Doublet Group distance statistics: 50725

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.000, 0.005, 0.010, 0.010 max_d=0.010 avg_d=0.005 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.000, 0.018, 0.035, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.018 std_dev=0.018
C4	A	0, 0.000, 0.019, 0.038, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.019 std_dev=0.019
N7	A	0, 0.000, 0.019, 0.038, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.019 std_dev=0.019
C8	A	0, 0.000, 0.019, 0.039, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.019 std_dev=0.019
N6	A	0, 0.000, 0.024, 0.048, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.024 std_dev=0.024
N9	A	0, 0.000, 0.025, 0.050, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.025 std_dev=0.025
N3	A	0, 0.000, 0.025, 0.050, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.025 std_dev=0.025
N1	A	0, 0.000, 0.030, 0.060, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.030 std_dev=0.030
C2	A	0, 0.000, 0.030, 0.060, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.030 std_dev=0.030
C1'	A	0, 0.000, 0.032, 0.064, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.032 std_dev=0.032
C2'	A	0, 0.000, 0.257, 0.514, 0.514 max_d=0.514 avg_d=0.257 std_dev=0.257
O2'	A	0, 0.000, 0.291, 0.581, 0.581 max_d=0.581 avg_d=0.291 std_dev=0.291
O4'	A	0, 0.000, 0.320, 0.641, 0.641 max_d=0.641 avg_d=0.320 std_dev=0.320
C6	B	0, 0.000, 0.388, 0.776, 0.776 max_d=0.776 avg_d=0.388 std_dev=0.388
C4	B	0, 0.000, 0.392, 0.784, 0.784 max_d=0.784 avg_d=0.392 std_dev=0.392
N1	B	0, 0.000, 0.401, 0.801, 0.801 max_d=0.801 avg_d=0.401 std_dev=0.401
C1'	B	0, 0.000, 0.403, 0.805, 0.805 max_d=0.805 avg_d=0.403 std_dev=0.403
N6	B	0, 0.000, 0.410, 0.820, 0.820 max_d=0.820 avg_d=0.410 std_dev=0.410
O4'	B	0, 0.000, 0.417, 0.833, 0.833 max_d=0.833 avg_d=0.417 std_dev=0.417
C5	B	0, 0.000, 0.418, 0.836, 0.836 max_d=0.836 avg_d=0.418 std_dev=0.418
N3	B	0, 0.000, 0.424, 0.848, 0.848 max_d=0.848 avg_d=0.424 std_dev=0.424
N9	B	0, 0.000, 0.429, 0.858, 0.858 max_d=0.858 avg_d=0.429 std_dev=0.429
C3'	A	0, 0.000, 0.430, 0.861, 0.861 max_d=0.861 avg_d=0.430 std_dev=0.430
C4'	A	0, 0.000, 0.440, 0.879, 0.879 max_d=0.879 avg_d=0.440 std_dev=0.440
C2	B	0, 0.000, 0.449, 0.898, 0.898 max_d=0.898 avg_d=0.449 std_dev=0.449
C8	B	0, 0.000, 0.518, 1.035, 1.035 max_d=1.035 avg_d=0.518 std_dev=0.518
N7	B	0, 0.000, 0.524, 1.049, 1.049 max_d=1.049 avg_d=0.524 std_dev=0.524
C2'	B	0, 0.000, 0.542, 1.084, 1.084 max_d=1.084 avg_d=0.542 std_dev=0.542
O2'	B	0, 0.000, 0.574, 1.149, 1.149 max_d=1.149 avg_d=0.574 std_dev=0.574
O3'	A	0, 0.000, 0.607, 1.214, 1.214 max_d=1.214 avg_d=0.607 std_dev=0.607
C4'	B	0, 0.000, 0.650, 1.301, 1.301 max_d=1.301 avg_d=0.650 std_dev=0.650
C5'	A	0, 0.000, 0.702, 1.403, 1.403 max_d=1.403 avg_d=0.702 std_dev=0.702
C3'	B	0, 0.000, 0.710, 1.420, 1.420 max_d=1.420 avg_d=0.710 std_dev=0.710
