Doublet Group distance statistics: 50730

back

Distances from reference structure (by RMSD)

3, 1, 8, 13, 20, 23, 12, 8, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.003, 0.012, 0.022, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.012 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.004, 0.018, 0.032, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.018 std_dev=0.014
C2	A	0, 0.010, 0.024, 0.039, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.024 std_dev=0.014
C6	A	0, 0.008, 0.023, 0.038, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.023 std_dev=0.015
C4	A	0, 0.008, 0.024, 0.039, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.024 std_dev=0.015
N3	A	0, -0.003, 0.014, 0.030, 0.129 max_d=0.129 avg_d=0.014 std_dev=0.016
C1'	A	0, 0.008, 0.026, 0.044, 0.101 max_d=0.101 avg_d=0.026 std_dev=0.018
O2	A	0, 0.028, 0.066, 0.104, 0.172 max_d=0.172 avg_d=0.066 std_dev=0.038
O4'	A	0, 0.074, 0.155, 0.236, 0.395 max_d=0.395 avg_d=0.155 std_dev=0.081
O4	A	0, 0.046, 0.130, 0.213, 0.455 max_d=0.455 avg_d=0.130 std_dev=0.083
C2'	A	0, 0.116, 0.209, 0.302, 0.465 max_d=0.465 avg_d=0.209 std_dev=0.093
C4'	A	0, 0.118, 0.242, 0.366, 0.789 max_d=0.789 avg_d=0.242 std_dev=0.124
C5	B	0, 0.203, 0.348, 0.492, 0.895 max_d=0.895 avg_d=0.348 std_dev=0.144
O2'	A	0, 0.166, 0.319, 0.472, 1.240 max_d=1.240 avg_d=0.319 std_dev=0.153
C6	B	0, 0.155, 0.313, 0.472, 1.064 max_d=1.064 avg_d=0.313 std_dev=0.159
C4	B	0, 0.268, 0.427, 0.586, 0.707 max_d=0.707 avg_d=0.427 std_dev=0.159
N1	B	0, 0.173, 0.335, 0.498, 1.105 max_d=1.105 avg_d=0.335 std_dev=0.163
C2	B	0, 0.221, 0.383, 0.546, 0.848 max_d=0.848 avg_d=0.383 std_dev=0.163
N3	B	0, 0.278, 0.450, 0.622, 0.789 max_d=0.789 avg_d=0.450 std_dev=0.172
N7	B	0, 0.228, 0.401, 0.575, 1.092 max_d=1.092 avg_d=0.401 std_dev=0.174
C3'	A	0, 0.126, 0.313, 0.500, 1.553 max_d=1.553 avg_d=0.313 std_dev=0.187
C5'	A	0, 0.243, 0.435, 0.627, 1.051 max_d=1.051 avg_d=0.435 std_dev=0.192
N6	B	0, 0.175, 0.373, 0.571, 1.374 max_d=1.374 avg_d=0.373 std_dev=0.198
N9	B	0, 0.326, 0.532, 0.739, 0.968 max_d=0.968 avg_d=0.532 std_dev=0.207
C8	B	0, 0.280, 0.495, 0.710, 1.149 max_d=1.149 avg_d=0.495 std_dev=0.215
O5'	A	0, 0.293, 0.536, 0.778, 1.690 max_d=1.690 avg_d=0.536 std_dev=0.242
C1'	B	0, 0.430, 0.706, 0.981, 1.279 max_d=1.279 avg_d=0.706 std_dev=0.276
P	A	0, 0.328, 0.610, 0.892, 1.854 max_d=1.854 avg_d=0.610 std_dev=0.282
O3'	A	0, 0.151, 0.488, 0.826, 3.079 max_d=3.079 avg_d=0.488 std_dev=0.338
C3'	B	0, 0.545, 0.903, 1.261, 2.057 max_d=2.057 avg_d=0.903 std_dev=0.358
O4'	B	0, 0.460, 0.833, 1.205, 2.440 max_d=2.440 avg_d=0.833 std_dev=0.373
C4'	B	0, 0.537, 0.923, 1.309, 2.340 max_d=2.340 avg_d=0.923 std_dev=0.386
