Doublet Group distance statistics: 50683

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 2, 19, 13, 14, 16, 12, 4, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.011, 0.018, 0.024, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.018 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.015, 0.023, 0.031, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.023 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.020, 0.030, 0.040, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.030 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.014, 0.025, 0.035, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.025 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.016, 0.028, 0.041, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.028 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.016, 0.029, 0.043, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.029 std_dev=0.013
N9	A	0, 0.017, 0.030, 0.044, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.030 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.014, 0.030, 0.047, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.030 std_dev=0.016
N6	A	0, 0.035, 0.057, 0.078, 0.115 max_d=0.115 avg_d=0.057 std_dev=0.021
N7	A	0, 0.022, 0.049, 0.075, 0.126 max_d=0.126 avg_d=0.049 std_dev=0.026
C8	A	0, 0.025, 0.056, 0.087, 0.147 max_d=0.147 avg_d=0.056 std_dev=0.031
N1	B	0, 0.298, 0.439, 0.580, 0.729 max_d=0.729 avg_d=0.439 std_dev=0.141
C2	B	0, 0.302, 0.480, 0.658, 0.828 max_d=0.828 avg_d=0.480 std_dev=0.178
C6	B	0, 0.320, 0.516, 0.711, 1.021 max_d=1.021 avg_d=0.516 std_dev=0.196
C4	B	0, 0.265, 0.469, 0.674, 0.875 max_d=0.875 avg_d=0.469 std_dev=0.205
O4'	A	0, 0.028, 0.233, 0.438, 1.255 max_d=1.255 avg_d=0.233 std_dev=0.205
N3	B	0, 0.263, 0.475, 0.686, 0.965 max_d=0.965 avg_d=0.475 std_dev=0.212
C2'	A	0, 0.003, 0.223, 0.443, 1.397 max_d=1.397 avg_d=0.223 std_dev=0.220
N2	B	0, 0.432, 0.660, 0.888, 1.034 max_d=1.034 avg_d=0.660 std_dev=0.228
C2'	B	0, 0.384, 0.630, 0.875, 1.678 max_d=1.678 avg_d=0.630 std_dev=0.245
O6	B	0, 0.415, 0.663, 0.912, 1.392 max_d=1.392 avg_d=0.663 std_dev=0.248
C1'	B	0, 0.419, 0.671, 0.924, 1.298 max_d=1.298 avg_d=0.671 std_dev=0.253
N9	B	0, 0.339, 0.593, 0.847, 1.156 max_d=1.156 avg_d=0.593 std_dev=0.254
C5	B	0, 0.277, 0.531, 0.785, 1.095 max_d=1.095 avg_d=0.531 std_dev=0.254
C3'	B	0, 0.474, 0.780, 1.087, 1.658 max_d=1.658 avg_d=0.780 std_dev=0.306
C4'	A	0, 0.132, 0.450, 0.769, 2.120 max_d=2.120 avg_d=0.450 std_dev=0.318
O2'	A	0, -0.048, 0.274, 0.597, 1.917 max_d=1.917 avg_d=0.274 std_dev=0.322
O4'	B	0, 0.501, 0.828, 1.156, 1.971 max_d=1.971 avg_d=0.828 std_dev=0.328
C3'	A	0, 0.097, 0.427, 0.757, 2.122 max_d=2.122 avg_d=0.427 std_dev=0.330
C8	B	0, 0.393, 0.733, 1.074, 1.497 max_d=1.497 avg_d=0.733 std_dev=0.340
N7	B	0, 0.365, 0.726, 1.088, 1.595 max_d=1.595 avg_d=0.726 std_dev=0.361
P	A	0, 0.492, 0.868, 1.245, 2.501 max_d=2.501 avg_d=0.868 std_dev=0.376
O5'	A	0, 0.337, 0.727, 1.118, 2.516 max_d=2.516 avg_d=0.727 std_dev=0.391
