Doublet Group distance statistics: 50701

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 2, 8, 4, 3, 6, 6, 4, 0, 3, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.005, 0.011, 0.017, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.011 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.003, 0.011, 0.019, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.008, 0.018, 0.029, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.018 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.008, 0.019, 0.030, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.019 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.007, 0.019, 0.031, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.019 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.006, 0.017, 0.029, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.017 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.008, 0.024, 0.040, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.024 std_dev=0.016
N9	A	0, 0.010, 0.028, 0.047, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.028 std_dev=0.018
N6	A	0, 0.016, 0.036, 0.056, 0.105 max_d=0.105 avg_d=0.036 std_dev=0.020
N7	A	0, 0.015, 0.037, 0.059, 0.104 max_d=0.104 avg_d=0.037 std_dev=0.022
C8	A	0, 0.018, 0.046, 0.074, 0.123 max_d=0.123 avg_d=0.046 std_dev=0.028
O4'	A	0, 0.249, 0.474, 0.699, 1.259 max_d=1.259 avg_d=0.474 std_dev=0.225
C2'	A	0, 0.323, 0.562, 0.800, 1.338 max_d=1.338 avg_d=0.562 std_dev=0.238
C4	B	0, 0.455, 0.696, 0.937, 1.226 max_d=1.226 avg_d=0.696 std_dev=0.241
C5	B	0, 0.433, 0.681, 0.929, 1.517 max_d=1.517 avg_d=0.681 std_dev=0.248
N3	B	0, 0.420, 0.691, 0.962, 1.240 max_d=1.240 avg_d=0.691 std_dev=0.271
N4	B	0, 0.528, 0.806, 1.085, 1.406 max_d=1.406 avg_d=0.806 std_dev=0.279
C2	B	0, 0.367, 0.648, 0.929, 1.305 max_d=1.305 avg_d=0.648 std_dev=0.281
O2'	A	0, 0.474, 0.762, 1.049, 1.601 max_d=1.601 avg_d=0.762 std_dev=0.288
C6	B	0, 0.333, 0.647, 0.962, 1.785 max_d=1.785 avg_d=0.647 std_dev=0.314
N1	B	0, 0.307, 0.623, 0.940, 1.437 max_d=1.437 avg_d=0.623 std_dev=0.317
C4'	A	0, 0.377, 0.697, 1.017, 1.854 max_d=1.854 avg_d=0.697 std_dev=0.320
O2	B	0, 0.368, 0.707, 1.046, 1.633 max_d=1.633 avg_d=0.707 std_dev=0.339
C3'	A	0, 0.498, 0.855, 1.211, 2.080 max_d=2.080 avg_d=0.855 std_dev=0.356
C1'	B	0, 0.259, 0.688, 1.117, 1.882 max_d=1.882 avg_d=0.688 std_dev=0.429
O5'	A	0, 1.167, 1.599, 2.031, 2.728 max_d=2.728 avg_d=1.599 std_dev=0.432
OP2	A	0, 1.175, 1.618, 2.062, 2.904 max_d=2.904 avg_d=1.618 std_dev=0.444
O4'	B	0, 0.316, 0.781, 1.247, 1.941 max_d=1.941 avg_d=0.781 std_dev=0.466
C3'	B	0, 0.374, 0.847, 1.321, 2.134 max_d=2.134 avg_d=0.847 std_dev=0.473
P	A	0, 1.035, 1.514, 1.992, 3.131 max_d=3.131 avg_d=1.514 std_dev=0.479
