Doublet Group distance statistics: 50665

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 3, 3, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.010, 0.018, 0.025, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.018 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.017, 0.032, 0.047, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.032 std_dev=0.015
N1	A	0, 0.014, 0.030, 0.046, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.030 std_dev=0.016
N3	A	0, 0.017, 0.034, 0.050, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.034 std_dev=0.017
C4	A	0, 0.021, 0.039, 0.057, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.039 std_dev=0.018
C2	A	0, 0.012, 0.032, 0.052, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.032 std_dev=0.020
C1'	A	0, 0.025, 0.051, 0.078, 0.096 max_d=0.096 avg_d=0.051 std_dev=0.026
N9	A	0, 0.029, 0.058, 0.087, 0.124 max_d=0.124 avg_d=0.058 std_dev=0.029
N7	A	0, 0.042, 0.072, 0.101, 0.113 max_d=0.113 avg_d=0.072 std_dev=0.030
N6	A	0, 0.042, 0.073, 0.105, 0.119 max_d=0.119 avg_d=0.073 std_dev=0.031
C8	A	0, 0.052, 0.088, 0.124, 0.139 max_d=0.139 avg_d=0.088 std_dev=0.036
O4'	A	0, 0.059, 0.141, 0.223, 0.301 max_d=0.301 avg_d=0.141 std_dev=0.082
C2'	A	0, 0.108, 0.193, 0.278, 0.319 max_d=0.319 avg_d=0.193 std_dev=0.085
C3'	A	0, 0.056, 0.189, 0.322, 0.449 max_d=0.449 avg_d=0.189 std_dev=0.133
N1	B	0, 0.168, 0.312, 0.455, 0.559 max_d=0.559 avg_d=0.312 std_dev=0.143
C6	B	0, 0.207, 0.350, 0.494, 0.511 max_d=0.511 avg_d=0.350 std_dev=0.143
C4'	A	0, 0.100, 0.244, 0.387, 0.443 max_d=0.443 avg_d=0.244 std_dev=0.144
O2'	A	0, 0.257, 0.409, 0.562, 0.609 max_d=0.609 avg_d=0.409 std_dev=0.152
C2	B	0, 0.204, 0.361, 0.517, 0.622 max_d=0.622 avg_d=0.361 std_dev=0.157
O2	B	0, 0.240, 0.415, 0.589, 0.648 max_d=0.648 avg_d=0.415 std_dev=0.175
O3'	A	0, 0.134, 0.319, 0.504, 0.627 max_d=0.627 avg_d=0.319 std_dev=0.185
C5	B	0, 0.282, 0.511, 0.739, 0.833 max_d=0.833 avg_d=0.511 std_dev=0.228
C5'	A	0, 0.178, 0.428, 0.678, 0.802 max_d=0.802 avg_d=0.428 std_dev=0.250
N3	B	0, 0.263, 0.576, 0.889, 1.141 max_d=1.141 avg_d=0.576 std_dev=0.313
C1'	B	0, 0.266, 0.589, 0.912, 1.304 max_d=1.304 avg_d=0.589 std_dev=0.323
C4	B	0, 0.356, 0.692, 1.027, 1.215 max_d=1.215 avg_d=0.692 std_dev=0.336
O4'	B	0, 0.376, 0.803, 1.230, 1.497 max_d=1.497 avg_d=0.803 std_dev=0.427
C2'	B	0, 0.410, 0.859, 1.307, 1.769 max_d=1.769 avg_d=0.859 std_dev=0.448
O4	B	0, 0.482, 0.979, 1.477, 1.883 max_d=1.883 avg_d=0.979 std_dev=0.497
O5'	B	0, 0.557, 1.089, 1.622, 1.800 max_d=1.800 avg_d=1.089 std_dev=0.532
P	B	0, 0.541, 1.130, 1.720, 1.897 max_d=1.897 avg_d=1.130 std_dev=0.589
C3'	B	0, 0.559, 1.159, 1.759, 2.247 max_d=2.247 avg_d=1.159 std_dev=0.600
