Doublet Group distance statistics: 50700

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 7, 5, 9, 9, 6, 3, 3, 1, 0, 0, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.005, 0.010, 0.015, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.010 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.006, 0.014, 0.022, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.014 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.001, 0.011, 0.021, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.011 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.005, 0.016, 0.027, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.016 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.003, 0.015, 0.026, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.015 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.005, 0.016, 0.028, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.016 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.003, 0.015, 0.027, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.015 std_dev=0.012
N9	A	0, 0.006, 0.020, 0.034, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.020 std_dev=0.014
N6	A	0, 0.011, 0.033, 0.054, 0.107 max_d=0.107 avg_d=0.033 std_dev=0.021
N7	A	0, 0.007, 0.031, 0.055, 0.115 max_d=0.115 avg_d=0.031 std_dev=0.024
C8	A	0, 0.008, 0.034, 0.059, 0.118 max_d=0.118 avg_d=0.034 std_dev=0.026
O2'	A	0, 0.036, 0.162, 0.288, 0.523 max_d=0.523 avg_d=0.162 std_dev=0.126
C2'	A	0, -0.001, 0.126, 0.252, 0.608 max_d=0.608 avg_d=0.126 std_dev=0.127
O4'	A	0, -0.017, 0.118, 0.252, 0.670 max_d=0.670 avg_d=0.118 std_dev=0.134
C2	B	0, 0.158, 0.338, 0.518, 0.765 max_d=0.765 avg_d=0.338 std_dev=0.180
O2	B	0, 0.162, 0.350, 0.538, 0.915 max_d=0.915 avg_d=0.350 std_dev=0.188
N3	B	0, 0.159, 0.350, 0.541, 0.865 max_d=0.865 avg_d=0.350 std_dev=0.191
C4	B	0, 0.209, 0.442, 0.675, 1.079 max_d=1.079 avg_d=0.442 std_dev=0.233
C4'	A	0, -0.027, 0.205, 0.438, 1.043 max_d=1.043 avg_d=0.205 std_dev=0.233
C3'	A	0, -0.021, 0.226, 0.472, 1.067 max_d=1.067 avg_d=0.226 std_dev=0.246
N4	B	0, 0.228, 0.510, 0.791, 1.543 max_d=1.543 avg_d=0.510 std_dev=0.281
N1	B	0, 0.138, 0.420, 0.702, 1.429 max_d=1.429 avg_d=0.420 std_dev=0.282
C5	B	0, 0.190, 0.528, 0.866, 1.720 max_d=1.720 avg_d=0.528 std_dev=0.338
C1'	B	0, 0.119, 0.472, 0.824, 1.657 max_d=1.657 avg_d=0.472 std_dev=0.352
C5'	A	0, -0.039, 0.320, 0.680, 1.618 max_d=1.618 avg_d=0.320 std_dev=0.359
P	A	0, 0.057, 0.421, 0.785, 1.753 max_d=1.753 avg_d=0.421 std_dev=0.364
C6	B	0, 0.147, 0.517, 0.887, 1.894 max_d=1.894 avg_d=0.517 std_dev=0.370
O5'	A	0, -0.048, 0.338, 0.725, 1.800 max_d=1.800 avg_d=0.338 std_dev=0.387
O3'	A	0, -0.038, 0.360, 0.757, 1.626 max_d=1.626 avg_d=0.360 std_dev=0.397
