Doublet Group distance statistics: 50702

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 0, 0, 2, 1, 1, 3, 4, 3, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.013, 0.022, 0.031, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.022 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.017, 0.030, 0.042, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.030 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.026, 0.043, 0.060, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.043 std_dev=0.017
C5	A	0, 0.023, 0.041, 0.059, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.041 std_dev=0.018
C1'	A	0, 0.023, 0.041, 0.060, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.041 std_dev=0.018
N3	A	0, 0.024, 0.042, 0.061, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.042 std_dev=0.019
C4	A	0, 0.029, 0.052, 0.075, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.052 std_dev=0.023
N9	A	0, 0.036, 0.060, 0.084, 0.093 max_d=0.093 avg_d=0.060 std_dev=0.024
N7	A	0, 0.049, 0.088, 0.126, 0.144 max_d=0.144 avg_d=0.088 std_dev=0.038
N6	A	0, 0.043, 0.082, 0.121, 0.149 max_d=0.149 avg_d=0.082 std_dev=0.039
C8	A	0, 0.063, 0.106, 0.149, 0.159 max_d=0.159 avg_d=0.106 std_dev=0.043
O4'	A	0, 0.111, 0.207, 0.303, 0.403 max_d=0.403 avg_d=0.207 std_dev=0.096
C2'	A	0, 0.196, 0.334, 0.472, 0.544 max_d=0.544 avg_d=0.334 std_dev=0.138
C4'	A	0, 0.283, 0.436, 0.589, 0.692 max_d=0.692 avg_d=0.436 std_dev=0.153
O2'	A	0, 0.304, 0.470, 0.636, 0.723 max_d=0.723 avg_d=0.470 std_dev=0.166
C3'	A	0, 0.340, 0.509, 0.677, 0.799 max_d=0.799 avg_d=0.509 std_dev=0.168
C2	B	0, 0.342, 0.557, 0.772, 0.911 max_d=0.911 avg_d=0.557 std_dev=0.215
N3	B	0, 0.340, 0.556, 0.773, 0.951 max_d=0.951 avg_d=0.556 std_dev=0.216
O2	B	0, 0.355, 0.583, 0.811, 0.895 max_d=0.895 avg_d=0.583 std_dev=0.228
C5'	A	0, 0.455, 0.700, 0.945, 1.142 max_d=1.142 avg_d=0.700 std_dev=0.245
C4	B	0, 0.432, 0.679, 0.927, 1.080 max_d=1.080 avg_d=0.679 std_dev=0.247
O3'	A	0, 0.501, 0.777, 1.053, 1.258 max_d=1.258 avg_d=0.777 std_dev=0.276
C5	B	0, 0.414, 0.705, 0.997, 1.198 max_d=1.198 avg_d=0.705 std_dev=0.291
N1	B	0, 0.451, 0.752, 1.053, 1.155 max_d=1.155 avg_d=0.752 std_dev=0.301
N4	B	0, 0.620, 0.923, 1.226, 1.234 max_d=1.234 avg_d=0.923 std_dev=0.303
C6	B	0, 0.431, 0.757, 1.083, 1.275 max_d=1.275 avg_d=0.757 std_dev=0.326
O5'	A	0, 0.581, 0.979, 1.376, 2.016 max_d=2.016 avg_d=0.979 std_dev=0.398
O4'	B	0, 0.685, 1.109, 1.533, 1.544 max_d=1.544 avg_d=1.109 std_dev=0.424
C1'	B	0, 0.712, 1.136, 1.561, 1.593 max_d=1.593 avg_d=1.136 std_dev=0.424
P	B	0, 0.608, 1.065, 1.522, 1.891 max_d=1.891 avg_d=1.065 std_dev=0.457
O5'	B	0, 0.672, 1.166, 1.660, 1.979 max_d=1.979 avg_d=1.166 std_dev=0.494
