Doublet Group distance statistics: 50693

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C4	A	0, 0.000, 0.002, 0.005, 0.005 max_d=0.005 avg_d=0.002 std_dev=0.002
N3	A	0, 0.000, 0.004, 0.008, 0.008 max_d=0.008 avg_d=0.004 std_dev=0.004
C2	A	0, 0.000, 0.006, 0.012, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.006 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.000, 0.006, 0.012, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.006 std_dev=0.006
N7	A	0, 0.000, 0.009, 0.019, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.009 std_dev=0.009
N9	A	0, 0.000, 0.010, 0.020, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.010 std_dev=0.010
C8	A	0, 0.000, 0.010, 0.020, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.010 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.000, 0.011, 0.022, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.011 std_dev=0.011
C6	A	0, 0.000, 0.013, 0.027, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.013 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.000, 0.016, 0.033, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.016 std_dev=0.016
N6	A	0, 0.000, 0.035, 0.070, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.035 std_dev=0.035
N9	B	0, 0.000, 0.614, 1.228, 1.228 max_d=1.228 avg_d=0.614 std_dev=0.614
C8	B	0, 0.000, 0.619, 1.238, 1.238 max_d=1.238 avg_d=0.619 std_dev=0.619
C5	B	0, 0.000, 0.629, 1.258, 1.258 max_d=1.258 avg_d=0.629 std_dev=0.629
N7	B	0, 0.000, 0.630, 1.260, 1.260 max_d=1.260 avg_d=0.630 std_dev=0.630
O4'	B	0, 0.000, 0.643, 1.286, 1.286 max_d=1.286 avg_d=0.643 std_dev=0.643
C1'	B	0, 0.000, 0.647, 1.295, 1.295 max_d=1.295 avg_d=0.647 std_dev=0.647
C4	B	0, 0.000, 0.652, 1.303, 1.303 max_d=1.303 avg_d=0.652 std_dev=0.652
O6	B	0, 0.000, 0.669, 1.339, 1.339 max_d=1.339 avg_d=0.669 std_dev=0.669
C6	B	0, 0.000, 0.673, 1.346, 1.346 max_d=1.346 avg_d=0.673 std_dev=0.673
N3	B	0, 0.000, 0.742, 1.483, 1.483 max_d=1.483 avg_d=0.742 std_dev=0.742
C4'	B	0, 0.000, 0.758, 1.517, 1.517 max_d=1.517 avg_d=0.758 std_dev=0.758
N1	B	0, 0.000, 0.765, 1.530, 1.530 max_d=1.530 avg_d=0.765 std_dev=0.765
C2'	B	0, 0.000, 0.770, 1.540, 1.540 max_d=1.540 avg_d=0.770 std_dev=0.770
C3'	B	0, 0.000, 0.796, 1.593, 1.593 max_d=1.593 avg_d=0.796 std_dev=0.796
C2	B	0, 0.000, 0.805, 1.610, 1.610 max_d=1.610 avg_d=0.805 std_dev=0.805
O5'	B	0, 0.000, 0.813, 1.625, 1.625 max_d=1.625 avg_d=0.813 std_dev=0.813
O2'	B	0, 0.000, 0.832, 1.664, 1.664 max_d=1.664 avg_d=0.832 std_dev=0.832
C5'	B	0, 0.000, 0.849, 1.698, 1.698 max_d=1.698 avg_d=0.849 std_dev=0.849
O4'	A	0, 0.000, 0.880, 1.760, 1.760 max_d=1.760 avg_d=0.880 std_dev=0.880
O3'	B	0, 0.000, 0.906, 1.812, 1.812 max_d=1.812 avg_d=0.906 std_dev=0.906
C2'	A	0, 0.000, 0.909, 1.818, 1.818 max_d=1.818 avg_d=0.909 std_dev=0.909
N2	B	0, 0.000, 0.947, 1.893, 1.893 max_d=1.893 avg_d=0.947 std_dev=0.947
