Doublet Group distance statistics: 50724

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.000, 0.013, 0.027, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.013 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.000, 0.019, 0.039, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.019 std_dev=0.019
C4	A	0, 0.000, 0.022, 0.044, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.022 std_dev=0.022
C5	A	0, 0.000, 0.024, 0.048, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.024 std_dev=0.024
C1'	A	0, 0.000, 0.029, 0.058, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.029 std_dev=0.029
N3	A	0, 0.000, 0.031, 0.063, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.031 std_dev=0.031
N9	A	0, 0.000, 0.032, 0.063, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.032 std_dev=0.032
C2	A	0, 0.000, 0.033, 0.066, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.033 std_dev=0.033
C8	A	0, 0.000, 0.038, 0.076, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.038 std_dev=0.038
N7	A	0, 0.000, 0.040, 0.081, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.040 std_dev=0.040
N6	A	0, 0.000, 0.041, 0.081, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.041 std_dev=0.041
O4'	A	0, 0.000, 0.079, 0.158, 0.158 max_d=0.158 avg_d=0.079 std_dev=0.079
N1	B	0, 0.000, 0.119, 0.238, 0.238 max_d=0.238 avg_d=0.119 std_dev=0.119
C2'	A	0, 0.000, 0.165, 0.330, 0.330 max_d=0.330 avg_d=0.165 std_dev=0.165
C4	B	0, 0.000, 0.173, 0.347, 0.347 max_d=0.347 avg_d=0.173 std_dev=0.173
C5	B	0, 0.000, 0.182, 0.364, 0.364 max_d=0.364 avg_d=0.182 std_dev=0.182
N9	B	0, 0.000, 0.232, 0.463, 0.463 max_d=0.463 avg_d=0.232 std_dev=0.232
C6	B	0, 0.000, 0.247, 0.493, 0.493 max_d=0.493 avg_d=0.247 std_dev=0.247
C8	B	0, 0.000, 0.262, 0.523, 0.523 max_d=0.523 avg_d=0.262 std_dev=0.262
C2	B	0, 0.000, 0.320, 0.640, 0.640 max_d=0.640 avg_d=0.320 std_dev=0.320
N7	B	0, 0.000, 0.387, 0.774, 0.774 max_d=0.774 avg_d=0.387 std_dev=0.387
C4'	A	0, 0.000, 0.395, 0.791, 0.791 max_d=0.791 avg_d=0.395 std_dev=0.395
N3	B	0, 0.000, 0.407, 0.813, 0.813 max_d=0.813 avg_d=0.407 std_dev=0.407
C2'	B	0, 0.000, 0.444, 0.889, 0.889 max_d=0.889 avg_d=0.444 std_dev=0.444
C3'	A	0, 0.000, 0.446, 0.893, 0.893 max_d=0.893 avg_d=0.446 std_dev=0.446
O2'	A	0, 0.000, 0.480, 0.961, 0.961 max_d=0.961 avg_d=0.480 std_dev=0.480
C1'	B	0, 0.000, 0.516, 1.032, 1.032 max_d=1.032 avg_d=0.516 std_dev=0.516
N6	B	0, 0.000, 0.524, 1.047, 1.047 max_d=1.047 avg_d=0.524 std_dev=0.524
C5'	A	0, 0.000, 0.617, 1.233, 1.233 max_d=1.233 avg_d=0.617 std_dev=0.617
O2'	B	0, 0.000, 0.691, 1.382, 1.382 max_d=1.382 avg_d=0.691 std_dev=0.691
O3'	A	0, 0.000, 0.745, 1.489, 1.489 max_d=1.489 avg_d=0.745 std_dev=0.745
C3'	B	0, 0.000, 0.834, 1.668, 1.668 max_d=1.668 avg_d=0.834 std_dev=0.834
O4'	B	0, 0.000, 0.857, 1.715, 1.715 max_d=1.715 avg_d=0.857 std_dev=0.857
O3'	B	0, 0.000, 1.026, 2.051, 2.051 max_d=2.051 avg_d=1.026 std_dev=1.026
