Doublet Group distance statistics: 50737

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 4, 6, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.001, 0.006, 0.010, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.006 std_dev=0.004
C5	A	0, 0.001, 0.006, 0.010, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.006 std_dev=0.004
N1	A	0, 0.005, 0.010, 0.015, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.010 std_dev=0.005
C4	A	0, 0.005, 0.014, 0.023, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.014 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.005, 0.014, 0.023, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.014 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.004, 0.014, 0.023, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.014 std_dev=0.009
C6	A	0, 0.004, 0.013, 0.023, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.013 std_dev=0.009
O2	A	0, 0.009, 0.034, 0.059, 0.104 max_d=0.104 avg_d=0.034 std_dev=0.025
O4	A	0, -0.013, 0.058, 0.129, 0.284 max_d=0.284 avg_d=0.058 std_dev=0.071
C4	B	0, 0.157, 0.261, 0.364, 0.493 max_d=0.493 avg_d=0.261 std_dev=0.103
N3	B	0, 0.156, 0.260, 0.364, 0.443 max_d=0.443 avg_d=0.260 std_dev=0.104
C2	B	0, 0.151, 0.273, 0.396, 0.448 max_d=0.448 avg_d=0.273 std_dev=0.122
N1	B	0, 0.152, 0.290, 0.427, 0.554 max_d=0.554 avg_d=0.290 std_dev=0.137
C5	B	0, 0.148, 0.288, 0.427, 0.546 max_d=0.546 avg_d=0.288 std_dev=0.140
C6	B	0, 0.144, 0.293, 0.443, 0.576 max_d=0.576 avg_d=0.293 std_dev=0.149
O4'	A	0, -0.036, 0.115, 0.266, 0.504 max_d=0.504 avg_d=0.115 std_dev=0.151
N9	B	0, 0.177, 0.338, 0.498, 0.623 max_d=0.623 avg_d=0.338 std_dev=0.161
C2'	A	0, -0.050, 0.123, 0.296, 0.564 max_d=0.564 avg_d=0.123 std_dev=0.173
O2'	A	0, -0.055, 0.152, 0.360, 0.681 max_d=0.681 avg_d=0.152 std_dev=0.207
C1'	B	0, 0.180, 0.396, 0.613, 0.803 max_d=0.803 avg_d=0.396 std_dev=0.216
C4'	A	0, -0.047, 0.181, 0.408, 0.752 max_d=0.752 avg_d=0.181 std_dev=0.228
C8	B	0, 0.153, 0.391, 0.629, 0.846 max_d=0.846 avg_d=0.391 std_dev=0.238
N7	B	0, 0.127, 0.367, 0.607, 0.832 max_d=0.832 avg_d=0.367 std_dev=0.240
N6	B	0, 0.122, 0.363, 0.603, 0.895 max_d=0.895 avg_d=0.363 std_dev=0.241
C3'	A	0, -0.068, 0.193, 0.454, 0.855 max_d=0.855 avg_d=0.193 std_dev=0.261
OP1	A	0, 0.084, 0.357, 0.629, 0.829 max_d=0.829 avg_d=0.357 std_dev=0.273
O4'	B	0, 0.136, 0.419, 0.701, 1.030 max_d=1.030 avg_d=0.419 std_dev=0.283
P	A	0, 0.039, 0.323, 0.607, 0.920 max_d=0.920 avg_d=0.323 std_dev=0.284
C3'	B	0, 0.100, 0.398, 0.696, 1.032 max_d=1.032 avg_d=0.398 std_dev=0.298
OP2	A	0, 0.042, 0.352, 0.663, 1.052 max_d=1.052 avg_d=0.352 std_dev=0.311
O3'	A	0, -0.093, 0.251, 0.594, 1.113 max_d=1.113 avg_d=0.251 std_dev=0.344