C2'	B	0, 0.232, 0.713, 1.194, 2.064 max_d=2.064 avg_d=0.713 std_dev=0.481
C5'	B	0, 0.586, 1.077, 1.569, 2.830 max_d=2.830 avg_d=1.077 std_dev=0.491
C4'	B	0, 0.434, 0.928, 1.421, 2.384 max_d=2.384 avg_d=0.928 std_dev=0.493
O3'	A	0, 0.720, 1.227, 1.733, 2.947 max_d=2.947 avg_d=1.227 std_dev=0.507
O5'	B	0, 0.563, 1.077, 1.591, 3.000 max_d=3.000 avg_d=1.077 std_dev=0.514
C5'	A	0, 0.743, 1.297, 1.852, 3.243 max_d=3.243 avg_d=1.297 std_dev=0.554
O2'	B	0, 0.296, 0.873, 1.451, 2.639 max_d=2.639 avg_d=0.873 std_dev=0.578
O3'	B	0, 0.464, 1.048, 1.633, 2.418 max_d=2.418 avg_d=1.048 std_dev=0.585
OP1	A	0, 0.987, 1.574, 2.161, 3.591 max_d=3.591 avg_d=1.574 std_dev=0.587
P	B	0, 0.700, 1.358, 2.016, 4.010 max_d=4.010 avg_d=1.358 std_dev=0.658
OP1	B	0, 0.730, 1.583, 2.436, 4.789 max_d=4.789 avg_d=1.583 std_dev=0.853
OP2	B	0, 0.623, 1.604, 2.586, 4.442 max_d=4.442 avg_d=1.604 std_dev=0.982

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.09	0.07	0.27	0.11
C2	0.03	0.00	0.16	0.17	0.01	0.06	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.16	0.22	0.06	0.19	0.13	0.29	0.15
C2'	0.00	0.16	0.00	0.01	0.09	0.01	0.06	0.02	0.09	0.07	0.13	0.16	0.08	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.14	0.16	0.17	0.07
C3'	0.01	0.17	0.01	0.00	0.10	0.00	0.08	0.02	0.11	0.10	0.15	0.16	0.10	0.09	0.04	0.02	0.01	0.01	0.19	0.22	0.14	0.13
C4	0.02	0.01	0.09	0.10	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.08	0.12	0.03	0.19	0.13	0.29	0.15
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.05	0.07	0.05	0.05	0.05	0.06	0.03	0.04	0.02	0.00	0.01	0.11	0.22	0.04
C5	0.01	0.01	0.06	0.08	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.11	0.02	0.24	0.17	0.30	0.18
C5'	0.02	0.08	0.02	0.02	0.07	0.01	0.09	0.00	0.10	0.10	0.09	0.07	0.11	0.11	0.06	0.04	0.03	0.01	0.01	0.12	0.21	0.02
C6	0.02	0.01	0.09	0.11	0.01	0.05	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.15	0.03	0.24	0.18	0.30	0.19
C8	0.01	0.01	0.07	0.10	0.00	0.07	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.12	0.04	0.24	0.16	0.30	0.17
N1	0.02	0.01	0.13	0.15	0.01	0.05	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.20	0.05	0.22	0.16	0.30	0.17
N3	0.03	0.00	0.16	0.16	0.00	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.15	0.20	0.05	0.17	0.11	0.28	0.14
N6	0.01	0.01	0.08	0.10	0.01	0.05	0.01	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.08	0.15	0.03	0.27	0.21	0.31	0.21
N7	0.01	0.01	0.05	0.09	0.00	0.06	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.04	0.11	0.03	0.27	0.19	0.31	0.20
N9	0.00	0.01	0.02	0.04	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.01	0.18	0.11	0.29	0.14
O2'	0.01	0.16	0.00	0.02	0.08	0.04	0.06	0.04	0.09	0.05	0.13	0.15	0.08	0.04	0.02	0.00	0.05	0.04	0.06	0.17	0.19	0.06