C2'	B	0, 0.083, 0.494, 0.906, 1.902 max_d=1.902 avg_d=0.494 std_dev=0.411
O2'	B	0, 0.133, 0.548, 0.964, 2.054 max_d=2.054 avg_d=0.548 std_dev=0.415
OP1	A	0, 0.097, 0.530, 0.964, 1.759 max_d=1.759 avg_d=0.530 std_dev=0.433
OP2	A	0, 0.042, 0.545, 1.048, 2.445 max_d=2.445 avg_d=0.545 std_dev=0.503
O4'	B	0, 0.030, 0.629, 1.228, 2.982 max_d=2.982 avg_d=0.629 std_dev=0.599
C3'	B	0, -0.036, 0.639, 1.314, 3.275 max_d=3.275 avg_d=0.639 std_dev=0.675
C4'	B	0, -0.050, 0.695, 1.441, 3.625 max_d=3.625 avg_d=0.695 std_dev=0.745
O3'	B	0, -0.078, 0.763, 1.605, 4.004 max_d=4.004 avg_d=0.763 std_dev=0.842
C5'	B	0, -0.125, 0.890, 1.904, 4.944 max_d=4.944 avg_d=0.890 std_dev=1.014
O5'	B	0, 0.135, 1.280, 2.424, 5.422 max_d=5.422 avg_d=1.280 std_dev=1.145
OP1	B	0, 0.607, 1.756, 2.905, 6.096 max_d=6.096 avg_d=1.756 std_dev=1.149
P	B	0, -0.219, 1.031, 2.282, 5.899 max_d=5.899 avg_d=1.031 std_dev=1.251
OP2	B	0, -0.178, 1.126, 2.431, 6.136 max_d=6.136 avg_d=1.126 std_dev=1.304

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.08	0.11	0.37	0.12
C2	0.03	0.00	0.13	0.16	0.01	0.06	0.01	0.07	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.21	0.03	0.15	0.16	0.30	0.11
C2'	0.01	0.13	0.00	0.01	0.08	0.01	0.06	0.02	0.08	0.04	0.11	0.12	0.08	0.04	0.03	0.01	0.02	0.01	0.06	0.18	0.34	0.14
C3'	0.01	0.16	0.01	0.00	0.12	0.01	0.13	0.03	0.15	0.11	0.16	0.15	0.15	0.12	0.09	0.03	0.01	0.01	0.06	0.19	0.27	0.13
C4	0.02	0.01	0.08	0.12	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.07	0.14	0.02	0.15	0.13	0.31	0.11
C4'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.05	0.00	0.06	0.01	0.06	0.07	0.06	0.06	0.07	0.07	0.04	0.06	0.03	0.01	0.02	0.08	0.26	0.08
C5	0.01	0.01	0.06	0.13	0.00	0.06	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.16	0.02	0.20	0.14	0.28	0.12
C5'	0.03	0.07	0.02	0.03	0.07	0.01	0.11	0.00	0.11	0.12	0.09	0.06	0.13	0.13	0.07	0.06	0.04	0.02	0.01	0.15	0.12	0.02
C6	0.01	0.01	0.08	0.15	0.01	0.06	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.19	0.03	0.21	0.15	0.26	0.13
C8	0.02	0.02	0.04	0.11	0.01	0.07	0.01	0.12	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.13	0.04	0.21	0.12	0.33	0.12
N1	0.02	0.01	0.11	0.16	0.01	0.06	0.01	0.09	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.21	0.03	0.19	0.16	0.27	0.12
N3	0.03	0.01	0.12	0.15	0.01	0.06	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.17	0.03	0.13	0.14	0.32	0.11
N6	0.02	0.01	0.08	0.15	0.01	0.07	0.01	0.13	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.08	0.19	0.03	0.23	0.16	0.24	0.15
N7	0.01	0.01	0.04	0.12	0.01	0.07	0.01	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.15	0.04	0.23	0.14	0.28	0.14