O5'	A	0, -0.050, 0.314, 0.679, 1.195 max_d=1.195 avg_d=0.314 std_dev=0.364
C4'	B	0, 0.034, 0.434, 0.834, 1.372 max_d=1.372 avg_d=0.434 std_dev=0.400
C2'	B	0, 0.098, 0.502, 0.906, 1.463 max_d=1.463 avg_d=0.502 std_dev=0.404
C5'	A	0, -0.131, 0.312, 0.756, 1.445 max_d=1.445 avg_d=0.312 std_dev=0.443
OP1	B	0, -0.078, 0.409, 0.896, 1.651 max_d=1.651 avg_d=0.409 std_dev=0.487
O3'	B	0, 0.004, 0.511, 1.018, 1.754 max_d=1.754 avg_d=0.511 std_dev=0.507
C5'	B	0, -0.087, 0.424, 0.936, 1.698 max_d=1.698 avg_d=0.424 std_dev=0.511
O2'	B	0, 0.082, 0.660, 1.238, 2.049 max_d=2.049 avg_d=0.660 std_dev=0.578
P	B	0, -0.187, 0.398, 0.984, 1.910 max_d=1.910 avg_d=0.398 std_dev=0.585
O5'	B	0, -0.224, 0.482, 1.188, 2.318 max_d=2.318 avg_d=0.482 std_dev=0.706
OP2	B	0, -0.330, 0.544, 1.417, 2.828 max_d=2.828 avg_d=0.544 std_dev=0.874

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.11	0.12	0.16	0.04
C2	0.01	0.00	0.07	0.08	0.00	0.03	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.08	0.01	0.02	0.23	0.16	0.09	0.11
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.02	0.01	0.06	0.01	0.07	0.01	0.04	0.13	0.00	0.02	0.03	0.00	0.19	0.23	0.06	0.12
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.03	0.00	0.07	0.02	0.09	0.02	0.06	0.13	0.01	0.00	0.03	0.01	0.25	0.30	0.03	0.19
C4	0.00	0.00	0.02	0.03	0.00	0.04	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.04	0.00	0.01	0.33	0.20	0.10	0.19
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.04	0.00	0.03	0.00	0.03	0.02	0.04	0.04	0.04	0.01	0.04	0.00	0.01	0.11	0.23	0.02
C5	0.00	0.00	0.06	0.07	0.00	0.03	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.09	0.01	0.03	0.35	0.21	0.10	0.20
C5'	0.02	0.08	0.01	0.02	0.10	0.00	0.08	0.00	0.06	0.06	0.09	0.07	0.04	0.02	0.10	0.01	0.01	0.15	0.30	0.01
C6	0.00	0.00	0.07	0.09	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.10	0.01	0.03	0.31	0.18	0.08	0.15
N1	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.23	0.15	0.10	0.10
N3	0.01	0.00	0.04	0.06	0.00	0.04	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.07	0.00	0.01	0.29	0.18	0.08	0.15
O2	0.02	0.00	0.13	0.13	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.09	0.15	0.01	0.04	0.19	0.14	0.11	0.09
O2'	0.01	0.04	0.00	0.01	0.02	0.04	0.04	0.04	0.04	0.01	0.03	0.09	0.00	0.03	0.03	0.02	0.07	0.17	0.11	0.05
O3'	0.01	0.08	0.02	0.00	0.04	0.01	0.09	0.02	0.10	0.02	0.07	0.15	0.03	0.00	0.03	0.01	0.20	0.33	0.04	0.19
O4	0.01	0.01	0.03	0.03	0.00	0.04	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.03	0.00	0.01	0.35	0.21	0.14	0.21
O4'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.03	0.00	0.01	0.04	0.02	0.01	0.01	0.00	0.06	0.07	0.26	0.09
