Doublet Group distance statistics: 50667

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 1, 4, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.007, 0.013, 0.020, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.013 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.014, 0.025, 0.035, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.025 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.007, 0.018, 0.029, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.018 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.008, 0.020, 0.031, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.020 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.014, 0.027, 0.040, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.027 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.005, 0.020, 0.034, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.020 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.017, 0.032, 0.047, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.032 std_dev=0.015
N9	A	0, 0.010, 0.025, 0.040, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.025 std_dev=0.015
N6	A	0, 0.010, 0.027, 0.044, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.027 std_dev=0.017
N7	A	0, 0.016, 0.040, 0.063, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.040 std_dev=0.023
C8	A	0, 0.014, 0.041, 0.068, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.041 std_dev=0.027
C2'	A	0, -0.012, 0.092, 0.196, 0.360 max_d=0.360 avg_d=0.092 std_dev=0.104
O2'	A	0, 0.076, 0.186, 0.297, 0.424 max_d=0.424 avg_d=0.186 std_dev=0.110
O4'	A	0, 0.024, 0.154, 0.285, 0.409 max_d=0.409 avg_d=0.154 std_dev=0.130
C2	B	0, 0.206, 0.392, 0.578, 0.734 max_d=0.734 avg_d=0.392 std_dev=0.186
C3'	A	0, 0.082, 0.271, 0.461, 0.571 max_d=0.571 avg_d=0.271 std_dev=0.189
C4'	A	0, 0.060, 0.257, 0.455, 0.548 max_d=0.548 avg_d=0.257 std_dev=0.197
P	A	0, 0.119, 0.348, 0.578, 0.630 max_d=0.630 avg_d=0.348 std_dev=0.230
C5	B	0, 0.248, 0.485, 0.722, 0.824 max_d=0.824 avg_d=0.485 std_dev=0.237
C4	B	0, 0.220, 0.469, 0.719, 0.942 max_d=0.942 avg_d=0.469 std_dev=0.250
N1	B	0, 0.130, 0.380, 0.631, 0.868 max_d=0.868 avg_d=0.380 std_dev=0.250
OP2	A	0, 0.171, 0.422, 0.673, 0.809 max_d=0.809 avg_d=0.422 std_dev=0.251
N3	B	0, 0.297, 0.559, 0.822, 1.041 max_d=1.041 avg_d=0.559 std_dev=0.262
O3'	A	0, 0.199, 0.467, 0.736, 0.844 max_d=0.844 avg_d=0.467 std_dev=0.268
O5'	A	0, 0.055, 0.328, 0.601, 0.922 max_d=0.922 avg_d=0.328 std_dev=0.273
O2	B	0, 0.332, 0.610, 0.889, 1.083 max_d=1.083 avg_d=0.610 std_dev=0.279
C6	B	0, 0.262, 0.578, 0.893, 1.112 max_d=1.112 avg_d=0.578 std_dev=0.315
C5'	A	0, 0.041, 0.367, 0.693, 0.989 max_d=0.989 avg_d=0.367 std_dev=0.326
C1'	B	0, 0.326, 0.662, 0.999, 1.204 max_d=1.204 avg_d=0.662 std_dev=0.337