OP1	B	0, 0.781, 1.310, 1.839, 2.223 max_d=2.223 avg_d=1.310 std_dev=0.529
OP2	B	0, 0.663, 1.198, 1.733, 2.132 max_d=2.132 avg_d=1.198 std_dev=0.535
C5'	B	0, 0.743, 1.299, 1.855, 2.071 max_d=2.071 avg_d=1.299 std_dev=0.556
C2'	B	0, 0.966, 1.578, 2.190, 2.186 max_d=2.186 avg_d=1.578 std_dev=0.612
OP1	A	0, 1.025, 1.647, 2.270, 2.703 max_d=2.703 avg_d=1.647 std_dev=0.622
P	A	0, 0.741, 1.413, 2.084, 3.008 max_d=3.008 avg_d=1.413 std_dev=0.672
C4'	B	0, 0.823, 1.499, 2.175, 2.193 max_d=2.193 avg_d=1.499 std_dev=0.676
O2'	B	0, 1.247, 1.952, 2.657, 2.795 max_d=2.795 avg_d=1.952 std_dev=0.705
C3'	B	0, 0.940, 1.789, 2.638, 2.636 max_d=2.636 avg_d=1.789 std_dev=0.849
OP2	A	0, 0.510, 1.560, 2.611, 4.127 max_d=4.127 avg_d=1.560 std_dev=1.051
O3'	B	0, 1.369, 2.509, 3.649, 3.518 max_d=3.518 avg_d=2.509 std_dev=1.140

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.09	0.10	0.21	0.06
C2	0.03	0.00	0.10	0.14	0.01	0.06	0.01	0.09	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.12	0.18	0.04	0.23	0.17	0.66	0.35
C2'	0.01	0.10	0.00	0.01	0.06	0.01	0.05	0.01	0.07	0.05	0.10	0.10	0.07	0.04	0.03	0.01	0.02	0.01	0.19	0.09	0.32	0.11
C3'	0.01	0.14	0.01	0.00	0.09	0.00	0.09	0.02	0.12	0.06	0.15	0.12	0.11	0.06	0.04	0.02	0.01	0.01	0.27	0.08	0.34	0.19
C4	0.02	0.01	0.06	0.09	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.10	0.02	0.22	0.18	0.60	0.34
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.07	0.04	0.07	0.05	0.07	0.05	0.03	0.05	0.02	0.01	0.01	0.23	0.04	0.11
C5	0.01	0.01	0.05	0.09	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.10	0.02	0.27	0.32	0.78	0.49
C5'	0.02	0.09	0.01	0.02	0.07	0.01	0.09	0.00	0.11	0.07	0.11	0.07	0.12	0.09	0.05	0.05	0.03	0.03	0.01	0.09	0.08	0.02
C6	0.01	0.01	0.07	0.12	0.01	0.07	0.01	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.14	0.03	0.28	0.36	0.85	0.53
C8	0.01	0.02	0.05	0.06	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.04	0.07	0.03	0.26	0.30	0.63	0.44
N1	0.02	0.01	0.10	0.15	0.01	0.07	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.18	0.02	0.26	0.28	0.79	0.45
N3	0.03	0.01	0.10	0.12	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.11	0.14	0.04	0.20	0.11	0.55	0.27
N6	0.01	0.01	0.07	0.11	0.01	0.07	0.01	0.12	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.08	0.14	0.04	0.30	0.46	0.96	0.62
N7	0.01	0.01	0.04	0.06	0.01	0.05	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.04	0.08	0.03	0.29	0.41	0.83	0.57
N9	0.01	0.02	0.03	0.04	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.04	0.04	0.01	0.19	0.13	0.47	0.27
O2'	0.02	0.12	0.01	0.02	0.07	0.05	0.06	0.05	0.09	0.04	0.11	0.11	0.08	0.04	0.04	0.00	0.03	0.04	0.08	0.30	0.11	0.12
O3'	0.01	0.18	0.02	0.01	0.10	0.02	0.10	0.03	0.14	0.07	0.18	0.14	0.14	0.08	0.04	0.03	0.00	0.02	0.25	0.13	0.28	0.15
