Doublet Group distance statistics: 50691

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.001, 0.005, 0.009, 0.011 max_d=0.011 avg_d=0.005 std_dev=0.004
N1	A	0, 0.000, 0.006, 0.013, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.006 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.000, 0.007, 0.013, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.007 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.001, 0.009, 0.017, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.009 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.001, 0.009, 0.017, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.009 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.000, 0.010, 0.019, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.010 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.000, 0.010, 0.020, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.010 std_dev=0.010
N9	A	0, 0.000, 0.012, 0.025, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.012 std_dev=0.012
N7	A	0, -0.002, 0.015, 0.031, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.015 std_dev=0.016
C8	A	0, -0.001, 0.020, 0.042, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.020 std_dev=0.022
N6	A	0, 0.001, 0.024, 0.046, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.024 std_dev=0.022
C5	B	0, 0.006, 0.476, 0.947, 0.961 max_d=0.961 avg_d=0.476 std_dev=0.471
C2'	A	0, -0.096, 0.391, 0.879, 1.196 max_d=1.196 avg_d=0.391 std_dev=0.487
O4'	A	0, -0.097, 0.394, 0.885, 1.204 max_d=1.204 avg_d=0.394 std_dev=0.491
C4	B	0, 0.001, 0.493, 0.985, 1.101 max_d=1.101 avg_d=0.493 std_dev=0.492
N1	B	0, -0.008, 0.521, 1.050, 1.196 max_d=1.196 avg_d=0.521 std_dev=0.529
C2	B	0, 0.003, 0.533, 1.063, 1.155 max_d=1.155 avg_d=0.533 std_dev=0.530
O2'	A	0, -0.090, 0.449, 0.987, 1.326 max_d=1.326 avg_d=0.449 std_dev=0.539
C8	B	0, 0.005, 0.544, 1.083, 1.169 max_d=1.169 avg_d=0.544 std_dev=0.539
N7	B	0, -0.003, 0.570, 1.143, 1.280 max_d=1.280 avg_d=0.570 std_dev=0.573
N9	B	0, 0.011, 0.639, 1.266, 1.271 max_d=1.271 avg_d=0.639 std_dev=0.627
N3	B	0, 0.003, 0.630, 1.257, 1.384 max_d=1.384 avg_d=0.630 std_dev=0.627
C6	B	0, -0.034, 0.594, 1.222, 1.487 max_d=1.487 avg_d=0.594 std_dev=0.628
N2	B	0, -0.044, 0.666, 1.376, 1.699 max_d=1.699 avg_d=0.666 std_dev=0.710
C4'	A	0, -0.153, 0.593, 1.340, 1.829 max_d=1.829 avg_d=0.593 std_dev=0.746
C3'	A	0, -0.158, 0.639, 1.437, 1.955 max_d=1.955 avg_d=0.639 std_dev=0.797
O6	B	0, -0.155, 0.825, 1.805, 2.401 max_d=2.401 avg_d=0.825 std_dev=0.980
C1'	B	0, -0.038, 1.006, 2.051, 2.456 max_d=2.456 avg_d=1.006 std_dev=1.044
O3'	A	0, -0.248, 0.902, 2.052, 2.816 max_d=2.816 avg_d=0.902 std_dev=1.150
O4'	B	0, -0.073, 1.129, 2.331, 2.872 max_d=2.872 avg_d=1.129 std_dev=1.202
C5'	A	0, -0.221, 1.005, 2.230, 3.006 max_d=3.006 avg_d=1.005 std_dev=1.226
O5'	B	0, -0.128, 1.166, 2.459, 3.150 max_d=3.150 avg_d=1.166 std_dev=1.293
O3'	B	0, -0.026, 1.325, 2.677, 3.083 max_d=3.083 avg_d=1.325 std_dev=1.352
C2'	B	0, -0.103, 1.274, 2.652, 3.315 max_d=3.315 avg_d=1.274 std_dev=1.378