C4'	B	0, 0.000, 1.118, 2.236, 2.236 max_d=2.236 avg_d=1.118 std_dev=1.118
C5'	B	0, 0.000, 1.447, 2.895, 2.895 max_d=2.895 avg_d=1.447 std_dev=1.447
O5'	A	0, 0.000, 1.840, 3.680, 3.680 max_d=3.680 avg_d=1.840 std_dev=1.840
O5'	B	0, 0.000, 2.198, 4.396, 4.396 max_d=4.396 avg_d=2.198 std_dev=2.198
OP2	B	0, 0.000, 2.436, 4.872, 4.872 max_d=4.872 avg_d=2.436 std_dev=2.436
P	A	0, 0.000, 2.526, 5.053, 5.053 max_d=5.053 avg_d=2.526 std_dev=2.526
OP2	A	0, 0.000, 2.613, 5.225, 5.225 max_d=5.225 avg_d=2.613 std_dev=2.613
P	B	0, 0.000, 2.756, 5.512, 5.512 max_d=5.512 avg_d=2.756 std_dev=2.756
OP1	A	0, 0.000, 2.929, 5.858, 5.858 max_d=5.858 avg_d=2.929 std_dev=2.929
OP1	B	0, 0.000, 3.605, 7.211, 7.211 max_d=7.211 avg_d=3.605 std_dev=3.605

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.04	0.01	0.03	0.00	0.01	0.03	0.00	0.26	0.17	0.07	0.12
C2	0.04	0.00	0.08	0.04	0.01	0.02	0.00	0.05	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.26	0.02	0.02	0.48	0.35	0.52	0.37
C2'	0.01	0.08	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.08	0.05	0.08	0.02	0.06	0.02	0.00	0.03	0.02	0.13	0.10	0.21	0.19
C3'	0.03	0.04	0.01	0.00	0.12	0.01	0.19	0.00	0.17	0.25	0.10	0.02	0.22	0.26	0.14	0.02	0.01	0.01	0.09	0.14	0.36	0.31
C4	0.01	0.01	0.01	0.12	0.00	0.05	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.12	0.12	0.01	0.59	0.50	0.56	0.49
C4'	0.00	0.02	0.02	0.01	0.05	0.00	0.12	0.00	0.10	0.18	0.04	0.04	0.14	0.19	0.07	0.08	0.01	0.00	0.01	0.02	0.28	0.14
C5	0.01	0.00	0.02	0.19	0.00	0.12	0.00	0.21	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.22	0.03	0.82	0.79	0.88	0.78
C5'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.11	0.00	0.21	0.00	0.20	0.26	0.13	0.02	0.26	0.29	0.12	0.07	0.01	0.01	0.00	0.22	0.30	0.00
C6	0.00	0.01	0.00	0.17	0.00	0.10	0.00	0.20	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.14	0.20	0.03	0.82	0.80	0.94	0.79
C8	0.03	0.00	0.08	0.25	0.00	0.18	0.01	0.26	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.05	0.28	0.05	0.90	0.87	0.82	0.84
N1	0.02	0.00	0.05	0.10	0.00	0.04	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.22	0.11	0.00	0.66	0.58	0.76	0.59
N3	0.04	0.00	0.08	0.02	0.00	0.04	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.24	0.00	0.03	0.39	0.26	0.37	0.26
N6	0.01	0.01	0.02	0.22	0.01	0.14	0.01	0.26	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.11	0.26	0.05	0.96	1.00	1.15	0.98
N7	0.03	0.00	0.06	0.26	0.00	0.19	0.00	0.29	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.31	0.06	1.00	1.02	1.07	1.00
N9	0.00	0.01	0.02	0.14	0.00	0.07	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.15	0.01	0.58	0.49	0.45	0.46
O2'	0.01	0.26	0.00	0.02	0.12	0.08	0.08	0.07	0.14	0.05	0.22	0.24	0.11	0.01	0.02	0.00	0.01	0.09	0.03	0.24	0.30	0.31
O3'	0.03	0.02	0.03	0.01	0.12	0.01	0.22	0.01	0.20	0.28	0.11	0.00	0.26	0.31	0.15	0.01	0.00	0.02	0.15	0.49	0.62	0.66