C3'	A	0, 0.000, 1.243, 2.487, 2.487 max_d=2.487 avg_d=1.243 std_dev=1.243
OP2	B	0, 0.000, 1.263, 2.526, 2.526 max_d=2.526 avg_d=1.263 std_dev=1.263
P	B	0, 0.000, 1.285, 2.569, 2.569 max_d=2.569 avg_d=1.285 std_dev=1.285
O2'	A	0, 0.000, 1.315, 2.631, 2.631 max_d=2.631 avg_d=1.315 std_dev=1.315
C4'	A	0, 0.000, 1.348, 2.696, 2.696 max_d=2.696 avg_d=1.348 std_dev=1.348
O3'	A	0, 0.000, 1.449, 2.897, 2.897 max_d=2.897 avg_d=1.449 std_dev=1.449
OP1	B	0, 0.000, 1.698, 3.396, 3.396 max_d=3.396 avg_d=1.698 std_dev=1.698
C5'	A	0, 0.000, 1.990, 3.979, 3.979 max_d=3.979 avg_d=1.990 std_dev=1.990
O5'	A	0, 0.000, 2.229, 4.458, 4.458 max_d=4.458 avg_d=2.229 std_dev=2.229
OP2	A	0, 0.000, 2.431, 4.861, 4.861 max_d=4.861 avg_d=2.431 std_dev=2.431
P	A	0, 0.000, 2.467, 4.935, 4.935 max_d=4.935 avg_d=2.467 std_dev=2.467
OP1	A	0, 0.000, 2.666, 5.333, 5.333 max_d=5.333 avg_d=2.666 std_dev=2.666

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.00	0.02	0.26	0.00	0.11	0.01	0.23	0.01
C2	0.01	0.00	0.35	0.23	0.00	0.16	0.00	0.21	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.23	0.10	0.33	0.27	0.19	0.08	0.20
C2'	0.00	0.35	0.00	0.00	0.19	0.00	0.09	0.16	0.16	0.17	0.28	0.35	0.11	0.07	0.01	0.00	0.02	0.01	0.20	0.38	0.58	0.36
C3'	0.00	0.23	0.00	0.00	0.24	0.00	0.30	0.01	0.31	0.26	0.28	0.19	0.34	0.32	0.20	0.02	0.01	0.01	0.03	0.08	0.19	0.08
C4	0.01	0.00	0.19	0.24	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.18	0.36	0.23	0.08	0.26
C4'	0.00	0.16	0.00	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.23	0.09	0.16	0.04	0.19	0.08	0.26	0.01	0.00	0.01	0.13	0.20	0.00
C5	0.01	0.00	0.09	0.30	0.00	0.06	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.19	0.07	0.09	0.53	0.38	0.28	0.44
C5'	0.05	0.21	0.16	0.01	0.07	0.00	0.03	0.00	0.03	0.24	0.14	0.21	0.02	0.20	0.04	0.08	0.18	0.00	0.00	0.25	0.24	0.01
C6	0.02	0.00	0.16	0.31	0.01	0.00	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.11	0.07	0.16	0.51	0.40	0.33	0.44
C8	0.00	0.00	0.17	0.26	0.00	0.23	0.01	0.24	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.43	0.10	0.18	0.62	0.39	0.23	0.49
N1	0.02	0.00	0.28	0.28	0.01	0.09	0.00	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.01	0.27	0.39	0.31	0.22	0.33
N3	0.01	0.00	0.35	0.19	0.00	0.16	0.00	0.21	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.25	0.15	0.32	0.21	0.13	0.01	0.13
N6	0.03	0.01	0.11	0.34	0.01	0.04	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.21	0.13	0.13	0.59	0.49	0.45	0.54
N7	0.00	0.00	0.07	0.32	0.00	0.19	0.00	0.20	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.00	0.00	0.39	0.15	0.09	0.68	0.49	0.41	0.59
N9	0.00	0.00	0.01	0.20	0.00	0.08	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.17	0.05	0.00	0.37	0.20	0.00	0.25
O2'	0.02	0.23	0.00	0.02	0.01	0.26	0.19	0.08	0.11	0.43	0.07	0.25	0.21	0.39	0.17	0.00	0.01	0.19	0.14	0.38	0.64	0.33
