Doublet Group distance statistics: 50706

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.001, 0.003, 0.005, 0.005 max_d=0.005 avg_d=0.003 std_dev=0.002
C6	A	0, 0.000, 0.005, 0.009, 0.009 max_d=0.009 avg_d=0.005 std_dev=0.004
C1'	A	0, 0.001, 0.005, 0.010, 0.010 max_d=0.010 avg_d=0.005 std_dev=0.004
N1	A	0, 0.001, 0.007, 0.012, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.007 std_dev=0.005
N3	A	0, 0.001, 0.007, 0.013, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.007 std_dev=0.006
N9	A	0, 0.001, 0.008, 0.015, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.008 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.001, 0.009, 0.016, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.009 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.001, 0.010, 0.018, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.010 std_dev=0.009
N7	A	0, 0.003, 0.015, 0.026, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.015 std_dev=0.012
C8	A	0, 0.003, 0.018, 0.032, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.018 std_dev=0.015
N6	A	0, 0.001, 0.017, 0.033, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.017 std_dev=0.016
N1	B	0, 0.006, 0.237, 0.468, 0.472 max_d=0.472 avg_d=0.237 std_dev=0.231
O4'	B	0, 0.006, 0.435, 0.863, 0.869 max_d=0.869 avg_d=0.435 std_dev=0.429
O4'	A	0, 0.002, 0.534, 1.067, 1.068 max_d=1.068 avg_d=0.534 std_dev=0.532
C2'	A	0, 0.001, 0.590, 1.178, 1.181 max_d=1.181 avg_d=0.590 std_dev=0.588
C6	B	0, 0.008, 0.606, 1.204, 1.205 max_d=1.205 avg_d=0.606 std_dev=0.598
C2	B	0, 0.008, 0.649, 1.291, 1.291 max_d=1.291 avg_d=0.649 std_dev=0.642
N3	B	0, 0.010, 0.681, 1.352, 1.354 max_d=1.354 avg_d=0.681 std_dev=0.671
C4'	B	0, 0.006, 0.685, 1.364, 1.372 max_d=1.372 avg_d=0.685 std_dev=0.679
C5'	B	0, 0.007, 0.699, 1.391, 1.396 max_d=1.396 avg_d=0.699 std_dev=0.692
C1'	B	0, 0.006, 0.865, 1.725, 1.730 max_d=1.730 avg_d=0.865 std_dev=0.860
C4	B	0, 0.011, 0.878, 1.744, 1.745 max_d=1.745 avg_d=0.878 std_dev=0.867
C4'	A	0, 0.003, 0.890, 1.777, 1.778 max_d=1.778 avg_d=0.890 std_dev=0.887
C3'	A	0, 0.002, 0.915, 1.827, 1.828 max_d=1.828 avg_d=0.915 std_dev=0.913
O5'	A	0, 0.005, 0.948, 1.890, 1.896 max_d=1.896 avg_d=0.948 std_dev=0.943
O2'	A	0, 0.001, 0.970, 1.940, 1.944 max_d=1.944 avg_d=0.970 std_dev=0.969
C5	B	0, 0.009, 1.029, 2.048, 2.049 max_d=2.049 avg_d=1.029 std_dev=1.019
P	A	0, 0.007, 1.132, 2.258, 2.263 max_d=2.263 avg_d=1.132 std_dev=1.125
C5'	A	0, 0.005, 1.134, 2.263, 2.268 max_d=2.268 avg_d=1.134 std_dev=1.129
O3'	B	0, 0.005, 1.178, 2.350, 2.358 max_d=2.358 avg_d=1.178 std_dev=1.173
C3'	B	0, 0.006, 1.207, 2.408, 2.412 max_d=2.412 avg_d=1.207 std_dev=1.201
O2	B	0, 0.007, 1.326, 2.645, 2.647 max_d=2.647 avg_d=1.326 std_dev=1.319
