Doublet Group distance statistics: 50673

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.001, 0.004, 0.007, 0.007 max_d=0.007 avg_d=0.004 std_dev=0.003
N7	A	0, 0.001, 0.005, 0.010, 0.010 max_d=0.010 avg_d=0.005 std_dev=0.004
N1	A	0, 0.002, 0.007, 0.013, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.007 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.001, 0.006, 0.012, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.006 std_dev=0.005
N9	A	0, 0.002, 0.008, 0.014, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.008 std_dev=0.006
C4	A	0, 0.002, 0.009, 0.016, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.009 std_dev=0.007
C8	A	0, 0.003, 0.011, 0.019, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.003, 0.012, 0.020, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.012 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.003, 0.013, 0.023, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.013 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.005, 0.016, 0.027, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.016 std_dev=0.011
N6	A	0, 0.000, 0.027, 0.053, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.027 std_dev=0.026
N1	B	0, 0.140, 0.513, 0.887, 0.878 max_d=0.878 avg_d=0.513 std_dev=0.373
C6	B	0, 0.078, 0.472, 0.865, 0.964 max_d=0.964 avg_d=0.472 std_dev=0.394
C2	B	0, 0.164, 0.567, 0.970, 0.905 max_d=0.905 avg_d=0.567 std_dev=0.403
N3	B	0, 0.131, 0.560, 0.990, 1.044 max_d=1.044 avg_d=0.560 std_dev=0.430
C1'	B	0, 0.173, 0.614, 1.054, 1.011 max_d=1.011 avg_d=0.614 std_dev=0.440
C5	B	0, 0.146, 0.602, 1.058, 1.103 max_d=1.103 avg_d=0.602 std_dev=0.456
O4'	A	0, 0.170, 0.643, 1.116, 1.126 max_d=1.126 avg_d=0.643 std_dev=0.473
C2'	A	0, 0.162, 0.637, 1.113, 1.143 max_d=1.143 avg_d=0.637 std_dev=0.476
C4	B	0, 0.158, 0.638, 1.118, 1.158 max_d=1.158 avg_d=0.638 std_dev=0.480
O2	B	0, 0.177, 0.666, 1.156, 1.163 max_d=1.163 avg_d=0.666 std_dev=0.490
O4'	B	0, 0.173, 0.681, 1.190, 1.222 max_d=1.222 avg_d=0.681 std_dev=0.509
O2'	A	0, 0.141, 0.673, 1.205, 1.301 max_d=1.301 avg_d=0.673 std_dev=0.532
O4	B	0, 0.229, 0.808, 1.387, 1.327 max_d=1.327 avg_d=0.808 std_dev=0.579
C2'	B	0, 0.239, 0.823, 1.406, 1.293 max_d=1.293 avg_d=0.823 std_dev=0.584
C4'	B	0, 0.259, 0.904, 1.550, 1.464 max_d=1.464 avg_d=0.904 std_dev=0.645
C3'	B	0, 0.272, 0.928, 1.584, 1.392 max_d=1.392 avg_d=0.928 std_dev=0.656
O2'	B	0, 0.267, 0.954, 1.640, 1.589 max_d=1.589 avg_d=0.954 std_dev=0.687
C4'	A	0, 0.270, 0.962, 1.654, 1.597 max_d=1.597 avg_d=0.962 std_dev=0.692
C5'	B	0, 0.298, 1.021, 1.743, 1.563 max_d=1.563 avg_d=1.021 std_dev=0.722
C3'	A	0, 0.275, 1.033, 1.790, 1.794 max_d=1.794 avg_d=1.033 std_dev=0.757