C4'	B	0, 0.557, 1.161, 1.766, 2.219 max_d=2.219 avg_d=1.161 std_dev=0.605
OP2	B	0, 0.551, 1.192, 1.834, 2.042 max_d=2.042 avg_d=1.192 std_dev=0.642
O2'	B	0, 0.464, 1.146, 1.827, 2.577 max_d=2.577 avg_d=1.146 std_dev=0.682
C5'	B	0, 0.609, 1.292, 1.975, 2.271 max_d=2.271 avg_d=1.292 std_dev=0.683
O5'	A	0, 0.027, 0.779, 1.532, 2.719 max_d=2.719 avg_d=0.779 std_dev=0.753
OP1	B	0, 0.540, 1.313, 2.086, 2.497 max_d=2.497 avg_d=1.313 std_dev=0.773
O3'	B	0, 0.733, 1.675, 2.616, 3.444 max_d=3.444 avg_d=1.675 std_dev=0.942
P	A	0, 0.080, 1.029, 1.979, 3.547 max_d=3.547 avg_d=1.029 std_dev=0.950
OP2	A	0, 0.049, 1.212, 2.376, 4.310 max_d=4.310 avg_d=1.212 std_dev=1.163
OP1	A	0, 0.070, 1.373, 2.676, 4.945 max_d=4.945 avg_d=1.373 std_dev=1.303

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.04	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.16	0.15	0.33	0.17
C2	0.04	0.00	0.10	0.13	0.01	0.06	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.17	0.03	0.40	0.34	0.68	0.43
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.06	0.01	0.05	0.01	0.06	0.02	0.09	0.10	0.05	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.25	0.30	0.18	0.19
C3'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.10	0.01	0.10	0.02	0.12	0.07	0.13	0.12	0.12	0.09	0.06	0.01	0.01	0.02	0.34	0.43	0.08	0.25
C4	0.02	0.01	0.06	0.10	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.06	0.11	0.01	0.42	0.37	0.66	0.44
C4'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.07	0.05	0.05	0.07	0.08	0.03	0.03	0.03	0.01	0.02	0.15	0.26	0.02
C5	0.02	0.01	0.05	0.10	0.00	0.06	0.00	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.13	0.02	0.54	0.52	0.86	0.59
C5'	0.02	0.07	0.01	0.02	0.08	0.01	0.12	0.00	0.13	0.13	0.10	0.05	0.15	0.16	0.07	0.03	0.05	0.02	0.01	0.24	0.34	0.02
C6	0.02	0.01	0.06	0.12	0.01	0.06	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.07	0.15	0.02	0.56	0.55	0.94	0.63
C8	0.02	0.01	0.02	0.07	0.01	0.07	0.01	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.08	0.04	0.53	0.50	0.75	0.55
N1	0.03	0.00	0.09	0.13	0.01	0.05	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.17	0.02	0.50	0.46	0.84	0.55
N3	0.04	0.01	0.10	0.12	0.00	0.05	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.14	0.03	0.34	0.28	0.57	0.35
N6	0.02	0.01	0.05	0.12	0.01	0.07	0.01	0.15	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.06	0.16	0.04	0.63	0.65	1.07	0.73
N7	0.02	0.01	0.02	0.09	0.01	0.08	0.01	0.16	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.11	0.04	0.61	0.60	0.94	0.67
N9	0.01	0.01	0.02	0.06	0.00	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.06	0.01	0.38	0.33	0.56	0.38
O2'	0.02	0.11	0.01	0.01	0.06	0.03	0.05	0.03	0.07	0.02	0.09	0.10	0.06	0.02	0.02	0.00	0.04	0.03	0.06	0.18	0.18	0.03