O3'	0.26	0.10	0.02	0.01	0.05	0.01	0.07	0.18	0.07	0.10	0.01	0.15	0.13	0.15	0.05	0.01	0.00	0.18	0.14	0.24	0.04	0.15
O4'	0.00	0.33	0.01	0.01	0.18	0.00	0.09	0.00	0.16	0.18	0.27	0.32	0.13	0.09	0.00	0.19	0.18	0.00	0.18	0.21	0.13	0.14
O5'	0.11	0.27	0.20	0.03	0.36	0.01	0.53	0.00	0.51	0.62	0.39	0.21	0.59	0.68	0.37	0.14	0.14	0.18	0.00	0.00	0.01	0.00
OP1	0.01	0.19	0.38	0.08	0.23	0.13	0.38	0.25	0.40	0.39	0.31	0.13	0.49	0.49	0.20	0.38	0.24	0.21	0.00	0.00	0.00	0.00
OP2	0.23	0.08	0.58	0.19	0.08	0.20	0.28	0.24	0.33	0.23	0.22	0.01	0.45	0.41	0.00	0.64	0.04	0.13	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.01	0.20	0.36	0.08	0.26	0.00	0.44	0.01	0.44	0.49	0.33	0.13	0.54	0.59	0.25	0.33	0.15	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.21	0.11	0.10	0.05	0.21	0.14	0.26	0.15	0.26	0.29	0.17	0.00	0.13	0.32	0.23	0.12	0.05	0.22	0.20	0.30	0.71	0.49	0.39
C2	0.15	0.02	0.03	0.03	0.13	0.08	0.17	0.08	0.14	0.22	0.04	0.17	0.04	0.22	0.16	0.06	0.11	0.17	0.12	0.15	0.55	0.33	0.24
C2'	0.12	0.22	0.22	0.22	0.09	0.14	0.01	0.08	0.02	0.04	0.11	0.37	0.21	0.09	0.07	0.24	0.30	0.08	0.01	0.12	0.52	0.33	0.20
C3'	0.08	0.13	0.10	0.13	0.09	0.10	0.07	0.08	0.07	0.05	0.11	0.18	0.12	0.04	0.08	0.08	0.16	0.07	0.06	0.06	0.46	0.18	0.10
C4	0.21	0.08	0.10	0.05	0.20	0.14	0.25	0.15	0.23	0.28	0.14	0.05	0.11	0.30	0.23	0.12	0.04	0.22	0.19	0.26	0.66	0.45	0.36
C4'	0.41	0.37	0.40	0.35	0.38	0.38	0.37	0.36	0.35	0.38	0.36	0.36	0.38	0.37	0.39	0.44	0.32	0.40	0.36	0.32	0.92	0.59	0.54
C5	0.24	0.09	0.14	0.10	0.22	0.18	0.27	0.20	0.25	0.31	0.15	0.03	0.14	0.33	0.26	0.16	0.02	0.26	0.23	0.29	0.69	0.48	0.40
C5'	0.54	0.53	0.57	0.54	0.50	0.53	0.46	0.51	0.45	0.47	0.49	0.55	0.53	0.44	0.50	0.63	0.55	0.52	0.49	0.39	1.09	0.71	0.68
C6	0.23	0.05	0.13	0.08	0.20	0.17	0.25	0.19	0.22	0.30	0.10	0.08	0.11	0.31	0.24	0.15	0.01	0.25	0.22	0.24	0.63	0.43	0.35
C8	0.25	0.13	0.16	0.12	0.25	0.21	0.30	0.23	0.29	0.34	0.19	0.02	0.17	0.36	0.28	0.18	0.04	0.27	0.27	0.33	0.76	0.55	0.46
N1	0.18	0.02	0.07	0.01	0.15	0.12	0.19	0.12	0.15	0.24	0.02	0.18	0.06	0.25	0.19	0.10	0.06	0.20	0.15	0.15	0.56	0.35	0.27
N3	0.16	0.03	0.04	0.01	0.15	0.09	0.20	0.10	0.18	0.24	0.09	0.11	0.07	0.25	0.18	0.07	0.10	0.18	0.14	0.21	0.60	0.38	0.28
N6	0.25	0.05	0.16	0.12	0.22	0.21	0.27	0.23	0.22	0.32	0.08	0.08	0.12	0.33	0.26	0.18	0.06	0.27	0.25	0.25	0.64	0.46	0.39
N7	0.27	0.13	0.19	0.15	0.26	0.23	0.31	0.25	0.29	0.35	0.19	0.01	0.17	0.37	0.29	0.20	0.07	0.29	0.29	0.33	0.75	0.56	0.47
N9	0.22	0.11	0.12	0.07	0.22	0.16	0.27	0.18	0.26	0.30	0.17	0.01	0.14	0.33	0.24	0.14	0.02	0.24	0.22	0.30	0.71	0.50	0.40
O2'	0.00	0.16	0.18	0.17	0.05	0.04	0.21	0.05	0.23	0.26	0.02	0.38	0.13	0.34	0.09	0.24	0.31	0.06	0.17	0.38	0.66	0.55	0.38
O3'	0.17	0.11	0.15	0.12	0.14	0.15	0.14	0.15	0.12	0.17	0.11	0.08	0.12	0.16	0.16	0.19	0.09	0.17	0.16	0.11	0.62	0.33	0.27
O4'	0.56	0.51	0.50	0.44	0.54	0.49	0.53	0.47	0.52	0.55	0.51	0.48	0.52	0.54	0.55	0.56	0.38	0.55	0.47	0.49	1.02	0.72	0.66