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.03	0.02	0.04	0.04	0.03	0.01	0.04	0.02	0.00	0.08	0.21	0.06	0.13
O5'	0.09	0.23	0.19	0.27	0.22	0.01	0.27	0.01	0.28	0.26	0.26	0.20	0.30	0.29	0.19	0.08	0.25	0.08	0.00	0.02	0.03	0.01
OP1	0.10	0.17	0.09	0.08	0.18	0.23	0.32	0.09	0.36	0.30	0.28	0.11	0.46	0.41	0.13	0.30	0.13	0.21	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.21	0.66	0.32	0.34	0.60	0.04	0.78	0.08	0.85	0.63	0.79	0.55	0.96	0.83	0.47	0.11	0.28	0.06	0.03	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.35	0.11	0.19	0.34	0.11	0.49	0.02	0.53	0.44	0.45	0.27	0.62	0.57	0.27	0.12	0.15	0.13	0.01	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.16	0.09	0.18	0.19	0.26	0.23	0.20	0.21	0.12	0.09	0.21	0.37	0.07	0.36	0.29	0.21	0.16	0.16	0.21	0.13
C2	0.21	0.15	0.23	0.26	0.21	0.27	0.17	0.26	0.15	0.15	0.20	0.26	0.14	0.37	0.35	0.25	0.23	0.25	0.23	0.22
C2'	0.16	0.11	0.19	0.21	0.28	0.25	0.23	0.23	0.16	0.11	0.23	0.39	0.07	0.35	0.33	0.21	0.20	0.20	0.23	0.17
C3'	0.10	0.19	0.15	0.15	0.39	0.16	0.34	0.14	0.24	0.16	0.32	0.50	0.13	0.29	0.26	0.13	0.18	0.16	0.30	0.16
C4	0.16	0.10	0.17	0.17	0.24	0.20	0.19	0.18	0.12	0.10	0.20	0.33	0.07	0.33	0.25	0.20	0.15	0.15	0.20	0.13
C4'	0.09	0.16	0.13	0.13	0.38	0.15	0.33	0.13	0.22	0.13	0.30	0.50	0.09	0.30	0.24	0.13	0.15	0.14	0.30	0.15
C5	0.12	0.09	0.12	0.10	0.25	0.14	0.20	0.11	0.12	0.08	0.21	0.34	0.06	0.28	0.17	0.15	0.11	0.10	0.22	0.10
C5'	0.09	0.23	0.13	0.13	0.46	0.10	0.42	0.11	0.30	0.20	0.37	0.60	0.15	0.25	0.18	0.11	0.20	0.21	0.40	0.24
C6	0.12	0.10	0.12	0.10	0.23	0.13	0.18	0.11	0.12	0.09	0.20	0.29	0.06	0.26	0.17	0.14	0.11	0.11	0.21	0.11
C8	0.11	0.09	0.11	0.08	0.28	0.13	0.23	0.10	0.14	0.07	0.22	0.40	0.08	0.28	0.15	0.14	0.10	0.10	0.25	0.11
N1	0.17	0.14	0.19	0.19	0.20	0.21	0.17	0.20	0.14	0.14	0.20	0.25	0.13	0.32	0.27	0.21	0.18	0.19	0.21	0.17
N3	0.20	0.13	0.22	0.24	0.22	0.27	0.17	0.25	0.14	0.13	0.20	0.30	0.11	0.37	0.34	0.25	0.21	0.23	0.22	0.19
N6	0.07	0.09	0.08	0.08	0.23	0.05	0.19	0.05	0.12	0.07	0.20	0.29	0.05	0.20	0.12	0.09	0.10	0.11	0.23	0.12
N7	0.09	0.09	0.08	0.07	0.28	0.09	0.24	0.07	0.14	0.07	0.22	0.39	0.08	0.24	0.11	0.12	0.10	0.11	0.26	0.12
N9	0.15	0.09	0.16	0.15	0.26	0.19	0.20	0.17	0.12	0.08	0.21	0.37	0.07	0.32	0.23	0.19	0.13	0.12	0.21	0.11
O2'	0.24	0.12	0.26	0.30	0.25	0.36	0.21	0.34	0.17	0.15	0.21	0.36	0.10	0.43	0.43	0.31	0.29	0.31	0.26	0.25
O3'	0.11	0.23	0.17	0.17	0.42	0.16	0.37	0.15	0.27	0.19	0.36	0.53	0.17	0.28	0.28	0.13	0.19	0.16	0.31	0.17
O4'	0.14	0.11	0.16	0.16	0.30	0.19	0.24	0.16	0.15	0.09	0.23	0.42	0.08	0.34	0.25	0.18	0.12	0.12	0.23	0.11
O5'	0.41	0.26	0.38	0.34	0.15	0.44	0.17	0.40	0.23	0.30	0.16	0.22	0.35	0.56	0.41	0.45	0.31	0.28	0.20	0.26