O3'	0.02	0.17	0.02	0.01	0.11	0.03	0.13	0.05	0.15	0.08	0.17	0.14	0.16	0.11	0.06	0.04	0.00	0.03	0.29	0.47	0.19	0.25
O4'	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.04	0.02	0.03	0.04	0.04	0.01	0.03	0.03	0.00	0.09	0.09	0.35	0.14
O5'	0.16	0.40	0.25	0.34	0.42	0.02	0.54	0.01	0.56	0.53	0.50	0.34	0.63	0.61	0.38	0.06	0.29	0.09	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.15	0.34	0.30	0.43	0.37	0.15	0.52	0.24	0.55	0.50	0.46	0.28	0.65	0.60	0.33	0.18	0.47	0.09	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.33	0.68	0.18	0.08	0.66	0.26	0.86	0.34	0.94	0.75	0.84	0.57	1.07	0.94	0.56	0.18	0.19	0.35	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.17	0.43	0.19	0.25	0.44	0.02	0.59	0.02	0.63	0.55	0.55	0.35	0.73	0.67	0.38	0.03	0.25	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.18	0.15	0.26	0.25	0.19	0.19	0.18	0.17	0.16	0.15	0.16	0.16	0.40	0.32	0.24	0.16	0.22	0.25	0.37	0.27
C2	0.18	0.14	0.24	0.19	0.20	0.16	0.19	0.13	0.16	0.15	0.16	0.17	0.38	0.24	0.27	0.16	0.18	0.21	0.33	0.24
C2'	0.17	0.15	0.27	0.26	0.22	0.20	0.20	0.15	0.18	0.16	0.19	0.14	0.43	0.33	0.28	0.16	0.19	0.21	0.36	0.25
C3'	0.20	0.16	0.29	0.27	0.23	0.22	0.23	0.16	0.21	0.19	0.19	0.14	0.45	0.34	0.28	0.18	0.20	0.23	0.38	0.27
C4	0.18	0.14	0.24	0.21	0.18	0.16	0.17	0.13	0.15	0.15	0.14	0.17	0.38	0.26	0.24	0.16	0.20	0.24	0.37	0.26
C4'	0.17	0.14	0.27	0.25	0.19	0.19	0.18	0.16	0.16	0.15	0.15	0.15	0.41	0.33	0.24	0.16	0.21	0.24	0.37	0.27
C5	0.19	0.15	0.22	0.19	0.16	0.14	0.16	0.12	0.15	0.15	0.13	0.18	0.36	0.25	0.22	0.16	0.21	0.28	0.40	0.29
C5'	0.17	0.13	0.25	0.23	0.19	0.17	0.20	0.13	0.17	0.15	0.15	0.14	0.40	0.31	0.24	0.15	0.19	0.23	0.37	0.26
C6	0.19	0.15	0.20	0.17	0.14	0.12	0.16	0.11	0.15	0.15	0.11	0.19	0.33	0.23	0.22	0.16	0.21	0.29	0.42	0.30
C8	0.18	0.14	0.23	0.21	0.16	0.15	0.17	0.13	0.15	0.15	0.13	0.17	0.37	0.28	0.22	0.16	0.22	0.28	0.41	0.29
N1	0.19	0.14	0.21	0.17	0.18	0.13	0.17	0.11	0.15	0.15	0.12	0.19	0.34	0.21	0.27	0.16	0.19	0.25	0.38	0.27
N3	0.18	0.14	0.25	0.22	0.20	0.18	0.18	0.15	0.16	0.15	0.16	0.17	0.40	0.27	0.26	0.16	0.19	0.21	0.33	0.24
N6	0.20	0.16	0.19	0.18	0.12	0.10	0.15	0.12	0.15	0.16	0.13	0.20	0.30	0.24	0.17	0.17	0.24	0.34	0.46	0.33
N7	0.19	0.15	0.22	0.20	0.15	0.14	0.16	0.13	0.15	0.16	0.13	0.18	0.36	0.27	0.20	0.17	0.22	0.31	0.43	0.31
N9	0.18	0.14	0.25	0.22	0.18	0.17	0.17	0.14	0.15	0.15	0.14	0.17	0.39	0.29	0.24	0.16	0.21	0.25	0.38	0.27
O2'	0.19	0.19	0.28	0.27	0.24	0.22	0.22	0.20	0.19	0.18	0.22	0.19	0.42	0.36	0.29	0.19	0.22	0.23	0.36	0.26
O3'	0.24	0.20	0.32	0.30	0.28	0.26	0.27	0.20	0.26	0.23	0.24	0.17	0.48	0.38	0.32	0.22	0.22	0.24	0.40	0.29
O4'	0.18	0.15	0.26	0.26	0.18	0.20	0.18	0.19	0.16	0.16	0.15	0.17	0.40	0.33	0.24	0.17	0.24	0.28	0.38	0.29