O5'	0.11	0.23	0.19	0.25	0.33	0.01	0.35	0.01	0.31	0.23	0.29	0.19	0.07	0.20	0.35	0.06	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.12	0.16	0.23	0.30	0.20	0.11	0.21	0.15	0.18	0.15	0.18	0.14	0.17	0.33	0.21	0.07	0.02	0.00	0.00	0.01
OP2	0.16	0.09	0.06	0.03	0.10	0.23	0.10	0.30	0.08	0.10	0.08	0.11	0.11	0.04	0.14	0.26	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.04	0.11	0.12	0.19	0.19	0.02	0.20	0.01	0.15	0.10	0.15	0.09	0.05	0.19	0.21	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.28	0.09	0.48	0.17	0.11	0.28	0.12	0.42	0.18	0.11	0.12	0.14	0.30	0.17	0.17	0.65	0.10	0.27	0.15	0.07	0.05	0.01
C2	0.29	0.12	0.42	0.15	0.16	0.27	0.10	0.40	0.14	0.20	0.13	0.16	0.25	0.10	0.23	0.64	0.11	0.29	0.09	0.22	0.21	0.13
C2'	0.19	0.11	0.35	0.12	0.09	0.20	0.18	0.33	0.23	0.12	0.18	0.09	0.33	0.22	0.11	0.44	0.11	0.21	0.12	0.06	0.09	0.02
C3'	0.25	0.09	0.40	0.11	0.09	0.27	0.15	0.40	0.19	0.11	0.14	0.11	0.27	0.21	0.13	0.45	0.08	0.26	0.12	0.07	0.02	0.01
C4	0.24	0.14	0.32	0.15	0.17	0.17	0.10	0.27	0.08	0.16	0.10	0.18	0.16	0.11	0.20	0.63	0.13	0.23	0.23	0.14	0.07	0.05
C4'	0.41	0.20	0.62	0.29	0.20	0.44	0.14	0.56	0.16	0.15	0.15	0.25	0.25	0.18	0.25	0.71	0.11	0.39	0.09	0.08	0.06	0.02
C5	0.24	0.13	0.34	0.17	0.14	0.16	0.09	0.23	0.11	0.13	0.09	0.18	0.20	0.12	0.17	0.67	0.16	0.21	0.34	0.09	0.10	0.12
C5'	0.59	0.38	0.80	0.48	0.37	0.59	0.26	0.66	0.25	0.28	0.29	0.44	0.25	0.24	0.42	0.89	0.22	0.55	0.10	0.13	0.13	0.03
C6	0.26	0.11	0.41	0.16	0.13	0.19	0.11	0.28	0.15	0.13	0.09	0.16	0.25	0.17	0.17	0.69	0.15	0.23	0.33	0.08	0.11	0.13
N1	0.28	0.10	0.44	0.15	0.13	0.25	0.10	0.37	0.15	0.13	0.11	0.15	0.27	0.12	0.19	0.66	0.11	0.27	0.19	0.11	0.06	0.03
N3	0.27	0.13	0.37	0.14	0.18	0.23	0.12	0.35	0.10	0.21	0.12	0.17	0.19	0.14	0.23	0.63	0.12	0.27	0.12	0.22	0.18	0.11
O2	0.31	0.13	0.44	0.17	0.17	0.31	0.11	0.45	0.15	0.23	0.15	0.16	0.26	0.13	0.24	0.63	0.12	0.33	0.08	0.30	0.34	0.23
O2'	0.17	0.13	0.34	0.10	0.12	0.19	0.21	0.31	0.27	0.15	0.21	0.10	0.37	0.25	0.11	0.41	0.11	0.17	0.08	0.08	0.12	0.04
O3'	0.17	0.11	0.31	0.07	0.10	0.22	0.18	0.33	0.21	0.14	0.17	0.09	0.28	0.23	0.09	0.28	0.10	0.20	0.01	0.02	0.02	0.00
O4	0.23	0.19	0.28	0.19	0.20	0.17	0.14	0.23	0.10	0.18	0.13	0.22	0.09	0.14	0.21	0.58	0.16	0.22	0.25	0.13	0.06	0.04
O4'	0.39	0.17	0.61	0.27	0.18	0.39	0.10	0.52	0.14	0.12	0.11	0.24	0.25	0.15	0.23	0.79	0.11	0.36	0.14	0.08	0.03	0.02
O5'	0.10	0.28	0.20	0.09	0.31	0.07	0.45	0.20	0.47	0.43	0.38	0.22	0.55	0.53	0.27	0.39	0.29	0.11	0.53	0.31	0.37	0.36
OP1	0.13	0.20	0.20	0.15	0.24	0.14	0.35	0.12	0.34	0.40	0.26	0.18	0.41	0.45	0.25	0.38	0.41	0.14	0.66	0.40	0.64	0.52
OP2	0.15	0.20	0.27	0.09	0.18	0.12	0.25	0.20	0.27	0.23	0.24	0.18	0.32	0.30	0.15	0.58	0.26	0.11	0.42	0.10	0.28	0.20
P	0.09	0.19	0.23	0.09	0.21	0.07	0.32	0.12	0.33	0.34	0.26	0.15	0.40	0.41	0.19	0.48	0.33	0.07	0.56	0.27	0.45	0.37