C2'	B	0, 0.364, 0.769, 1.174, 2.967 max_d=2.967 avg_d=0.769 std_dev=0.405
OP1	A	0, 0.245, 0.688, 1.131, 2.647 max_d=2.647 avg_d=0.688 std_dev=0.443
OP2	A	0, 0.242, 0.738, 1.234, 3.335 max_d=3.335 avg_d=0.738 std_dev=0.496
O3'	B	0, 0.623, 1.124, 1.625, 3.383 max_d=3.383 avg_d=1.124 std_dev=0.501
C5'	B	0, 0.270, 0.953, 1.636, 5.014 max_d=5.014 avg_d=0.953 std_dev=0.683
O2'	B	0, 0.160, 0.965, 1.769, 5.250 max_d=5.250 avg_d=0.965 std_dev=0.804
O5'	B	0, -0.017, 0.818, 1.653, 6.000 max_d=6.000 avg_d=0.818 std_dev=0.835
P	B	0, -0.446, 0.818, 2.083, 9.033 max_d=9.033 avg_d=0.818 std_dev=1.265
OP1	B	0, -0.482, 0.897, 2.276, 9.517 max_d=9.517 avg_d=0.897 std_dev=1.379
OP2	B	0, -0.378, 1.075, 2.528, 10.463 max_d=10.463 avg_d=1.075 std_dev=1.453

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.02	0.05	0.02	0.07	0.03	0.01	0.08	0.23	0.15	0.12
C2	0.03	0.00	0.06	0.06	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.08	0.02	0.03	0.11	0.36	0.23	0.17
C2'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.04	0.01	0.05	0.05	0.05	0.02	0.05	0.10	0.00	0.01	0.06	0.01	0.10	0.19	0.10	0.13
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.10	0.01	0.12	0.02	0.11	0.06	0.08	0.09	0.02	0.01	0.11	0.01	0.04	0.08	0.06	0.04
C4	0.03	0.01	0.04	0.10	0.00	0.06	0.01	0.09	0.01	0.02	0.01	0.01	0.10	0.07	0.01	0.04	0.15	0.46	0.36	0.21
C4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.06	0.00	0.07	0.01	0.06	0.03	0.04	0.06	0.08	0.02	0.06	0.00	0.02	0.07	0.13	0.04
C5	0.02	0.01	0.05	0.12	0.01	0.07	0.00	0.10	0.01	0.02	0.02	0.02	0.08	0.10	0.02	0.05	0.16	0.46	0.36	0.21
C5'	0.03	0.06	0.05	0.02	0.09	0.01	0.10	0.00	0.08	0.05	0.07	0.06	0.06	0.06	0.11	0.02	0.01	0.12	0.15	0.02
C6	0.02	0.01	0.05	0.11	0.01	0.06	0.01	0.08	0.00	0.01	0.02	0.02	0.07	0.09	0.02	0.04	0.14	0.39	0.25	0.17
N1	0.01	0.01	0.02	0.06	0.02	0.03	0.02	0.05	0.01	0.00	0.02	0.02	0.05	0.03	0.02	0.01	0.11	0.33	0.20	0.15
N3	0.02	0.01	0.05	0.08	0.01	0.04	0.02	0.07	0.02	0.02	0.00	0.01	0.10	0.06	0.02	0.03	0.13	0.41	0.30	0.19
O2	0.05	0.01	0.10	0.09	0.01	0.06	0.02	0.06	0.02	0.02	0.01	0.00	0.12	0.15	0.02	0.06	0.11	0.33	0.21	0.16
O2'	0.02	0.09	0.00	0.02	0.10	0.08	0.08	0.06	0.07	0.05	0.10	0.12	0.00	0.04	0.11	0.06	0.08	0.15	0.12	0.12
O3'	0.07	0.08	0.01	0.01	0.07	0.02	0.10	0.06	0.09	0.03	0.06	0.15	0.04	0.00	0.09	0.04	0.08	0.20	0.11	0.10
O4	0.03	0.02	0.06	0.11	0.01	0.06	0.02	0.11	0.02	0.02	0.02	0.02	0.11	0.09	0.00	0.05	0.16	0.49	0.41	0.23
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.04	0.00	0.05	0.02	0.04	0.01	0.03	0.06	0.06	0.04	0.05	0.00	0.08	0.18	0.20	0.11