O5'	0.09	0.07	0.03	0.06	0.12	0.09	0.16	0.10	0.17	0.17	0.12	0.04	0.08	0.19	0.13	0.03	0.04	0.11	0.14	0.23	0.45	0.08	0.05
OP1	0.03	0.00	0.05	0.04	0.05	0.01	0.09	0.02	0.09	0.10	0.04	0.04	0.01	0.12	0.06	0.10	0.07	0.05	0.05	0.15	0.54	0.18	0.15
OP2	0.02	0.07	0.11	0.09	0.00	0.04	0.05	0.02	0.05	0.08	0.02	0.13	0.06	0.10	0.02	0.16	0.13	0.01	0.02	0.12	0.56	0.19	0.18
P	0.02	0.02	0.06	0.04	0.04	0.00	0.10	0.02	0.10	0.11	0.04	0.07	0.01	0.14	0.06	0.12	0.07	0.05	0.06	0.17	0.54	0.16	0.14

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.19	0.00	0.06
C2	0.02	0.00	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.07	0.02	0.02	0.03	0.01	0.53	0.22	0.16
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.03	0.00	0.04	0.05	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.43	0.14	0.10
C3'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.51	0.18	0.18
C4	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.01	0.03	0.01	0.38	0.14	0.08
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.03	0.18	0.02	0.01
C5	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.01	0.00	0.03	0.01	0.35	0.15	0.08
C5'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.04	0.03	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.00	0.04	0.06	0.01	0.00
C6	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.01	0.03	0.00	0.43	0.20	0.14
C8	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.11	0.02	0.07
N1	0.02	0.00	0.04	0.02	0.01	0.02	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.01	0.02	0.04	0.01	0.52	0.23	0.17
N2	0.03	0.00	0.05	0.03	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.09	0.03	0.03	0.04	0.02	0.59	0.25	0.19
N3	0.02	0.00	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.06	0.01	0.02	0.03	0.00	0.47	0.18	0.12
N7	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.02	0.03	0.19	0.05	0.00
N9	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.03	0.02	0.24	0.05	0.01
O2'	0.00	0.07	0.00	0.01	0.03	0.03	0.03	0.03	0.04	0.01	0.06	0.09	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.05	0.33	0.07	0.02
O3'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.61	0.22	0.23
O4'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.11	0.17
O5'	0.02	0.03	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.00	0.03	0.03	0.04	0.04	0.03	0.02	0.03	0.01	0.03	0.01	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00
O6	0.02	0.01	0.04	0.02	0.01	0.03	0.01	0.04	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.05	0.01	0.02	0.05	0.00	0.42	0.22	0.16
OP1	0.19	0.53	0.43	0.51	0.38	0.18	0.35	0.06	0.43	0.11	0.52	0.59	0.47	0.19	0.24	0.33	0.61	0.00	0.00	0.42	0.00	0.00	0.00
OP2	0.00	0.22	0.14	0.18	0.14	0.02	0.15	0.01	0.20	0.02	0.23	0.25	0.18	0.05	0.05	0.07	0.22	0.11	0.00	0.22	0.00	0.00	0.00
P	0.06	0.16	0.10	0.18	0.08	0.01	0.08	0.00	0.14	0.07	0.17	0.19	0.12	0.00	0.01	0.02	0.23	0.17	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00