OP1	A	0, 0.111, 0.480, 0.850, 1.061 max_d=1.061 avg_d=0.480 std_dev=0.370
O4'	B	0, 0.524, 0.912, 1.299, 1.463 max_d=1.463 avg_d=0.912 std_dev=0.387
O4	B	0, 0.337, 0.733, 1.129, 1.407 max_d=1.407 avg_d=0.733 std_dev=0.396
C2'	B	0, 0.478, 0.875, 1.272, 1.432 max_d=1.432 avg_d=0.875 std_dev=0.397
C4'	B	0, 0.696, 1.186, 1.677, 1.853 max_d=1.853 avg_d=1.186 std_dev=0.491
C3'	B	0, 0.653, 1.146, 1.640, 1.722 max_d=1.722 avg_d=1.146 std_dev=0.493
O5'	B	0, 0.770, 1.290, 1.809, 1.869 max_d=1.869 avg_d=1.290 std_dev=0.519
OP2	B	0, 0.859, 1.414, 1.969, 2.060 max_d=2.060 avg_d=1.414 std_dev=0.555
P	B	0, 0.971, 1.542, 2.112, 1.934 max_d=1.934 avg_d=1.542 std_dev=0.570
C5'	B	0, 0.825, 1.396, 1.967, 2.132 max_d=2.132 avg_d=1.396 std_dev=0.571
O2'	B	0, 0.582, 1.311, 2.040, 2.584 max_d=2.584 avg_d=1.311 std_dev=0.729
OP1	B	0, 1.243, 1.978, 2.713, 2.491 max_d=2.491 avg_d=1.978 std_dev=0.735
O3'	B	0, 0.818, 1.575, 2.332, 2.525 max_d=2.525 avg_d=1.575 std_dev=0.757

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.05	0.05	0.21	0.15
C2	0.02	0.00	0.07	0.10	0.00	0.04	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.12	0.02	0.12	0.15	0.31	0.20
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.04	0.01	0.03	0.01	0.04	0.05	0.06	0.07	0.04	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.12	0.11	0.07
C3'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.07	0.00	0.09	0.01	0.10	0.10	0.10	0.09	0.11	0.10	0.05	0.01	0.01	0.00	0.03	0.19	0.05	0.04
C4	0.01	0.00	0.04	0.07	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.07	0.01	0.11	0.13	0.29	0.19
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.05	0.06	0.05	0.03	0.07	0.07	0.03	0.04	0.01	0.00	0.01	0.08	0.07	0.05
C5	0.01	0.01	0.03	0.09	0.00	0.05	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.10	0.01	0.13	0.19	0.33	0.22
C5'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.05	0.01	0.08	0.00	0.09	0.09	0.08	0.05	0.11	0.10	0.05	0.04	0.02	0.01	0.01	0.07	0.02	0.01
C6	0.01	0.00	0.04	0.10	0.00	0.05	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.12	0.02	0.15	0.22	0.35	0.23
C8	0.01	0.01	0.05	0.10	0.00	0.06	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.11	0.02	0.13	0.15	0.30	0.19
N1	0.02	0.00	0.06	0.10	0.00	0.05	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.12	0.02	0.14	0.19	0.33	0.22
N3	0.02	0.00	0.07	0.09	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.10	0.02	0.10	0.11	0.28	0.19
N6	0.01	0.00	0.04	0.11	0.01	0.07	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.14	0.02	0.16	0.26	0.36	0.25
N7	0.01	0.01	0.04	0.10	0.01	0.07	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.12	0.02	0.15	0.21	0.34	0.22
N9	0.01	0.01	0.02	0.05	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.01	0.09	0.10	0.27	0.18