O3'	A	0, 0.002, 1.352, 2.702, 2.704 max_d=2.704 avg_d=1.352 std_dev=1.350
OP2	A	0, 0.008, 1.363, 2.719, 2.722 max_d=2.722 avg_d=1.363 std_dev=1.356
O5'	B	0, 0.008, 1.384, 2.760, 2.773 max_d=2.773 avg_d=1.384 std_dev=1.376
N4	B	0, 0.012, 1.416, 2.821, 2.824 max_d=2.824 avg_d=1.416 std_dev=1.404
OP1	A	0, 0.008, 1.534, 3.060, 3.068 max_d=3.068 avg_d=1.534 std_dev=1.526
C2'	B	0, 0.006, 1.638, 3.270, 3.274 max_d=3.274 avg_d=1.638 std_dev=1.632
P	B	0, 0.010, 2.172, 4.334, 4.348 max_d=4.348 avg_d=2.172 std_dev=2.162
OP2	B	0, 0.012, 2.442, 4.872, 4.883 max_d=4.883 avg_d=2.442 std_dev=2.430
OP1	B	0, 0.011, 2.567, 5.123, 5.138 max_d=5.138 avg_d=2.567 std_dev=2.556
O2'	B	0, 0.006, 2.588, 5.170, 5.174 max_d=5.174 avg_d=2.588 std_dev=2.582

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.30	0.00	0.07	0.08	0.04	0.02
C2	0.00	0.00	0.30	0.21	0.00	0.07	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.08	0.20	0.21	0.11	0.12	0.41	0.24
C2'	0.00	0.30	0.00	0.00	0.16	0.00	0.07	0.19	0.14	0.16	0.24	0.29	0.09	0.08	0.01	0.00	0.02	0.02	0.40	0.46	0.55	0.46
C3'	0.00	0.21	0.00	0.00	0.24	0.00	0.32	0.00	0.33	0.30	0.29	0.17	0.37	0.35	0.21	0.01	0.00	0.01	0.05	0.23	0.13	0.13
C4	0.00	0.00	0.16	0.24	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.11	0.10	0.11	0.14	0.16	0.37	0.25
C4'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.02	0.00	0.08	0.00	0.05	0.20	0.02	0.08	0.08	0.17	0.08	0.27	0.02	0.00	0.00	0.08	0.01	0.01
C5	0.00	0.00	0.07	0.32	0.00	0.08	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.26	0.05	0.06	0.25	0.33	0.58	0.40
C5'	0.06	0.11	0.19	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.01	0.15	0.06	0.12	0.05	0.14	0.02	0.06	0.19	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01
C6	0.00	0.00	0.14	0.33	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.21	0.04	0.10	0.25	0.35	0.65	0.43
C8	0.01	0.01	0.16	0.30	0.00	0.20	0.01	0.15	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.41	0.13	0.12	0.28	0.35	0.45	0.39
N1	0.00	0.00	0.24	0.29	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.07	0.17	0.19	0.24	0.56	0.35
N3	0.00	0.00	0.29	0.17	0.00	0.08	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.11	0.25	0.20	0.06	0.05	0.30	0.17
N6	0.01	0.00	0.09	0.37	0.00	0.08	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.29	0.13	0.08	0.31	0.46	0.78	0.52
N7	0.01	0.01	0.08	0.35	0.00	0.17	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.41	0.18	0.06	0.34	0.45	0.66	0.50
N9	0.00	0.01	0.01	0.21	0.00	0.08	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.20	0.07	0.00	0.12	0.14	0.26	0.21
O2'	0.01	0.08	0.00	0.01	0.11	0.27	0.26	0.06	0.21	0.41	0.06	0.11	0.29	0.41	0.20	0.00	0.01	0.19	0.33	0.38	0.70	0.44
