Doublet Group distance statistics: 50733

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 3, 7, 11, 13, 4, 2, 0, 0, 1, 2, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.001, 0.010, 0.019, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.010 std_dev=0.009
C6	A	0, 0.007, 0.016, 0.026, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.016 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.007, 0.016, 0.026, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.016 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.007, 0.016, 0.026, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.016 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.007, 0.017, 0.028, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.017 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.002, 0.013, 0.023, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.013 std_dev=0.011
N3	A	0, -0.001, 0.010, 0.022, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.010 std_dev=0.012
O2	A	0, 0.014, 0.043, 0.072, 0.159 max_d=0.159 avg_d=0.043 std_dev=0.029
O4	A	0, 0.027, 0.058, 0.089, 0.150 max_d=0.150 avg_d=0.058 std_dev=0.031
O4'	A	0, 0.035, 0.118, 0.201, 0.466 max_d=0.466 avg_d=0.118 std_dev=0.083
O3'	A	0, 0.056, 0.142, 0.229, 0.473 max_d=0.473 avg_d=0.142 std_dev=0.086
C3'	A	0, 0.060, 0.155, 0.251, 0.506 max_d=0.506 avg_d=0.155 std_dev=0.095
C2'	A	0, 0.051, 0.148, 0.245, 0.526 max_d=0.526 avg_d=0.148 std_dev=0.097
C4'	A	0, 0.052, 0.158, 0.264, 0.562 max_d=0.562 avg_d=0.158 std_dev=0.106
O2'	A	0, 0.063, 0.224, 0.385, 0.839 max_d=0.839 avg_d=0.224 std_dev=0.161
C5'	A	0, 0.122, 0.295, 0.469, 0.956 max_d=0.956 avg_d=0.295 std_dev=0.173
C2	B	0, 0.194, 0.374, 0.554, 1.074 max_d=1.074 avg_d=0.374 std_dev=0.180
O5'	A	0, 0.105, 0.297, 0.489, 0.899 max_d=0.899 avg_d=0.297 std_dev=0.192
N1	B	0, 0.195, 0.391, 0.587, 1.124 max_d=1.124 avg_d=0.391 std_dev=0.196
N3	B	0, 0.180, 0.381, 0.583, 1.160 max_d=1.160 avg_d=0.381 std_dev=0.202
C4	B	0, 0.180, 0.397, 0.614, 1.216 max_d=1.216 avg_d=0.397 std_dev=0.217
C6	B	0, 0.178, 0.411, 0.644, 1.280 max_d=1.280 avg_d=0.411 std_dev=0.233
C5	B	0, 0.166, 0.414, 0.662, 1.325 max_d=1.325 avg_d=0.414 std_dev=0.248
N9	B	0, 0.174, 0.451, 0.728, 1.318 max_d=1.318 avg_d=0.451 std_dev=0.277
N6	B	0, 0.163, 0.468, 0.773, 1.439 max_d=1.439 avg_d=0.468 std_dev=0.305
O4'	B	0, 0.274, 0.580, 0.885, 1.519 max_d=1.519 avg_d=0.580 std_dev=0.306
P	A	0, 0.131, 0.450, 0.769, 1.810 max_d=1.810 avg_d=0.450 std_dev=0.319
C1'	B	0, 0.193, 0.517, 0.842, 1.729 max_d=1.729 avg_d=0.517 std_dev=0.325
N7	B	0, 0.136, 0.467, 0.799, 1.567 max_d=1.567 avg_d=0.467 std_dev=0.332
C8	B	0, 0.142, 0.481, 0.821, 1.641 max_d=1.641 avg_d=0.481 std_dev=0.340
