Doublet Group distance statistics: 50731

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 10, 14, 9, 15, 10, 3, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.004, 0.007, 0.011, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.007 std_dev=0.003
N1	A	0, 0.005, 0.008, 0.012, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.008 std_dev=0.004
N3	A	0, 0.007, 0.011, 0.015, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.011 std_dev=0.004
C4	A	0, 0.005, 0.010, 0.016, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.010 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.004, 0.010, 0.015, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.010 std_dev=0.005
C1'	A	0, 0.011, 0.016, 0.022, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.016 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.013, 0.020, 0.027, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.020 std_dev=0.007
O2	A	0, 0.029, 0.047, 0.064, 0.093 max_d=0.093 avg_d=0.047 std_dev=0.018
O4	A	0, 0.018, 0.056, 0.094, 0.196 max_d=0.196 avg_d=0.056 std_dev=0.038
C2'	A	0, 0.036, 0.078, 0.120, 0.206 max_d=0.206 avg_d=0.078 std_dev=0.042
O4'	A	0, 0.026, 0.072, 0.117, 0.241 max_d=0.241 avg_d=0.072 std_dev=0.045
O2'	A	0, 0.072, 0.130, 0.188, 0.292 max_d=0.292 avg_d=0.130 std_dev=0.058
C4'	A	0, 0.071, 0.141, 0.211, 0.411 max_d=0.411 avg_d=0.141 std_dev=0.070
C3'	A	0, 0.060, 0.134, 0.208, 0.385 max_d=0.385 avg_d=0.134 std_dev=0.074
C5'	A	0, 0.116, 0.226, 0.336, 0.597 max_d=0.597 avg_d=0.226 std_dev=0.110
O3'	A	0, 0.104, 0.217, 0.331, 0.592 max_d=0.592 avg_d=0.217 std_dev=0.113
O5'	A	0, 0.126, 0.241, 0.357, 0.562 max_d=0.562 avg_d=0.241 std_dev=0.116
C4	B	0, 0.160, 0.313, 0.465, 0.733 max_d=0.733 avg_d=0.313 std_dev=0.153
N1	B	0, 0.157, 0.315, 0.473, 0.651 max_d=0.651 avg_d=0.315 std_dev=0.158
C2	B	0, 0.189, 0.355, 0.522, 0.668 max_d=0.668 avg_d=0.355 std_dev=0.167
N3	B	0, 0.203, 0.369, 0.536, 0.743 max_d=0.743 avg_d=0.369 std_dev=0.167
N9	B	0, 0.166, 0.342, 0.517, 0.825 max_d=0.825 avg_d=0.342 std_dev=0.175
C6	B	0, 0.161, 0.338, 0.515, 0.836 max_d=0.836 avg_d=0.338 std_dev=0.177
C5	B	0, 0.153, 0.332, 0.511, 0.853 max_d=0.853 avg_d=0.332 std_dev=0.179
P	B	0, 0.104, 0.290, 0.477, 0.739 max_d=0.739 avg_d=0.290 std_dev=0.186
P	A	0, 0.158, 0.352, 0.546, 1.009 max_d=1.009 avg_d=0.352 std_dev=0.194
C1'	B	0, 0.219, 0.422, 0.625, 0.955 max_d=0.955 avg_d=0.422 std_dev=0.203
OP2	B	0, 0.135, 0.342, 0.549, 0.908 max_d=0.908 avg_d=0.342 std_dev=0.207
OP1	B	0, 0.176, 0.390, 0.603, 0.897 max_d=0.897 avg_d=0.390 std_dev=0.214
O4'	B	0, 0.223, 0.449, 0.676, 1.016 max_d=1.016 avg_d=0.449 std_dev=0.226
O5'	B	0, 0.174, 0.401, 0.628, 0.957 max_d=0.957 avg_d=0.401 std_dev=0.227