OP2	A	0, 0.000, 0.711, 1.421, 1.421 max_d=1.421 avg_d=0.711 std_dev=0.711
O5'	B	0, 0.000, 0.754, 1.508, 1.508 max_d=1.508 avg_d=0.754 std_dev=0.754
O5'	A	0, 0.000, 0.768, 1.536, 1.536 max_d=1.536 avg_d=0.768 std_dev=0.768
C5'	B	0, 0.000, 0.775, 1.551, 1.551 max_d=1.551 avg_d=0.775 std_dev=0.775
P	B	0, 0.000, 0.868, 1.736, 1.736 max_d=1.736 avg_d=0.868 std_dev=0.868
OP2	B	0, 0.000, 0.897, 1.794, 1.794 max_d=1.794 avg_d=0.897 std_dev=0.897
P	A	0, 0.000, 0.909, 1.819, 1.819 max_d=1.819 avg_d=0.909 std_dev=0.909
O3'	B	0, 0.000, 0.921, 1.843, 1.843 max_d=1.843 avg_d=0.921 std_dev=0.921
OP1	B	0, 0.000, 0.973, 1.946, 1.946 max_d=1.946 avg_d=0.973 std_dev=0.973
OP1	A	0, 0.000, 1.177, 2.354, 2.354 max_d=2.354 avg_d=1.177 std_dev=1.177

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.04	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.06	0.07	0.02	0.03
C2	0.04	0.00	0.08	0.10	0.01	0.03	0.01	0.09	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.10	0.12	0.11	0.07	0.12
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.05	0.02	0.02	0.00	0.04	0.06	0.05	0.09	0.03	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00	0.05	0.08	0.06	0.04
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.08	0.01	0.07	0.01	0.09	0.01	0.09	0.09	0.09	0.04	0.04	0.00	0.01	0.02	0.03	0.04	0.01	0.02
C4	0.02	0.01	0.05	0.08	0.00	0.01	0.00	0.06	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.08	0.05	0.11	0.11	0.06	0.10
C4'	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.03	0.00	0.01	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.05	0.03	0.02
C5	0.01	0.01	0.02	0.07	0.00	0.00	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.09	0.01	0.12	0.11	0.07	0.11
C5'	0.01	0.09	0.00	0.01	0.06	0.01	0.06	0.00	0.07	0.04	0.09	0.08	0.06	0.05	0.05	0.08	0.07	0.01	0.00	0.06	0.01	0.01
C6	0.02	0.01	0.04	0.09	0.01	0.01	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.11	0.04	0.12	0.11	0.08	0.12
C8	0.01	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.02	0.07	0.12	0.11	0.07	0.09
N1	0.04	0.00	0.05	0.09	0.02	0.03	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.11	0.08	0.13	0.12	0.08	0.13
N3	0.04	0.00	0.09	0.09	0.00	0.03	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.08	0.10	0.12	0.11	0.07	0.11
N6	0.01	0.01	0.03	0.09	0.00	0.00	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.12	0.01	0.11	0.09	0.07	0.11
N7	0.01	0.00	0.03	0.04	0.00	0.01	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.06	0.04	0.12	0.10	0.08	0.11
N9	0.00	0.01	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.05	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.01	0.11	0.10	0.05	0.08
O2'	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.09	0.02	0.08	0.02	0.05	0.02	0.02	0.03	0.05	0.01	0.00	0.05	0.04	0.02	0.01	0.02	0.03
O3'	0.02	0.10	0.01	0.01	0.08	0.00	0.09	0.07	0.11	0.02	0.11	0.08	0.12	0.06	0.04	0.05	0.00	0.01	0.13	0.07	0.10	0.12
O4'	0.00	0.10	0.00	0.02	0.05	0.00	0.01	0.01	0.04	0.07	0.08	0.10	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.00	0.02	0.03	0.06	0.03