C3'	B	0, -0.091, 1.317, 2.725, 3.366 max_d=3.366 avg_d=1.317 std_dev=1.408
P	B	0, -0.327, 1.287, 2.901, 3.963 max_d=3.963 avg_d=1.287 std_dev=1.614
C4'	B	0, -0.128, 1.491, 3.109, 3.900 max_d=3.900 avg_d=1.491 std_dev=1.619
OP2	B	0, -0.492, 1.129, 2.750, 3.908 max_d=3.908 avg_d=1.129 std_dev=1.621
O2'	B	0, -0.164, 1.534, 3.233, 4.107 max_d=4.107 avg_d=1.534 std_dev=1.699
OP1	B	0, -0.248, 1.617, 3.483, 4.569 max_d=4.569 avg_d=1.617 std_dev=1.865
O5'	A	0, -0.501, 1.439, 3.379, 4.720 max_d=4.720 avg_d=1.439 std_dev=1.940
C5'	B	0, -0.197, 1.753, 3.703, 4.736 max_d=4.736 avg_d=1.753 std_dev=1.950
P	A	0, -0.726, 1.769, 4.265, 6.029 max_d=6.029 avg_d=1.769 std_dev=2.496
OP2	A	0, -0.757, 1.784, 4.325, 6.128 max_d=6.128 avg_d=1.784 std_dev=2.541
OP1	A	0, -0.849, 2.074, 4.998, 7.064 max_d=7.064 avg_d=2.074 std_dev=2.923

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.08	0.27	1.00	0.42
C2	0.01	0.00	0.29	0.21	0.00	0.05	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.30	0.32	0.19	0.11	0.88	1.39	0.87
C2'	0.00	0.29	0.00	0.00	0.16	0.01	0.09	0.02	0.15	0.12	0.23	0.28	0.12	0.05	0.02	0.00	0.03	0.00	0.21	0.14	0.63	0.15
C3'	0.01	0.21	0.00	0.00	0.10	0.00	0.05	0.02	0.10	0.14	0.17	0.20	0.08	0.07	0.02	0.01	0.01	0.01	0.31	0.32	0.34	0.15
C4	0.01	0.00	0.16	0.10	0.00	0.04	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.15	0.15	0.10	0.11	0.67	1.20	0.64
C4'	0.00	0.05	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.05	0.04	0.06	0.04	0.02	0.04	0.00	0.00	0.02	0.11	0.60	0.18
C5	0.00	0.00	0.09	0.05	0.00	0.05	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.09	0.08	0.05	0.23	0.74	0.99	0.53
C5'	0.03	0.18	0.02	0.02	0.14	0.01	0.15	0.00	0.18	0.07	0.19	0.16	0.18	0.12	0.09	0.04	0.02	0.01	0.00	0.14	0.32	0.01
C6	0.01	0.00	0.15	0.10	0.00	0.05	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.16	0.16	0.09	0.18	0.88	1.05	0.64
C8	0.01	0.00	0.12	0.14	0.00	0.02	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.09	0.16	0.11	0.47	0.37	0.59	0.15
N1	0.01	0.00	0.23	0.17	0.00	0.05	0.00	0.19	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.25	0.26	0.15	0.10	0.94	1.26	0.80
N3	0.01	0.00	0.28	0.20	0.00	0.04	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.28	0.29	0.18	0.10	0.75	1.38	0.81
N6	0.01	0.01	0.12	0.08	0.00	0.06	0.00	0.18	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.13	0.12	0.07	0.25	0.91	0.84	0.56
N7	0.01	0.00	0.05	0.07	0.00	0.04	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.10	0.05	0.43	0.57	0.59	0.25
N9	0.00	0.00	0.02	0.02	0.00	0.02	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.03	0.01	0.21	0.45	1.01	0.43
O2'	0.01	0.30	0.00	0.01	0.15	0.04	0.09	0.04	0.16	0.09	0.25	0.28	0.13	0.04	0.02	0.00	0.04	0.04	0.05	0.19	0.74	0.24
O3'	0.02	0.32	0.03	0.01	0.15	0.00	0.08	0.02	0.16	0.16	0.26	0.29	0.12	0.10	0.03	0.04	0.00	0.01	0.27	0.58	0.26	0.30
O4'	0.00	0.19	0.00	0.01	0.10	0.00	0.05	0.01	0.09	0.11	0.15	0.18	0.07	0.05	0.01	0.04	0.01	0.00	0.09	0.28	1.04	0.49
O5'	0.08	0.11	0.21	0.31	0.11	0.02	0.23	0.00	0.18	0.47	0.10	0.10	0.25	0.43	0.21	0.05	0.27	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00