C4'	B	0, 0.297, 0.664, 1.031, 1.886 max_d=1.886 avg_d=0.664 std_dev=0.367
C5'	B	0, 0.333, 0.722, 1.111, 2.107 max_d=2.107 avg_d=0.722 std_dev=0.389
C3'	B	0, 0.226, 0.638, 1.051, 2.480 max_d=2.480 avg_d=0.638 std_dev=0.412
O5'	B	0, 0.384, 0.801, 1.218, 2.193 max_d=2.193 avg_d=0.801 std_dev=0.417
OP1	A	0, 0.336, 0.789, 1.242, 2.337 max_d=2.337 avg_d=0.789 std_dev=0.453
C2'	B	0, 0.090, 0.554, 1.019, 2.344 max_d=2.344 avg_d=0.554 std_dev=0.465
P	B	0, 0.395, 0.870, 1.345, 2.431 max_d=2.431 avg_d=0.870 std_dev=0.475
OP2	B	0, 0.373, 0.854, 1.334, 2.484 max_d=2.484 avg_d=0.854 std_dev=0.480
O3'	B	0, 0.221, 0.737, 1.254, 3.042 max_d=3.042 avg_d=0.737 std_dev=0.516
OP1	B	0, 0.436, 0.982, 1.528, 2.739 max_d=2.739 avg_d=0.982 std_dev=0.546
O2'	B	0, -0.118, 0.604, 1.327, 3.462 max_d=3.462 avg_d=0.604 std_dev=0.722
OP2	A	0, 0.164, 0.898, 1.631, 3.409 max_d=3.409 avg_d=0.898 std_dev=0.733

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.03	0.02	0.01	0.09	0.22	0.34	0.11
C2	0.02	0.00	0.04	0.03	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.05	0.02	0.04	0.13	0.17	0.31	0.13
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.04	0.01	0.05	0.05	0.05	0.02	0.04	0.07	0.00	0.02	0.05	0.01	0.09	0.33	0.44	0.16
C3'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.04	0.01	0.04	0.03	0.04	0.01	0.03	0.05	0.02	0.01	0.04	0.01	0.09	0.38	0.51	0.16
C4	0.02	0.01	0.04	0.04	0.00	0.04	0.00	0.10	0.01	0.02	0.00	0.02	0.07	0.03	0.01	0.03	0.16	0.17	0.40	0.19
C4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.04	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.03	0.05	0.02	0.01	0.04	0.00	0.02	0.25	0.35	0.08
C5	0.01	0.01	0.05	0.04	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.02	0.08	0.04	0.01	0.04	0.16	0.18	0.42	0.20
C5'	0.04	0.07	0.05	0.03	0.10	0.01	0.11	0.00	0.11	0.07	0.08	0.07	0.04	0.03	0.11	0.02	0.01	0.16	0.20	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.04	0.01	0.05	0.01	0.11	0.00	0.00	0.01	0.01	0.07	0.04	0.02	0.04	0.14	0.16	0.34	0.17
N1	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.07	0.00	0.00	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.01	0.13	0.16	0.30	0.13
N3	0.02	0.01	0.04	0.03	0.00	0.03	0.01	0.08	0.01	0.02	0.00	0.02	0.07	0.04	0.01	0.04	0.15	0.15	0.33	0.15
O2	0.03	0.01	0.07	0.05	0.02	0.05	0.02	0.07	0.01	0.01	0.02	0.00	0.12	0.07	0.02	0.07	0.12	0.20	0.32	0.12
O2'	0.01	0.07	0.00	0.02	0.07	0.02	0.08	0.04	0.07	0.03	0.07	0.12	0.00	0.05	0.07	0.01	0.10	0.40	0.49	0.19
O3'	0.03	0.05	0.02	0.01	0.03	0.01	0.04	0.03	0.04	0.03	0.04	0.07	0.05	0.00	0.03	0.03	0.10	0.43	0.55	0.16
O4	0.02	0.02	0.05	0.04	0.01	0.04	0.01	0.11	0.02	0.02	0.01	0.02	0.07	0.03	0.00	0.03	0.15	0.19	0.44	0.21
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.02	0.04	0.01	0.04	0.07	0.01	0.03	0.03	0.00	0.11	0.15	0.28	0.09