C3'	B	0, 0.259, 0.490, 0.721, 1.132 max_d=1.132 avg_d=0.490 std_dev=0.231
OP1	A	0, 0.196, 0.429, 0.662, 1.181 max_d=1.181 avg_d=0.429 std_dev=0.233
C8	B	0, 0.149, 0.382, 0.615, 1.110 max_d=1.110 avg_d=0.382 std_dev=0.233
OP2	A	0, 0.154, 0.387, 0.620, 1.137 max_d=1.137 avg_d=0.387 std_dev=0.233
C4'	B	0, 0.253, 0.491, 0.729, 1.188 max_d=1.188 avg_d=0.491 std_dev=0.238
N6	B	0, 0.186, 0.435, 0.684, 1.190 max_d=1.190 avg_d=0.435 std_dev=0.249
C5'	B	0, 0.248, 0.505, 0.762, 1.232 max_d=1.232 avg_d=0.505 std_dev=0.257
N7	B	0, 0.141, 0.404, 0.666, 1.147 max_d=1.147 avg_d=0.404 std_dev=0.263
C2'	B	0, 0.248, 0.683, 1.117, 1.574 max_d=1.574 avg_d=0.683 std_dev=0.434
O3'	B	0, 0.372, 1.026, 1.680, 2.165 max_d=2.165 avg_d=1.026 std_dev=0.654
O2'	B	0, 0.131, 1.195, 2.260, 3.177 max_d=3.177 avg_d=1.195 std_dev=1.064

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.04	0.08	0.04
C2	0.01	0.00	0.04	0.05	0.00	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.05	0.01	0.02	0.08	0.09	0.14	0.10
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.06	0.00	0.01	0.03	0.01	0.03	0.05	0.07	0.04
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.05	0.00	0.05	0.01	0.04	0.03	0.05	0.06	0.01	0.00	0.06	0.01	0.03	0.07	0.06	0.04
C4	0.01	0.00	0.03	0.05	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.06	0.00	0.01	0.11	0.15	0.20	0.15
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.04	0.02	0.03	0.03	0.03	0.01	0.04	0.00	0.01	0.05	0.03	0.01
C5	0.01	0.01	0.02	0.05	0.00	0.04	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.06	0.01	0.02	0.12	0.15	0.19	0.15
C5'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.08	0.00	0.09	0.00	0.08	0.05	0.06	0.04	0.03	0.01	0.09	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01
C6	0.01	0.01	0.03	0.04	0.01	0.04	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.02	0.10	0.11	0.14	0.11
N1	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.07	0.08	0.12	0.08
N3	0.01	0.00	0.03	0.05	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.06	0.00	0.01	0.10	0.12	0.18	0.13
O2	0.02	0.01	0.06	0.06	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.06	0.06	0.01	0.03	0.07	0.07	0.13	0.08
O2'	0.02	0.04	0.00	0.01	0.02	0.03	0.02	0.03	0.02	0.02	0.03	0.06	0.00	0.04	0.03	0.03	0.02	0.06	0.05	0.02
O3'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.06	0.01	0.06	0.01	0.05	0.03	0.06	0.06	0.04	0.00	0.08	0.01	0.04	0.10	0.07	0.05
O4	0.01	0.01	0.03	0.06	0.00	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.08	0.00	0.02	0.12	0.18	0.22	0.17
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.03	0.01	0.02	0.00	0.03	0.04	0.07	0.05