OP1	0.56	0.47	0.50	0.48	0.36	0.58	0.40	0.56	0.46	0.49	0.39	0.31	0.52	0.62	0.50	0.60	0.50	0.48	0.38	0.48
OP2	1.11	1.00	1.01	0.97	0.83	1.10	0.88	1.07	0.97	1.03	0.90	0.71	1.06	1.14	0.97	1.15	0.99	0.94	0.81	0.95
P	0.72	0.62	0.66	0.62	0.49	0.73	0.53	0.71	0.60	0.65	0.54	0.40	0.68	0.79	0.64	0.76	0.64	0.60	0.49	0.61

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.02	0.01	0.09	0.08	0.13	0.07
C2	0.02	0.00	0.06	0.08	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.09	0.02	0.11	0.12	0.20	0.12
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.05	0.02	0.06	0.02	0.07	0.03	0.06	0.05	0.11	0.01	0.02	0.01	0.07	0.10	0.15	0.08
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.10	0.00	0.11	0.02	0.11	0.06	0.09	0.11	0.11	0.02	0.01	0.01	0.09	0.11	0.11	0.08
C4	0.01	0.01	0.05	0.10	0.00	0.05	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.07	0.11	0.03	0.14	0.17	0.24	0.17
C4'	0.01	0.03	0.02	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.06	0.03	0.04	0.05	0.05	0.07	0.03	0.00	0.01	0.06	0.04	0.01
C5	0.01	0.01	0.06	0.11	0.01	0.07	0.00	0.09	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.13	0.03	0.15	0.18	0.23	0.17
C5'	0.03	0.05	0.02	0.02	0.08	0.01	0.09	0.00	0.08	0.04	0.06	0.09	0.05	0.07	0.04	0.02	0.01	0.06	0.03	0.02
C6	0.01	0.01	0.07	0.11	0.01	0.06	0.00	0.08	0.00	0.00	0.02	0.02	0.01	0.04	0.11	0.03	0.14	0.14	0.19	0.14
N1	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.03	0.01	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.05	0.01	0.11	0.10	0.17	0.10
N3	0.02	0.01	0.06	0.09	0.01	0.04	0.01	0.06	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.10	0.02	0.12	0.15	0.23	0.14
N4	0.01	0.01	0.05	0.11	0.01	0.05	0.01	0.09	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.08	0.13	0.03	0.15	0.20	0.26	0.19
O2	0.03	0.01	0.11	0.11	0.02	0.05	0.02	0.05	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.16	0.13	0.03	0.11	0.13	0.20	0.11
O2'	0.02	0.10	0.01	0.02	0.07	0.07	0.05	0.07	0.04	0.04	0.10	0.08	0.16	0.00	0.04	0.05	0.04	0.08	0.10	0.04
O3'	0.02	0.09	0.02	0.01	0.11	0.03	0.13	0.04	0.11	0.05	0.10	0.13	0.13	0.04	0.00	0.02	0.13	0.14	0.11	0.12
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.02	0.03	0.01	0.02	0.03	0.03	0.05	0.02	0.00	0.11	0.09	0.11	0.08
O5'	0.09	0.11	0.07	0.09	0.14	0.01	0.15	0.01	0.14	0.11	0.12	0.15	0.11	0.04	0.13	0.11	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.08	0.12	0.10	0.11	0.17	0.06	0.18	0.06	0.14	0.10	0.15	0.20	0.13	0.08	0.14	0.09	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.13	0.20	0.15	0.11	0.24	0.04	0.23	0.03	0.19	0.17	0.23	0.26	0.20	0.10	0.11	0.11	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.07	0.12	0.08	0.08	0.17	0.01	0.17	0.02	0.14	0.10	0.14	0.19	0.11	0.04	0.12	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00