O4'	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.03	0.05	0.00	0.03	0.05	0.06	0.01	0.09	0.02	0.00	0.21	0.25	0.02	0.17
O5'	0.26	0.48	0.13	0.09	0.59	0.01	0.82	0.00	0.82	0.90	0.66	0.39	0.96	1.00	0.58	0.03	0.15	0.21	0.00	0.01	0.00	0.00
OP1	0.17	0.35	0.10	0.14	0.50	0.02	0.79	0.22	0.80	0.87	0.58	0.26	1.00	1.02	0.49	0.24	0.49	0.25	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.07	0.52	0.21	0.36	0.56	0.28	0.88	0.30	0.94	0.82	0.76	0.37	1.15	1.07	0.45	0.30	0.62	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.12	0.37	0.19	0.31	0.49	0.14	0.78	0.00	0.79	0.84	0.59	0.26	0.98	1.00	0.46	0.31	0.66	0.17	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.02	0.02	0.10	0.38	0.02	0.35	0.05	0.58	0.03	0.08	0.01	0.00	0.02	0.09	0.04	0.04	0.48	0.14	1.15	1.90	1.45	1.44
C2	0.05	0.02	0.12	0.36	0.05	0.32	0.10	0.52	0.08	0.13	0.01	0.00	0.11	0.15	0.08	0.00	0.43	0.15	1.09	1.66	1.34	1.30
C2'	0.09	0.11	0.01	0.26	0.06	0.21	0.00	0.44	0.00	0.03	0.06	0.11	0.04	0.06	0.04	0.17	0.35	0.01	1.00	1.71	1.31	1.27
C3'	0.01	0.06	0.05	0.33	0.03	0.30	0.11	0.54	0.10	0.15	0.01	0.05	0.17	0.19	0.06	0.12	0.41	0.10	1.12	1.85	1.48	1.41
C4	0.05	0.01	0.13	0.39	0.05	0.36	0.08	0.58	0.05	0.12	0.00	0.01	0.06	0.13	0.08	0.01	0.47	0.17	1.16	1.81	1.45	1.41
C4'	0.03	0.07	0.03	0.32	0.01	0.30	0.04	0.56	0.03	0.08	0.03	0.06	0.06	0.10	0.02	0.13	0.41	0.10	1.15	1.93	1.49	1.46
C5	0.06	0.03	0.13	0.38	0.04	0.36	0.07	0.58	0.04	0.13	0.02	0.01	0.05	0.14	0.08	0.02	0.45	0.17	1.17	1.78	1.47	1.41
C5'	0.05	0.02	0.10	0.41	0.07	0.40	0.13	0.67	0.10	0.18	0.03	0.00	0.14	0.20	0.10	0.06	0.48	0.20	1.28	2.09	1.64	1.62
C6	0.06	0.06	0.12	0.35	0.03	0.34	0.07	0.55	0.03	0.14	0.04	0.03	0.05	0.14	0.07	0.02	0.41	0.16	1.13	1.66	1.41	1.34
C8	0.07	0.01	0.15	0.41	0.05	0.40	0.08	0.63	0.04	0.13	0.00	0.01	0.04	0.13	0.09	0.03	0.50	0.19	1.22	1.90	1.53	1.49
N1	0.05	0.06	0.11	0.34	0.03	0.31	0.08	0.51	0.05	0.14	0.04	0.03	0.09	0.15	0.07	0.01	0.39	0.14	1.09	1.60	1.35	1.28
N3	0.05	0.01	0.13	0.39	0.06	0.35	0.09	0.56	0.07	0.13	0.03	0.02	0.09	0.14	0.08	0.00	0.46	0.16	1.13	1.76	1.39	1.36
N6	0.05	0.08	0.11	0.32	0.01	0.32	0.05	0.52	0.00	0.13	0.07	0.05	0.03	0.14	0.06	0.03	0.37	0.15	1.10	1.58	1.39	1.29
N7	0.07	0.03	0.14	0.40	0.04	0.38	0.07	0.61	0.03	0.13	0.02	0.00	0.03	0.13	0.08	0.03	0.47	0.19	1.20	1.83	1.51	1.46
N9	0.06	0.00	0.14	0.41	0.06	0.38	0.08	0.61	0.05	0.13	0.01	0.02	0.05	0.13	0.08	0.01	0.50	0.18	1.20	1.89	1.49	1.47
O2'	0.34	0.33	0.25	0.02	0.29	0.04	0.23	0.19	0.22	0.21	0.28	0.33	0.17	0.18	0.28	0.42	0.12	0.23	0.74	1.48	1.05	1.02
O3'	0.11	0.14	0.06	0.22	0.04	0.18	0.08	0.43	0.08	0.10	0.03	0.14	0.18	0.16	0.01	0.25	0.28	0.00	1.01	1.72	1.39	1.30
O4'	0.05	0.00	0.13	0.42	0.05	0.40	0.06	0.65	0.03	0.10	0.01	0.02	0.02	0.10	0.07	0.01	0.52	0.18	1.23	2.02	1.54	1.54
O5'	0.40	0.26	0.39	0.72	0.44	0.75	0.56	1.07	0.54	0.64	0.38	0.29	0.65	0.69	0.49	0.19	0.74	0.58	1.71	2.52	2.16	2.09
OP1	0.25	0.05	0.24	0.62	0.29	0.66	0.47	1.04	0.43	0.57	0.21	0.08	0.59	0.65	0.37	0.01	0.65	0.46	1.69	2.58	2.22	2.12