OP1	0.27	0.88	0.14	0.32	0.67	0.11	0.74	0.14	0.88	0.37	0.94	0.75	0.91	0.57	0.45	0.19	0.58	0.28	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	1.00	1.39	0.63	0.34	1.20	0.60	0.99	0.32	1.05	0.59	1.26	1.38	0.84	0.59	1.01	0.74	0.26	1.04	0.00	0.01	0.00	0.00
P	0.42	0.87	0.15	0.15	0.64	0.18	0.53	0.01	0.64	0.15	0.80	0.81	0.56	0.25	0.43	0.24	0.30	0.49	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.35	0.22	0.50	0.40	0.35	0.52	0.45	0.87	0.45	0.48	0.33	0.11	0.23	0.52	0.39	0.83	0.32	0.43	0.79	0.54	0.77	0.90	0.84
C2	0.31	0.31	0.38	0.28	0.39	0.38	0.51	0.64	0.57	0.47	0.49	0.15	0.28	0.54	0.39	0.71	0.27	0.36	0.67	0.65	0.61	0.62	0.63
C2'	0.23	0.28	0.29	0.24	0.25	0.31	0.36	0.64	0.38	0.37	0.28	0.42	0.25	0.45	0.27	0.52	0.25	0.26	0.70	0.52	0.67	0.77	0.71
C3'	0.28	0.29	0.43	0.37	0.27	0.47	0.36	0.85	0.35	0.42	0.27	0.43	0.25	0.46	0.31	0.68	0.32	0.35	0.83	0.44	0.84	0.99	0.89
C4	0.35	0.19	0.49	0.38	0.35	0.50	0.46	0.84	0.46	0.49	0.32	0.10	0.22	0.53	0.39	0.82	0.31	0.43	0.78	0.55	0.73	0.84	0.80
C4'	0.49	0.25	0.72	0.66	0.41	0.75	0.47	1.14	0.42	0.56	0.31	0.17	0.29	0.56	0.48	1.03	0.59	0.59	1.00	0.47	1.03	1.19	1.09
C5	0.38	0.09	0.55	0.42	0.32	0.57	0.41	0.93	0.37	0.49	0.20	0.17	0.16	0.52	0.39	0.85	0.34	0.48	0.84	0.45	0.80	0.90	0.87
C5'	0.71	0.33	1.01	0.97	0.54	1.06	0.56	1.46	0.46	0.71	0.35	0.22	0.44	0.66	0.66	1.32	0.90	0.84	1.27	0.47	1.34	1.49	1.38
C6	0.37	0.07	0.53	0.39	0.32	0.54	0.43	0.87	0.39	0.50	0.20	0.22	0.15	0.52	0.40	0.83	0.32	0.46	0.81	0.47	0.74	0.82	0.81
C8	0.39	0.09	0.59	0.47	0.30	0.63	0.38	1.02	0.32	0.49	0.17	0.16	0.15	0.50	0.39	0.89	0.38	0.50	0.90	0.39	0.89	1.03	0.97
N1	0.33	0.21	0.43	0.30	0.37	0.43	0.49	0.71	0.52	0.48	0.39	0.10	0.22	0.54	0.39	0.75	0.28	0.39	0.71	0.59	0.64	0.65	0.67
N3	0.32	0.29	0.41	0.31	0.38	0.41	0.50	0.70	0.54	0.48	0.45	0.15	0.27	0.54	0.39	0.74	0.28	0.38	0.71	0.64	0.65	0.71	0.69
N6	0.40	0.12	0.59	0.43	0.27	0.62	0.36	0.97	0.24	0.50	0.16	0.36	0.08	0.50	0.40	0.85	0.36	0.51	0.87	0.32	0.81	0.88	0.88
N7	0.40	0.06	0.61	0.48	0.28	0.65	0.36	1.04	0.27	0.49	0.12	0.22	0.12	0.49	0.39	0.90	0.39	0.52	0.92	0.34	0.90	1.03	0.98
N9	0.36	0.17	0.53	0.42	0.34	0.55	0.43	0.91	0.42	0.49	0.28	0.11	0.20	0.52	0.39	0.85	0.33	0.46	0.82	0.50	0.79	0.92	0.87
O2'	0.23	0.27	0.26	0.24	0.25	0.26	0.36	0.51	0.41	0.35	0.30	0.39	0.26	0.44	0.25	0.43	0.30	0.23	0.64	0.56	0.61	0.67	0.62
O3'	0.28	0.38	0.35	0.30	0.27	0.38	0.32	0.74	0.31	0.36	0.29	0.58	0.35	0.41	0.28	0.55	0.29	0.30	0.77	0.41	0.79	0.93	0.83
O4'	0.57	0.33	0.79	0.71	0.48	0.80	0.50	1.15	0.45	0.58	0.36	0.21	0.40	0.57	0.54	1.15	0.63	0.66	0.97	0.48	0.97	1.12	1.04
O5'	0.58	0.24	0.95	0.93	0.35	0.96	0.32	1.32	0.30	0.44	0.30	0.21	0.31	0.37	0.46	1.33	0.93	0.68	1.11	0.38	1.14	1.22	1.15
OP1	1.79	1.05	2.25	2.30	1.40	2.34	1.28	2.76	1.02	1.60	0.91	0.88	1.30	1.42	1.61	2.55	2.28	1.96	2.46	0.86	2.62	2.69	2.59
OP2	1.63	1.15	2.08	2.02	1.31	2.00	1.13	2.29	0.93	1.33	0.95	1.11	1.33	1.16	1.44	2.49	2.05	1.69	1.99	0.72	1.97	1.99	1.98
P	1.44	0.86	1.89	1.87	1.09	1.88	0.93	2.22	0.71	1.17	0.69	0.78	1.07	1.00	1.24	2.27	1.89	1.55	1.92	0.55	1.97	2.02	1.96