O3'	0.02	0.22	0.02	0.01	0.12	0.02	0.11	0.03	0.15	0.12	0.20	0.20	0.15	0.11	0.05	0.05	0.00	0.02	0.20	0.33	0.21	0.21
O4'	0.00	0.06	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.04	0.05	0.05	0.03	0.03	0.01	0.04	0.02	0.00	0.10	0.09	0.33	0.16
O5'	0.09	0.19	0.14	0.19	0.19	0.01	0.24	0.01	0.24	0.24	0.22	0.17	0.27	0.27	0.18	0.06	0.20	0.10	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.07	0.13	0.16	0.22	0.13	0.11	0.17	0.12	0.18	0.16	0.16	0.11	0.21	0.19	0.11	0.17	0.33	0.09	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.27	0.29	0.17	0.14	0.29	0.22	0.30	0.21	0.30	0.30	0.30	0.28	0.31	0.31	0.29	0.19	0.21	0.33	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.15	0.07	0.13	0.15	0.04	0.18	0.02	0.19	0.17	0.17	0.14	0.21	0.20	0.14	0.06	0.21	0.16	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.31	0.27	0.32	0.25	0.15	0.25	0.15	0.21	0.17	0.24	0.20	0.20	0.38	0.43	0.28	0.27	0.32	0.78	0.34	0.33
C2	0.30	0.30	0.31	0.25	0.15	0.25	0.15	0.22	0.18	0.25	0.22	0.23	0.40	0.38	0.26	0.26	0.29	0.79	0.27	0.32
C2'	0.44	0.39	0.45	0.39	0.23	0.40	0.23	0.35	0.29	0.37	0.30	0.22	0.49	0.55	0.41	0.41	0.41	0.72	0.36	0.35
C3'	0.46	0.42	0.46	0.39	0.28	0.41	0.28	0.37	0.32	0.39	0.34	0.26	0.52	0.56	0.41	0.44	0.42	0.76	0.37	0.37
C4	0.30	0.29	0.31	0.25	0.17	0.25	0.16	0.22	0.19	0.25	0.23	0.20	0.39	0.39	0.27	0.26	0.31	0.82	0.32	0.33
C4'	0.35	0.31	0.35	0.27	0.19	0.29	0.19	0.25	0.21	0.28	0.24	0.22	0.42	0.47	0.30	0.32	0.34	0.80	0.34	0.35
C5	0.30	0.31	0.32	0.26	0.20	0.25	0.19	0.23	0.21	0.27	0.27	0.20	0.39	0.38	0.27	0.26	0.31	0.88	0.33	0.35
C5'	0.33	0.31	0.32	0.25	0.22	0.26	0.22	0.24	0.22	0.27	0.25	0.26	0.41	0.44	0.26	0.30	0.33	0.87	0.35	0.38
C6	0.30	0.33	0.32	0.26	0.22	0.26	0.21	0.25	0.23	0.28	0.30	0.20	0.39	0.36	0.27	0.27	0.31	0.90	0.32	0.36
C8	0.30	0.30	0.32	0.26	0.19	0.25	0.19	0.23	0.20	0.26	0.25	0.20	0.39	0.39	0.28	0.26	0.31	0.87	0.35	0.35
N1	0.30	0.32	0.31	0.26	0.19	0.26	0.18	0.24	0.21	0.27	0.29	0.19	0.39	0.36	0.27	0.27	0.30	0.86	0.29	0.34
N3	0.30	0.28	0.31	0.25	0.15	0.25	0.15	0.22	0.17	0.24	0.20	0.22	0.39	0.40	0.27	0.26	0.30	0.77	0.29	0.31
N6	0.31	0.34	0.32	0.27	0.27	0.27	0.25	0.27	0.26	0.30	0.33	0.25	0.38	0.35	0.28	0.28	0.33	0.95	0.34	0.39
N7	0.30	0.32	0.32	0.26	0.21	0.25	0.21	0.24	0.22	0.27	0.28	0.21	0.39	0.38	0.28	0.27	0.32	0.90	0.35	0.37
N9	0.30	0.28	0.32	0.25	0.16	0.25	0.16	0.22	0.18	0.25	0.22	0.20	0.38	0.40	0.28	0.26	0.31	0.82	0.33	0.34
O2'	0.46	0.37	0.47	0.41	0.21	0.43	0.22	0.37	0.28	0.37	0.27	0.20	0.48	0.59	0.44	0.44	0.43	0.67	0.37	0.36
O3'	0.55	0.49	0.54	0.48	0.34	0.51	0.34	0.46	0.40	0.48	0.41	0.31	0.59	0.65	0.49	0.54	0.49	0.72	0.40	0.41
O4'	0.28	0.25	0.28	0.21	0.16	0.22	0.16	0.19	0.16	0.21	0.20	0.23	0.36	0.39	0.24	0.24	0.31	0.84	0.34	0.36