O2'	B	0, 0.385, 0.780, 1.176, 3.064 max_d=3.064 avg_d=0.780 std_dev=0.396
C4'	B	0, 0.517, 0.922, 1.327, 2.181 max_d=2.181 avg_d=0.922 std_dev=0.405
C5'	A	0, 0.383, 0.794, 1.204, 2.791 max_d=2.791 avg_d=0.794 std_dev=0.411
O3'	B	0, 0.565, 0.977, 1.389, 1.918 max_d=1.918 avg_d=0.977 std_dev=0.412
O3'	A	0, 0.093, 0.568, 1.043, 2.932 max_d=2.932 avg_d=0.568 std_dev=0.475
OP1	A	0, 0.508, 0.986, 1.463, 2.437 max_d=2.437 avg_d=0.986 std_dev=0.477
OP2	A	0, 0.555, 1.042, 1.530, 2.490 max_d=2.490 avg_d=1.042 std_dev=0.488
O5'	B	0, 0.658, 1.203, 1.747, 4.349 max_d=4.349 avg_d=1.203 std_dev=0.545
C5'	B	0, 0.564, 1.121, 1.679, 3.188 max_d=3.188 avg_d=1.121 std_dev=0.557
OP2	B	0, 1.359, 2.261, 3.164, 5.511 max_d=5.511 avg_d=2.261 std_dev=0.902
P	B	0, 0.795, 1.698, 2.601, 6.088 max_d=6.088 avg_d=1.698 std_dev=0.903
OP1	B	0, 0.722, 1.759, 2.796, 7.237 max_d=7.237 avg_d=1.759 std_dev=1.037

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.01	0.11	0.13	0.22	0.11
C2	0.02	0.00	0.15	0.14	0.01	0.05	0.01	0.15	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.15	0.09	0.19	0.18	0.28	0.18
C2'	0.00	0.15	0.00	0.00	0.08	0.02	0.05	0.12	0.07	0.08	0.12	0.15	0.06	0.06	0.02	0.00	0.02	0.01	0.21	0.28	0.27	0.21
C3'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.13	0.00	0.16	0.02	0.17	0.15	0.16	0.13	0.18	0.17	0.10	0.02	0.01	0.01	0.19	0.28	0.15	0.15
C4	0.01	0.01	0.08	0.13	0.00	0.04	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.06	0.09	0.05	0.19	0.17	0.27	0.17
C4'	0.01	0.05	0.02	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.09	0.05	0.04	0.08	0.09	0.04	0.13	0.02	0.00	0.02	0.14	0.17	0.03
C5	0.01	0.01	0.05	0.16	0.00	0.06	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.10	0.10	0.03	0.24	0.22	0.31	0.23
C5'	0.08	0.15	0.12	0.02	0.15	0.01	0.18	0.00	0.18	0.18	0.17	0.13	0.20	0.19	0.13	0.07	0.11	0.01	0.01	0.15	0.19	0.01
C6	0.01	0.01	0.07	0.17	0.01	0.06	0.01	0.18	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.11	0.04	0.25	0.24	0.33	0.25
C8	0.01	0.01	0.08	0.15	0.00	0.09	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.15	0.12	0.06	0.24	0.20	0.28	0.21
N1	0.02	0.00	0.12	0.16	0.01	0.05	0.01	0.17	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.12	0.07	0.22	0.21	0.31	0.22
N3	0.02	0.00	0.15	0.13	0.00	0.04	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.10	0.16	0.09	0.17	0.16	0.26	0.15
N6	0.01	0.01	0.06	0.18	0.01	0.08	0.01	0.20	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.12	0.14	0.04	0.27	0.28	0.36	0.28
N7	0.01	0.01	0.06	0.17	0.00	0.09	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.15	0.14	0.04	0.27	0.25	0.33	0.26
N9	0.01	0.01	0.02	0.10	0.00	0.04	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.07	0.06	0.01	0.18	0.15	0.24	0.15
O2'	0.01	0.10	0.00	0.02	0.06	0.13	0.10	0.07	0.09	0.15	0.08	0.10	0.12	0.15	0.07	0.00	0.04	0.09	0.12	0.23	0.28	0.16
O3'	0.13	0.15	0.02	0.01	0.09	0.02	0.10	0.11	0.11	0.12	0.12	0.16	0.14	0.14	0.06	0.04	0.00	0.12	0.22	0.41	0.26	0.25
O4'	0.01	0.09	0.01	0.01	0.05	0.00	0.03	0.01	0.04	0.06	0.07	0.09	0.04	0.04	0.01	0.09	0.12	0.00	0.11	0.12	0.25	0.14