O5'	0.06	0.12	0.05	0.03	0.11	0.01	0.12	0.00	0.12	0.12	0.13	0.12	0.11	0.12	0.11	0.02	0.13	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01
OP1	0.07	0.11	0.08	0.04	0.11	0.05	0.11	0.06	0.11	0.11	0.12	0.11	0.09	0.10	0.10	0.01	0.07	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00
OP2	0.02	0.07	0.06	0.01	0.06	0.03	0.07	0.01	0.08	0.07	0.08	0.07	0.07	0.08	0.05	0.02	0.10	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00
P	0.03	0.12	0.04	0.02	0.10	0.02	0.11	0.01	0.12	0.09	0.13	0.11	0.11	0.11	0.08	0.03	0.12	0.03	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.08	0.11	0.21	0.29	0.05	0.21	0.00	0.28	0.00	0.02	0.06	0.10	0.04	0.04	0.04	0.15	0.41	0.08	0.15	0.13	0.15	0.13
C2	0.15	0.20	0.28	0.36	0.12	0.26	0.06	0.32	0.05	0.04	0.15	0.18	0.03	0.01	0.11	0.23	0.46	0.14	0.07	0.05	0.07	0.06
C2'	0.23	0.23	0.35	0.43	0.19	0.34	0.14	0.40	0.13	0.13	0.17	0.23	0.08	0.10	0.19	0.29	0.53	0.22	0.01	0.02	0.00	0.02
C3'	0.25	0.25	0.35	0.41	0.21	0.34	0.17	0.40	0.17	0.16	0.21	0.25	0.13	0.14	0.21	0.29	0.51	0.24	0.01	0.01	0.00	0.03
C4	0.15	0.18	0.27	0.36	0.12	0.27	0.07	0.33	0.07	0.05	0.14	0.17	0.02	0.02	0.11	0.22	0.47	0.13	0.08	0.06	0.08	0.06
C4'	0.08	0.12	0.18	0.25	0.06	0.18	0.01	0.24	0.01	0.02	0.07	0.11	0.02	0.04	0.04	0.13	0.35	0.07	0.19	0.20	0.20	0.18
C5	0.18	0.21	0.30	0.39	0.16	0.30	0.12	0.37	0.13	0.09	0.18	0.19	0.09	0.08	0.15	0.25	0.50	0.16	0.04	0.01	0.03	0.02
C5'	0.04	0.09	0.13	0.19	0.02	0.13	0.03	0.18	0.02	0.07	0.05	0.07	0.06	0.09	0.00	0.08	0.29	0.02	0.27	0.29	0.29	0.26
C6	0.19	0.22	0.32	0.41	0.18	0.31	0.15	0.38	0.16	0.12	0.21	0.21	0.12	0.10	0.17	0.26	0.51	0.17	0.01	0.02	0.00	0.01
C8	0.16	0.18	0.29	0.38	0.14	0.29	0.10	0.36	0.11	0.08	0.15	0.17	0.07	0.06	0.13	0.23	0.50	0.15	0.06	0.03	0.05	0.04
N1	0.19	0.23	0.31	0.40	0.17	0.30	0.12	0.37	0.13	0.10	0.21	0.21	0.06	0.07	0.16	0.26	0.50	0.17	0.02	0.01	0.01	0.00
N3	0.14	0.18	0.26	0.34	0.10	0.25	0.04	0.31	0.03	0.02	0.11	0.16	0.03	0.01	0.09	0.21	0.46	0.13	0.10	0.08	0.09	0.08
N6	0.20	0.22	0.32	0.42	0.20	0.32	0.18	0.40	0.20	0.15	0.22	0.21	0.18	0.14	0.19	0.27	0.52	0.18	0.02	0.07	0.04	0.04
N7	0.18	0.20	0.30	0.40	0.16	0.30	0.13	0.38	0.14	0.11	0.18	0.19	0.11	0.09	0.15	0.25	0.52	0.16	0.03	0.00	0.02	0.01
N9	0.14	0.16	0.26	0.35	0.11	0.26	0.06	0.33	0.06	0.04	0.12	0.16	0.02	0.02	0.10	0.21	0.47	0.13	0.09	0.07	0.09	0.07
O2'	0.13	0.11	0.26	0.34	0.08	0.25	0.02	0.31	0.01	0.02	0.05	0.12	0.03	0.01	0.08	0.20	0.46	0.12	0.08	0.06	0.08	0.06
O3'	0.26	0.24	0.33	0.39	0.22	0.33	0.18	0.39	0.17	0.18	0.20	0.25	0.14	0.15	0.22	0.27	0.47	0.25	0.02	0.02	0.02	0.04
O4'	0.01	0.04	0.10	0.18	0.03	0.11	0.07	0.18	0.06	0.10	0.00	0.03	0.09	0.12	0.05	0.05	0.29	0.01	0.27	0.27	0.27	0.25
O5'	0.03	0.08	0.12	0.18	0.01	0.11	0.03	0.17	0.02	0.07	0.04	0.07	0.06	0.09	0.00	0.08	0.28	0.01	0.26	0.27	0.28	0.25
OP1	0.04	0.09	0.12	0.17	0.03	0.11	0.02	0.17	0.00	0.05	0.06	0.08	0.03	0.07	0.01	0.07	0.26	0.02	0.27	0.30	0.29	0.27