O5'	0.30	0.28	0.31	0.24	0.19	0.24	0.21	0.22	0.21	0.25	0.23	0.23	0.38	0.41	0.25	0.27	0.37	0.96	0.40	0.44
OP1	0.29	0.27	0.30	0.21	0.17	0.22	0.18	0.19	0.17	0.23	0.21	0.20	0.38	0.41	0.23	0.25	0.38	0.98	0.43	0.45
OP2	0.35	0.36	0.37	0.31	0.29	0.30	0.29	0.28	0.29	0.32	0.33	0.30	0.43	0.44	0.32	0.31	0.51	1.04	0.55	0.56
P	0.27	0.26	0.29	0.20	0.17	0.20	0.19	0.18	0.17	0.22	0.21	0.21	0.36	0.39	0.22	0.22	0.41	1.02	0.45	0.48

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.01	0.01	0.12	0.27	0.35	0.17
C2	0.02	0.00	0.07	0.10	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.05	0.12	0.03	0.22	0.56	0.24	0.24
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.04	0.01	0.06	0.02	0.07	0.02	0.06	0.04	0.12	0.00	0.02	0.01	0.12	0.16	0.17	0.08
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.08	0.01	0.09	0.02	0.10	0.05	0.10	0.08	0.14	0.01	0.01	0.01	0.14	0.22	0.09	0.10
C4	0.02	0.01	0.04	0.08	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.10	0.03	0.31	0.79	0.24	0.33
C4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.05	0.00	0.06	0.01	0.06	0.03	0.05	0.06	0.05	0.05	0.02	0.00	0.02	0.12	0.31	0.08
C5	0.01	0.01	0.06	0.09	0.00	0.06	0.00	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.12	0.04	0.34	0.79	0.23	0.35
C5'	0.02	0.07	0.02	0.02	0.10	0.01	0.10	0.00	0.09	0.05	0.09	0.12	0.06	0.05	0.04	0.02	0.01	0.27	0.27	0.01
C6	0.01	0.01	0.07	0.10	0.01	0.06	0.01	0.09	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.04	0.12	0.04	0.31	0.62	0.23	0.29
N1	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.05	0.01	0.23	0.49	0.26	0.23
N3	0.02	0.00	0.06	0.10	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.12	0.02	0.26	0.69	0.22	0.29
N4	0.02	0.01	0.04	0.08	0.01	0.06	0.01	0.12	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.11	0.04	0.33	0.87	0.29	0.36
O2	0.04	0.00	0.12	0.14	0.01	0.05	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.10	0.18	0.05	0.18	0.48	0.27	0.22
O2'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.04	0.05	0.04	0.05	0.04	0.02	0.05	0.04	0.10	0.00	0.03	0.04	0.04	0.09	0.26	0.11
O3'	0.01	0.12	0.02	0.01	0.10	0.02	0.12	0.04	0.12	0.05	0.12	0.11	0.18	0.03	0.00	0.02	0.11	0.38	0.15	0.17
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.02	0.04	0.01	0.02	0.04	0.05	0.04	0.02	0.00	0.08	0.18	0.49	0.20
O5'	0.12	0.22	0.12	0.14	0.31	0.02	0.34	0.01	0.31	0.23	0.26	0.33	0.18	0.04	0.11	0.08	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.27	0.56	0.16	0.22	0.79	0.12	0.79	0.27	0.62	0.49	0.69	0.87	0.48	0.09	0.38	0.18	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.35	0.24	0.17	0.09	0.24	0.31	0.23	0.27	0.23	0.26	0.22	0.29	0.27	0.26	0.15	0.49	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.17	0.24	0.08	0.10	0.33	0.08	0.35	0.01	0.29	0.23	0.29	0.36	0.22	0.11	0.17	0.20	0.00	0.01	0.01	0.00