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.20	0.00	0.09	0.14	0.12	0.07
C2	0.01	0.00	0.06	0.07	0.00	0.02	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.33	0.21	0.02	0.23	0.16	0.16	0.15
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.03	0.00	0.04	0.16	0.04	0.06	0.05	0.06	0.05	0.06	0.03	0.00	0.01	0.01	0.10	0.15	0.08	0.07
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.10	0.00	0.15	0.01	0.14	0.20	0.10	0.06	0.16	0.20	0.12	0.01	0.01	0.01	0.28	0.18	0.30	0.19
C4	0.01	0.00	0.03	0.10	0.00	0.04	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.25	0.13	0.01	0.23	0.14	0.16	0.14
C4'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.04	0.00	0.07	0.00	0.06	0.10	0.03	0.02	0.08	0.10	0.05	0.19	0.02	0.00	0.01	0.11	0.17	0.04
C5	0.01	0.00	0.04	0.15	0.00	0.07	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.27	0.09	0.02	0.30	0.17	0.19	0.20
C5'	0.06	0.10	0.16	0.01	0.11	0.00	0.15	0.00	0.15	0.16	0.13	0.09	0.17	0.18	0.10	0.05	0.14	0.01	0.00	0.05	0.25	0.01
C6	0.01	0.00	0.04	0.14	0.01	0.06	0.00	0.15	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.32	0.10	0.02	0.30	0.20	0.21	0.22
C8	0.01	0.00	0.06	0.20	0.00	0.10	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.15	0.12	0.02	0.29	0.13	0.18	0.18
N1	0.01	0.00	0.05	0.10	0.01	0.03	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.34	0.15	0.02	0.27	0.18	0.19	0.19
N3	0.01	0.00	0.06	0.06	0.00	0.02	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.29	0.22	0.02	0.20	0.14	0.14	0.12
N6	0.01	0.00	0.05	0.16	0.01	0.08	0.01	0.17	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.33	0.10	0.02	0.33	0.23	0.24	0.26
N7	0.01	0.00	0.06	0.20	0.00	0.10	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.22	0.13	0.02	0.33	0.18	0.21	0.23
N9	0.00	0.00	0.03	0.12	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.15	0.10	0.01	0.21	0.12	0.14	0.11
O2'	0.01	0.33	0.00	0.01	0.25	0.19	0.27	0.05	0.32	0.15	0.34	0.29	0.33	0.22	0.15	0.00	0.05	0.13	0.19	0.13	0.22	0.07
O3'	0.20	0.21	0.01	0.01	0.13	0.02	0.09	0.14	0.10	0.12	0.15	0.22	0.10	0.13	0.10	0.05	0.00	0.15	0.29	0.14	0.38	0.22
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.13	0.15	0.00	0.04	0.16	0.13	0.09
O5'	0.09	0.23	0.10	0.28	0.23	0.01	0.30	0.00	0.30	0.29	0.27	0.20	0.33	0.33	0.21	0.19	0.29	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.14	0.16	0.15	0.18	0.14	0.11	0.17	0.05	0.20	0.13	0.18	0.14	0.23	0.18	0.12	0.13	0.14	0.16	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.12	0.16	0.08	0.30	0.16	0.17	0.19	0.25	0.21	0.18	0.19	0.14	0.24	0.21	0.14	0.22	0.38	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.07	0.15	0.07	0.19	0.14	0.04	0.20	0.01	0.22	0.18	0.19	0.12	0.26	0.23	0.11	0.07	0.22	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00