O5'	0.08	0.11	0.10	0.04	0.15	0.02	0.16	0.01	0.14	0.11	0.13	0.11	0.08	0.08	0.16	0.08	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.23	0.36	0.19	0.08	0.46	0.07	0.46	0.12	0.39	0.33	0.41	0.33	0.15	0.20	0.49	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.15	0.23	0.10	0.06	0.36	0.13	0.36	0.15	0.25	0.20	0.30	0.21	0.12	0.11	0.41	0.20	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.12	0.17	0.13	0.04	0.21	0.04	0.21	0.02	0.17	0.15	0.19	0.16	0.12	0.10	0.23	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.14	0.11	0.32	0.24	0.10	0.10	0.12	0.16	0.14	0.18	0.12	0.10	0.19	0.18	0.12	0.52	0.28	0.18	0.49	0.76	0.66	0.73
C2	0.13	0.12	0.23	0.20	0.11	0.14	0.12	0.08	0.14	0.16	0.13	0.11	0.18	0.17	0.13	0.48	0.20	0.22	0.27	0.58	0.40	0.44
C2'	0.13	0.11	0.32	0.27	0.11	0.15	0.14	0.34	0.15	0.17	0.13	0.10	0.19	0.18	0.13	0.42	0.31	0.12	0.65	1.01	0.89	0.95
C3'	0.17	0.13	0.39	0.21	0.13	0.11	0.15	0.37	0.15	0.19	0.14	0.13	0.18	0.18	0.15	0.47	0.22	0.15	0.73	0.96	0.90	0.99
C4	0.17	0.11	0.21	0.20	0.14	0.24	0.13	0.27	0.08	0.19	0.09	0.13	0.11	0.18	0.17	0.51	0.19	0.30	0.13	0.44	0.19	0.14
C4'	0.14	0.10	0.40	0.24	0.09	0.08	0.11	0.28	0.12	0.17	0.11	0.09	0.17	0.17	0.12	0.55	0.30	0.17	0.65	0.78	0.82	0.88
C5	0.20	0.12	0.26	0.21	0.13	0.27	0.12	0.29	0.09	0.21	0.10	0.13	0.11	0.18	0.19	0.61	0.22	0.35	0.14	0.40	0.21	0.17
C5'	0.13	0.12	0.41	0.27	0.09	0.14	0.11	0.25	0.13	0.15	0.13	0.10	0.17	0.15	0.10	0.59	0.35	0.21	0.58	0.60	0.72	0.73
C6	0.18	0.11	0.31	0.22	0.11	0.21	0.11	0.16	0.10	0.21	0.10	0.12	0.14	0.19	0.17	0.62	0.24	0.31	0.21	0.43	0.28	0.32
N1	0.15	0.11	0.29	0.21	0.10	0.14	0.11	0.07	0.12	0.18	0.11	0.10	0.17	0.18	0.14	0.54	0.24	0.24	0.32	0.58	0.43	0.49
N3	0.14	0.12	0.20	0.19	0.12	0.17	0.12	0.15	0.11	0.17	0.12	0.12	0.14	0.17	0.14	0.47	0.18	0.24	0.14	0.48	0.24	0.25
O2	0.13	0.14	0.23	0.20	0.12	0.13	0.14	0.13	0.17	0.16	0.17	0.12	0.23	0.17	0.13	0.45	0.22	0.19	0.35	0.69	0.54	0.56
O2'	0.18	0.20	0.33	0.31	0.20	0.23	0.22	0.44	0.23	0.23	0.22	0.19	0.26	0.25	0.19	0.40	0.34	0.18	0.75	1.15	1.09	1.10
O3'	0.24	0.14	0.41	0.25	0.16	0.27	0.15	0.58	0.15	0.21	0.13	0.16	0.17	0.18	0.20	0.43	0.18	0.25	0.91	1.18	1.19	1.27
O4	0.20	0.15	0.19	0.21	0.19	0.29	0.20	0.37	0.17	0.22	0.14	0.18	0.18	0.22	0.21	0.47	0.22	0.33	0.24	0.54	0.30	0.25
O4'	0.15	0.10	0.37	0.24	0.09	0.11	0.11	0.14	0.12	0.18	0.11	0.10	0.17	0.17	0.12	0.60	0.31	0.22	0.49	0.64	0.64	0.70
O5'	0.14	0.14	0.42	0.31	0.09	0.22	0.12	0.22	0.15	0.16	0.15	0.11	0.18	0.15	0.10	0.66	0.39	0.27	0.43	0.41	0.51	0.49
OP1	0.27	0.46	0.35	0.31	0.35	0.36	0.34	0.38	0.40	0.26	0.45	0.42	0.39	0.28	0.29	0.56	0.42	0.45	0.29	0.25	0.48	0.26
OP2	0.35	0.40	0.71	0.61	0.34	0.30	0.33	0.29	0.36	0.29	0.39	0.38	0.36	0.29	0.32	1.04	0.64	0.20	0.43	0.31	0.43	0.36
P	0.16	0.18	0.44	0.39	0.12	0.30	0.14	0.30	0.18	0.17	0.20	0.15	0.21	0.16	0.12	0.72	0.51	0.31	0.32	0.22	0.43	0.29

