18	0.12	0.08
O3'	0.01	0.26	0.02	0.01	0.14	0.01	0.12	0.03	0.17	0.13	0.23	0.23	0.16	0.11	0.05	0.04	0.00	0.01	0.12	0.34	0.30	0.23
O4'	0.00	0.10	0.01	0.01	0.05	0.00	0.02	0.01	0.04	0.06	0.07	0.09	0.02	0.04	0.01	0.04	0.01	0.00	0.07	0.08	0.15	0.12
O5'	0.07	0.16	0.07	0.10	0.16	0.02	0.19	0.00	0.21	0.18	0.19	0.14	0.23	0.21	0.13	0.06	0.12	0.07	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.09	0.16	0.18	0.23	0.15	0.11	0.21	0.09	0.23	0.17	0.20	0.13	0.28	0.23	0.13	0.18	0.34	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.09	0.23	0.12	0.18	0.20	0.07	0.26	0.09	0.30	0.18	0.28	0.19	0.35	0.27	0.15	0.12	0.30	0.15	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.09	0.18	0.08	0.15	0.18	0.02	0.23	0.01	0.25	0.20	0.22	0.16	0.29	0.25	0.15	0.08	0.23	0.12	0.01	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.22	0.16	0.26	0.30	0.18	0.21	0.16	0.27	0.11	0.14	0.13	0.25	0.28	0.34	0.27	0.23	0.49	0.56	0.25	0.46
C2	0.20	0.16	0.22	0.27	0.24	0.18	0.19	0.25	0.13	0.14	0.17	0.26	0.25	0.27	0.33	0.20	0.46	0.52	0.25	0.42
C2'	0.19	0.18	0.21	0.27	0.30	0.23	0.28	0.29	0.22	0.19	0.23	0.19	0.27	0.47	0.37	0.25	0.43	0.52	0.30	0.40
C3'	0.22	0.22	0.20	0.25	0.34	0.26	0.33	0.30	0.28	0.24	0.27	0.21	0.29	0.46	0.40	0.30	0.41	0.51	0.31	0.38
C4	0.19	0.15	0.23	0.29	0.18	0.18	0.16	0.26	0.10	0.13	0.11	0.26	0.27	0.28	0.28	0.19	0.49	0.57	0.23	0.46
C4'	0.19	0.14	0.22	0.26	0.22	0.18	0.20	0.25	0.14	0.14	0.14	0.22	0.27	0.35	0.30	0.23	0.46	0.54	0.23	0.42
C5	0.18	0.17	0.20	0.30	0.14	0.16	0.14	0.25	0.08	0.12	0.10	0.28	0.29	0.25	0.24	0.16	0.50	0.61	0.22	0.47
C5'	0.18	0.15	0.21	0.24	0.22	0.15	0.22	0.21	0.16	0.14	0.14	0.23	0.29	0.31	0.31	0.22	0.45	0.53	0.20	0.41
C6	0.17	0.18	0.18	0.30	0.14	0.15	0.14	0.25	0.08	0.12	0.11	0.29	0.29	0.23	0.25	0.14	0.49	0.61	0.22	0.45
C8	0.18	0.16	0.21	0.31	0.13	0.16	0.13	0.26	0.08	0.12	0.09	0.26	0.28	0.27	0.22	0.17	0.50	0.62	0.21	0.48
N1	0.18	0.17	0.19	0.28	0.20	0.16	0.17	0.24	0.10	0.12	0.11	0.29	0.28	0.24	0.32	0.16	0.48	0.56	0.23	0.43
N3	0.20	0.16	0.24	0.28	0.22	0.18	0.19	0.26	0.13	0.14	0.16	0.24	0.25	0.30	0.32	0.21	0.47	0.53	0.25	0.43
N6	0.17	0.21	0.17	0.32	0.07	0.15	0.10	0.25	0.06	0.13	0.17	0.31	0.32	0.23	0.16	0.12	0.50	0.65	0.25	0.46
N7	0.17	0.17	0.19	0.31	0.11	0.15	0.12	0.25	0.07	0.12	0.10	0.28	0.29	0.25	0.20	0.15	0.51	0.64	0.22	0.48
N9	0.20	0.15	0.23	0.30	0.17	0.18	0.15	0.26	0.10	0.13	0.11	0.25	0.27	0.29	0.26	0.19	0.49	0.58	0.23	0.47
O2'	0.21	0.20	0.27	0.32	0.29	0.25	0.26	0.32	0.22	0.20	0.24	0.20	0.25	0.52	0.36	0.27	0.45	0.53	0.34	0.44
O3'	0.31	0.31	0.28	0.34	0.41	0.37	0.41	0.39	0.37	0.33	0.35	0.28	0.36	0.60	0.46	0.40	0.43	0.53	0.38	0.40
O4'	0.28	0.21	0.33	0.35	0.15	0.25	0.13	0.30	0.12	0.19	0.13	0.31	0.34	0.35	0.23	0.26	0.53	0.59	0.26	0.50