O3'	0.30	0.20	0.02	0.00	0.10	0.02	0.05	0.19	0.04	0.13	0.07	0.25	0.13	0.18	0.07	0.01	0.00	0.21	0.16	0.07	0.11	0.11
O4'	0.00	0.21	0.02	0.01	0.11	0.00	0.06	0.00	0.10	0.12	0.17	0.20	0.08	0.06	0.00	0.19	0.21	0.00	0.08	0.08	0.16	0.15
O5'	0.07	0.11	0.40	0.05	0.14	0.00	0.25	0.01	0.25	0.28	0.19	0.06	0.31	0.34	0.12	0.33	0.16	0.08	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.08	0.12	0.46	0.23	0.16	0.08	0.33	0.00	0.35	0.35	0.24	0.05	0.46	0.45	0.14	0.38	0.07	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.04	0.41	0.55	0.13	0.37	0.01	0.58	0.00	0.65	0.45	0.56	0.30	0.78	0.66	0.26	0.70	0.11	0.16	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.02	0.24	0.46	0.13	0.25	0.01	0.40	0.01	0.43	0.39	0.35	0.17	0.52	0.50	0.21	0.44	0.11	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.44	0.23	1.21	0.92	0.52	0.47	0.21	0.30	0.06	0.09	0.56	0.78	0.22	1.53	0.72	0.10	0.13	0.24	0.12	0.01
C2	0.59	0.14	1.26	0.91	0.57	0.48	0.31	0.24	0.00	0.14	0.55	0.82	0.03	1.75	0.69	0.17	0.03	0.02	0.15	0.20
C2'	0.71	0.01	1.42	1.15	0.45	0.75	0.15	0.55	0.19	0.29	0.42	0.79	0.09	1.79	0.96	0.39	0.32	0.39	0.23	0.16
C3'	0.56	0.01	1.24	0.92	0.28	0.53	0.03	0.37	0.21	0.26	0.28	0.52	0.05	1.53	0.65	0.23	0.19	0.24	0.20	0.07
C4	0.48	0.17	1.16	0.87	0.55	0.44	0.27	0.23	0.01	0.11	0.55	0.83	0.07	1.47	0.64	0.12	0.10	0.16	0.04	0.04
C4'	0.14	0.39	0.85	0.55	0.54	0.15	0.27	0.04	0.08	0.11	0.61	0.72	0.44	1.06	0.28	0.17	0.06	0.07	0.02	0.13
C5	0.45	0.10	1.00	0.77	0.57	0.39	0.32	0.17	0.03	0.11	0.51	0.86	0.08	1.18	0.52	0.12	0.14	0.18	0.07	0.01
C5'	0.00	0.46	0.66	0.40	0.56	0.03	0.31	0.06	0.16	0.20	0.65	0.72	0.52	0.76	0.10	0.26	0.06	0.09	0.05	0.11
C6	0.49	0.02	0.94	0.72	0.62	0.36	0.39	0.12	0.08	0.12	0.50	0.91	0.29	1.11	0.46	0.14	0.10	0.10	0.02	0.07
C8	0.39	0.15	1.00	0.79	0.52	0.39	0.26	0.20	0.00	0.08	0.50	0.80	0.06	1.13	0.54	0.09	0.20	0.29	0.18	0.08
N1	0.58	0.05	1.09	0.80	0.62	0.42	0.39	0.15	0.07	0.15	0.53	0.87	0.27	1.42	0.55	0.17	0.00	0.01	0.14	0.18
N3	0.54	0.19	1.28	0.94	0.55	0.49	0.26	0.27	0.03	0.12	0.56	0.81	0.10	1.74	0.73	0.14	0.02	0.07	0.06	0.13
N6	0.42	0.11	0.71	0.58	0.64	0.29	0.47	0.04	0.16	0.12	0.40	0.98	0.51	0.75	0.32	0.14	0.13	0.10	0.01	0.05
N7	0.39	0.09	0.90	0.72	0.53	0.35	0.30	0.15	0.04	0.09	0.46	0.83	0.06	0.98	0.47	0.10	0.20	0.26	0.16	0.07
N9	0.44	0.19	1.13	0.87	0.53	0.43	0.25	0.25	0.03	0.09	0.55	0.80	0.14	1.39	0.64	0.10	0.14	0.23	0.11	0.02
O2'	0.66	0.19	1.46	1.21	0.74	0.75	0.39	0.51	0.02	0.15	0.68	1.14	0.05	1.96	1.13	0.32	0.17	0.24	0.00	0.03
O3'	0.16	0.34	0.85	0.48	0.59	0.08	0.38	0.08	0.16	0.12	0.59	0.80	0.30	1.22	0.21	0.21	0.34	0.33	0.31	0.48
O4'	0.06	0.50	0.81	0.54	0.62	0.10	0.34	0.01	0.14	0.19	0.73	0.81	0.58	1.02	0.29	0.25	0.09	0.07	0.01	0.15
O5'	0.35	0.08	0.95	0.72	0.24	0.36	0.02	0.25	0.15	0.14	0.29	0.43	0.10	1.01	0.41	0.09	0.28	0.40	0.38	0.21