O5'	0.09	0.13	0.09	0.09	0.16	0.02	0.16	0.01	0.14	0.13	0.15	0.12	0.10	0.10	0.15	0.11	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.22	0.17	0.33	0.38	0.17	0.25	0.18	0.16	0.16	0.16	0.15	0.20	0.40	0.43	0.19	0.15	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.34	0.31	0.44	0.51	0.40	0.35	0.42	0.20	0.34	0.30	0.33	0.32	0.49	0.55	0.44	0.28	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.13	0.16	0.16	0.19	0.08	0.20	0.01	0.17	0.13	0.15	0.12	0.19	0.16	0.21	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.33	0.19	0.39	0.33	0.19	0.27	0.12	0.19	0.17	0.14	0.17	0.22	0.29	0.11	0.22	0.71	0.48	0.24	0.16	0.19	0.26	0.16
C2	0.25	0.17	0.25	0.24	0.15	0.22	0.09	0.18	0.12	0.13	0.12	0.20	0.24	0.12	0.17	0.49	0.44	0.21	0.17	0.20	0.27	0.18
C2'	0.34	0.18	0.44	0.33	0.19	0.27	0.15	0.19	0.19	0.18	0.18	0.21	0.30	0.12	0.25	0.75	0.45	0.24	0.18	0.19	0.28	0.17
C3'	0.34	0.18	0.46	0.36	0.19	0.28	0.15	0.18	0.19	0.17	0.18	0.21	0.29	0.14	0.23	0.79	0.46	0.25	0.15	0.17	0.24	0.13
C4	0.18	0.14	0.13	0.19	0.09	0.21	0.15	0.18	0.17	0.16	0.13	0.16	0.25	0.20	0.12	0.26	0.43	0.20	0.19	0.24	0.28	0.20
C4'	0.34	0.18	0.44	0.39	0.18	0.31	0.15	0.20	0.19	0.14	0.17	0.21	0.30	0.15	0.21	0.78	0.52	0.26	0.14	0.16	0.21	0.11
C5	0.23	0.17	0.17	0.24	0.10	0.25	0.16	0.20	0.20	0.17	0.15	0.20	0.28	0.24	0.12	0.35	0.47	0.23	0.18	0.25	0.28	0.20
C5'	0.32	0.19	0.41	0.42	0.18	0.33	0.20	0.22	0.24	0.17	0.20	0.21	0.34	0.23	0.20	0.74	0.54	0.28	0.16	0.17	0.18	0.12
C6	0.31	0.19	0.29	0.30	0.15	0.28	0.14	0.21	0.19	0.12	0.16	0.23	0.29	0.20	0.17	0.57	0.50	0.26	0.18	0.23	0.28	0.18
N1	0.30	0.18	0.31	0.29	0.17	0.26	0.09	0.19	0.16	0.11	0.15	0.22	0.28	0.12	0.19	0.60	0.48	0.24	0.17	0.20	0.26	0.17
N3	0.21	0.15	0.17	0.20	0.12	0.21	0.11	0.18	0.13	0.14	0.10	0.18	0.23	0.16	0.14	0.35	0.43	0.20	0.19	0.22	0.27	0.19
O2	0.26	0.17	0.27	0.24	0.17	0.21	0.12	0.17	0.12	0.17	0.14	0.20	0.20	0.14	0.19	0.52	0.43	0.21	0.18	0.19	0.26	0.18
O2'	0.31	0.18	0.41	0.27	0.21	0.23	0.17	0.20	0.18	0.24	0.18	0.21	0.27	0.16	0.26	0.68	0.38	0.22	0.22	0.23	0.35	0.23
O3'	0.34	0.20	0.45	0.34	0.21	0.26	0.17	0.18	0.19	0.21	0.19	0.23	0.27	0.15	0.25	0.78	0.44	0.23	0.16	0.18	0.27	0.15
O4	0.16	0.12	0.14	0.17	0.12	0.19	0.18	0.19	0.19	0.20	0.14	0.12	0.24	0.22	0.15	0.16	0.40	0.19	0.21	0.26	0.29	0.22
O4'	0.33	0.18	0.40	0.37	0.17	0.30	0.12	0.20	0.18	0.11	0.16	0.21	0.29	0.13	0.20	0.74	0.53	0.26	0.14	0.17	0.22	0.12
O5'	0.38	0.21	0.48	0.46	0.20	0.37	0.20	0.26	0.22	0.20	0.19	0.25	0.32	0.25	0.23	0.84	0.58	0.31	0.18	0.21	0.23	0.16
OP1	0.32	0.31	0.34	0.46	0.35	0.43	0.42	0.42	0.42	0.45	0.36	0.31	0.50	0.50	0.36	0.50	0.53	0.41	0.43	0.39	0.40	0.41
OP2	0.36	0.36	0.41	0.52	0.34	0.47	0.37	0.42	0.39	0.34	0.37	0.35	0.42	0.37	0.34	0.46	0.54	0.42	0.35	0.30	0.33	0.28