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.16	0.00	0.12	0.01	0.13	0.24	0.06
C2	0.01	0.00	0.11	0.06	0.01	0.01	0.00	0.21	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.52	0.11	0.01	0.26	0.00	0.17	0.19	0.07
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.07	0.03	0.08	0.15	0.10	0.03	0.11	0.12	0.09	0.05	0.03	0.00	0.01	0.01	0.18	0.11	0.22	0.23	0.10
C3'	0.03	0.06	0.00	0.00	0.15	0.00	0.22	0.03	0.19	0.30	0.12	0.05	0.05	0.30	0.19	0.01	0.00	0.03	0.29	0.22	0.31	0.12	0.20
C4	0.00	0.01	0.07	0.15	0.00	0.04	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.35	0.04	0.01	0.25	0.01	0.16	0.24	0.09
C4'	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.06	0.13	0.03	0.04	0.01	0.12	0.06	0.27	0.03	0.00	0.02	0.08	0.12	0.29	0.02
C5	0.01	0.00	0.08	0.22	0.00	0.07	0.00	0.25	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.34	0.15	0.03	0.28	0.01	0.15	0.28	0.09
C5'	0.08	0.21	0.15	0.03	0.19	0.01	0.25	0.00	0.27	0.24	0.25	0.20	0.17	0.27	0.16	0.12	0.21	0.02	0.00	0.30	0.20	0.40	0.01
C6	0.01	0.00	0.10	0.19	0.01	0.06	0.01	0.27	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.43	0.14	0.03	0.29	0.00	0.15	0.24	0.07
C8	0.01	0.01	0.03	0.30	0.00	0.13	0.00	0.24	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.12	0.21	0.04	0.25	0.01	0.16	0.39	0.13
N1	0.01	0.00	0.11	0.12	0.01	0.03	0.01	0.25	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.50	0.06	0.02	0.28	0.01	0.15	0.20	0.07
N2	0.01	0.00	0.12	0.05	0.01	0.04	0.01	0.20	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.55	0.20	0.00	0.26	0.01	0.18	0.18	0.07
N3	0.01	0.00	0.09	0.05	0.00	0.01	0.00	0.17	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.47	0.13	0.00	0.24	0.01	0.17	0.20	0.07
N7	0.01	0.01	0.05	0.30	0.00	0.12	0.00	0.27	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.22	0.25	0.04	0.27	0.01	0.17	0.38	0.12
N9	0.00	0.01	0.03	0.19	0.00	0.06	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.17	0.05	0.02	0.22	0.01	0.14	0.28	0.09
O2'	0.01	0.52	0.00	0.01	0.35	0.27	0.34	0.12	0.43	0.12	0.50	0.55	0.47	0.22	0.17	0.00	0.07	0.18	0.22	0.43	0.30	0.20	0.17
O3'	0.16	0.11	0.01	0.00	0.04	0.03	0.15	0.21	0.14	0.21	0.06	0.20	0.13	0.25	0.05	0.07	0.00	0.12	0.30	0.19	0.43	0.18	0.29
O4'	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.03	0.02	0.03	0.04	0.02	0.00	0.00	0.04	0.02	0.18	0.12	0.00	0.03	0.04	0.08	0.28	0.07
O5'	0.12	0.26	0.18	0.29	0.25	0.02	0.28	0.00	0.29	0.25	0.28	0.26	0.24	0.27	0.22	0.22	0.30	0.03	0.00	0.30	0.02	0.01	0.00
O6	0.01	0.00	0.11	0.22	0.01	0.08	0.01	0.30	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.43	0.19	0.04	0.30	0.00	0.14	0.25	0.07
OP1	0.13	0.17	0.22	0.31	0.16	0.12	0.15	0.20	0.15	0.16	0.15	0.18	0.17	0.17	0.14	0.30	0.43	0.08	0.02	0.14	0.00	0.00	0.00
OP2	0.24	0.19	0.23	0.12	0.24	0.29	0.28	0.40	0.24	0.39	0.20	0.18	0.20	0.38	0.28	0.20	0.18	0.28	0.01	0.25	0.00	0.00	0.00
P	0.06	0.07	0.10	0.20	0.09	0.02	0.09	0.01	0.07	0.13	0.07	0.07	0.07	0.12	0.09	0.17	0.29	0.07	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00