OP1	0.35	0.02	0.91	0.69	0.03	0.35	0.17	0.27	0.27	0.22	0.12	0.16	0.05	0.88	0.34	0.10	0.37	0.52	0.56	0.35
OP2	0.85	0.53	1.34	1.16	0.36	0.83	0.53	0.71	0.68	0.69	0.35	0.18	0.54	1.27	0.81	0.60	0.84	0.94	0.97	0.78
P	0.51	0.16	1.07	0.87	0.05	0.53	0.25	0.43	0.39	0.36	0.01	0.11	0.11	1.02	0.54	0.27	0.55	0.69	0.70	0.51

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.30	0.00	0.18	0.22	0.01	0.12
C2	0.00	0.00	0.04	0.10	0.00	0.00	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.18	0.28	0.05	0.28	0.31	0.30	0.25
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.04	0.01	0.09	0.21	0.10	0.02	0.01	0.04	0.09	0.00	0.03	0.02	0.17	0.26	0.16	0.08
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.26	0.00	0.33	0.01	0.31	0.16	0.17	0.28	0.02	0.00	0.00	0.01	0.36	0.47	0.11	0.32
C4	0.01	0.00	0.04	0.26	0.00	0.08	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.37	0.01	0.01	0.53	0.59	0.63	0.51
C4'	0.00	0.00	0.01	0.00	0.08	0.00	0.13	0.00	0.13	0.05	0.03	0.08	0.06	0.25	0.01	0.00	0.01	0.11	0.21	0.01
C5	0.01	0.00	0.09	0.33	0.00	0.13	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.40	0.18	0.03	0.66	0.73	0.68	0.63
C5'	0.08	0.05	0.21	0.01	0.01	0.00	0.04	0.00	0.03	0.03	0.02	0.02	0.08	0.03	0.20	0.01	0.01	0.17	0.40	0.01
C6	0.01	0.00	0.10	0.31	0.01	0.13	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.34	0.15	0.04	0.62	0.64	0.47	0.53
N1	0.00	0.01	0.02	0.16	0.01	0.05	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.20	0.12	0.00	0.37	0.39	0.26	0.30
N3	0.01	0.00	0.01	0.17	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.27	0.18	0.04	0.38	0.42	0.46	0.36
N4	0.01	0.00	0.04	0.28	0.00	0.08	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.40	0.05	0.01	0.56	0.65	0.73	0.57
O2	0.00	0.00	0.09	0.02	0.00	0.06	0.00	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.49	0.08	0.12	0.14	0.17	0.10
O2'	0.01	0.18	0.00	0.00	0.37	0.25	0.40	0.03	0.34	0.20	0.27	0.40	0.03	0.00	0.01	0.17	0.29	0.41	0.13	0.19
O3'	0.30	0.28	0.03	0.00	0.01	0.01	0.18	0.20	0.15	0.12	0.18	0.05	0.49	0.01	0.00	0.21	0.38	0.72	0.28	0.47
O4'	0.00	0.05	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.04	0.00	0.04	0.01	0.08	0.17	0.21	0.00	0.02	0.08	0.11	0.00
O5'	0.18	0.28	0.17	0.36	0.53	0.01	0.66	0.01	0.62	0.37	0.38	0.56	0.12	0.29	0.38	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.22	0.31	0.26	0.47	0.59	0.11	0.73	0.17	0.64	0.39	0.42	0.65	0.14	0.41	0.72	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.01	0.30	0.16	0.11	0.63	0.21	0.68	0.40	0.47	0.26	0.46	0.73	0.17	0.13	0.28	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.12	0.25	0.08	0.32	0.51	0.01	0.63	0.01	0.53	0.30	0.36	0.57	0.10	0.19	0.47	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00