O3'	B	0, 0.342, 1.179, 2.015, 1.853 max_d=1.853 avg_d=1.179 std_dev=0.836
OP1	B	0, 0.225, 1.113, 2.001, 2.173 max_d=2.173 avg_d=1.113 std_dev=0.888
O5'	B	0, 0.313, 1.323, 2.333, 2.450 max_d=2.450 avg_d=1.323 std_dev=1.010
O3'	A	0, 0.355, 1.403, 2.451, 2.517 max_d=2.517 avg_d=1.403 std_dev=1.048
OP2	A	0, 0.442, 1.563, 2.683, 2.572 max_d=2.572 avg_d=1.563 std_dev=1.121
O5'	A	0, 0.475, 1.665, 2.856, 2.713 max_d=2.713 avg_d=1.665 std_dev=1.191
P	A	0, 0.454, 1.648, 2.842, 2.791 max_d=2.791 avg_d=1.648 std_dev=1.194
C5'	A	0, 0.475, 1.694, 2.912, 2.817 max_d=2.817 avg_d=1.694 std_dev=1.219
OP1	A	0, 0.446, 1.695, 2.945, 2.975 max_d=2.975 avg_d=1.695 std_dev=1.250
P	B	0, -0.196, 1.169, 2.533, 3.082 max_d=3.082 avg_d=1.169 std_dev=1.364
OP2	B	0, 0.084, 1.772, 3.460, 4.043 max_d=4.043 avg_d=1.772 std_dev=1.688

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.32	0.26	0.13	0.23
C2	0.01	0.00	0.20	0.24	0.00	0.10	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.18	0.31	0.04	0.58	0.47	0.38	0.44
C2'	0.00	0.20	0.00	0.00	0.11	0.01	0.06	0.01	0.10	0.08	0.16	0.21	0.07	0.04	0.02	0.00	0.00	0.01	0.27	0.24	0.05	0.17
C3'	0.00	0.24	0.00	0.00	0.11	0.01	0.07	0.01	0.11	0.16	0.19	0.22	0.09	0.12	0.05	0.02	0.01	0.02	0.25	0.31	0.03	0.16
C4	0.01	0.00	0.11	0.11	0.00	0.05	0.00	0.16	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.11	0.13	0.02	0.53	0.43	0.32	0.41
C4'	0.01	0.10	0.01	0.01	0.05	0.00	0.08	0.01	0.08	0.15	0.08	0.10	0.09	0.14	0.06	0.02	0.01	0.00	0.00	0.14	0.26	0.09
C5	0.01	0.00	0.06	0.07	0.00	0.08	0.00	0.23	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.08	0.07	0.01	0.58	0.49	0.41	0.47
C5'	0.04	0.14	0.01	0.01	0.16	0.01	0.23	0.00	0.23	0.31	0.18	0.12	0.26	0.32	0.17	0.03	0.04	0.01	0.01	0.29	0.39	0.01
C6	0.01	0.00	0.10	0.11	0.00	0.08	0.00	0.23	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.11	0.14	0.02	0.61	0.52	0.47	0.51
C8	0.00	0.00	0.08	0.16	0.01	0.15	0.00	0.31	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.04	0.15	0.02	0.51	0.42	0.29	0.41
N1	0.01	0.00	0.16	0.19	0.00	0.08	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.15	0.24	0.03	0.61	0.51	0.44	0.49
N3	0.01	0.00	0.21	0.22	0.00	0.10	0.00	0.12	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.17	0.28	0.03	0.52	0.42	0.31	0.39
N6	0.01	0.01	0.07	0.09	0.00	0.09	0.01	0.26	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.10	0.10	0.02	0.63	0.57	0.54	0.55
N7	0.00	0.00	0.04	0.12	0.01	0.14	0.00	0.32	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.04	0.11	0.01	0.56	0.48	0.42	0.48
N9	0.00	0.00	0.02	0.05	0.00	0.06	0.01	0.17	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.03	0.00	0.47	0.37	0.24	0.35
O2'	0.01	0.18	0.00	0.02	0.11	0.02	0.08	0.03	0.11	0.04	0.15	0.17	0.10	0.04	0.04	0.00	0.01	0.05	0.06	0.05	0.12	0.09