O5'	0.22	0.20	0.18	0.20	0.29	0.15	0.30	0.18	0.25	0.21	0.21	0.24	0.33	0.27	0.36	0.27	0.49	0.56	0.22	0.43
OP1	0.23	0.22	0.18	0.19	0.33	0.18	0.35	0.21	0.29	0.23	0.24	0.25	0.34	0.28	0.40	0.29	0.50	0.60	0.26	0.46
OP2	0.27	0.27	0.19	0.23	0.40	0.25	0.43	0.29	0.38	0.31	0.31	0.27	0.40	0.29	0.46	0.35	0.55	0.67	0.34	0.52
P	0.22	0.22	0.16	0.19	0.34	0.16	0.36	0.20	0.30	0.24	0.25	0.24	0.35	0.23	0.40	0.28	0.51	0.60	0.27	0.47

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.06	0.01	0.02	0.03	0.05	0.02	0.22	0.02	0.00	0.19	0.19	0.35	0.16
C2	0.03	0.00	0.10	0.19	0.01	0.08	0.01	0.15	0.01	0.01	0.00	0.00	0.18	0.16	0.01	0.06	0.34	0.37	0.29	0.23
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.04	0.01	0.10	0.14	0.12	0.02	0.06	0.19	0.00	0.02	0.04	0.01	0.37	0.43	0.40	0.33
C3'	0.02	0.19	0.00	0.00	0.27	0.00	0.28	0.02	0.24	0.16	0.24	0.18	0.01	0.01	0.28	0.01	0.26	0.37	0.31	0.19
C4	0.02	0.01	0.04	0.27	0.00	0.13	0.01	0.21	0.00	0.01	0.00	0.01	0.26	0.17	0.00	0.03	0.45	0.56	0.42	0.33
C4'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.13	0.00	0.14	0.01	0.13	0.08	0.10	0.07	0.19	0.03	0.14	0.00	0.01	0.13	0.32	0.07
C5	0.02	0.01	0.10	0.28	0.01	0.14	0.00	0.20	0.00	0.01	0.01	0.01	0.25	0.22	0.00	0.05	0.44	0.55	0.54	0.29
C5'	0.06	0.15	0.14	0.02	0.21	0.01	0.20	0.00	0.17	0.12	0.19	0.14	0.08	0.13	0.23	0.01	0.01	0.18	0.36	0.02
C6	0.01	0.01	0.12	0.24	0.00	0.13	0.00	0.17	0.00	0.01	0.01	0.01	0.21	0.19	0.01	0.06	0.37	0.42	0.50	0.20
N1	0.02	0.01	0.02	0.16	0.01	0.08	0.01	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.15	0.11	0.01	0.03	0.31	0.32	0.36	0.17
N3	0.03	0.00	0.06	0.24	0.00	0.10	0.01	0.19	0.01	0.01	0.00	0.01	0.23	0.14	0.01	0.04	0.41	0.47	0.31	0.30
O2	0.05	0.00	0.19	0.18	0.01	0.07	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00	0.15	0.28	0.01	0.09	0.31	0.32	0.26	0.23
O2'	0.02	0.18	0.00	0.01	0.26	0.19	0.25	0.08	0.21	0.15	0.23	0.15	0.00	0.04	0.28	0.14	0.22	0.33	0.46	0.26
O3'	0.22	0.16	0.02	0.01	0.17	0.03	0.22	0.13	0.19	0.11	0.14	0.28	0.04	0.00	0.20	0.16	0.25	0.49	0.57	0.32
O4	0.02	0.01	0.04	0.28	0.00	0.14	0.00	0.23	0.01	0.01	0.01	0.01	0.28	0.20	0.00	0.03	0.48	0.62	0.44	0.38
O4'	0.00	0.06	0.01	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.06	0.03	0.04	0.09	0.14	0.16	0.03	0.00	0.07	0.16	0.42	0.25
O5'	0.19	0.34	0.37	0.26	0.45	0.01	0.44	0.01	0.37	0.31	0.41	0.31	0.22	0.25	0.48	0.07	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.19	0.37	0.43	0.37	0.56	0.13	0.55	0.18	0.42	0.32	0.47	0.32	0.33	0.49	0.62	0.16	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.35	0.29	0.40	0.31	0.42	0.32	0.54	0.36	0.50	0.36	0.31	0.26	0.46	0.57	0.44	0.42	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.16	0.23	0.33	0.19	0.33	0.07	0.29	0.02	0.20	0.17	0.30	0.23	0.26	0.32	0.38	0.25	0.01	0.00	0.01	0.00