P	0.30	0.22	0.39	0.44	0.22	0.38	0.25	0.32	0.27	0.25	0.24	0.23	0.34	0.29	0.23	0.61	0.50	0.33	0.25	0.15	0.21	0.17

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.03	0.04	0.01	0.04	0.05	0.04	0.01	0.01	0.02	0.14	0.00	0.09	0.12	0.15	0.10
C2	0.05	0.00	0.09	0.06	0.01	0.06	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.12	0.22	0.06	0.11	0.12	0.18	0.11
C2'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.05	0.01	0.03	0.09	0.05	0.05	0.08	0.10	0.05	0.04	0.02	0.00	0.02	0.02	0.18	0.26	0.27	0.21
C3'	0.02	0.06	0.00	0.00	0.05	0.01	0.08	0.02	0.08	0.11	0.06	0.06	0.10	0.11	0.06	0.01	0.01	0.02	0.05	0.21	0.10	0.10
C4	0.03	0.01	0.05	0.05	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.07	0.14	0.03	0.12	0.12	0.19	0.11
C4'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.05	0.08	0.05	0.06	0.07	0.07	0.03	0.10	0.01	0.01	0.01	0.05	0.05	0.03
C5	0.02	0.01	0.03	0.08	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.11	0.10	0.03	0.14	0.14	0.23	0.14
C5'	0.03	0.08	0.09	0.02	0.07	0.01	0.09	0.00	0.10	0.09	0.09	0.07	0.11	0.11	0.06	0.04	0.10	0.01	0.01	0.06	0.04	0.01
C6	0.04	0.01	0.05	0.08	0.01	0.05	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.10	0.13	0.04	0.14	0.14	0.24	0.14
C8	0.01	0.01	0.05	0.11	0.01	0.08	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.18	0.04	0.06	0.14	0.16	0.23	0.14
N1	0.04	0.01	0.08	0.06	0.02	0.05	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.09	0.18	0.05	0.13	0.13	0.22	0.12
N3	0.05	0.00	0.10	0.06	0.00	0.06	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.12	0.22	0.06	0.11	0.11	0.16	0.10
N6	0.04	0.01	0.05	0.10	0.02	0.07	0.02	0.11	0.00	0.03	0.01	0.02	0.00	0.03	0.03	0.13	0.10	0.06	0.15	0.16	0.27	0.16
N7	0.01	0.01	0.04	0.11	0.01	0.07	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.19	0.04	0.05	0.15	0.17	0.26	0.16
N9	0.01	0.02	0.02	0.06	0.01	0.03	0.01	0.06	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.00	0.09	0.09	0.01	0.11	0.12	0.18	0.11
O2'	0.02	0.12	0.00	0.01	0.07	0.10	0.11	0.04	0.10	0.18	0.09	0.12	0.13	0.19	0.09	0.00	0.04	0.05	0.15	0.29	0.31	0.21
O3'	0.14	0.22	0.02	0.01	0.14	0.01	0.10	0.10	0.13	0.04	0.18	0.22	0.10	0.04	0.09	0.04	0.00	0.08	0.14	0.27	0.20	0.19
O4'	0.00	0.06	0.02	0.02	0.03	0.01	0.03	0.01	0.04	0.06	0.05	0.06	0.06	0.05	0.01	0.05	0.08	0.00	0.06	0.08	0.07	0.07
O5'	0.09	0.11	0.18	0.05	0.12	0.01	0.14	0.01	0.14	0.14	0.13	0.11	0.15	0.15	0.11	0.15	0.14	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.12	0.12	0.26	0.21	0.12	0.05	0.14	0.06	0.14	0.16	0.13	0.11	0.16	0.17	0.12	0.29	0.27	0.08	0.01	0.00	0.02	0.01
OP2	0.15	0.18	0.27	0.10	0.19	0.05	0.23	0.04	0.24	0.23	0.22	0.16	0.27	0.26	0.18	0.31	0.20	0.07	0.01	0.02	0.00	0.01
P	0.10	0.11	0.21	0.10	0.11	0.03	0.14	0.01	0.14	0.14	0.12	0.10	0.16	0.16	0.11	0.21	0.19	0.07	0.00	0.01	0.01	0.00