O2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.03	0.04	0.02	0.04	0.03	0.03	0.05	0.06	0.03	0.03	0.01	0.00	0.04	0.04	0.02	0.13	0.09	0.05
O3'	0.02	0.12	0.02	0.01	0.07	0.01	0.10	0.02	0.12	0.11	0.12	0.10	0.14	0.12	0.04	0.04	0.00	0.01	0.04	0.29	0.12	0.11
O4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.05	0.07	0.22	0.17
O5'	0.05	0.12	0.03	0.03	0.11	0.01	0.13	0.01	0.15	0.13	0.14	0.10	0.16	0.15	0.09	0.02	0.04	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.05	0.15	0.12	0.19	0.13	0.08	0.19	0.07	0.22	0.15	0.19	0.11	0.26	0.21	0.10	0.13	0.29	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.21	0.31	0.11	0.05	0.29	0.07	0.33	0.02	0.35	0.30	0.33	0.28	0.36	0.34	0.27	0.09	0.12	0.22	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.15	0.20	0.07	0.04	0.19	0.05	0.22	0.01	0.23	0.19	0.22	0.19	0.25	0.22	0.18	0.05	0.11	0.17	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.18	0.18	0.43	0.33	0.25	0.16	0.23	0.15	0.18	0.17	0.20	0.23	0.19	0.24	0.33	0.17	0.22	0.24	0.32	0.25
C2	0.18	0.18	0.39	0.31	0.21	0.16	0.18	0.15	0.16	0.16	0.19	0.23	0.17	0.25	0.28	0.17	0.19	0.19	0.24	0.20
C2'	0.18	0.12	0.40	0.23	0.20	0.16	0.17	0.15	0.11	0.11	0.13	0.19	0.23	0.37	0.30	0.23	0.15	0.15	0.21	0.13
C3'	0.18	0.12	0.34	0.20	0.19	0.19	0.17	0.19	0.10	0.11	0.11	0.20	0.23	0.39	0.31	0.28	0.15	0.14	0.19	0.10
C4	0.17	0.18	0.37	0.34	0.24	0.16	0.22	0.16	0.18	0.16	0.19	0.23	0.17	0.19	0.32	0.16	0.23	0.25	0.32	0.25
C4'	0.17	0.14	0.39	0.29	0.22	0.13	0.20	0.12	0.13	0.13	0.15	0.21	0.19	0.27	0.32	0.20	0.18	0.20	0.30	0.20
C5	0.16	0.17	0.31	0.38	0.24	0.17	0.24	0.19	0.19	0.16	0.19	0.23	0.20	0.13	0.32	0.15	0.27	0.30	0.38	0.31
C5'	0.16	0.15	0.35	0.29	0.23	0.13	0.22	0.14	0.15	0.13	0.16	0.22	0.18	0.25	0.33	0.22	0.20	0.24	0.33	0.22
C6	0.15	0.17	0.28	0.38	0.24	0.18	0.23	0.20	0.19	0.16	0.18	0.22	0.21	0.11	0.32	0.15	0.27	0.30	0.37	0.30
C8	0.16	0.18	0.33	0.38	0.25	0.17	0.24	0.19	0.19	0.16	0.19	0.23	0.19	0.14	0.33	0.15	0.28	0.32	0.41	0.32
N1	0.16	0.18	0.32	0.34	0.22	0.16	0.20	0.17	0.17	0.16	0.19	0.23	0.17	0.15	0.28	0.16	0.22	0.23	0.29	0.24
N3	0.18	0.18	0.41	0.31	0.22	0.16	0.20	0.15	0.16	0.16	0.19	0.23	0.18	0.26	0.30	0.18	0.19	0.19	0.25	0.20
N6	0.14	0.15	0.21	0.42	0.24	0.21	0.25	0.24	0.20	0.15	0.16	0.19	0.29	0.12	0.32	0.16	0.33	0.37	0.44	0.37
N7	0.15	0.17	0.29	0.40	0.24	0.19	0.25	0.21	0.20	0.16	0.18	0.22	0.22	0.12	0.32	0.15	0.30	0.35	0.44	0.35
N9	0.17	0.18	0.38	0.35	0.25	0.16	0.23	0.16	0.18	0.17	0.20	0.23	0.17	0.19	0.33	0.16	0.24	0.27	0.35	0.27
O2'	0.20	0.15	0.48	0.26	0.23	0.16	0.19	0.15	0.15	0.15	0.18	0.19	0.31	0.36	0.32	0.21	0.17	0.17	0.22	0.16
O3'	0.23	0.13	0.36	0.19	0.20	0.27	0.17	0.28	0.12	0.14	0.12	0.21	0.29	0.49	0.31	0.36	0.20	0.18	0.14	0.10
O4'	0.19	0.20	0.44	0.38	0.26	0.18	0.25	0.18	0.20	0.19	0.21	0.24	0.19	0.22	0.34	0.17	0.26	0.29	0.38	0.30