O3'	0.00	0.31	0.00	0.01	0.13	0.01	0.07	0.04	0.14	0.15	0.24	0.28	0.10	0.11	0.03	0.01	0.00	0.01	0.05	0.23	0.13	0.05
O4'	0.00	0.04	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.03	0.02	0.01	0.00	0.05	0.01	0.00	0.23	0.25	0.18	0.21
O5'	0.32	0.58	0.27	0.25	0.53	0.00	0.58	0.01	0.61	0.51	0.61	0.52	0.63	0.56	0.47	0.06	0.05	0.23	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.26	0.47	0.24	0.31	0.43	0.14	0.49	0.29	0.52	0.42	0.51	0.42	0.57	0.48	0.37	0.05	0.23	0.25	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.13	0.38	0.05	0.03	0.32	0.26	0.41	0.39	0.47	0.29	0.44	0.31	0.54	0.42	0.24	0.12	0.13	0.18	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.23	0.44	0.17	0.16	0.41	0.09	0.47	0.01	0.51	0.41	0.49	0.39	0.55	0.48	0.35	0.09	0.05	0.21	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.16	0.13	0.31	0.27	0.15	0.18	0.14	0.05	0.11	0.12	0.13	0.16	0.38	0.40	0.20	0.12	0.67	0.50	1.29	0.93
C2	0.14	0.14	0.25	0.21	0.17	0.15	0.15	0.05	0.13	0.12	0.16	0.16	0.31	0.29	0.21	0.12	0.63	0.41	1.21	0.87
C2'	0.27	0.19	0.45	0.41	0.06	0.31	0.08	0.19	0.13	0.19	0.12	0.24	0.54	0.54	0.07	0.21	0.65	0.47	1.28	0.91
C3'	0.26	0.17	0.42	0.36	0.06	0.27	0.06	0.20	0.12	0.18	0.10	0.24	0.52	0.48	0.12	0.21	0.50	0.40	1.17	0.81
C4	0.12	0.10	0.25	0.20	0.14	0.12	0.13	0.03	0.10	0.09	0.11	0.13	0.31	0.31	0.19	0.09	0.64	0.50	1.27	0.92
C4'	0.15	0.06	0.32	0.26	0.11	0.15	0.09	0.07	0.02	0.05	0.02	0.13	0.43	0.39	0.20	0.08	0.54	0.43	1.20	0.84
C5	0.07	0.06	0.19	0.13	0.12	0.04	0.12	0.11	0.08	0.05	0.07	0.09	0.24	0.23	0.17	0.05	0.62	0.56	1.29	0.94
C5'	0.13	0.16	0.18	0.11	0.29	0.13	0.27	0.28	0.20	0.16	0.21	0.15	0.30	0.21	0.37	0.17	0.32	0.28	1.01	0.65
C6	0.04	0.04	0.14	0.08	0.12	0.02	0.12	0.14	0.08	0.04	0.06	0.06	0.19	0.16	0.17	0.05	0.60	0.54	1.27	0.93
C8	0.08	0.06	0.22	0.16	0.11	0.06	0.11	0.10	0.07	0.05	0.06	0.09	0.28	0.28	0.16	0.05	0.63	0.58	1.31	0.96
N1	0.09	0.09	0.18	0.13	0.15	0.07	0.14	0.06	0.10	0.08	0.12	0.10	0.23	0.20	0.19	0.07	0.61	0.47	1.23	0.90
N3	0.16	0.14	0.28	0.25	0.16	0.17	0.15	0.06	0.12	0.12	0.15	0.17	0.35	0.34	0.21	0.12	0.65	0.43	1.23	0.88
N6	0.03	0.04	0.07	0.04	0.11	0.10	0.12	0.25	0.10	0.06	0.05	0.05	0.10	0.07	0.15	0.09	0.55	0.59	1.27	0.93
N7	0.05	0.04	0.17	0.11	0.10	0.01	0.11	0.15	0.07	0.03	0.04	0.07	0.23	0.22	0.15	0.04	0.61	0.61	1.31	0.96
N9	0.12	0.10	0.26	0.22	0.13	0.12	0.12	0.03	0.09	0.08	0.10	0.13	0.33	0.33	0.18	0.08	0.65	0.53	1.30	0.94
O2'	0.35	0.27	0.55	0.53	0.16	0.42	0.17	0.30	0.21	0.27	0.21	0.32	0.65	0.68	0.14	0.31	0.77	0.52	1.34	0.99
O3'	0.38	0.26	0.54	0.49	0.10	0.40	0.13	0.30	0.21	0.28	0.17	0.32	0.67	0.61	0.08	0.33	0.53	0.44	1.18	0.83
O4'	0.16	0.13	0.30	0.26	0.17	0.16	0.17	0.06	0.13	0.12	0.14	0.16	0.38	0.37	0.22	0.12	0.68	0.54	1.32	0.96