OP2	0.62	0.35	0.62	0.99	0.61	1.05	0.77	1.41	0.70	0.91	0.47	0.41	0.84	0.96	0.71	0.40	1.03	0.83	2.05	2.88	2.55	2.45
P	0.34	0.13	0.35	0.73	0.36	0.77	0.52	1.14	0.48	0.64	0.26	0.17	0.62	0.70	0.44	0.12	0.77	0.55	1.77	2.65	2.28	2.19

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.00	0.02	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.21	0.30	0.00	0.13
C2	0.03	0.00	0.12	0.30	0.00	0.18	0.01	0.29	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.36	0.02	0.71	1.09	0.73	0.77
C2'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.07	0.00	0.02	0.01	0.04	0.06	0.08	0.14	0.03	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.21	0.43	0.02	0.20
C3'	0.00	0.30	0.00	0.00	0.17	0.00	0.09	0.00	0.16	0.11	0.25	0.29	0.13	0.05	0.03	0.01	0.01	0.00	0.22	0.50	0.03	0.23
C4	0.01	0.00	0.07	0.17	0.00	0.11	0.00	0.19	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.17	0.02	0.61	0.80	0.49	0.57
C4'	0.00	0.18	0.00	0.00	0.11	0.00	0.09	0.00	0.14	0.04	0.17	0.16	0.14	0.01	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.19	0.22	0.00
C5	0.00	0.01	0.02	0.09	0.00	0.09	0.00	0.18	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.09	0.03	0.69	0.86	0.63	0.67
C5'	0.03	0.29	0.01	0.00	0.19	0.00	0.18	0.00	0.25	0.02	0.30	0.25	0.25	0.06	0.07	0.02	0.03	0.01	0.00	0.16	0.31	0.00
C6	0.00	0.00	0.04	0.16	0.00	0.14	0.01	0.25	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.17	0.04	0.78	1.06	0.82	0.82
C8	0.02	0.01	0.06	0.11	0.01	0.04	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.12	0.00	0.45	0.39	0.18	0.30
N1	0.02	0.00	0.08	0.25	0.00	0.17	0.01	0.30	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.29	0.03	0.79	1.16	0.85	0.86
N3	0.03	0.00	0.14	0.29	0.00	0.16	0.01	0.25	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.33	0.01	0.60	0.92	0.55	0.62
N6	0.02	0.00	0.03	0.13	0.01	0.14	0.02	0.25	0.01	0.04	0.00	0.00	0.00	0.04	0.03	0.01	0.14	0.06	0.83	1.11	0.92	0.89
N7	0.01	0.01	0.05	0.05	0.00	0.01	0.01	0.06	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.00	0.00	0.02	0.07	0.02	0.60	0.62	0.47	0.53
N9	0.00	0.00	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.45	0.51	0.22	0.34
O2'	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.05	0.06	0.28	0.06	0.07
O3'	0.00	0.36	0.00	0.01	0.17	0.01	0.09	0.03	0.17	0.12	0.29	0.33	0.14	0.07	0.02	0.00	0.00	0.00	0.11	0.50	0.08	0.20
O4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.04	0.00	0.03	0.01	0.06	0.02	0.01	0.05	0.00	0.00	0.05	0.10	0.19	0.05
O5'	0.21	0.71	0.21	0.22	0.61	0.01	0.69	0.00	0.78	0.45	0.79	0.60	0.83	0.60	0.45	0.06	0.11	0.05	0.00	0.00	0.01	0.00
OP1	0.30	1.09	0.43	0.50	0.80	0.19	0.86	0.16	1.06	0.39	1.16	0.92	1.11	0.62	0.51	0.28	0.50	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00
OP2	0.00	0.73	0.02	0.03	0.49	0.22	0.63	0.31	0.82	0.18	0.85	0.55	0.92	0.47	0.22	0.06	0.08	0.19	0.01	0.00	0.00	0.01
P	0.13	0.77	0.20	0.23	0.57	0.00	0.67	0.00	0.82	0.30	0.86	0.62	0.89	0.53	0.34	0.07	0.20	0.05	0.00	0.00	0.01	0.00