OP2	0.11	0.15	0.20	0.27	0.09	0.20	0.06	0.26	0.07	0.03	0.12	0.13	0.04	0.02	0.08	0.16	0.37	0.09	0.16	0.16	0.17	0.15
P	0.03	0.09	0.12	0.18	0.01	0.11	0.03	0.17	0.01	0.07	0.05	0.07	0.05	0.09	0.01	0.08	0.28	0.01	0.28	0.30	0.30	0.27

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.03	0.02	0.00	0.03	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.02	0.03	0.09	0.04
C2	0.03	0.00	0.17	0.26	0.01	0.15	0.00	0.21	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.07	0.33	0.03	0.04	0.02	0.05	0.01
C2'	0.00	0.17	0.00	0.01	0.11	0.00	0.08	0.03	0.11	0.01	0.15	0.16	0.10	0.03	0.02	0.00	0.02	0.01	0.12	0.10	0.00	0.07
C3'	0.01	0.26	0.01	0.00	0.18	0.01	0.16	0.02	0.20	0.02	0.25	0.22	0.19	0.08	0.06	0.03	0.02	0.01	0.22	0.18	0.02	0.15
C4	0.02	0.01	0.11	0.18	0.00	0.11	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.04	0.21	0.02	0.04	0.01	0.05	0.01
C4'	0.00	0.15	0.00	0.01	0.11	0.00	0.11	0.01	0.13	0.04	0.15	0.12	0.13	0.08	0.05	0.05	0.02	0.00	0.02	0.04	0.14	0.04
C5	0.02	0.00	0.08	0.16	0.00	0.11	0.00	0.18	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.20	0.02	0.08	0.02	0.01	0.02
C5'	0.03	0.21	0.03	0.02	0.17	0.01	0.18	0.00	0.21	0.10	0.23	0.18	0.21	0.15	0.10	0.06	0.02	0.01	0.01	0.02	0.21	0.02
C6	0.02	0.00	0.11	0.20	0.01	0.13	0.00	0.21	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.05	0.27	0.02	0.08	0.02	0.00	0.03
C8	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.04	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.02	0.07	0.01	0.04	0.01
N1	0.03	0.00	0.15	0.25	0.01	0.15	0.01	0.23	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.07	0.33	0.03	0.06	0.00	0.03	0.01
N3	0.02	0.00	0.16	0.22	0.00	0.12	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.06	0.28	0.02	0.03	0.02	0.06	0.02
N6	0.02	0.01	0.10	0.19	0.01	0.13	0.00	0.21	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.26	0.02	0.11	0.05	0.04	0.06
N7	0.01	0.00	0.03	0.08	0.00	0.08	0.00	0.15	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.12	0.02	0.10	0.03	0.00	0.04
N9	0.00	0.01	0.02	0.06	0.01	0.05	0.01	0.10	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.01	0.04	0.01	0.07	0.02
O2'	0.02	0.07	0.00	0.03	0.04	0.05	0.04	0.06	0.05	0.01	0.07	0.06	0.05	0.02	0.01	0.00	0.02	0.06	0.03	0.03	0.10	0.05
O3'	0.02	0.33	0.02	0.02	0.21	0.02	0.20	0.02	0.27	0.04	0.33	0.28	0.26	0.12	0.08	0.02	0.00	0.02	0.23	0.23	0.03	0.18
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.02	0.01	0.06	0.02	0.00	0.15	0.13	0.18	0.13
O5'	0.02	0.04	0.12	0.22	0.04	0.02	0.08	0.01	0.08	0.07	0.06	0.03	0.11	0.10	0.04	0.03	0.23	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01
OP1	0.03	0.02	0.10	0.18	0.01	0.04	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.05	0.03	0.01	0.03	0.23	0.13	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.09	0.05	0.00	0.02	0.05	0.14	0.01	0.21	0.00	0.04	0.03	0.06	0.04	0.00	0.07	0.10	0.03	0.18	0.00	0.01	0.00	0.01
P	0.04	0.01	0.07	0.15	0.01	0.04	0.02	0.02	0.03	0.01	0.01	0.02	0.06	0.04	0.02	0.05	0.18	0.13	0.01	0.00	0.01	0.00