N9	0.01	0.01	0.03	0.09	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.08	0.01	0.14	0.11	0.34	0.11
O2'	0.01	0.13	0.01	0.03	0.07	0.06	0.06	0.06	0.08	0.02	0.11	0.12	0.08	0.03	0.03	0.00	0.06	0.06	0.05	0.12	0.31	0.11
O3'	0.02	0.21	0.02	0.01	0.14	0.03	0.16	0.04	0.19	0.13	0.21	0.17	0.19	0.15	0.08	0.06	0.00	0.02	0.10	0.22	0.23	0.14
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.04	0.03	0.03	0.03	0.04	0.01	0.06	0.02	0.00	0.08	0.12	0.38	0.14
O5'	0.08	0.15	0.06	0.06	0.15	0.02	0.20	0.01	0.21	0.21	0.19	0.13	0.23	0.23	0.14	0.05	0.10	0.08	0.00	0.03	0.03	0.01
OP1	0.11	0.16	0.18	0.19	0.13	0.08	0.14	0.15	0.15	0.12	0.16	0.14	0.16	0.14	0.11	0.12	0.22	0.12	0.03	0.00	0.01	0.01
OP2	0.37	0.30	0.34	0.27	0.31	0.26	0.28	0.12	0.26	0.33	0.27	0.32	0.24	0.28	0.34	0.31	0.23	0.38	0.03	0.01	0.00	0.01
P	0.12	0.11	0.14	0.13	0.11	0.08	0.12	0.02	0.13	0.12	0.12	0.11	0.15	0.14	0.11	0.11	0.14	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.20	0.09	0.36	0.43	0.19	0.30	0.16	0.31	0.13	0.12	0.15	0.30	0.14	0.41	0.57	0.19	0.42	0.62	0.51	0.44
C2	0.19	0.12	0.32	0.33	0.19	0.24	0.14	0.24	0.13	0.13	0.18	0.26	0.15	0.36	0.42	0.19	0.30	0.43	0.37	0.29
C2'	0.25	0.12	0.44	0.49	0.20	0.36	0.18	0.36	0.17	0.17	0.16	0.29	0.14	0.49	0.65	0.24	0.43	0.64	0.52	0.46
C3'	0.28	0.16	0.46	0.50	0.17	0.37	0.17	0.36	0.19	0.21	0.14	0.24	0.20	0.52	0.64	0.27	0.44	0.63	0.51	0.45
C4	0.17	0.09	0.32	0.36	0.20	0.24	0.16	0.24	0.12	0.11	0.15	0.30	0.14	0.37	0.47	0.16	0.33	0.48	0.42	0.33
C4'	0.21	0.09	0.37	0.43	0.18	0.31	0.15	0.31	0.13	0.13	0.13	0.28	0.14	0.43	0.57	0.20	0.41	0.62	0.49	0.43
C5	0.14	0.08	0.28	0.29	0.20	0.18	0.17	0.18	0.11	0.09	0.13	0.31	0.15	0.32	0.39	0.12	0.27	0.40	0.38	0.27
C5'	0.23	0.13	0.36	0.41	0.17	0.29	0.16	0.30	0.14	0.16	0.13	0.27	0.18	0.42	0.54	0.21	0.40	0.59	0.47	0.40
C6	0.12	0.07	0.24	0.23	0.20	0.14	0.16	0.14	0.10	0.08	0.13	0.30	0.15	0.28	0.31	0.11	0.21	0.31	0.34	0.21
C8	0.15	0.08	0.31	0.35	0.20	0.22	0.18	0.23	0.13	0.10	0.13	0.32	0.15	0.35	0.47	0.14	0.33	0.49	0.45	0.35
N1	0.15	0.09	0.25	0.25	0.19	0.16	0.15	0.16	0.10	0.10	0.17	0.27	0.14	0.30	0.32	0.14	0.22	0.32	0.32	0.21
N3	0.20	0.11	0.35	0.38	0.19	0.28	0.15	0.28	0.13	0.14	0.17	0.28	0.15	0.39	0.50	0.20	0.35	0.52	0.42	0.36
N6	0.11	0.09	0.19	0.17	0.21	0.10	0.19	0.12	0.12	0.08	0.11	0.31	0.17	0.23	0.23	0.10	0.17	0.26	0.36	0.21
N7	0.14	0.08	0.28	0.30	0.21	0.18	0.19	0.19	0.13	0.09	0.12	0.32	0.15	0.32	0.40	0.12	0.28	0.42	0.42	0.30
N9	0.18	0.09	0.34	0.38	0.20	0.26	0.17	0.26	0.12	0.11	0.14	0.31	0.14	0.38	0.51	0.16	0.36	0.54	0.46	0.38
O2'	0.20	0.14	0.39	0.47	0.25	0.34	0.21	0.35	0.18	0.15	0.22	0.34	0.13	0.44	0.64	0.21	0.43	0.67	0.54	0.47
O3'	0.32	0.20	0.50	0.53	0.18	0.41	0.19	0.40	0.22	0.24	0.16	0.23	0.24	0.56	0.68	0.31	0.46	0.65	0.52	0.47