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.02	0.02	0.03	0.03	0.02	0.02	0.01	0.01	0.17	0.00	0.12	0.40	0.12	0.16
C2	0.03	0.00	0.19	0.17	0.01	0.21	0.01	0.37	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.18	0.18	0.18	0.43	0.64	0.44	0.45
C2'	0.01	0.19	0.00	0.01	0.09	0.01	0.05	0.12	0.08	0.11	0.14	0.19	0.06	0.08	0.02	0.01	0.02	0.02	0.23	0.32	0.27	0.24
C3'	0.01	0.17	0.01	0.00	0.10	0.00	0.11	0.02	0.12	0.13	0.15	0.16	0.12	0.13	0.07	0.01	0.01	0.01	0.07	0.16	0.20	0.08
C4	0.01	0.01	0.09	0.10	0.00	0.09	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.13	0.09	0.16	0.48	0.14	0.15
C4'	0.01	0.21	0.01	0.00	0.09	0.00	0.05	0.01	0.09	0.12	0.16	0.20	0.07	0.09	0.03	0.12	0.03	0.00	0.02	0.17	0.09	0.04
C5	0.01	0.01	0.05	0.11	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.15	0.10	0.04	0.15	0.56	0.22	0.21
C5'	0.05	0.37	0.12	0.02	0.15	0.01	0.09	0.00	0.15	0.24	0.28	0.34	0.12	0.18	0.07	0.05	0.10	0.01	0.01	0.08	0.11	0.02
C6	0.02	0.01	0.08	0.12	0.01	0.09	0.01	0.15	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.16	0.11	0.08	0.17	0.52	0.19	0.16
C8	0.02	0.02	0.11	0.13	0.01	0.12	0.01	0.24	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.18	0.09	0.10	0.38	0.80	0.49	0.53
N1	0.03	0.01	0.14	0.15	0.01	0.16	0.01	0.28	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.17	0.15	0.14	0.32	0.57	0.31	0.31
N3	0.03	0.00	0.19	0.16	0.01	0.20	0.01	0.34	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.17	0.19	0.17	0.39	0.56	0.38	0.39
N6	0.02	0.02	0.06	0.12	0.01	0.07	0.02	0.12	0.01	0.03	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.19	0.10	0.07	0.17	0.55	0.25	0.20
N7	0.02	0.02	0.08	0.13	0.01	0.09	0.01	0.18	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.19	0.09	0.06	0.32	0.76	0.47	0.48
N9	0.01	0.02	0.02	0.07	0.01	0.03	0.01	0.07	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.10	0.11	0.01	0.16	0.53	0.20	0.24
O2'	0.01	0.18	0.01	0.01	0.12	0.12	0.15	0.05	0.16	0.18	0.17	0.17	0.19	0.19	0.10	0.00	0.05	0.08	0.20	0.29	0.29	0.22
O3'	0.17	0.18	0.02	0.01	0.13	0.03	0.10	0.10	0.11	0.09	0.15	0.19	0.10	0.09	0.11	0.05	0.00	0.13	0.13	0.20	0.23	0.14
O4'	0.00	0.18	0.02	0.01	0.09	0.00	0.04	0.01	0.08	0.10	0.14	0.17	0.07	0.06	0.01	0.08	0.13	0.00	0.08	0.36	0.12	0.16
O5'	0.12	0.43	0.23	0.07	0.16	0.02	0.15	0.01	0.17	0.38	0.32	0.39	0.17	0.32	0.16	0.20	0.13	0.08	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.40	0.64	0.32	0.16	0.48	0.17	0.56	0.08	0.52	0.80	0.57	0.56	0.55	0.76	0.53	0.29	0.20	0.36	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.12	0.44	0.27	0.20	0.14	0.09	0.22	0.11	0.19	0.49	0.31	0.38	0.25	0.47	0.20	0.29	0.23	0.12	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.16	0.45	0.24	0.08	0.15	0.04	0.21	0.02	0.16	0.53	0.31	0.39	0.20	0.48	0.24	0.22	0.14	0.16	0.01	0.01	0.01	0.00