O5'	0.11	0.19	0.21	0.19	0.19	0.02	0.24	0.01	0.25	0.24	0.22	0.17	0.27	0.27	0.18	0.12	0.22	0.11	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.13	0.18	0.28	0.28	0.17	0.14	0.22	0.15	0.24	0.20	0.21	0.16	0.28	0.25	0.15	0.23	0.41	0.12	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.22	0.28	0.27	0.15	0.27	0.17	0.31	0.19	0.33	0.28	0.31	0.26	0.36	0.33	0.24	0.28	0.26	0.25	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.11	0.18	0.21	0.15	0.17	0.03	0.23	0.01	0.25	0.21	0.22	0.15	0.28	0.26	0.15	0.16	0.25	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.25	0.22	0.16	0.22	0.19	0.14	0.15	0.17	0.14	0.16	0.16	0.27	0.24	0.15	0.20	0.24	0.33	0.29	0.18	0.17	0.21	0.46	0.28
C2	0.23	0.18	0.15	0.22	0.19	0.12	0.17	0.16	0.16	0.19	0.14	0.21	0.20	0.18	0.20	0.20	0.33	0.27	0.18	0.18	0.18	0.42	0.27
C2'	0.32	0.30	0.22	0.23	0.25	0.25	0.18	0.26	0.17	0.19	0.21	0.39	0.32	0.16	0.25	0.30	0.30	0.38	0.22	0.18	0.23	0.42	0.30
C3'	0.28	0.30	0.19	0.23	0.23	0.23	0.19	0.26	0.19	0.19	0.22	0.40	0.30	0.19	0.23	0.26	0.32	0.35	0.22	0.23	0.24	0.45	0.31
C4	0.21	0.21	0.14	0.24	0.17	0.11	0.14	0.16	0.14	0.15	0.15	0.26	0.21	0.14	0.17	0.20	0.36	0.25	0.20	0.17	0.22	0.47	0.30
C4'	0.24	0.23	0.16	0.23	0.18	0.15	0.12	0.18	0.11	0.13	0.15	0.30	0.24	0.11	0.18	0.24	0.35	0.29	0.18	0.15	0.20	0.44	0.26
C5	0.17	0.20	0.15	0.27	0.15	0.10	0.13	0.18	0.13	0.13	0.15	0.27	0.19	0.13	0.14	0.19	0.39	0.20	0.24	0.16	0.27	0.52	0.36
C5'	0.27	0.28	0.23	0.30	0.23	0.22	0.19	0.26	0.18	0.19	0.22	0.35	0.29	0.18	0.23	0.29	0.41	0.32	0.24	0.19	0.24	0.46	0.27
C6	0.15	0.19	0.17	0.29	0.14	0.12	0.13	0.18	0.13	0.13	0.15	0.25	0.18	0.14	0.14	0.19	0.40	0.19	0.25	0.17	0.28	0.52	0.36
C8	0.18	0.22	0.15	0.27	0.15	0.10	0.13	0.18	0.13	0.12	0.16	0.29	0.21	0.13	0.14	0.20	0.39	0.22	0.24	0.16	0.29	0.53	0.36
N1	0.18	0.18	0.15	0.25	0.15	0.10	0.14	0.16	0.14	0.14	0.14	0.22	0.18	0.14	0.16	0.19	0.36	0.21	0.21	0.18	0.22	0.46	0.31
N3	0.25	0.20	0.15	0.22	0.20	0.14	0.17	0.17	0.15	0.19	0.15	0.23	0.22	0.17	0.21	0.22	0.33	0.29	0.18	0.18	0.19	0.43	0.27
N6	0.15	0.19	0.21	0.33	0.15	0.17	0.15	0.23	0.14	0.16	0.17	0.24	0.17	0.17	0.15	0.23	0.43	0.17	0.30	0.18	0.35	0.57	0.43
N7	0.16	0.21	0.16	0.29	0.14	0.12	0.13	0.20	0.13	0.13	0.16	0.29	0.19	0.15	0.13	0.19	0.41	0.19	0.27	0.17	0.32	0.56	0.39
N9	0.21	0.21	0.14	0.24	0.17	0.11	0.14	0.17	0.13	0.14	0.15	0.28	0.22	0.13	0.17	0.21	0.36	0.25	0.20	0.16	0.23	0.48	0.31
O2'	0.36	0.29	0.23	0.19	0.26	0.27	0.20	0.27	0.18	0.22	0.20	0.37	0.33	0.18	0.28	0.35	0.24	0.42	0.23	0.19	0.22	0.39	0.27
O3'	0.28	0.30	0.24	0.26	0.19	0.25	0.12	0.27	0.13	0.11	0.18	0.43	0.30	0.12	0.19	0.32	0.35	0.35	0.19	0.19	0.14	0.37	0.20
O4'	0.26	0.22	0.20	0.27	0.20	0.16	0.16	0.18	0.15	0.17	0.16	0.27	0.24	0.16	0.21	0.27	0.39	0.28	0.22	0.17	0.25	0.49	0.31
O5'	0.36	0.39	0.26	0.30	0.33	0.28	0.30	0.31	0.30	0.29	0.33	0.46	0.38	0.29	0.32	0.35	0.40	0.41	0.37	0.30	0.33	0.56	0.42
OP1	0.37	0.41	0.27	0.32	0.33	0.31	0.30	0.36	0.30	0.30	0.34	0.51	0.40	0.31	0.33	0.36	0.44	0.42	0.41	0.32	0.36	0.58	0.43