O5'	0.03	0.08	0.03	0.03	0.11	0.01	0.12	0.01	0.10	0.07	0.10	0.07	0.02	0.04	0.12	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.04	0.09	0.05	0.07	0.15	0.05	0.15	0.05	0.11	0.08	0.12	0.07	0.06	0.10	0.18	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.08	0.14	0.07	0.06	0.20	0.03	0.19	0.01	0.14	0.12	0.18	0.13	0.05	0.07	0.22	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.04	0.10	0.04	0.04	0.15	0.01	0.15	0.01	0.11	0.08	0.13	0.08	0.02	0.05	0.17	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.25	0.12	0.59	0.17	0.09	0.11	0.13	0.06	0.18	0.14	0.13	0.15	0.30	0.22	0.13	1.06	0.23	0.18	0.06	0.12	0.03	0.05
C2	0.27	0.15	0.50	0.18	0.14	0.13	0.10	0.12	0.14	0.17	0.13	0.18	0.28	0.18	0.19	1.04	0.17	0.18	0.13	0.13	0.08	0.08
C2'	0.25	0.11	0.62	0.14	0.09	0.12	0.14	0.11	0.19	0.11	0.14	0.13	0.30	0.21	0.13	0.93	0.17	0.18	0.10	0.15	0.06	0.08
C3'	0.20	0.11	0.62	0.12	0.07	0.09	0.19	0.05	0.22	0.17	0.15	0.11	0.32	0.29	0.07	0.90	0.24	0.15	0.04	0.04	0.02	0.01
C4	0.25	0.16	0.37	0.21	0.15	0.15	0.12	0.12	0.13	0.18	0.09	0.20	0.26	0.21	0.18	1.03	0.23	0.18	0.13	0.14	0.09	0.10
C4'	0.20	0.12	0.60	0.15	0.07	0.12	0.18	0.11	0.20	0.19	0.14	0.13	0.31	0.29	0.07	1.00	0.38	0.16	0.10	0.04	0.05	0.03
C5	0.25	0.15	0.40	0.24	0.12	0.17	0.17	0.12	0.18	0.21	0.12	0.18	0.29	0.27	0.16	1.12	0.21	0.18	0.11	0.15	0.09	0.09
C5'	0.18	0.13	0.56	0.17	0.08	0.18	0.19	0.21	0.19	0.24	0.13	0.15	0.29	0.31	0.08	1.00	0.50	0.17	0.20	0.08	0.11	0.10
C6	0.25	0.14	0.49	0.23	0.10	0.16	0.17	0.11	0.19	0.22	0.12	0.17	0.30	0.29	0.15	1.15	0.23	0.19	0.09	0.12	0.07	0.07
N1	0.26	0.13	0.53	0.19	0.10	0.13	0.12	0.08	0.17	0.17	0.12	0.16	0.30	0.23	0.15	1.09	0.19	0.18	0.09	0.10	0.05	0.05
N3	0.27	0.17	0.43	0.19	0.17	0.14	0.12	0.13	0.12	0.19	0.12	0.20	0.26	0.19	0.21	1.02	0.21	0.19	0.14	0.13	0.09	0.10
O2	0.27	0.16	0.51	0.17	0.16	0.14	0.11	0.15	0.15	0.19	0.15	0.18	0.26	0.15	0.20	1.00	0.17	0.19	0.15	0.17	0.09	0.11
O2'	0.25	0.12	0.63	0.13	0.11	0.13	0.12	0.15	0.18	0.10	0.15	0.14	0.29	0.16	0.15	0.89	0.17	0.18	0.13	0.26	0.11	0.15
O3'	0.15	0.11	0.59	0.08	0.10	0.04	0.20	0.03	0.23	0.18	0.17	0.09	0.32	0.29	0.07	0.71	0.23	0.13	0.02	0.01	0.02	0.00
O4	0.25	0.19	0.29	0.21	0.17	0.16	0.13	0.14	0.11	0.17	0.10	0.22	0.22	0.18	0.19	0.94	0.29	0.19	0.15	0.16	0.11	0.11
O4'	0.22	0.13	0.57	0.20	0.08	0.14	0.16	0.10	0.19	0.18	0.13	0.14	0.31	0.28	0.10	1.08	0.36	0.18	0.09	0.06	0.03	0.02
O5'	0.19	0.15	0.53	0.22	0.08	0.20	0.18	0.22	0.18	0.25	0.13	0.16	0.27	0.31	0.09	1.08	0.48	0.16	0.18	0.12	0.11	0.10
OP1	0.16	0.19	0.40	0.16	0.12	0.23	0.18	0.33	0.17	0.26	0.15	0.20	0.24	0.30	0.12	0.85	0.65	0.15	0.25	0.17	0.19	0.16
OP2	0.17	0.22	0.29	0.29	0.13	0.26	0.17	0.29	0.16	0.25	0.16	0.22	0.22	0.28	0.12	1.05	0.53	0.14	0.21	0.19	0.16	0.14
P	0.16	0.19	0.40	0.23	0.10	0.23	0.18	0.29	0.17	0.26	0.14	0.19	0.24	0.30	0.10	1.03	0.59	0.14	0.22	0.16	0.15	0.13