O4'	0.18	0.09	0.33	0.40	0.20	0.28	0.16	0.29	0.12	0.11	0.15	0.32	0.14	0.38	0.54	0.18	0.40	0.61	0.49	0.42
O5'	0.29	0.22	0.40	0.42	0.20	0.33	0.20	0.32	0.21	0.24	0.19	0.25	0.27	0.45	0.54	0.28	0.43	0.55	0.45	0.40
OP1	0.16	0.16	0.32	0.37	0.26	0.23	0.24	0.25	0.19	0.16	0.21	0.35	0.15	0.35	0.51	0.15	0.31	0.54	0.49	0.36
OP2	0.25	0.25	0.32	0.34	0.33	0.26	0.32	0.26	0.28	0.25	0.29	0.40	0.24	0.37	0.43	0.25	0.24	0.42	0.45	0.32
P	0.19	0.13	0.35	0.38	0.17	0.25	0.16	0.25	0.14	0.15	0.13	0.25	0.18	0.40	0.50	0.17	0.32	0.52	0.46	0.35

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.06	0.13	0.24	0.10
C2	0.02	0.00	0.08	0.08	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.09	0.03	0.10	0.13	0.28	0.11
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.06	0.02	0.07	0.02	0.07	0.03	0.07	0.06	0.13	0.01	0.02	0.01	0.09	0.25	0.23	0.10
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.09	0.01	0.11	0.02	0.12	0.05	0.08	0.10	0.12	0.04	0.01	0.01	0.13	0.31	0.22	0.14
C4	0.02	0.01	0.06	0.09	0.00	0.06	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.10	0.03	0.17	0.18	0.34	0.17
C4'	0.01	0.04	0.02	0.01	0.06	0.00	0.08	0.01	0.07	0.03	0.05	0.07	0.05	0.04	0.03	0.01	0.02	0.14	0.16	0.05
C5	0.02	0.01	0.07	0.11	0.01	0.08	0.00	0.12	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.14	0.03	0.20	0.21	0.37	0.20
C5'	0.02	0.06	0.02	0.02	0.10	0.01	0.12	0.00	0.10	0.06	0.08	0.11	0.05	0.04	0.05	0.01	0.03	0.09	0.11	0.02
C6	0.01	0.01	0.07	0.12	0.01	0.07	0.00	0.10	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.13	0.03	0.17	0.18	0.33	0.17
N1	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.05	0.02	0.10	0.13	0.28	0.12
N3	0.02	0.00	0.07	0.08	0.01	0.05	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.08	0.10	0.03	0.13	0.15	0.30	0.13
N4	0.02	0.01	0.06	0.10	0.00	0.07	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.06	0.12	0.03	0.18	0.21	0.36	0.19
O2	0.03	0.01	0.13	0.12	0.02	0.05	0.02	0.05	0.02	0.01	0.02	0.03	0.00	0.14	0.15	0.05	0.08	0.14	0.26	0.10
O2'	0.01	0.08	0.01	0.04	0.05	0.04	0.05	0.04	0.05	0.03	0.08	0.06	0.14	0.00	0.07	0.04	0.07	0.26	0.22	0.10
O3'	0.02	0.09	0.02	0.01	0.10	0.03	0.14	0.05	0.13	0.05	0.10	0.12	0.15	0.07	0.00	0.02	0.16	0.43	0.25	0.21
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03	0.03	0.05	0.04	0.02	0.00	0.10	0.13	0.25	0.14
O5'	0.06	0.10	0.09	0.13	0.17	0.02	0.20	0.03	0.17	0.10	0.13	0.18	0.08	0.07	0.16	0.10	0.00	0.04	0.03	0.01
OP1	0.13	0.13	0.25	0.31	0.18	0.14	0.21	0.09	0.18	0.13	0.15	0.21	0.14	0.26	0.43	0.13	0.04	0.00	0.02	0.01
OP2	0.24	0.28	0.23	0.22	0.34	0.16	0.37	0.11	0.33	0.28	0.30	0.36	0.26	0.22	0.25	0.25	0.03	0.02	0.00	0.01
P	0.10	0.11	0.10	0.14	0.17	0.05	0.20	0.02	0.17	0.12	0.13	0.19	0.10	0.10	0.21	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00