OP2	0.39	0.42	0.40	0.48	0.38	0.40	0.38	0.46	0.38	0.39	0.39	0.50	0.41	0.41	0.38	0.42	0.62	0.43	0.50	0.42	0.45	0.65	0.50
P	0.32	0.36	0.30	0.39	0.31	0.30	0.30	0.36	0.30	0.30	0.31	0.43	0.35	0.31	0.30	0.34	0.53	0.37	0.42	0.32	0.38	0.60	0.44

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.11	0.01	0.13	0.01	0.18	0.15	0.17
C2	0.03	0.00	0.32	0.38	0.01	0.11	0.01	0.14	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.21	0.49	0.12	0.17	0.01	0.16	0.33	0.24
C2'	0.00	0.32	0.00	0.00	0.17	0.02	0.09	0.07	0.15	0.15	0.25	0.38	0.32	0.08	0.02	0.00	0.03	0.01	0.18	0.12	0.22	0.25	0.19
C3'	0.01	0.38	0.00	0.00	0.24	0.01	0.20	0.02	0.27	0.14	0.35	0.42	0.34	0.12	0.09	0.03	0.01	0.02	0.15	0.26	0.15	0.20	0.13
C4	0.01	0.01	0.17	0.24	0.00	0.08	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.10	0.26	0.06	0.17	0.01	0.16	0.29	0.24
C4'	0.01	0.11	0.02	0.01	0.08	0.00	0.09	0.01	0.11	0.06	0.11	0.12	0.09	0.08	0.04	0.11	0.02	0.01	0.02	0.11	0.15	0.07	0.08
C5	0.01	0.01	0.09	0.20	0.00	0.09	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.11	0.22	0.03	0.20	0.01	0.20	0.37	0.29
C5'	0.04	0.14	0.07	0.02	0.12	0.01	0.15	0.00	0.17	0.11	0.16	0.14	0.12	0.14	0.09	0.07	0.09	0.02	0.01	0.18	0.07	0.10	0.01
C6	0.01	0.01	0.15	0.27	0.01	0.11	0.01	0.17	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.32	0.05	0.21	0.00	0.21	0.42	0.31
C8	0.01	0.01	0.15	0.14	0.00	0.06	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.17	0.14	0.08	0.22	0.01	0.21	0.29	0.28
N1	0.02	0.00	0.25	0.35	0.01	0.11	0.01	0.16	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.16	0.44	0.09	0.20	0.01	0.18	0.39	0.28
N2	0.03	0.01	0.38	0.42	0.01	0.12	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.28	0.58	0.15	0.17	0.02	0.16	0.32	0.22
N3	0.02	0.01	0.32	0.34	0.00	0.09	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.21	0.42	0.12	0.15	0.01	0.15	0.28	0.22
N7	0.01	0.01	0.08	0.12	0.00	0.08	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.17	0.10	0.05	0.22	0.01	0.24	0.38	0.32
N9	0.00	0.01	0.02	0.09	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.08	0.07	0.01	0.17	0.01	0.16	0.24	0.22
O2'	0.02	0.21	0.00	0.03	0.10	0.11	0.11	0.07	0.12	0.17	0.16	0.28	0.21	0.17	0.08	0.00	0.08	0.08	0.12	0.13	0.24	0.22	0.16
O3'	0.11	0.49	0.03	0.01	0.26	0.02	0.22	0.09	0.32	0.14	0.44	0.58	0.42	0.10	0.07	0.08	0.00	0.07	0.20	0.31	0.21	0.25	0.15
O4'	0.01	0.12	0.01	0.02	0.06	0.01	0.03	0.02	0.05	0.08	0.09	0.15	0.12	0.05	0.01	0.08	0.07	0.00	0.12	0.04	0.22	0.14	0.20
O5'	0.13	0.17	0.18	0.15	0.17	0.02	0.20	0.01	0.21	0.22	0.20	0.17	0.15	0.22	0.17	0.12	0.20	0.12	0.00	0.23	0.02	0.02	0.00
O6	0.01	0.01	0.12	0.26	0.01	0.11	0.01	0.18	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.13	0.31	0.04	0.23	0.00	0.25	0.46	0.34
OP1	0.18	0.16	0.22	0.15	0.16	0.15	0.20	0.07	0.21	0.21	0.18	0.16	0.15	0.24	0.16	0.24	0.21	0.22	0.02	0.25	0.00	0.02	0.01
OP2	0.15	0.33	0.25	0.20	0.29	0.07	0.37	0.10	0.42	0.29	0.39	0.32	0.28	0.38	0.24	0.22	0.25	0.14	0.02	0.46	0.02	0.00	0.01
P	0.17	0.24	0.19	0.13	0.24	0.08	0.29	0.01	0.31	0.28	0.28	0.22	0.22	0.32	0.22	0.16	0.15	0.20	0.00	0.34	0.01	0.01	0.00