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.08	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.40	0.00	0.17	0.21	0.08	0.09
C2	0.03	0.00	0.14	0.09	0.00	0.03	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.31	0.48	0.08	0.17	0.23	0.14	0.14
C2'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.05	0.01	0.04	0.23	0.04	0.13	0.09	0.15	0.05	0.11	0.04	0.00	0.05	0.03	0.47	0.30	0.41	0.43
C3'	0.02	0.09	0.00	0.00	0.13	0.00	0.20	0.01	0.18	0.24	0.13	0.07	0.22	0.25	0.14	0.02	0.01	0.02	0.04	0.20	0.07	0.06
C4	0.02	0.00	0.05	0.13	0.00	0.03	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.31	0.34	0.04	0.17	0.22	0.14	0.13
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.06	0.12	0.03	0.04	0.08	0.11	0.05	0.27	0.04	0.00	0.02	0.19	0.04	0.06
C5	0.01	0.00	0.04	0.20	0.00	0.07	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.38	0.24	0.02	0.22	0.25	0.21	0.21
C5'	0.08	0.08	0.23	0.01	0.09	0.01	0.13	0.00	0.12	0.15	0.10	0.08	0.15	0.17	0.09	0.06	0.21	0.01	0.01	0.07	0.07	0.02
C6	0.02	0.00	0.04	0.18	0.01	0.06	0.00	0.12	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.41	0.29	0.04	0.22	0.26	0.22	0.22
C8	0.01	0.01	0.13	0.24	0.00	0.12	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.31	0.14	0.05	0.23	0.23	0.19	0.19
N1	0.03	0.00	0.09	0.13	0.01	0.03	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.38	0.39	0.06	0.19	0.25	0.19	0.18
N3	0.03	0.00	0.15	0.07	0.00	0.04	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.26	0.50	0.08	0.16	0.21	0.11	0.11
N6	0.02	0.00	0.05	0.22	0.01	0.08	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.44	0.24	0.03	0.25	0.28	0.27	0.27
N7	0.01	0.00	0.11	0.25	0.00	0.11	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.38	0.15	0.03	0.26	0.26	0.25	0.25
N9	0.01	0.01	0.04	0.14	0.00	0.05	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.24	0.26	0.01	0.16	0.21	0.12	0.11
O2'	0.01	0.31	0.00	0.02	0.31	0.27	0.38	0.06	0.41	0.31	0.38	0.26	0.44	0.38	0.24	0.00	0.06	0.17	0.38	0.27	0.29	0.39
O3'	0.40	0.48	0.05	0.01	0.34	0.04	0.24	0.21	0.29	0.14	0.39	0.50	0.24	0.15	0.26	0.06	0.00	0.28	0.22	0.21	0.22	0.21
O4'	0.00	0.08	0.03	0.02	0.04	0.00	0.02	0.01	0.04	0.05	0.06	0.08	0.03	0.03	0.01	0.17	0.28	0.00	0.04	0.31	0.13	0.16
O5'	0.17	0.17	0.47	0.04	0.17	0.02	0.22	0.01	0.22	0.23	0.19	0.16	0.25	0.26	0.16	0.38	0.22	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.21	0.23	0.30	0.20	0.22	0.19	0.25	0.07	0.26	0.23	0.25	0.21	0.28	0.26	0.21	0.27	0.21	0.31	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.08	0.14	0.41	0.07	0.14	0.04	0.21	0.07	0.22	0.19	0.19	0.11	0.27	0.25	0.12	0.29	0.22	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.09	0.14	0.43	0.06	0.13	0.06	0.21	0.02	0.22	0.19	0.18	0.11	0.27	0.25	0.11	0.39	0.21	0.16	0.00	0.00	0.00	0.00