O5'	0.69	0.64	0.81	0.75	0.60	0.67	0.62	0.51	0.64	0.65	0.63	0.65	0.88	0.84	0.58	0.64	1.15	1.15	1.89	1.53
OP1	0.60	0.56	0.69	0.62	0.52	0.55	0.52	0.39	0.54	0.56	0.54	0.57	0.76	0.71	0.50	0.55	1.10	1.14	1.86	1.50
OP2	0.53	0.50	0.61	0.55	0.48	0.48	0.49	0.33	0.49	0.50	0.49	0.50	0.67	0.62	0.48	0.49	1.07	1.15	1.85	1.49
P	0.57	0.54	0.67	0.61	0.51	0.54	0.51	0.38	0.52	0.53	0.53	0.56	0.74	0.70	0.49	0.53	1.10	1.12	1.85	1.49

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00	0.25	0.04	0.53	0.38
C2	0.02	0.00	0.14	0.11	0.00	0.02	0.01	0.09	0.01	0.00	0.00	0.00	0.13	0.14	0.01	0.03	0.46	0.30	0.98	0.71
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.02	0.00	0.07	0.01	0.10	0.01	0.10	0.25	0.00	0.01	0.02	0.01	0.28	0.29	0.35	0.21
C3'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.04	0.00	0.15	0.01	0.17	0.01	0.06	0.21	0.01	0.00	0.04	0.02	0.33	0.30	0.19	0.13
C4	0.00	0.00	0.02	0.04	0.00	0.09	0.00	0.22	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.02	0.00	0.02	0.60	0.66	1.31	0.99
C4'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.09	0.00	0.14	0.01	0.13	0.04	0.03	0.08	0.03	0.01	0.09	0.00	0.01	0.34	0.07	0.07
C5	0.01	0.01	0.07	0.15	0.00	0.14	0.00	0.26	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.15	0.00	0.01	0.61	0.70	1.29	1.02
C5'	0.03	0.09	0.01	0.01	0.22	0.01	0.26	0.00	0.23	0.11	0.15	0.04	0.04	0.03	0.23	0.00	0.01	0.10	0.28	0.01
C6	0.01	0.01	0.10	0.17	0.00	0.13	0.00	0.23	0.00	0.00	0.00	0.02	0.07	0.17	0.00	0.02	0.56	0.50	1.06	0.87
N1	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.45	0.28	0.88	0.68
N3	0.01	0.00	0.10	0.06	0.00	0.03	0.00	0.15	0.00	0.01	0.00	0.00	0.10	0.11	0.01	0.03	0.53	0.48	1.16	0.85
O2	0.04	0.00	0.25	0.21	0.00	0.08	0.01	0.04	0.02	0.02	0.00	0.00	0.24	0.27	0.01	0.03	0.40	0.17	0.87	0.60
O2'	0.00	0.13	0.00	0.01	0.03	0.03	0.05	0.04	0.07	0.02	0.10	0.24	0.00	0.03	0.03	0.02	0.07	0.59	0.10	0.09
O3'	0.01	0.14	0.01	0.00	0.02	0.01	0.15	0.03	0.17	0.01	0.11	0.27	0.03	0.00	0.01	0.02	0.20	0.66	0.22	0.17
O4	0.01	0.01	0.02	0.04	0.00	0.09	0.00	0.23	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.62	0.77	1.40	1.06
O4'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.03	0.02	0.02	0.02	0.00	0.10	0.03	0.36	0.29
O5'	0.25	0.46	0.28	0.33	0.60	0.01	0.61	0.01	0.56	0.45	0.53	0.40	0.07	0.20	0.62	0.10	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.04	0.30	0.29	0.30	0.66	0.34	0.70	0.10	0.50	0.28	0.48	0.17	0.59	0.66	0.77	0.03	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.53	0.98	0.35	0.19	1.31	0.07	1.29	0.28	1.06	0.88	1.16	0.87	0.10	0.22	1.40	0.36	0.02	0.00	0.00	0.00
P	0.38	0.71	0.21	0.13	0.99	0.07	1.02	0.01	0.87	0.68	0.85	0.60	0.09	0.17	1.06	0.29	0.01	0.00	0.00	0.00