O5'	0.17	0.17	0.27	0.26	0.27	0.15	0.27	0.18	0.20	0.16	0.19	0.23	0.22	0.28	0.36	0.26	0.25	0.27	0.34	0.25
OP1	0.21	0.21	0.23	0.23	0.31	0.21	0.32	0.27	0.26	0.22	0.24	0.23	0.25	0.31	0.38	0.33	0.30	0.30	0.33	0.27
OP2	0.33	0.32	0.27	0.29	0.35	0.30	0.37	0.34	0.34	0.32	0.32	0.36	0.45	0.37	0.40	0.40	0.37	0.36	0.37	0.33
P	0.24	0.23	0.25	0.27	0.26	0.20	0.27	0.24	0.23	0.21	0.22	0.29	0.31	0.27	0.33	0.31	0.28	0.29	0.34	0.26

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.07	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.34	0.02	0.00	0.18	0.22	0.23	0.15
C2	0.01	0.00	0.13	0.19	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.00	0.00	0.00	0.21	0.23	0.01	0.07	0.11	0.09	0.09	0.05
C2'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.02	0.02	0.08	0.19	0.11	0.01	0.09	0.22	0.00	0.05	0.03	0.01	0.41	0.55	0.64	0.50
C3'	0.01	0.19	0.00	0.00	0.37	0.01	0.40	0.01	0.36	0.22	0.28	0.11	0.01	0.00	0.39	0.02	0.05	0.21	0.09	0.07
C4	0.02	0.01	0.02	0.37	0.00	0.15	0.00	0.13	0.01	0.01	0.00	0.01	0.38	0.11	0.00	0.03	0.19	0.21	0.28	0.21
C4'	0.01	0.03	0.02	0.01	0.15	0.00	0.20	0.00	0.19	0.08	0.08	0.06	0.30	0.02	0.16	0.01	0.01	0.11	0.05	0.03
C5	0.01	0.01	0.08	0.40	0.00	0.20	0.00	0.18	0.00	0.01	0.00	0.01	0.38	0.24	0.00	0.09	0.21	0.23	0.27	0.22
C5'	0.07	0.05	0.19	0.01	0.13	0.00	0.18	0.00	0.14	0.05	0.07	0.09	0.10	0.23	0.15	0.01	0.01	0.06	0.02	0.02
C6	0.01	0.01	0.11	0.36	0.01	0.19	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.01	0.31	0.18	0.01	0.11	0.15	0.12	0.11	0.11
N1	0.01	0.00	0.01	0.22	0.01	0.08	0.01	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.21	0.11	0.02	0.01	0.11	0.09	0.09	0.05
N3	0.02	0.00	0.09	0.28	0.00	0.08	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.30	0.10	0.01	0.04	0.13	0.12	0.17	0.13
O2	0.01	0.00	0.22	0.11	0.01	0.06	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00	0.13	0.45	0.02	0.13	0.12	0.14	0.09	0.06
O2'	0.01	0.21	0.00	0.01	0.38	0.30	0.38	0.10	0.31	0.21	0.30	0.13	0.00	0.07	0.41	0.20	0.28	0.44	0.73	0.43
O3'	0.34	0.23	0.05	0.00	0.11	0.02	0.24	0.23	0.18	0.11	0.10	0.45	0.07	0.00	0.15	0.22	0.28	0.28	0.23	0.27
O4	0.02	0.01	0.03	0.39	0.00	0.16	0.00	0.15	0.01	0.02	0.01	0.02	0.41	0.15	0.00	0.03	0.22	0.28	0.37	0.27
O4'	0.00	0.07	0.01	0.02	0.03	0.01	0.09	0.01	0.11	0.01	0.04	0.13	0.20	0.22	0.03	0.00	0.04	0.05	0.12	0.09
O5'	0.18	0.11	0.41	0.05	0.19	0.01	0.21	0.01	0.15	0.11	0.13	0.12	0.28	0.28	0.22	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.22	0.09	0.55	0.21	0.21	0.11	0.23	0.06	0.12	0.09	0.12	0.14	0.44	0.28	0.28	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.23	0.09	0.64	0.09	0.28	0.05	0.27	0.02	0.11	0.09	0.17	0.09	0.73	0.23	0.37	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.15	0.05	0.50	0.07	0.21	0.03	0.22	0.02	0.11	0.05	0.13	0.06	0.43	0.27	0.27	0.09	0.00	0.00	0.01	0.00