O5'	0.39	0.40	0.36	0.39	0.55	0.38	0.55	0.41	0.49	0.42	0.47	0.32	0.43	0.39	0.63	0.41	0.47	0.47	0.63	0.55
OP1	0.34	0.36	0.30	0.28	0.55	0.31	0.54	0.33	0.47	0.39	0.45	0.28	0.41	0.29	0.63	0.37	0.38	0.37	0.55	0.47
OP2	0.76	0.80	0.70	0.74	1.03	0.77	1.04	0.82	0.96	0.84	0.90	0.68	0.70	0.70	1.11	0.80	0.89	0.90	1.06	0.99
P	0.46	0.48	0.41	0.42	0.66	0.45	0.66	0.47	0.60	0.51	0.56	0.40	0.48	0.40	0.74	0.49	0.52	0.51	0.67	0.60

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.04	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.03	0.04	0.01	0.02	0.04	0.01	0.07	0.09	0.10	0.08
C2	0.03	0.00	0.11	0.11	0.02	0.04	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.14	0.13	0.04	0.03	0.12	0.14	0.18	0.14
C2'	0.01	0.11	0.00	0.01	0.07	0.02	0.11	0.02	0.12	0.03	0.08	0.20	0.01	0.02	0.09	0.01	0.04	0.12	0.09	0.05
C3'	0.02	0.11	0.01	0.00	0.19	0.00	0.26	0.01	0.25	0.11	0.14	0.18	0.03	0.01	0.21	0.01	0.06	0.14	0.11	0.08
C4	0.04	0.02	0.07	0.19	0.00	0.11	0.00	0.18	0.00	0.03	0.01	0.03	0.08	0.24	0.00	0.03	0.25	0.29	0.34	0.28
C4'	0.01	0.04	0.02	0.00	0.11	0.00	0.15	0.01	0.14	0.06	0.06	0.07	0.09	0.02	0.12	0.01	0.02	0.07	0.04	0.03
C5	0.02	0.01	0.11	0.26	0.00	0.15	0.00	0.23	0.00	0.02	0.01	0.01	0.07	0.32	0.01	0.04	0.31	0.34	0.37	0.33
C5'	0.02	0.07	0.02	0.01	0.18	0.01	0.23	0.00	0.20	0.10	0.12	0.05	0.08	0.03	0.20	0.02	0.01	0.06	0.02	0.02
C6	0.01	0.01	0.12	0.25	0.00	0.14	0.00	0.20	0.00	0.00	0.02	0.01	0.07	0.29	0.01	0.05	0.27	0.27	0.27	0.25
N1	0.01	0.00	0.03	0.11	0.03	0.06	0.02	0.10	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.11	0.03	0.01	0.14	0.15	0.16	0.14
N3	0.03	0.01	0.08	0.14	0.01	0.06	0.01	0.12	0.02	0.01	0.00	0.02	0.13	0.16	0.03	0.02	0.17	0.20	0.25	0.20
O2	0.04	0.00	0.20	0.18	0.03	0.07	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.00	0.24	0.24	0.04	0.05	0.09	0.11	0.14	0.11
O2'	0.01	0.14	0.01	0.03	0.08	0.09	0.07	0.08	0.07	0.04	0.13	0.24	0.00	0.06	0.09	0.08	0.07	0.13	0.08	0.08
O3'	0.02	0.13	0.02	0.01	0.24	0.02	0.32	0.03	0.29	0.11	0.16	0.24	0.06	0.00	0.28	0.02	0.11	0.19	0.18	0.13
O4	0.04	0.04	0.09	0.21	0.00	0.12	0.01	0.20	0.01	0.03	0.03	0.04	0.09	0.28	0.00	0.03	0.28	0.34	0.39	0.33
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.01	0.04	0.02	0.05	0.01	0.02	0.05	0.08	0.02	0.03	0.00	0.10	0.11	0.14	0.13
O5'	0.07	0.12	0.04	0.06	0.25	0.02	0.31	0.01	0.27	0.14	0.17	0.09	0.07	0.11	0.28	0.10	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.09	0.14	0.12	0.14	0.29	0.07	0.34	0.06	0.27	0.15	0.20	0.11	0.13	0.19	0.34	0.11	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.10	0.18	0.09	0.11	0.34	0.04	0.37	0.02	0.27	0.16	0.25	0.14	0.08	0.18	0.39	0.14	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.14	0.05	0.08	0.28	0.03	0.33	0.02	0.25	0.14	0.20	0.11	0.08	0.13	0.33	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00